BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-531D08.T7 (MSMg01no531_d08.b1) | MSMg01-531D08.TJ (MSMg01no531_d08.g1) |
ACC | AG599665 | AG599666 |
length | 757 | 759 |
length of high quality (start - end) | 675 (54 - 728) | 546 (78 - 623) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no531_d08.b1 PHD_FILE: MSMg01no531_d08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:07:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no531_d08.g1 PHD_FILE: MSMg01no531_d08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:07:46 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCTTCTATTTTTTGCCGCGCTAATACGACTACTATTTCGAGAGGATCCGC
GGAATTCATGTTTTTTCATACTATATAGAGATAGACTCTAGATACACTTC
ATCTGGACTGCTAAGATAAATGCAGTTTGCCAGATGAAACACTTGATGTA
GACTCTGGAGCCATAGTATTCTGCTCGAATATCTCATCTGGGGGAAAAAA
AACTATTCTACAGAAACTGTAAAGTTCAAAATTGATTTGAATAAATTAAA
TATATAGGCTATTGGCCTGCAATCTAAGACCTGAGAGTGTGAAACCACAG
GAGGGACACAGGGCTTTGGGTTAGGAAAAAGTAGAAGAGGAGGAAGAGGA
AGAAGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGCCATACTAAACCATTAACAAAGCCA
TACTAAAAATAAAGGCTCCAGTATAAATGACATCATCAGTGCAGGACGCC
CACAGGAAGGCAGGGACATATGCAGAGCATGTATCTAGTAAGGTCTGTGT
ACAAAGCAGAGAAAGAATTTTACAACTCAACCATAGCAGGATAGACAACC
CAATTAAACAGTGGAAAACAGCATCTGGACAGAGATACCCTCAAAGACCA
CGTACAAATGGCTAGTGAGCATCTATGGAGGCTCAGCATCACTTCTGATG
GAGGCTCAGCATCACTTCTGATGGAGGCTCAGCATCAGCATCACTGGTCA
TTATGGAAATGCACGTTTAAGACACAGGAGATTGTGCTTTGGACCCACGA
GAATGGC
| CTTCCATTTTTTGTGTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATGGATGCAGCTTCCCTGTCATA
TATAGAAGACATTGTTTCACAGCAGATCTCCTGGCTCGCTGGCTCTTAAA
ATCTTTCTACCCTCTCTTCCATCAATTTCCCTGAGTCCTAGGTATAGGTG
TAGCATTGGCAACGTATGCGTTTGGGTTGGTTACATCATGCTCACTTATT
CTCTGCATTTTGACTAGTTGTGGATCTCTGTTCTAGTGTCCACATATGTT
GCTAAAAGAAACTTCTTTGATTAGGATTAGGAGCTACACTTCTGTAGATA
TACATAAGGTACACTTACAGATATAAGCTACACTCATATCCATAGTTACC
TATGGATCTAAGGCTAAATATTCAGAGTGCATTTAGACATTACATTGGTC
TTAGAAAATGGCAGCTTTAGGCTCTCTCCGTTTTGTGACCTCCCCGGTCA
CAGGTAGTTGGCTATAGCCCTGCAGTGCCAGGCATAAATTCCCGTCTCTT
GAATGGGCATTAGGTCTAGTTGGTCAGCTGTTGGTTACCCCCAAGCTAGG
CGTGCCACTGTCACACCATTGCAGATATCCTGCTGGCCCAGTCTTTGTTG
TGACTCACAGGAACAGCTGGGTAGGACTACCAGTTGCTCCTCTTCTTGGC
CCTTCTACCCACCTCCCAGCCCTTTGAGAGCAGTTCTCAGGGAATGTACT
CTAGTCAGC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 13 15 8 8 8 6 6 8 15 17 22 19 8 8 8 15 19 17 19 8 8 8 19 13 10 10 10 9 9 9 11 11 9 9 14 14 14 16 29 28
30 18 18 19 25 32 28 37 33 21 27 11 10 8 10 10 8 8 9 20 23 34 39 28 28 13 13 13 24 27 39 47 42 42 48 57 57 43 43 35 35 35 39 39 35 39 36 42 42 32
32 32 42 59 57 57 44 44 39 30 30 44 44 44 25 25 30 29 32 35 33 36 35 37 37 42 43 46 39 39 35 35 35 39 43 57 47 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 37 37 31
29 28 44 44 57 57 50 46 43 43 50 46 43 43 37 35 43 43 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57
68 68 57 57 57 57 59 59 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 54 54 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 52 52
62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 43 39 39 39 43 62 62 62 62 44 43 27 27 26 41 41 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62
52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57
