BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-124N08
Chromosome7 (Build37)
Map Location 81,352,391 - 81,545,954
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC546979, Slco3a1, EG665308
Upstream gene4930429H19Rik, LOC665588, Rgma, Chd2, 1810026B05Rik, EG665610, LOC244061, A830073O21Rik, St8sia2, LOC100042127, LOC100042140
Downstream geneEG665641, 0610006L08Rik, Sv2b, 1500012K07Rik, LOC100042171
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-124N08.bB6Ng01-124N08.g
ACCDH927636DH927637
length1,0151,084
definitionDH927636|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124N08, 5' end.DH927637|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124N08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,352,391 - 81,353,409)(81,544,866 - 81,545,954)
sequence
gaattcattgtgtaagtgggtttgagtaggaatgtttgctacactaggcc
cctggagtctccttagccttgggtctaaggcttgcaggacttgtccctct
gatgtttagagttaggagagaagctggtgcctacattcacttccagctac
agtgatcttcacttctgcctgcccctgtgagaggtttacttctgacaata
ataaacccaacagggcatatcttcccactttccctcttcattcatgactg
aggaacttggtgggacctcaaaactgaagaatatatttggccaccatagt
ggtttttaaaattagaaatataaatcacacaacatagaatttacttgcca
aagtgctcagtttaggtgttcttaaagataggcacaataatgttactatt
aacatttttaaaaagttccatccctttccctcataaaattcatgcacatt
aacatgtccatttcctccaacccagacaatcactaatctccctacattaa
tatgccattcccttcagcatgaatgttaactaatctttctttttctgtag
tttgtctattctagtgacttcaaataatggatgtaggaagtggagatagt
cctaagtgattgtagtcctgtgtggatgtatgcttttgatatgggaatgg
ccatgccatgggccccatagtcttgggctcagagggatggcaaagctttc
ctggggactaagtatgaatactgacagtgaatgcagaaaatgcccaccat
gggtttccccttgaaagatgttcatgccctgaagactcctccctacagag
actgctctagtgagatttgctacagttctttctttgatctggctctgtag
cataaagcctgcatccctgtttatatgtttgtaagatcctacctacttgt
tcagctgcaggaaataaacctgcctctcttttcaactctatgtaataaaa
tgtggaacttcctgggagctgcattttctccagcaatagtacactgaccc
caaatcttctgtctg
gaattcactgaccacgaggtttagcttcaaattaagtgagtggctgaatg
caccttctagagaagagtggataggagcaggtaagaggtctggttcccag
agtaaccccatgcagttctgaattccattgctttcttctgtctgccacaa
cgttcaatagaagatgctgtgtcccactccccactcctaccctgatcttc
ccagccaaggcaaacacttcaattctttttactgctagcatttagcatat
atcagtcattaaatatgtctggcaaagggtatgctgagtctctgcagaac
ctgaaatgggttttaaaaggatagaatgttgactgttgccaacaaatatg
gaagttgacctcagggattcactaaaacctagtactggttatttatgtct
tctaaaagatgactgatttggggagcatttagaaagttgggtaaccatag
gctgtaaggctgctgaacatacaaagctgtgtgacaggctctacaatgag
caatgggagatatcagagtgacattattcttgggagtaactgatagagca
atctggtgctccaagctcatcaaaggacttagagagtaagctattgatta
ccacaggggtgtagcatggagggaaggtgaaacttcagcagagccaggtg
agtaggagttcaccagcaagccaagagggggactgagaggagatggtggc
ataaagatacagaaacatggaaggacatgacaggcttcacaagcagcacc
cttcagactagctaaggagaagaaaaagtgatgtcaggctgtggacatac
ccaggcagagggtgccagggatgcagtcagggtggatggaaggcgtcaga
gggtctcaagctttgttttttgtgagcaagactttggtggccagagaatg
gtgaaaagataagagaatgcttctagaagaaagacaagcagatggagctg
cctgctcctgttatcatggtgatttcctttgacccacctcgatgccattg
tcacagctattgctgcctcttcagtggagagtctttattccctggctgtg
cgcctcatttttagtgaactggcctaggcattga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_81352391_81353409
seq2: B6Ng01-124N08.b_49_1063

seq1  GAATTCATTGTGTAAGTGGGTTTGAGTAGGAATGTTTGCTACACTAGGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGTGTAAGTGGGTTTGAGTAGGAATGTTTGCTACACTAGGCC  50

seq1  CCTGGAGTCTCCTTAGCCTTGGGTCTAAGGCTTGCAGGACTTGTCCCTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGAGTCTCCTTAGCCTTGGGTCTAAGGCTTGCAGGACTTGTCCCTCT  100

seq1  GATGTTTAGAGTTAGGAGAGAAGCTGGTGCCTACATTCACTTCCAGCTAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTTAGAGTTAGGAGAGAAGCTGGTGCCTACATTCACTTCCAGCTAC  150

