BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-114D10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 75,406,046 - 75,535,734
singlet/doubletdoublet
Overlap geneC330024D12Rik, EG434197
Upstream geneMef2a, EG665304, Lrrc28, Ttc23, Dmn, LOC665319, LOC100041771, Igf1r
Downstream geneLOC100041800, EG384639, Arrdc4, LOC384741
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-114D10.bB6Ng01-114D10.g
ACCDH919790DH919791
length1,195716
definitionDH919790|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114D10, 5' end.DH919791|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114D10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,406,046 - 75,407,054)(75,535,019 - 75,535,734)
sequence
gaattcatttcagcatataattatgttatagcccatcactgtgggaaagt
tgaggcaggacttcaaacaacagtcacatagcatccacagtcaaagagca
gagagatgcacacatgctcacttgcttgtgctcagtttgatttctcctct
ctcctacagctcaaggatctccagcctaaggaatggtaccacctacagtg
ggctgggccttctcatatcaattagccaattgtcttacttgtgggcacag
acatactcacaggccaacattcctaggaaatgttgacatgcccacaggcc
aatcattgcctagggaatggttctgcttatatcaattagcttaactaaga
taatcctccaaaaaaaaaccatgtccacaagccaacccaattcctcaaca
attcttgttaattgatgtgggggaacccagttcactatgggcagtgtcat
tccctaggcattgagtcctgaactataaaagaatggagaaatccaagctg
aacatgagaaagcaaacaagacagcaaatatgtatgcatttctctctgct
cttgactgtggatgtgatgcgaccaattctctgaagttcctgctgctgac
tttcccaccacgatggactgtaacctggaattgtaaacggaaataaactc
ctttatcctttgtcgtttgtttgttttctggatattttattacagccaaa
tgagtctgaaaaggacaccacgtgttaaaatgggggaagaaagtgcggaa
gaagctaatgtgggagtagcaggggaaggcgttttgaggtggaggcaatt
ccaggaagccttgcactggtctaaattgtatagagcggtctgtgtgcacg
tgcacacatactcattcctcaacccctccatcccgttctccttcccttcc
ttctcccctctctctgcttctctctttcttaattgtactgatgtagtaca
ttggattggacattgaagatgtcagcatcagcaaccctagtgaaatttgc
aggagtttctttcttacaatttcttctgatcctatatttctaaaatgaaa
atgtgtggcctcctcctgggggagctagcatgtcagactgaaggagggga
gcctcatctcagcttgggctgcagtaatgagcatcgtcctgtatcagttt
tatctgagaatgactggaggtttgagttccctcacctgacctcag
gaattcacttaggccctgggtggtagaattagattgactcaaatgctttg
tgaagccagatgtctcagatagcttggatatctggggaagaagggaggaa
agactatgagggcagccagtgttttgtcatgtgtgtggctaccaacacat
caggaggtcttcttccttaacttcaggagcacaagctgggaaaggggtgg
aaaaggtgaccaccttcctggagtgcttcctattggccatatactgtact
ttctcgcaggccccttctgggaatcacaaatgagcagagcctctgagtga
tacggccctgtgcctaagtgtcagattgtgtgactccaggatctgaggga
cacttgcatcctgggacacttgctggtgcatatagaagaggcatagcagg
catagatggatgtgttcctgcagaaacagccacttcctggtagttacctg
ggatgacgccgtcaacttggaacatcattgtcctcccagggaggtgagtc
tgaaagcctaaggaacacatgctgtcccaggattacatgtcagcacactg
actcttcccttcccttctcaagcccttttcccccatggtggtcaattaat
caaggaaataattcaatgagtcaaaaatagaagaccatacacaggggact
tctctgtacaaccaaataactgtctgattccaactgattggttgattggt
tggttggttggtgggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_75406046_75407054
seq2: B6Ng01-114D10.b_244_1239

seq1  GGGCTGGGCCTTCTCATATCAATTAGCCAATTGTCTTACTTGTGGGCACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGGGCCTTCTCATATCAATTAGCCAATTGTCTTACTTGTGGGCACA  50

