BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-060D22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 151,963,956 - 152,143,080
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC677315, Fgf3, Fgf4, Fgf15, Oraov1, Ccnd1
Upstream geneMrgpre, Nadsyn1, Dhcr7, Gm498, Shank2, Cttn, Ppfia1, Fadd, Tmem16a, LOC669079
Downstream gene1810010D01Rik, LOC100040049, Tpcn2, Mrgprf, Mrgprd
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-060D22.bB6Ng01-060D22.g
ACCDH881274DH881275
length1,1031,151
definitionDH881274|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-060D22, 5' end.DH881275|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-060D22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,963,956 - 151,965,029)(152,141,917 - 152,143,080)
sequence
gaattcagtccccgaacccacaaggtggagaaagagaagtatttcctgcc
agctgtcctctggcttccacactcacacgccactcactctcatacacacc
acacactcacacacacacacacacacacacacacactcacacacacatca
cacactctcacatgtactcattcaaacacactcatacagactcacatgct
cacacaccccacacatactcattcacatatgcatacttacattcacactc
ttactcacatgcacacttgctcccacagactcatgctctctctctttctc
tctctctctcttacacacacacacacatttttttaatgaggctggagaga
tggctcagcagctaacaactcacactgctcctgcagaggacctgaatctg
gttcccagtacccacataaagcagttcgccaactgcctttaagtttaaca
actcagggcctaatgactttgtctggcctcctcaggcacctacaagctgt
gcatacatacacataaaataaaataaatattttaagtaaaaacaaacaaa
caaaatatactgctatttttaaagtggtttagcaccatgttaaaatgcag
ttttgctgtgcctctggtacttgagctcagccctcacgtctctgcccatc
cccagccagccatgctccctagtatagcagagatggggctaactgcttca
cacaccctggctgttcctgccctgcactggccctggcgtctcgatggctc
cttccctctcttcacaccactaaaccttctgtcaggctaggccaggtttg
gggaggcaccatgggctgagctcagttgtggaagacttgagaactgaggg
ccacatcaatgtctccaggaaaaagccagcttctccgggccaggaatgac
attgggaagttctcatgatacccttacagggatgtggcttcttatagatg
aggaaactgacgcacagaaaagatgaatcagtgcagctctatctctgggt
tgtatcctccaacctgaggaggatcgtgacccacagctcttttcttcgag
gggcaaggcatctcgggtcagacaaaggcattatctacctgatctttctt
act
gaattcagaatcacaagagatacacctctgattgtgtctataggagtttc
tagattgggttatctggagaaggaagacccacactgaatatggacggcac
catcccatgggctggggacctgggccaaataaaaaggagaaagtgagctg
agcaccagtgttctctccgattcctcgctgtggatgcaatgtgagcagct
gcctcatgttccggccaccatgccttcccaccatgatggactgtgtcctc
aaactgggagccagaataaaacccacttcctttagtggttccttgtgtgg
tatttgtcccaacaaagagacaaggaccaagcacacttgaggaacggtga
gctgcgatgctgaggtgactctagggacggtatcttcagtaccatgtatg
tagccagagtaattcaccttccaggccctggtgaagaaggcatgcagtcc
cgactccctgctccaaaggcctttagctctgcatcacaagtattcccatc
tctgcccttctcacagacagcaaccatgcatcttccataggaatagccca
tgtttgatacttactatctaccatagggctatgggtgtccacttggtgag
ttgtggtctccacccagcctgcctgatgctatcaacatcccttttactga
ctaactgtgagacccctggaggcaagaactcaggggaaagactatagaca
gttctgtctcctgctcagctcaaagatggcagaggaagccctgaaggtag
gggatctgttttccccatgcagcccagagttggtctagaagcaagagagt
ccagtatgggttagagcaagctgactttcggtgcagactcctgacttggt
gtttgaggctctggagacagctctttcccagcaccactgccctttactca
gccatcgcaaggctcaaggttcaccaagtacttttttccaagttctcagt
gagcatccagtctcttgtgttggcagccactctccttgattgccaccgac
ttcccagagtcaactgacccagacacctaatgagacttcaggatggagag
ctcaagagtgagctgttcttagtaagaaagacctcacgatgggacagtat
gtggtcaggcacactcataactctctctgaagactgatagccagtctctg
g
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_151963956_151965029
seq2: B6Ng01-060D22.b_78_1149

seq1  AAGAGAAGTATTTCCTGCCAGCTGTCCTCTGGCTTCCACACTCACACGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAAGTATTTCCTGCCAGCTGTCCTCTGGCTTCCACACTCACACGCC  50

seq1  ACTCACTCTCATACACACCACACACTCACACACACACACACACACACACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACTCTCATACACACCACACACTCACACACACACACACACACACACA  100

seq1  CACACTCACACACACATCACACACTCTCACATGTACTCATTCAAACACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTCACACACACATCACACACTCTCACATGTACTCATTCAAACACAC  150

seq1  TCATACAGACTCACATGCTCACACACCCCACACATACTCATTCACATATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATACAGACTCACATGCTCACACACCCCACACATACTCATTCACATATG  200

