BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-099C17
Chromosome7 (Build37)
Map Location 140,934,512 - 141,095,936
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDhx32, Fank1, Adam12
Upstream geneA930008G19Rik, 2010208K18Rik, C430003P19Rik, Zranb1, Ctbp2, LOC668747, 4930404H21Rik, LOC100043237, 2700050L05Rik, Mmp21, Uros, Bccip, LOC100043695
Downstream geneA130023I24Rik, 4933400E14Rik, LOC100043248, LOC100043699, LOC668750, Dock1, B830028B13Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-099C17.bB6Ng01-099C17.g
ACCDH909037DH909038
length1,1351,086
definitionDH909037|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-099C17, 5' end.DH909038|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-099C17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(141,094,799 - 141,095,936)(140,934,512 - 140,935,614)
sequence
gaattccctcatcatgaggcttcttagacctcactttcagcaatgccacc
tctgcactgtgctaaactgggactaacagaccgcatgacccaagaggagt
tgagcacaatgattttctcccagagttgtcagttctcacagaagtggctc
tttcaaagcaaccacccaaaagctttctgtcttgtgaaactaagagactc
ttcccctttaaacaccagtcacaggaactccatatcctcactctgagctg
tgtctgcctggagcctttcagagacaagtgacaccaataactgcatgagt
ttcctgtcattacacacagggacctgggatctattccatgcaggtgtgga
cagtatctagaggtgactcttgcttggcagcagaaattaaatccactgac
actttaaagttccctgggtaccatcccacacaacatgactcagatgtgcc
tccgtggccaatcctgctatgcttgtccaaatctatcacactccatggat
ggggcacattggctaactttatatttaaagaatgagtgtcatctttcttg
aaagcatttaatcctccataagctcaactcattctcttgtccaaatgtgc
ctcttggaacctgggtttctcatccatggttgtatgtgcttatacctgcc
tgtacctgctatgtgcacatcctaggcgctcatgtgtgggccgtcagaga
acaacctgcagggcttagttttctttccaccttgctgaggcagggcctat
ggtttgtacattgagtctctgtctccatcttttcacagaggaatgctagg
attattagatgtgcctagatgtgtcaggagccacttccctggacttacag
tgtgcctatgttactgttgggaggacggagagcagaacaaggattagttg
gtagagtatttacctagtatgcatgaagtcttaggttcacagaaagatag
catggttgatataagcctataatcccaggcttcagaggttagaggcagag
atcaaaaaattcaaggctagtcaagtgtagtgctcttacttagcagaagt
gggtggatctctatgagttcaggatcagcttgtctacatagagtcttgca
taagagattcaggacatgcagaagcttcatagtga
gaattcccatgaacaccatgtaaaggactccacgtataccctggctttct
ttgtggcactggttacatttttttcccttggagccaagatttctttgagg
tgatagactgtagggtcacagcacagaaccccacacaaacacattttaaa
tatcccttgtacaagctcagtgagtcctcaaggctcaccacaggagccct
ggtcagaggcctctccttacagaggtctgtaaccagtgatcacaacaacc
cagtgtcctgctgttaatcacaagcctatgcaaactcactgttacaaatg
gtaataaatgcatggaacacttgccggtggctttgtaaactacacagtat
tgtcatggaacatccttactggacagttacctcccttcctgtcattggtg
gaactctgggtactgccacatactttacaaggaaagaactcaggctcatg
gcccagccacgcacattaagattctcactgggggttgctggtgacaacta
tgtcaccaaggtgctaacatcattaagtttgaaatgttgctcaaataaga
gcaaacagaagttgctacacagtaatcatcagcttggagtacttgtgcaa
accggctgccatgcctgatggagcagggagcctattagtgactttgtttc
tctgagatgttggtctcaaattcaaaatcttccagcttcagcctccttca
ttggtgatgtaagattccccctgcccaggggcctttgagatattaaaaaa
aaaaattaaaggctccatggtaatcatctactaccatcaagacttctttc
tgatactgtttgtatatgcatacagcttactgtttggagaggaagattta
tgaattctccgcctctcccagaacttaagactgaggttcttggatgggtc
tgctggcaagctgagccttggctgacatttagcttggatttggacttgcc
cagctgacagaggtggctttatcagcctagatcatgtgacacgtgcttct
ttctctgagagaccctctcacagctcactgctgctctgctccgacctgct
ccctgggatagctttagttggaggagacagttctga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_141094799_141095936
seq2: B6Ng01-099C17.b_46_1180 (reverse)

seq1  TCACTATGAAGC-TCTGACTGTCCTGGATCTC-TATGC-AGACTCTATGT  47
      |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||
seq2  TCACTATGAAGCTTCTGCATGTCCTGAATCTCTTATGCAAGACTCTATGT  50

seq1  AGACCAGGCTGATCTTGAACTCATAGAGATCCACCCACTTCTGCCTAGGT  97
      ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
seq2  AGA-CAAGCTGATCCTGAACTCATAGAGATCCACCCACTTCTG-CTAAGT  98

