BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-115M10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 139,374,787 - 139,520,662
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4631426J05Rik, LOC100043682
Upstream gene5430419D17Rik, LOC546006, LOC100043173, Cuzd1, 1700007K09Rik, 1700063I17Rik, 2310057M21Rik, Pstk, Ikzf5, Acadsb, Hmx3, Hmx2, Bub3, LOC677073, LOC100043679, Gpr26, Cpxm2
Downstream geneLOC100043683, Oat, Nkx1-2, 2310007H09Rik, A930008G19Rik, 2010208K18Rik, C430003P19Rik, Zranb1, Ctbp2
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-115M10.bB6Ng01-115M10.g
ACCDH920952DH920953
length1,0971,095
definitionDH920952|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-115M10, 5' end.DH920953|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-115M10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(139,374,787 - 139,375,895)(139,519,560 - 139,520,662)
sequence
gaattctcatatgattcaacctctttcaatatctgattcctggccccttc
caggaagagatggagaagggttcagagctgtaggtttctaaccatacttt
gctctttctggcatcctgctctattaagaagctgtctaggagccaccagg
actctcctcactaggacaaatgataccctggacacccagaaaattccaag
agatttaggaactcagtgaagaaaccagaggcagagagtaaatacgcatt
tttattatatcatgctaacataatgccctcgctctgaggaggcacatgct
gaaggatgaggatttaaagtgaagaaactcatcagctatgacttgtcatt
aaatgatttttatatgcggacatgtctgtgcattatctaaaatatatagg
ccagtagtatggtcagcaggtaaaagcacttgccaataaacctgataacc
tgattttgatctctggaacccacatggtgataagagactctatttgtctt
ttgacctgcacatacacaacatggtatatacatatactctcacacatgca
tatataatatatgtgtaatagattatatatatatatatgtatatatatat
atatgtacatacataatacaacatacagtatataatattgacaagcagag
agaaaagcaaattgagtaaatgaatctagataaaggatgcaagttgtcaa
ttctccatacatttaacaaattttattaaaggctaaggagtctattttcc
aggacaattcattaatatttccccccggcacatgacagacgtgcctgcta
taaacaccccagtgctgtgcatgaaacctcaagcccagctgggccgggtc
ctagttctaaagggaaatatggccacagattgtaattaaaacagggtgct
ttttttcttcagtttcacacataaggttctaacagcaaggggcttgaagg
aacaacccagtagttattttttctttctcagctaggtgcatctctaccaa
tgaaaccgcatctttttttttaaagcccgagaagcagctttcacgctgct
agctcctgcagagtccagcctcattaagagtgagaattatagaaaga
gaattcttaggaaaccattgcagtttagtgtggcctgacagagggcgact
taaatgtactagtctaggtgggtgagcttggcctctgctactgtctgcta
ccccagacttcactggttaaacatttaatctatttgtgtgtaccatgccc
agattgtgtgcagagactcagcatttggtgtccttacagaaggtcagtaa
ttgacatggctttggcttcagtggtccagcacctcagtatcaatagcaag
ctgagtaacagcatctgcttttccccatccaactagaaatgacacttgcc
atcccattcctaatcccttggcaagaaatcacaggcatcaattccatgag
aaggcagctatcaaaggcaggaggagtcatgactgctcagtgggcaatat
tgtgtgcatatagggtggggcagcgcaccttccaggctatggggagggac
aaggagtcacttctgaggtagctctgagcagctcatcgctggtggggaga
gaaagaatgagggctggatggggctagataatctctgagccagctgtgct
cacgagctccggctacagtgaaggtgatggtgtgaagagccaaccaaggt
tgcgatcaggagacactatgggaatatactctagggaactgatcaagggg
atgggtgcaggcttgaactggggctatggcagtgggtcggggtggggagg
tgaaatcaacagtgtcaccaggtagatgataatggcagttctctagctct
tcatccagtgactgtcgtgtctcaggtgtgattcagagagtcaggatcag
ctttgatggacaaccaggagcttagaagcggatgtgccagcatctgcagg
gcaccagctttgaaggcttaggatagagaggcctgaccatggagctatcg
gctgactgtgcacatccagctaacaaacctagcactggctgaagggcttc
tccctccctttcagcttggctagagaaactgggaaagcaacaacaatttc
ctacaaacagaaacaaatcattcacattaaaagttcacatgctacggtgg
gagccaaagttctgactctggtagtagaataagattctaatgtga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_139374787_139375895
seq2: B6Ng01-115M10.b_46_1142

seq1  GAATTCTCATATGATTCAACCTCTTTCAATATCTGATTCCTGGCCCCTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATATGATTCAACCTCTTTCAATATCTGATTCCTGGCCCCTTC  50

seq1  CAGGAAGAGATGGAGAAGGGTTCAGAGCTGTAGGTTTCTAACCATACTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAGAGATGGAGAAGGGTTCAGAGCTGTAGGTTTCTAACCATACTTT  100