seq1  AGTGATCTTCACTTCTGCCTGCCCCTGTGAGAGGTTTACTTCTGACAATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATCTTCACTTCTGCCTGCCCCTGTGAGAGGTTTACTTCTGACAATA  200

seq1  ATAAACCCAACAGGGCATATCTTCCCACTTTCCCTCTTCATTCATGACTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACCCAACAGGGCATATCTTCCCACTTTCCCTCTTCATTCATGACTG  250

seq1  AGGAACTTGGTGGGACCTCAAAACTGAAGAATATATTTGGCCACCATAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAACTTGGTGGGACCTCAAAACTGAAGAATATATTTGGCCACCATAGT  300

seq1  GGTTTTTAAAATTAGAAATATAAATCACACAACATAGAATTTACTTGCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTTAAAATTAGAAATATAAATCACACAACATAGAATTTACTTGCCA  350

seq1  AAGTGCTCAGTTTAGGTGTTCTTAAAGATAGGCACAATAATGTTACTATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCTCAGTTTAGGTGTTCTTAAAGATAGGCACAATAATGTTACTATT  400

seq1  AACATTTTTAAAAAGTTCCATCCCTTTCCCTCATAAAATTCATGCACATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTTTAAAAAGTTCCATCCCTTTCCCTCATAAAATTCATGCACATT  450

seq1  AACATGTCCATTTCCTCCAACCCAGACAATCACTAATCTCCCTACATTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGTCCATTTCCTCCAACCCAGACAATCACTAATCTCCCTACATTAA  500

seq1  TATGCCATTCCCTTCAGCATGAATGTTAACTAATCTTTCTTTTTCTGTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCATTCCCTTCAGCATGAATGTTAACTAATCTTTCTTTTTCTGTAG  550

seq1  TTTGTCTATTCTAGTGACTTCAAATAATGGATGTAGGAAGTGGAGATAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCTATTCTAGTGACTTCAAATAATGGATGTAGGAAGTGGAGATAGT  600

seq1  CCTAAGTGATTGTAGTCCTGTGTGGATGTATGCTTTTGATATGGGAATGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAGTGATTGTAGTCCTGTGTGGATGTATGCTTTTGATATGGGAATGG  650

seq1  CCATGCCATGGGCCCCATAGTCTTGGGCTCAGAGGGATGGCAAAGCTTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCCATGGGCCCCATAGTCTTGGGCTCAGAGGGATGGCAAAGCTTTC  700

seq1  CTGGGGACTAAGTATGAATACTGACAGTGAATGCAGAAAATGCCCACCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGACTAAGTATGAATACTGACAGTGAATGCAGAAAATGCCCACCAT  750

seq1  GGGTTTCCCCTTGAAAGATGTTCATGCCCTGAAGACTCCTCCCTACAGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTCCCCTTGAAAGATGTTCATGCCCTGAAGACTCCTCCCTACAGAG  800

seq1  ACTGCTCTTAGTGAGATTTGCTACAGTTCTTTCCTTGATCTGGCTCTGTA  850
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ACTGCTC-TAGTGAGATTTGCTACAGTTCTTTCTTTGATCTGGCTCTGTA  849

seq1  GCATAAAGCCTGCATCCCTGTTTATATGTTTGTAAGAATCCTACCTACTT  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GCATAAAGCCTGCATCCCTGTTTATATGTTTGTAAG-ATCCTACCTACTT  898

seq1  GTTCAGCTGCAGGAAATAACCCTGCCTCTCTATTCAACTCTATGTAATAA  950
      ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GTTCAGCTGCAGGAAATAAACCTGCCTCTCTTTTCAACTCTATGTAATAA  948

seq1  AATGTTGAACTTTCTTGGAGCTGCATTTTCTCCAGCAAAGAGTACACCTG  1000
      ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| |||
seq2  AATGTGGAACTTCCTGGGAGCTGCATTTTCTCCAGC-AATAGTACA-CTG  996

seq1  ACCCCAGATCTTCTGTCTG  1019
      |||||| ||||||||||||
seq2  ACCCCAAATCTTCTGTCTG  1015

seq1: chr7_81544866_81545954
seq2: B6Ng01-124N08.g_69_1152 (reverse)

seq1  TCAATGCATGCCCTTGGCCAG-TCACTAAAATTGTAGCGCCAACAG-CAG  48
      ||||||     ||| |||||| ||||||||| ||  ||||  |||| |||
seq2  TCAATG-----CCTAGGCCAGTTCACTAAAAATGAGGCGC--ACAGCCAG  43

seq1  GGACAAAAGACTCT-CACTGATGAAGCAGCCATAGCTGTGACAATGGCAT  97
      |||  ||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||
seq2  GGAATAAAGACTCTCCACTGAAGAGGCAGCAATAGCTGTGACAATGGCAT  93