seq1  AAGAGCCACTACACCTGACTAGCCTTGAATTTTTTGATCTTCCTGCCTCT  147
      ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||
seq2  AAGAG-CACTACACTTGACTAGCCTTGAATTTTTTGATCT--CTGCCTCT  145

seq1  AACCTCCTGAAGGCTGGGATTATAGGCTTATATC-ACCATGCTATCTTTC  196
      ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AACCT-CTGAAGCCTGGGATTATAGGCTTATATCAACCATGCTATCTTTC  194

seq1  TGTGAACCCTAGGACTTCATGCATACTAGGTAAATACTCTACCAACTAAT  246
      |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAA-CCTAAGACTTCATGCATACTAGGTAAATACTCTACCAACTAAT  243

seq1  CCTTGTTCTGCTCTCCGTCCT-CCAACAGTAACATTAGGCACACTGTAAG  295
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CCTTGTTCTGCTCTCCGTCCTCCCAACAGTAACA-TAGGCACACTGTAAG  292

seq1  TCCAGGGAAGTGGCTCCTGACACATCTAGGCACATCTAATAATCCTAGCA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGGAAGTGGCTCCTGACACATCTAGGCACATCTAATAATCCTAGCA  342

seq1  TTCCTCTGTGAAAAGATGGAGACAGAGACTCAATGTACAAACCATAGGCC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCTGTGAAAAGATGGAGACAGAGACTCAATGTACAAACCATAGGCC  392

seq1  CTGCCTCAGCAAGGTGGAAAGAAAACTAAGCCCTGCAGGTTGTTCTCTGA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCAGCAAGGTGGAAAGAAAACTAAGCCCTGCAGGTTGTTCTCTGA  442

seq1  CGGCCCACACATGAGCGCCTAGGATGTGCACATAGCAGGTACAGGCAGGT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCCCACACATGAGCGCCTAGGATGTGCACATAGCAGGTACAGGCAGGT  492

seq1  ATAAGCACATACAACCATGGATGAGAAACCCAGGTTCCAAGAGGCACATT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCACATACAACCATGGATGAGAAACCCAGGTTCCAAGAGGCACATT  542

seq1  TGGACAAGAGAATGAGTTGAGCTTATGGAGGATTAAATGCTTTCAAGAAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACAAGAGAATGAGTTGAGCTTATGGAGGATTAAATGCTTTCAAGAAA  592

seq1  GATGACACTCATTCTTTAAATATAAAGTTAGCCAATGTGCCCCATCCATG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACACTCATTCTTTAAATATAAAGTTAGCCAATGTGCCCCATCCATG  642

seq1  GAGTGTGATAGATTTGGACAAGCATAGCAGGATTGGCCACGGAGGCACAT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTGATAGATTTGGACAAGCATAGCAGGATTGGCCACGGAGGCACAT  692

seq1  CTGAGTCATGTTGTGTGGGATGGTACCCAGGGAACTTTAAAGTGTCAGTG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTCATGTTGTGTGGGATGGTACCCAGGGAACTTTAAAGTGTCAGTG  742

seq1  GATTTAATTTCTGCTGCCAAGCAAGAGTCACCTCTAGATACTGTCCACAC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTAATTTCTGCTGCCAAGCAAGAGTCACCTCTAGATACTGTCCACAC  792

seq1  CTGCATGGAATAGATCCCAGGTCCCTGTGTGTAATGACAGGAAACTCATG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATGGAATAGATCCCAGGTCCCTGTGTGTAATGACAGGAAACTCATG  842

seq1  CAGTTATTGGTGTCACTTGTCTCTGAAAGGCTCCAGGCAGACACAGCTCA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTATTGGTGTCACTTGTCTCTGAAAGGCTCCAGGCAGACACAGCTCA  892

seq1  GAGTGAGGATATGGAGTTCCTGTGACTGGTGTTTAAAGGGGAAGAGTCTC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGAGGATATGGAGTTCCTGTGACTGGTGTTTAAAGGGGAAGAGTCTC  942

seq1  TTAGTTTCACAAGACAGAAAGCTTTTGGGTGGTTGCTTTGAAAGAGCCAC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTTTCACAAGACAGAAAGCTTTTGGGTGGTTGCTTTGAAAGAGCCAC  992

seq1  TTCTGTGAGAACTGACAACTCTGGGAGAAAATCATTGTGCTCAACTCCTC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTGAGAACTGACAACTCTGGGAGAAAATCATTGTGCTCAACTCCTC  1042

seq1  TTGGGTCATGCGGTCTGTTAGTCCCAGTTTAGCACAGTGCAGAGGTGGCA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTCATGCGGTCTGTTAGTCCCAGTTTAGCACAGTGCAGAGGTGGCA  1092

seq1  TTGCTGAAAGAGAGGTCTAAGAAGCCTCATGATGAGGGAATTC  1138
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGAAAGTGAGGTCTAAGAAGCCTCATGATGAGGGAATTC  1135

seq1: chr7_140934512_140935614
seq2: B6Ng01-099C17.g_68_1153

seq1  GAATTCCCATGAACACCATGTAAAGGACTCCACGTATACCCTGGCTTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCATGAACACCATGTAAAGGACTCCACGTATACCCTGGCTTTCT  50

