BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-112I24
Chromosome7 (Build37)
Map Location 105,243,956 - 105,245,023
singlet/doubletsinglet
Overlap geneMyo7a
Upstream geneGab2, LOC100040457, Usp35, EG622320, Alg8, Ndufc2, Thrsp, Kctd14, Ints4, 1810020D17Rik, Rsf1, LOC622994, LOC100040211, Clns1a, Aqp11, LOC100040594, Pak1, Gdpd4
Downstream geneCapn5, Omp, B3gnt6, Phca, Tsku, LOC100040269, Gucy2d, LOC100040721, EG434215, A630091E08Rik, 2210018M11Rik, LOC100040769, Prkrir, Wnt11, LOC666978, Uvrag, EG666529
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-112I24.bB6Ng01-112I24.g
ACCDH918594DH918595
length1,081975
definitionDH918594|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112I24, 5' end.DH918595|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112I24, 3' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattccaactctatctccctggagagaacctatttgggatttaaggtgt
tgtgggtgggacaggaccttctcttctgtaactagctagcgggcacactc
actctccctctgtctcacacgcagacataccacacaccatgtataccacg
tacaccacataccatgtacaacacatataccacacatacaccatacacac
acactcagacaatacacatataccacacacacaccaaataaacagataca
ccacacatgtgatacattccacacaaacacacacacatatgcacacacat
gagcacatacgtacgcacaccatacataccacacacacaggcacatgcac
acgcacacacacacatgcacacatgcacaactataccacacacaccacac
acacactcctgcacacacaccacacacatactcctgagcaggctgtgtct
acacttcccctctgtggttcacgcatggtgacagttgaagggaactcccc
caggagtgggcagcaccctggagctgtgtggatctgggtaaggtgttggt
gctgtgagctgtggtgaaaaggagtgcttgggtgagctgtatagtgtcca
gctcttactcatgtcagggtgccccagagaagaccacaggaccattctac
atatcctgggcattgccctcctgacatcccctgacacttccctgtccctc
ccattttgtgccatgccccctctcctgcccagggtaactgcatcacctgt
gagggccgcgtggacagtcaggagtatgcccaacatcccgctctgccatg
aaagttctcatggttcacagacacggagaactggagatctcgaagcttct
ggctgccattctacacatgggcaatctgcatattgaagggtgaggcccca
cggtgccacataccactcaagggtagcatggcaccccaccttctaggggt
tggcagttgctgtctactgcagcgggcattacattgggaattctcccagc
ctgacttcaatctcaagggtggaacacagtggcagttccccttccccaaa
gctggcagctgaagggttttcaagagtaaca
gaattccaggaagtctttactttctttctttattgcttccctgatcaagt
tatcattgattagagagttcttcagttatcatcggtatgtaggctttctg
ttgtttttgttgttattgaagaccagccttaggccatggtgatctgatca
aatgcatagaaattatttcaatcttcttgtattggttcaggtttgttttg
tgaccaattatacggtcaattttggagaaggtaccatgaggtgctgagaa
gaaggtttatgcttttgttttagggtgaaatgttctgtagatatctgtta
aatccatttggttcataacctctattagtttcaccatgtctctgtttagt
ttctgttttaatgacctattggtgagagtggggtgttgaaggcttgcact
attactgtttggggttcaatgtatgttttgagctttagtagaatttattt
tataaatatgggtgcccttgcattttgggcatagatgttcagaattaaga
ctttctcttggtgaagttttcctttgacaaacataaaatgtccttcccat
cttgcttgataacttttggttaaaagtccattttattggatattagaatg
gctactcccacttgtttctgtgaccatttgtttggaagactttttcccag
cctttttctctgaggtagtgtctgtctttgtcattaaggtatgtttcttg
tatgcagcaaaatgttggatttttcttgagtgttagcttatgtctttttt
attggagaattgaatccattgatatcgagacagatgattgttggtccctc
ttgtgtttgttgttgtaagtggcattatgtgtatgtgattctttttttgg
ttttgttatgagaagataatttattgttttttttctttggtgtagatact
ctcatatgttgggagttttcttttttggaatcctctgtaggggtttgaat
tgggagataagatattgtttaaatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_105243956_105245023
seq2: B6Ng01-112I24.b_47_1127 (reverse)

seq1  TGTTAACTC-TGAAAACC--TCAGCTGCCAGCTCTGGGGA--GGGGACTG  45
      |||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||| ||||
seq2  TGTT-ACTCTTGAAAACCCTTCAGCTGCCAGCTTTGGGGAAGGGGAACTG  49

seq1  CCACTGTGTACCACCCTTGAGACTGAAGTCAGGCTGGGAGAAT--CCCAT  93
      ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||
seq2  CCACTGTGTTCCACCCTTGAGATTGAAGTCAGGCTGGGAGAATTCCCAAT  99