seq1  CATACTTACATTCACACTCTTACTCACATGCACACTTGCTCCCACAGACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTTACATTCACACTCTTACTCACATGCACACTTGCTCCCACAGACT  250

seq1  CATGCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTACACACACACACACATTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTACACACACACACACATTTT  300

seq1  TTTAATGAGGCTGGAGAGATGGCTCAGCAGCTAACAACTCACACTGCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATGAGGCTGGAGAGATGGCTCAGCAGCTAACAACTCACACTGCTCC  350

seq1  TGCAGAGGACCTGAATCTGGTTCCCAGTACCCACATAAAGCAGTTCGCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGAGGACCTGAATCTGGTTCCCAGTACCCACATAAAGCAGTTCGCCA  400

seq1  ACTGCCTTTAAGTTTAACAACTCAGGGCCTAATGACTTTGTCTGGCCTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCCTTTAAGTTTAACAACTCAGGGCCTAATGACTTTGTCTGGCCTCC  450

seq1  TCAGGCACCTACAAGCTGTGCATACATACACATAAAATAAAATAAATATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGCACCTACAAGCTGTGCATACATACACATAAAATAAAATAAATATT  500

seq1  TTAAGTAAAAACAAACAAACAAAATATACTGCTATTTTTAAAGTGGTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTAAAAACAAACAAACAAAATATACTGCTATTTTTAAAGTGGTTTA  550

seq1  GCACCATGTTAAAATGCAGTTTTGCTGTGCCTCTGGTACTTGAGCTCAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCATGTTAAAATGCAGTTTTGCTGTGCCTCTGGTACTTGAGCTCAGC  600

seq1  CCTCACGTCTCTGCCCATCCCCAGCCAGCCATGCTCCCTAGTATAGCAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCACGTCTCTGCCCATCCCCAGCCAGCCATGCTCCCTAGTATAGCAGA  650

seq1  GATGGGGCTAACTGCTTCACACACCCTGGCTGTTCCTGCCCTGCACTGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGGCTAACTGCTTCACACACCCTGGCTGTTCCTGCCCTGCACTGGC  700

seq1  CCTGGCGTCTCGATGGCTCCTTCCCTCTCTTCACACCACTAAACCTTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCGTCTCGATGGCTCCTTCCCTCTCTTCACACCACTAAACCTTCTG  750

seq1  TCAGGGCTAGGCCAGGTTTGGGGAGGCACCATGGGCTGAGCTCAGGTTGT  800
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TCA-GGCTAGGCCAGGTTTGGGGAGGCACCATGGGCTGAGCTCA-GTTGT  798

seq1  GGAAGACTTGAGAACTGA-GGCCACATCAATGTCCCCAGGAAAAAGCCAG  849
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GGAAGACTTGAGAACTGAGGGCCACATCAATGTCTCCAGGAAAAAGCCAG  848

seq1  CTTCCCCGGGCCAGGAATGACATTGGGAAGTTCTCATGACTACCCTTACA  899
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CTTCTCCGGGCCAGGAATGACATTGGGAAGTTCTCATGA-TACCCTTACA  897

seq1  GGGATGTGGCTTCTTATAGATGAGGAAACTGACGCACAG-AAAGATGAAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GGGATGTGGCTTCTTATAGATGAGGAAACTGACGCACAGAAAAGATGAAT  947

seq1  CAGTGCAGCCCTACCCCTGGGTGGTACCCTCCAACCTGAGGAGGATCGTG  998
      ||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCAGCTCTATCTCTGGGTTGTATCCTCCAACCTGAGGAGGATCGTG  997

seq1  ACCCACAGC-CCTTTCCTCGAGGGGCAAGGCACCTCGGGTCACACACAGG  1047
      ||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||
seq2  ACCCACAGCTCTTTTCTTCGAGGGGCAAGGCATCTCGGGTCAGACAAAGG  1047

seq1  CATTATCTACCCCTGATCTTTCTTACT  1074
      |||||||||  ||||||||||||||||
seq2  CATTATCTA--CCTGATCTTTCTTACT  1072

seq1: chr7_152141917_152143080
seq2: B6Ng01-060D22.g_67_1217 (reverse)

seq1  CCAGAGACTGGGCTTAACTGACCTCATGGGAGAGTTATGGAGTGTGGCTT  50
      |||||||||||   || | | | ||| | ||||||||| ||||||| || 
seq2  CCAGAGACTGG--CTATCAGTCTTCA-GAGAGAGTTAT-GAGTGTGCCT-  45

seq1  GTACCACATAACTGGTCCCACTGTGAGGTCTTTCTTACTTTAGGACAGGC  100
        ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| | || ||||  
seq2  -GACCACAT-ACT-GTCCCATCGTGAGGTCTTTCTTAC-TAAGAACAG--  89

seq1  TGTCACTCTGTGGCTCTCCCATCCTGAAGTCTCATGTGGTGTTCTGGGTC  150
        |||||||   ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||
seq2  -CTCACTCTTGAGCTCT-CCATCCTGAAGTCTCATTAGGTG-TCTGGGTC  136