seq1  TTGTGGCACTGGTTACATTTTTTTCCCTTGGAGCCAAGATTTCTTTGAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGCACTGGTTACATTTTTTTCCCTTGGAGCCAAGATTTCTTTGAGG  100

seq1  TGATAGACTGTAGGGTCACAGCACAGAACCCCACACAAACACATTTTAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGACTGTAGGGTCACAGCACAGAACCCCACACAAACACATTTTAAA  150

seq1  TATCCCTTGTACAAGCTCAGTGAGTCCTCAAGGCTCACCACAGGAGCCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCCTTGTACAAGCTCAGTGAGTCCTCAAGGCTCACCACAGGAGCCCT  200

seq1  GGTCAGAGGCCTCTCCTTACAGAGGTCTGTAACCAGTGATCACAACAACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAGAGGCCTCTCCTTACAGAGGTCTGTAACCAGTGATCACAACAACC  250

seq1  CAGTGTCCTGCTGTTAATCACAAGCCTATGCAAACTCACTGTTACAAATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTCCTGCTGTTAATCACAAGCCTATGCAAACTCACTGTTACAAATG  300

seq1  GTAATAAATGCATGGAACACTTGCCGGTGGCTTTGTAAACTACACAGTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATAAATGCATGGAACACTTGCCGGTGGCTTTGTAAACTACACAGTAT  350

seq1  TGTCATGGAACATCCTTACTGGACAGTTACCTCCCTTCCTGTCATTGGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATGGAACATCCTTACTGGACAGTTACCTCCCTTCCTGTCATTGGTG  400

seq1  GAACTCTGGGTACTGCCACATACTTTACAAGGAAAGAACTCAGGCTCATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTCTGGGTACTGCCACATACTTTACAAGGAAAGAACTCAGGCTCATG  450

seq1  GCCCAGCCACGCACATTAAGATTCTCACTGGGGGTTGCTGGTGACAACTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGCCACGCACATTAAGATTCTCACTGGGGGTTGCTGGTGACAACTA  500

seq1  TGTCACCAAGGTGCTAACATCATTAAGTTTGAAATGTTGCTCAAATAAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACCAAGGTGCTAACATCATTAAGTTTGAAATGTTGCTCAAATAAGA  550

seq1  GCAAACAGAAGTTGCTACACAGTAATCATCAGCTTGGAGTACTTGTGCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACAGAAGTTGCTACACAGTAATCATCAGCTTGGAGTACTTGTGCAA  600

seq1  ACCGGCTGCCATGCCTGATGGAGCAGGGAGCCTATTAGTGACTTTGTTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGGCTGCCATGCCTGATGGAGCAGGGAGCCTATTAGTGACTTTGTTTC  650

seq1  TCTGAGATGTTGGTCTCAAATTCAAAATCTTCCAGCTTCAGCCTCCTTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGATGTTGGTCTCAAATTCAAAATCTTCCAGCTTCAGCCTCCTTCA  700

seq1  TTGGTGATGTAAGATTCCCCCTGCCCAGGGGCCTTTGAGATATTAAAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGATGTAAGATTCCCCCTGCCCAGGGGCCTTTGAGATATTAAAAAA  750

seq1  AAAAATTAAAGGCTCCATGGTAATCATCTACTACCATCAAGACTTCTTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTAAAGGCTCCATGGTAATCATCTACTACCATCAAGACTTCTTTC  800

seq1  TGATACTGTTTGTATATGCATACAGCTTACTGTTTGGAGAGGAAGATTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATACTGTTTGTATATGCATACAGCTTACTGTTTGGAGAGGAAGATTTA  850

seq1  TGAATTCTCCGCCTCTCCCAGAACTTAAGACTGAGGTTCTTGGATGGGTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTCTCCGCCTCTCCCAGAACTTAAGACTGAGGTTCTTGGATGGGTC  900

seq1  TGCTGGCAAAGCTGAGCCTTGGCTGACATTTAGCTTGGATTTGGACTTGC  950
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGC-AAGCTGAGCCTTGGCTGACATTTAGCTTGGATTTGGACTTGC  949

seq1  CCCAAGCTGACAGAGGTGGCTTTATCAGCCTAGGAATCATGTGAACACGT  1000
      ||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||
seq2  CC--AGCTGACAGAGGTGGCTTTATCAGCCTAG--ATCATGTG-ACACGT  994

seq1  GCTTTCTTTCCTCTGAGGAGACCCTCTTCACAGCTCACTTGGCTGGCTCT  1050
      || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||
seq2  GC-TTCTTT-CTCTGA-GAGACCCTC-TCACAGCTCACT--GCT-GCTCT  1037

seq1  GCTCCCGACCTGCTTCCCTGTGATAAGCTTTAGTTGTGAGGAGACAGTTC  1100
      ||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||
seq2  GCT-CCGACCTGC-TCCCTGGGAT-AGCTTTAGTTG-GAGGAGACAGTTC  1083

seq1  TGA  1103
      |||
seq2  TGA  1086