seq1  GACATACTCACAGGCCAACATTCCTAGGAAATGTTGACATGCCCACAGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATACTCACAGGCCAACATTCCTAGGAAATGTTGACATGCCCACAGGC  100

seq1  CAATCATTGCCTAGGGAATGGTTCTGCTTATATCAATTAGCTTAACTAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCATTGCCTAGGGAATGGTTCTGCTTATATCAATTAGCTTAACTAAG  150

seq1  ATAATCCTCCAAAAAAAAACCATGTCCACAAGCCAACCCAATTCCTCAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATCCTCCAAAAAAAAACCATGTCCACAAGCCAACCCAATTCCTCAAC  200

seq1  AATTCTTGTTAATTGATGTGGGGGAACCCAGTTCACTATGGGCAGTGTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTTGTTAATTGATGTGGGGGAACCCAGTTCACTATGGGCAGTGTCA  250

seq1  TTCCCTAGGCATTGAGTCCTGAACTATAAAAGAATGGAGAAATCCAAGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTAGGCATTGAGTCCTGAACTATAAAAGAATGGAGAAATCCAAGCT  300

seq1  GAACATGAGAAAGCAAACAAGACAGCAAATATGTATGCATTTCTCTCTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATGAGAAAGCAAACAAGACAGCAAATATGTATGCATTTCTCTCTGC  350

seq1  TCTTGACTGTGGATGTGATGCGACCAATTCTCTGAAGTTCCTGCTGCTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGACTGTGGATGTGATGCGACCAATTCTCTGAAGTTCCTGCTGCTGA  400

seq1  CTTTCCCACCACGATGGACTGTAACCTGGAATTGTAAACGGAAATAAACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCCACCACGATGGACTGTAACCTGGAATTGTAAACGGAAATAAACT  450

seq1  CCTTTATCCTTTGTCGTTTGTTTGTTTTCTGGATATTTTATTACAGCCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTATCCTTTGTCGTTTGTTTGTTTTCTGGATATTTTATTACAGCCAA  500

seq1  ATGAGTCTGAAAAGGACACCACGTGTTAAAATGGGGGAAGAAAGTGCGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTCTGAAAAGGACACCACGTGTTAAAATGGGGGAAGAAAGTGCGGA  550

seq1  AGAAGCTAAGGTGGGAGTAGCAGGGGAAGGCGTTTTGAGGTGGAGGCAAT  600
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCTAATGTGGGAGTAGCAGGGGAAGGCGTTTTGAGGTGGAGGCAAT  600

seq1  TCCAGGAAGCCTTGCACTGGTCTAAATTGTATAGAGCGGTCTGTGTGCAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGAAGCCTTGCACTGGTCTAAATTGTATAGAGCGGTCTGTGTGCAC  650

seq1  GTGCACACATACTCATTCCTCAACCCCTCCATCCCGTTCTCCTTCCCTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCACACATACTCATTCCTCAACCCCTCCATCCCGTTCTCCTTCCCTTC  700

seq1  CTTCTCCCCCTCTCTCTGCTTCTCTCTTTCTTAATTGTACTGATGTTAGT  750
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CTTCT-CCCCTCTCTCTGCTTCTCTCTTTCTTAATTGTACTGATG-TAGT  748

seq1  ACATTGGATTGGACATTGAAGATGTCAGCATCAGGCAACCCTAGTGAGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
seq2  ACATTGGATTGGACATTGAAGATGTCAGCATCA-GCAACCCTAGTGAAAT  797

seq1  TTGCAAGGAGTTCTCTTTCTTTACAATTTCTTCTTGAT-CTATATTTCTA  849
      |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||
seq2  TTGC-AGGAGTT-TCTTTC-TTACAATTTCTTC-TGATCCTATATTTCTA  843

seq1  AAATGAAAAATGTGTGGCCTCCTCCTGGGGGAGGCTAGCATGTCAGACTG  899
      ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AAATG-AAAATGTGTGGCCTCCTCCTGGGGGA-GCTAGCATGTCAGACTG  891