59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 54 54 57 57 52 52 43 43 43 43 43 50 57 50 57 48 50
44 50 43 43 43 57 57 54 54 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 47 43 43 43 47 59 57 57 57 57 54 54 57 59 57 54 54 59 59 59 59 59 59 59 54 54 54 57
57 54 54 54 57 59 59 43 43 43 59 59 48 48 48 57 47 50 47 47 48 48 48 59 59 59 59 48 48 48 48 41 41 41 41 41 43 39 31 27 32 37 37 39 41 39 41 34 34 28
28 28 37 37 48 48 48 43 47 43 43 43 43 43 43 43 43 48 48 43 43 43 43 43 46 47 48 46 48 48 48 48 48 43 44 43 43 48 59 47 43 35 35 35 39 42 43 43 43 43
43 46 43 43 37 43 43 43 39 47 40 43 40 43 39 40 43 43 48 48 48 47 41 36 36 36 37 28 24 20 22 24 23 23 20 23 34 37 37 43 43 33 34 33 36 36 37 39 41 37
39 37 32 32 41 34 34 23 22 19 26 26 28 28 37 47 48 48 37 36 28 28 28 30 28 27 27 30 30 23 14 14 16 23 12 12 12 25 30 47 43 40 31 34 22 22 12 19 20 27
23 21 11 11 11 21 21 37 41 41 41 41 41 41 38 25 28 29 32 25 30 33 28 28 22 28 22 25 15 14 10 12 12 16 28 31 30 16 12 12 12 12 18 12 12 16 20 15 21 15
24 19 26 32 26 22 22 | Open.Hide. 8 10 10 12 10 8 8 8 9 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 22 18 12 11 11 12 15 21 21 25 21 21 20 9 9 9 9 9 9 9 15 9 14 14 28 23 37 28 28 28 31
36 36 42 42 37 47 48 48 48 28 23 15 10 9 10 10 19 16 28 32 37 36 41 41 41 41 40 46 34 42 42 47 48 48 68 57 59 54 57 59 59 59 59 59 47 47 47 47 48 57
57 57 57 57 57 59 57 39 43 46 57 57 68 68 59 50 50 47 47 50 50 57 50 43 43 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 52 57 52 57 52 52 52 52 52 57 59 59 59 50 50
50 50 50 50 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 57 59 59 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62
62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 44 43 35 35 43 43 62 62 54 54 62 62 62 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 52 52 52 57 57
57 57 57 57 57 59 59 57 54 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 54 54 54 57 57 52 52 52 57 52 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 52 52 59 59 59
59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 57 57 57 59 50 57 54 59 57 57 57 57 43 37 35 28 41 28 35 42 42 46 44 44 37 37 37 43 46 54 44 44 43 43 43 46 46 57 47 47
43 44 30 30 30 37 32 47 41 41 32 36 36 43 47 59 59 44 37 23 23 41 41 59 59 59 59 48 48 48 57 57 48 43 40 36 32 32 32 39 39 39 43 39 24 24 15 15 17 30
34 46 34 28 18 13 13 13 19 18 23 34 34 31 28 25 30 28 23 32 28 28 20 28 23 32 32 40 37 36 35 39 26 26 18 19 19 32 32 48 48 57 48 48 48 57 57 54 57 57
57 44 47 41 41 31 20 20 20 32 32 36 36 25 28 28 37 33 35 31 37 28 23 23 28 23 28 28 28 34 33 39 39 27 27 14 18 18 34 30 48 43 43 43 43 40 40 39 39 32
28 28 22 18 21 18 15 15 15 15 18 29 30 35 35 35 37 37 32 32 23 20 15 15 14 21 21 28 19 17 17 17 18 24 19 18 28 20 27 30 24 24 23 21 21 18 13 13 15 15
21 31 30 33 28 35 25 23 15 17 19 18 16 17 17 15 23 19 12 9 8 8 8 10 15 14 14 17 15 10 13 12 17 25 29 28 28 32 39 36 36 32 29 29 24 28 14 21 13 14
14 21 15 9 10 10 10 10 9 11 11 11 16 21 19 22 15 14 14 15 24 32 37 37 32 39 31 18 16 17 12 12 10 20 10 15 10 13 9 8 8 9 12 9 9 10 12 13 19 21
13 13 14 21 17 12 11 11 11 |