seq1  GCTCTTTCTGGCATCCTGCTCTATTAAGAAGCTGTCTAGGAGCCACCAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTTCTGGCATCCTGCTCTATTAAGAAGCTGTCTAGGAGCCACCAGG  150

seq1  ACTCTCCTCACTAGGACAAATGATACCCTGGACACCCAGAAAATTCCAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTCCTCACTAGGACAAATGATACCCTGGACACCCAGAAAATTCCAAG  200

seq1  AGATTTAGGAACTCAGTGAAGAAACCAGAGGCAGAGAGTAAATACGCATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTAGGAACTCAGTGAAGAAACCAGAGGCAGAGAGTAAATACGCATT  250

seq1  TTTATTATATCATGCTAACATAATGCCCTCGCTCTGAGGAGGCACATGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTATATCATGCTAACATAATGCCCTCGCTCTGAGGAGGCACATGCT  300

seq1  GAAGGATGAGGATTTAAAGTGAAGAAACTCATCAGCTATGACTTGTCATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGATGAGGATTTAAAGTGAAGAAACTCATCAGCTATGACTTGTCATT  350

seq1  AAATGATTTTTATATGCGGACATGTCTGTGCATTATCTAAAATATATAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGATTTTTATATGCGGACATGTCTGTGCATTATCTAAAATATATAGG  400

seq1  CCAGTAGTATGGTCAGCAGGTAAAAGCACTTGCCAATAAACCTGATAACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTAGTATGGTCAGCAGGTAAAAGCACTTGCCAATAAACCTGATAACC  450

seq1  TGATTTTGATCTCTGGAACCCACATGGTGATAAGAGACTCTATTTGTCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTTGATCTCTGGAACCCACATGGTGATAAGAGACTCTATTTGTCTT  500

seq1  TTGACCTGCACATACACAACATGGTATATACATATACTCTCACACATGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACCTGCACATACACAACATGGTATATACATATACTCTCACACATGCA  550

seq1  TATATAATATATGTGTAATAGATTATATATATATATATGTATATATATAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAATATATGTGTAATAGATTATATATATATATATGTATATATATAT  600

seq1  ATATGTACATACATAATACAACATACAGTATATAATATTGACAAGCAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTACATACATAATACAACATACAGTATATAATATTGACAAGCAGAG  650

seq1  AGAAAAGCAAATTGAGTAAATGAATCTAGATAAAGGATGCAAGTTGTCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAGCAAATTGAGTAAATGAATCTAGATAAAGGATGCAAGTTGTCAA  700

seq1  TTCTCCATACATTTAACAAATTTTATTAAAGGCTAAGGAGTCTATTTTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCATACATTTAACAAATTTTATTAAAGGCTAAGGAGTCTATTTTCC  750

seq1  AGGACAATTCATTAATATTTCCCCCCGGCACATGACAGACGTGCCTGCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAATTCATTAATATTTCCCCCCGGCACATGACAGACGTGCCTGCTA  800

seq1  TAAACACCCCAGTGCTGTGCATGAAACCTCAAGCCCAGCTGGGCCGGGTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACACCCCAGTGCTGTGCATGAAACCTCAAGCCCAGCTGGGCCGGGTC  850

seq1  CTAGTTCTAAAGGGAAATATGGCCACAGATTGTAATTAAAACAGGGTGC-  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CTAGTTCTAAAGGGAAATATGGCCACAGATTGTAATTAAAACAGGGTGCT  900

seq1  TTTTTTCTTCAGTTTCACACATAAGGTTCTAACAGCAAGGGGCTTGAGGG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTTTTTCTTCAGTTTCACACATAAGGTTCTAACAGCAAGGGGCTTGAAGG  950

seq1  AACAACCCAGTAGTTATTTTTTCTTTCTCAGCTAGGTGCAATCTCTACCA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AACAACCCAGTAGTTATTTTTTCTTTCTCAGCTAGGTGC-ATCTCTACCA  999

seq1  ATGAAAACCGCATCTTTTTTTTTTAAAGCCCGAGAAGGCAGGCTTTCACG  1049
      ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
seq2  ATG-AAACCGCATC-TTTTTTTTTAAAGCCCGAGAA-GCA-GCTTTCACG  1045

seq1  CCTGCTTAGCTCCCTGGCAGAGTTCCAGGCCTCATTAAGAAGTGGAGATT  1099
       |||| |||||||   |||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |
seq2  -CTGC-TAGCTCC--TGCAGAG-TCCA-GCCTCATTAAG-AGT-GAGAAT  1087

seq1  ATTAGAAAGA  1109
        ||||||||
seq2  TATAGAAAGA  1097

seq1: chr7_139519560_139520662
seq2: B6Ng01-115M10.g_67_1161 (reverse)

seq1  TCACATTAGGAATCTTA-TCTACTACCAGAGTCAGAACTTTGGCT-CCAC  48
      |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TCACATTA-GAATCTTATTCTACTACCAGAGTCAGAACTTTGGCTCCCAC  49