seq1  CGAGGTGGGTCACAAGAAATCACACTGATAACAGGAACAGGGCAGCTCAT  147
      |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| || ||||||||  
seq2  CGAGGTGGGTCAAAGGAAATCACCATGATAACAGGAGCA-GGCAGCTCCA  142

seq1  CCTGCTTGTCTTTCTTCTAG-AGCATTCCTCTTATCTTTTCACCATTCTC  196
       ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTTGTCTTTCTTCTAGAAGCATT-CTCTTATCTTTTCACCATTCTC  191

seq1  TGGCCACCAAAGTCTTGCTCACAAAAAACAAAGCTTGAGACCCTCTGACG  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCACCAAAGTCTTGCTCACAAAAAACAAAGCTTGAGACCCTCTGACG  241

seq1  CCTTCCATCCACCCTGACTGCATCCCTGGCACCCTCTGCCTGGGTATGTC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCATCCACCCTGACTGCATCCCTGGCACCCTCTGCCTGGGTATGTC  291

seq1  CACAGCCTGACATCACTTTTTCTTCTCCTTAGCTAGTCTGAAGGGTGCTG  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCCTGACATCACTTTTTCTTCTCCTTAGCTAGTCTGAAGGGTGCTG  341

seq1  CTTGTGAAGCCTGTCATGTCCTTCCATGTTTCTGTATCTTTATGCCACCA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGAAGCCTGTCATGTCCTTCCATGTTTCTGTATCTTTATGCCACCA  391

seq1  TCTCCTCTCAGTCCCCCTCTTGGCTTGCTGGTGAACTCCTACTCACCTGG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTCTCAGTCCCCCTCTTGGCTTGCTGGTGAACTCCTACTCACCTGG  441

seq1  CTCTGCTGAAGTTTCACCTTCCCTCCATGCTACACCCCTGTGGTAATCAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCTGAAGTTTCACCTTCCCTCCATGCTACACCCCTGTGGTAATCAA  491

seq1  TAGCTTACTCTCTAAGTCCTTTGATGAGCTTGGAGCACCAGATTGCTCTA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTACTCTCTAAGTCCTTTGATGAGCTTGGAGCACCAGATTGCTCTA  541

seq1  TCAGTTACTCCCAAGAATAATGTCACTCTGATATCTCCCATTGCTCATTG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTACTCCCAAGAATAATGTCACTCTGATATCTCCCATTGCTCATTG  591

seq1  TAGAGCCTGTCACACAGCTTTGTATGTTCAGCAGCCTTACAGCCTATGGT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGCCTGTCACACAGCTTTGTATGTTCAGCAGCCTTACAGCCTATGGT  641

seq1  TACCCAACTTTCTAAATGCTCCCCAAATCAGTCATCTTTTAGAAGACATA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCAACTTTCTAAATGCTCCCCAAATCAGTCATCTTTTAGAAGACATA  691

seq1  AATAACCAGTACTAGGTTTTAGTGAATCCCTGAGGTCAACTTCCATATTT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAACCAGTACTAGGTTTTAGTGAATCCCTGAGGTCAACTTCCATATTT  741

seq1  GTTGGCAACAGTCAACATTCTATCCTTTTAAAACCCATTTCAGGTTCTGC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGCAACAGTCAACATTCTATCCTTTTAAAACCCATTTCAGGTTCTGC  791

seq1  AGAGACTCAGCATACCCTTTGCCAGACATATTTAATGACTGATATATGCT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACTCAGCATACCCTTTGCCAGACATATTTAATGACTGATATATGCT  841

seq1  AAATGCTAGCAGTAAAAAGAATTGAAGTGTTTGCCTTGGCTGGGAAGATC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCTAGCAGTAAAAAGAATTGAAGTGTTTGCCTTGGCTGGGAAGATC  891

seq1  AGGGTAGGAGTGGGGAGTGGGACACAGCATCTTCTATTGAACGTTGTGGC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTAGGAGTGGGGAGTGGGACACAGCATCTTCTATTGAACGTTGTGGC  941

seq1  AGACAGAAGAAAGCAATGGAATTCAGAACTGCATGGGGTTACTCTGGGAA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAAGAAAGCAATGGAATTCAGAACTGCATGGGGTTACTCTGGGAA  991

seq1  CCAGACCTCTTACCTGCTCCTATCCACTCTTCTCTAGAAGGTGCATTCAG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGACCTCTTACCTGCTCCTATCCACTCTTCTCTAGAAGGTGCATTCAG  1041

seq1  CCACTCACTTAATTTGAAGCTAAACCTCGTGGTCAGTGAATTC  1089
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCACTTAATTTGAAGCTAAACCTCGTGGTCAGTGAATTC  1084