seq1  GTAATGCCCGCTGCAGTAGACAGC-ACTGCCAACCCCTAGAAGGT-GGGT  141
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
seq2  GTAATGCCCGCTGCAGTAGACAGCAACTGCCAACCCCTAGAAGGTGGGGT  149

seq1  GCCATGCTACCC-TGAGTGGTATGTGGCACCGTGGGGCCTCACCC-TCAT  189
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| 
seq2  GCCATGCTACCCTTGAGTGGTATGTGGCACCGTGGGGCCTCACCCTTCAA  199

seq1  ACTGCAGATTGCCCATGTGTAGGATGGCAGCCAGAAGCTTCGAGATCTCC  239
        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TATGCAGATTGCCCATGTGTAGAATGGCAGCCAGAAGCTTCGAGATCT-C  248

seq1  CAGTTCTCCGTGTCTGTGAA-CATGAGAACCTTCATGGCAGAGC-GGATG  287
      |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||
seq2  CAGTTCTCCGTGTCTGTGAACCATGAGAACTTTCATGGCAGAGCGGGATG  298

seq1  TT-GGCATACTCCTGACTGTCCACGCGGCCCTCACAGGTGATGCAGTTAC  336
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCATACTCCTGACTGTCCACGCGGCCCTCACAGGTGATGCAGTTAC  348

seq1  CCTGGGCAGGAGAGGGGGCATGGCACAAAATGGGA-GGACAGGGAAGTGT  385
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CCTGGGCAGGAGAGGGGGCATGGCACAAAATGGGAGGGACAGGGAAGTGT  398

seq1  CAGGGGATGTCAGGAGGGCAATGCCCAGGATATGTAGAATGGTCCTGTGG  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGATGTCAGGAGGGCAATGCCCAGGATATGTAGAATGGTCCTGTGG  448

seq1  TCTTCTCTGGGGCACCCTGACATGAGTAAGAGCTGGACACTATACAGCTC  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTCTGGGGCACCCTGACATGAGTAAGAGCTGGACACTATACAGCTC  498

seq1  ACCCAAGCACTCCTTTTCACCACAGCTCACAGCACCAACACCTTACCCAG  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAAGCACTCCTTTTCACCACAGCTCACAGCACCAACACCTTACCCAG  548

seq1  ATCCACACAGCTCCAGGGTGCTGCCCACTCCTGGGGGAGTTCCCTTCAAC  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCACACAGCTCCAGGGTGCTGCCCACTCCTGGGGGAGTTCCCTTCAAC  598

seq1  TGTCACCATGCGTGAACCACAGAGGGGAAGTGTAGACACAGCCTGCTCAG  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACCATGCGTGAACCACAGAGGGGAAGTGTAGACACAGCCTGCTCAG  648

seq1  GAGTATGTGTGTGGTGTGTGTGCAGGAGTGTGTGTGTGGTGTGTGTGGTA  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTATGTGTGTGGTGTGTGTGCAGGAGTGTGTGTGTGGTGTGTGTGGTA  698

seq1  TAGTTGTGCATGTGTGCATGTGTGTGTGTGCGTGTGCATGTGCCTGTGTG  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTGTGCATGTGTGCATGTGTGTGTGTGCGTGTGCATGTGCCTGTGTG  748

seq1  TGTGGTATGTATGGTGTGCGTACGTATGTGCTCATGTGTGTGCATATGTG  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTATGTATGGTGTGCGTACGTATGTGCTCATGTGTGTGCATATGTG  798

seq1  TGTGTGTTTGTGTGGAATGTATCACATGTGTGGTGTATCTGTTTATTTGG  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTTTGTGTGGAATGTATCACATGTGTGGTGTATCTGTTTATTTGG  848

seq1  TGTGTGTGTGGTATATGTGTATTGTCTGAGTGTGTGTGTATGGTGTATGT  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGGTATATGTGTATTGTCTGAGTGTGTGTGTATGGTGTATGT  898

seq1  GTGGTATATGTGTTGTACATGGTATGTGGTGTACGTGGTATACATGGTGT  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTATATGTGTTGTACATGGTATGTGGTGTACGTGGTATACATGGTGT  948

seq1  GTGGTATGTCTGCGTGTGAGACAGAGGGAGAGTGAGTGTGCCCGCTAGCT  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTATGTCTGCGTGTGAGACAGAGGGAGAGTGAGTGTGCCCGCTAGCT  998

seq1  AGTTACAGAAGAGAAGGTCCTGTCCCACCCACAACACCTTAAATCCCAAA  1035
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACAGAAGAGAAGGTCCTGTCCCACCCACAACACCTTAAATCCCAAA  1048

seq1  TAGGTTCTCTCCAGGGAGATAGAGTTGGAATTC  1068
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTCTCTCCAGGGAGATAGAGTTGGAATTC  1081