seq1  GGTAGCATGTGAACTTTTTAATGTGAATGTATTTGTTTCTGGTTTGTGGG  98
       ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||
seq2  CGTAGCATGTGAAC-TTTTAATGTGAATG-ATTTGTTTCT-GTTTGTAGG  96

seq1  AAATGGTTGGTTGGCTTTCCCAGTTTCTCTAGCCAAGCTGAAAGGGAGGG  148
      |||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTGTTG--TTGCTTTCCCAGTTTCTCTAGCCAAGCTGAAAGGGAGGG  144

seq1  AGGAAGGCCCTTCAGCCAGTGCTAGGTTTGGTTAGCTGGATGGTGCACAG  198
      ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
seq2  AG--AAGCCCTTCAGCCAGTGCTAGGTTT-GTTAGCTGGAT-GTGCACAG  190

seq1  TCAGCCGATAGCTCCATGGTCAGGCCTCTCTATCCTAAGCCTTCAAAGCT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCCGATAGCTCCATGGTCAGGCCTCTCTATCCTAAGCCTTCAAAGCT  240

seq1  GGTGCCCTGCAGATGCTGGCACATCCGCTTCTAAGCTCCTGGTTGTCCAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCCCTGCAGATGCTGGCACATCCGCTTCTAAGCTCCTGGTTGTCCAT  290

seq1  CAAAGCTGATCCTGACTCTCTGAATCACACCTGAGACACGACAGTCACTG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCTGATCCTGACTCTCTGAATCACACCTGAGACACGACAGTCACTG  340

seq1  GATGAAGAGCTAGAGAACTGCCATTATCATCTACCTGGTGACACTGTTGA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAAGAGCTAGAGAACTGCCATTATCATCTACCTGGTGACACTGTTGA  390

seq1  TTTCACCTCCCCACCCCGACCCACTGCCATAGCCCCAGTTCAAGCCTGCA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACCTCCCCACCCCGACCCACTGCCATAGCCCCAGTTCAAGCCTGCA  440

seq1  CCCATCCCCTTGATCAGTTCCCTAGAGTATATTCCCATAGTGTCTCCTGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATCCCCTTGATCAGTTCCCTAGAGTATATTCCCATAGTGTCTCCTGA  490

seq1  TCGCAACCTTGGTTGGCTCTTCACACCATCACCTTCACTGTAGCCGGAGC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCAACCTTGGTTGGCTCTTCACACCATCACCTTCACTGTAGCCGGAGC  540

seq1  TCGTGAGCACAGCTGGCTCAGAGATTATCTAGCCCCATCCAGCCCTCATT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTGAGCACAGCTGGCTCAGAGATTATCTAGCCCCATCCAGCCCTCATT  590

seq1  CTTTCTCTCCCCACCAGCGATGAGCTGCTCAGAGCTACCTCAGAAGTGAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCTCCCCACCAGCGATGAGCTGCTCAGAGCTACCTCAGAAGTGAC  640

seq1  TCCTTGTCCCTCCCCATAGCCTGGAAGGTGCGCTGCCCCACCCTATATGC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGTCCCTCCCCATAGCCTGGAAGGTGCGCTGCCCCACCCTATATGC  690

seq1  ACACAATATTGCCCACTGAGCAGTCATGACTCCTCCTGCCTTTGATAGCT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAATATTGCCCACTGAGCAGTCATGACTCCTCCTGCCTTTGATAGCT  740

seq1  GCCTTCTCATGGAATTGATGCCTGTGATTTCTTGCCAAGGGATTAGGAAT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCTCATGGAATTGATGCCTGTGATTTCTTGCCAAGGGATTAGGAAT  790

seq1  GGGATGGCAAGTGTCATTTCTAGTTGGATGGGGAAAAGCAGATGCTGTTA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGGCAAGTGTCATTTCTAGTTGGATGGGGAAAAGCAGATGCTGTTA  840

seq1  CTCAGCTTGCTATTGATACTGAGGTGCTGGACCACTGAAGCCAAAGCCAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCTTGCTATTGATACTGAGGTGCTGGACCACTGAAGCCAAAGCCAT  890

seq1  GTCAATTACTGACCTTCTGTAAGGACACCAAATGCTGAGTCTCTGCACAC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAATTACTGACCTTCTGTAAGGACACCAAATGCTGAGTCTCTGCACAC  940

seq1  AATCTGGGCATGGTACACACAAATAGATTAAATGTTTAACCAGTGAAGTC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGGGCATGGTACACACAAATAGATTAAATGTTTAACCAGTGAAGTC  990

seq1  TGGGGTAGCAGACAGTAGCAGAGGCCAAGCTCACCCACCTAGACTAGTAC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTAGCAGACAGTAGCAGAGGCCAAGCTCACCCACCTAGACTAGTAC  1040

seq1  ATTTAAGTCGCCCTCTGTCAGGCCACACTAAACTGCAATGGTTTCCTAAG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGTCGCCCTCTGTCAGGCCACACTAAACTGCAATGGTTTCCTAAG  1090

seq1  AATTC  1103
      |||||
seq2  AATTC  1095