seq1  AGAGGAGGGGAGCCTCATCTCAGCTTGGGCTGCAGGTAGGGTTGAGCATC  949
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    ||||||||
seq2  A-AGGAGGGGAGCCTCATCTCAGCTTGGGCTGCAGTAA----TGAGCATC  936

seq1  GTCCTG-ATCAGTTTTATCTGGAGTATGACTGAGGGTTTGAG-TCCCTCA  997
      |||||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| |||||||
seq2  GTCCTGTATCAGTTTTATCT-GAGAATGACTGGAGGTTTGAGTTCCCTCA  985

seq1  CCTGACTCTCAG  1009
      |||||| |||||
seq2  CCTGAC-CTCAG  996

seq1: chr7_75535019_75535734
seq2: B6Ng01-114D10.g_68_783 (reverse)

seq1  ACCCACCAACCAACCAACCAATCAACCAATCAGTTGGAATCAGACAGTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCACCAACCAACCAACCAATCAACCAATCAGTTGGAATCAGACAGTTA  50

seq1  TTTGGTTGTACAGAGAAGTCCCCTGTGTATGGTCTTCTATTTTTGACTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTTGTACAGAGAAGTCCCCTGTGTATGGTCTTCTATTTTTGACTCA  100

seq1  TTGAATTATTTCCTTGATTAATTGACCACCATGGGGGAAAAGGGCTTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATTATTTCCTTGATTAATTGACCACCATGGGGGAAAAGGGCTTGAG  150

seq1  AAGGGAAGGGAAGAGTCAGTGTGCTGACATGTAATCCTGGGACAGCATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGAAGGGAAGAGTCAGTGTGCTGACATGTAATCCTGGGACAGCATGT  200

seq1  GTTCCTTAGGCTTTCAGACTCACCTCCCTGGGAGGACAATGATGTTCCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCTTAGGCTTTCAGACTCACCTCCCTGGGAGGACAATGATGTTCCAA  250

seq1  GTTGACGGCGTCATCCCAGGTAACTACCAGGAAGTGGCTGTTTCTGCAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGACGGCGTCATCCCAGGTAACTACCAGGAAGTGGCTGTTTCTGCAGG  300

seq1  AACACATCCATCTATGCCTGCTATGCCTCTTCTATATGCACCAGCAAGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACATCCATCTATGCCTGCTATGCCTCTTCTATATGCACCAGCAAGTG  350

seq1  TCCCAGGATGCAAGTGTCCCTCAGATCCTGGAGTCACACAATCTGACACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGGATGCAAGTGTCCCTCAGATCCTGGAGTCACACAATCTGACACT  400

seq1  TAGGCACAGGGCCGTATCACTCAGAGGCTCTGCTCATTTGTGATTCCCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCACAGGGCCGTATCACTCAGAGGCTCTGCTCATTTGTGATTCCCAG  450

seq1  AAGGGGCCTGCGAGAAAGTACAGTATATGGCCAATAGGAAGCACTCCAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGGCCTGCGAGAAAGTACAGTATATGGCCAATAGGAAGCACTCCAGG  500

seq1  AAGGTGGTCACCTTTTCCACCCCTTTCCCAGCTTGTGCTCCTGAAGTTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGGTCACCTTTTCCACCCCTTTCCCAGCTTGTGCTCCTGAAGTTAA  550

seq1  GGAAGAAGACCTCCTGATGTGTTGGTAGCCACACACATGACAAAACACTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAAGACCTCCTGATGTGTTGGTAGCCACACACATGACAAAACACTG  600

seq1  GCTGCCCTCATAGTCTTTCCTCCCTTCTTCCCCAGATATCCAAGCTATCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCCCTCATAGTCTTTCCTCCCTTCTTCCCCAGATATCCAAGCTATCT  650

seq1  GAGACATCTGGCTTCACAAAGCATTTGAGTCAATCTAATTCTACCACCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACATCTGGCTTCACAAAGCATTTGAGTCAATCTAATTCTACCACCCA  700

seq1  GGGCCTAAGTGAATTC  716
      ||||||||||||||||
seq2  GGGCCTAAGTGAATTC  716