seq1  AGTTGGCTTCTGTGGAGTTGGTGGCAATTCAAGG-GGGTGGCTGCCAACA  199
      ||||| | |||| | ||| |||||||| |||||| | |||||||||||||
seq2  AGTTGAC-TCTGGGAAGTCGGTGGCAA-TCAAGGAGAGTGGCTGCCAACA  184

seq1  CAAGAGGCTGGATGCTCACTGAGAACTTGG-AAAAAGTACTTGGTGAACC  248
      |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGACTGGATGCTCACTGAGAACTTGGAAAAAAGTACTTGGTGAACC  234

seq1  TTGGGCCTTGCGATGGCTGGGT-AAGGGCAGTGGTGCTGGGGAAAGAGCT  297
      ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTGAGCCTTGCGATGGCTGAGTAAAGGGCAGTGGTGCT-GGGAAAGAGCT  283

seq1  GTCTCCAGAGCCTCAAACACCAAGTCAGGAGTCTGCACCGAAAGTCAGCT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCAGAGCCTCAAACACCAAGTCAGGAGTCTGCACCGAAAGTCAGCT  333

seq1  TGCTCTAACCCATACTGGACTCTCTTGCTTCTAGACCAACTCTGGGCTGC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTAACCCATACTGGACTCTCTTGCTTCTAGACCAACTCTGGGCTGC  383

seq1  ATGGGGAAAACAGAT-CCCTACCTTCAGGGCTTCCTCTGCCATCTTTGAG  446
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGAAAACAGATCCCCTACCTTCAGGGCTTCCTCTGCCATCTTTGAG  433

seq1  CTGAGCAGGAGACAGAACTGTCTATAGTCTTTCCCCTGAGTTCTTGCCTC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCAGGAGACAGAACTGTCTATAGTCTTTCCCCTGAGTTCTTGCCTC  483

seq1  CAGGGGTCTCACAGTTAGTCAGTAAAAGGGATGTTGATAGCATCAGGCAG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGTCTCACAGTTAGTCAGTAAAAGGGATGTTGATAGCATCAGGCAG  533

seq1  GCTGGGTGGAGACCACAACTCACCAAGTGGACACCCATAGCCCTATGGTA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGTGGAGACCACAACTCACCAAGTGGACACCCATAGCCCTATGGTA  583

seq1  GATAGTAAGTATCAAACATGGGCTATTCCTATGGAAGATGCATGGTTGCT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGTAAGTATCAAACATGGGCTATTCCTATGGAAGATGCATGGTTGCT  633

seq1  GTCTGTGAGAAGGGCAGAGATGGGAATACTTGTGATGCAGAGCTAAAGGC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTGAGAAGGGCAGAGATGGGAATACTTGTGATGCAGAGCTAAAGGC  683

seq1  CTTTGGAGCAGGGAGTCGGGACTGCATGCCTTCTTCACCAGGGCCTGGAA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGAGCAGGGAGTCGGGACTGCATGCCTTCTTCACCAGGGCCTGGAA  733

seq1  GGTGAATTACTCTGGCTACATACATGGTACTGAAGATACCGTCCCTAGAG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAATTACTCTGGCTACATACATGGTACTGAAGATACCGTCCCTAGAG  783

seq1  TCACCTCAGCATCGCAGCTCACCGTTCCTCAAGTGTGCTTGGTCCTTGTC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTCAGCATCGCAGCTCACCGTTCCTCAAGTGTGCTTGGTCCTTGTC  833

seq1  TCTTTGTTGGGACAAATACCACACAAGGAACCACTAAAGGAAGTGGGTTT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGTTGGGACAAATACCACACAAGGAACCACTAAAGGAAGTGGGTTT  883

seq1  TATTCTGGCTCCCAGTTTGAGGACACAGTCCATCATGGTGGGAAGGCATG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTGGCTCCCAGTTTGAGGACACAGTCCATCATGGTGGGAAGGCATG  933

seq1  GTGGCCGGAACATGAGGCAGCTGCTCACATTGCATCCACAGCGAGGAATC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCGGAACATGAGGCAGCTGCTCACATTGCATCCACAGCGAGGAATC  983

seq1  GGAGAGAACACTGGTGCTCAGCTCACTTTCTCCTTTTTATTTGGCCCAGG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGAACACTGGTGCTCAGCTCACTTTCTCCTTTTTATTTGGCCCAGG  1033

seq1  TCCCCAGCCCATGGGATGGTGCCGTCCATATTCAGTGTGGGTCTTCCTTC  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCAGCCCATGGGATGGTGCCGTCCATATTCAGTGTGGGTCTTCCTTC  1083

seq1  TCCAGATAACCCAATCTAGAAACTCCTATAGACACAATCAGAGGTGTATC  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGATAACCCAATCTAGAAACTCCTATAGACACAATCAGAGGTGTATC  1133

seq1  TCTTGTGATTCTGAATTC  1164
      ||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTGATTCTGAATTC  1151