BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-134G22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 130,555,878 - 130,710,094
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLcmt1, Aqp8, Zkscan2, LOC100043482
Upstream genePrkcb1, LOC668486, Cacng3, 4930413G21Rik, Rbbp6, LOC628696, LOC100042977, LOC100042981, Tnrc6a, Slc5a11, Arhgap17
Downstream geneEG628779
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-134G22.bB6Ng01-134G22.g
ACCDH934730DH934731
length1,1101,118
definitionDH934730|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134G22, 5' end.DH934731|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134G22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(130,708,976 - 130,710,094)(130,555,878 - 130,556,985)
sequence
gaattcacaaatttaccaatggatgcaatgtaaacattcctttttaaaaa
atcattgcacatgtttgggtgttcttgcccccatgtatgcccatgcaaca
tgcgtgtgcagtagccacagaggccagcagagggcatcatatcctctgga
actgaagctgcagatggtgtgagccaccacataagtgctgggaataaaca
caagtcctcagaagagcagccagtgggcttaaccattgagccatctctcc
aacccctaaatatcttctaaagttattgtttataacaaaaacagaaaccc
ctaaaatatatcaatattaatataacacttaatagtctatgtattcattt
gtatatatgtgtgtgtgcgtgtgaacattgcacaagcatgtctataaagg
tcataattgaattcatttctagggatggaattcaggtcatcaggcttggc
agcaagcacctttatccactgggtcaacttcatggccccttaatatgaat
ataacttactgaactattctagagtgaaactcctgaacagtatacggctg
acataaaggaagaggcaacactccacaaatgatgtacaaatgctcctcca
aatggtccttagaccacttactgcataaccggcccctcatcctgtactct
ctctataacacactaaatcctcacctgtcctcagatggacttctctgttc
cgtgccattgatatatccatctatccctccagctgctgctgctataaatt
ccattcttttataacacataatatatgatgcacgttggctctcgttattc
ttatttcaaagaatattcctagtaatcgcttcaagacttaagaacaaaac
agtattaaggttcgagttgaaactgcattgaatgtatagatttatttagt
gagagctgacgtctttacagcctggaatcttcttacccaagtgcaaagtt
tgacaccccattgattcaaatctcttttatggcccccaatagaggttata
gtttcatcatatagaccctgcaagttgcctgtagccttatctggagaaat
ttttatgagtattgtagcaatggcatgtgggatcggtgccaaaacaaatt
tgttccactt
gaattcaaagcaacagggcctaccagtcttgaatggaagcctctaacaaa
cactgtgtgctgaagtagccttttctgtatgagctggctctcgtgtgtta
cagagtggagagagaacacagtcggggaagtctgagggcatgcctgggtc
ttccactccatggatctccaattatagcatgtagcatagtctcctttggc
tgaatataacgtattgattcaaggacactggtttccttaggcttgtgctt
agagagcatgttagtgagagtcacagggaatggaatcggatgtcctacct
gagcatagtgccaaccttttaatgaactagctatttgacaatggtccttt
aaaatatattttttaatttatttggtccttagttcttttctacattgtga
aatgggataaatactgtatcaccaaatggatttgaagatttgatgaagaa
atgcatgtgagggtgggagaacagaaagaagtgtgcactggttacttatg
gagtaagccacgcctcagtctgacttcagctctagggacctgtggcttct
gcagtggtgggacagagcagggaatcaccagctcgtgagcgagctgacga
cgggggaattggcctcccttttggaactcagtaccaatggagaagagcag
tgttacaacaagtgtgagagctgtgctgatttcccaggtggcttccttat
cttttcactgcttgcttttccatctgttttgaaaagtcgggatcctgaac
tgagccatgtggctcatgctggccatcccagtacttgggaatctgaggca
ggtaagtcactgtgagttcgagggcagctggggttcatagcacacagtag
gtgagagcttgtctttaaaaaaaaatcaaatgttaatcctggtttaatgt
taatgagtaccttaaaagtagttttttggggctgtagagctggctcagca
gttaagagctctttccagagatcctgagttcaattcccaacacgaacatg
gtggcctcacaatcattttgtaatggttatccaacaccctccttcctggt
ggagttctgaaggagaaccattaggtccggcattatcctaagaataaata
aatacatctctttaaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_130708976_130710094
seq2: B6Ng01-134G22.b_45_1154 (reverse)

seq1  AAGTGGATTAAAATTTTGTTTTGGGCACTCTGAATTCCACATGCATATGC  50
      |||||||  | || |||||||| |||||     || ||||||||   |||
seq2  AAGTGGA--ACAAATTTGTTTT-GGCAC---CGATCCCACATGCCATTGC  44

seq1  TACAATACTCAT-AAAATATCTCCAGATAAGCCTAACAGGCAACTTGCAG  99
      |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||
seq2  TACAATACTCATAAAAATTTCTCCAGATAAGGCT-ACAGGCAACTTGCAG  93

seq1  GGTCTATATGAATGAAACTATAAACCTCTATTGGGGGCCATAAAAGGAGA  149
      |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGTCTATATG-ATGAAACTAT-AACCTCTATTGGGGGCCATAAAA-GAGA  140

seq1  TTTGAATCAATGGGGTGTCAAACTTTGCACTTGGGTAAGAAGATTCCAGG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAATCAATGGGGTGTCAAACTTTGCACTTGGGTAAGAAGATTCCAGG  190

seq1  CTGTAAAGACGTCAGCTCTCACTAAATAAATCTATACATTCAATGCAGTT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAAAGACGTCAGCTCTCACTAAATAAATCTATACATTCAATGCAGTT  240

seq1  TCAACTCGAACCTTAATACTGTTTTGTTCTTAAGTCTTGAAGCGATTACT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTCGAACCTTAATACTGTTTTGTTCTTAAGTCTTGAAGCGATTACT  290

seq1  AGGAATATTCTTTGAAATAAGAATAACGAGAGCCAACCTGCATCATATAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AGGAATATTCTTTGAAATAAGAATAACGAGAGCCAACGTGCATCATATAT  340

seq1  TATGTGTTATAAAAGAATGGAATTTATAGCAGCAGCAGCTGGAGGGATAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGTTATAAAAGAATGGAATTTATAGCAGCAGCAGCTGGAGGGATAG  390

seq1  ATGGATATATCAATGGCACGGAACAGAGAAGTCCATCTGAGGACAGGTGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATATATCAATGGCACGGAACAGAGAAGTCCATCTGAGGACAGGTGA  440

seq1  GGATTTAGTGTGTTATAGAGAGAGTACAGGATGAGGGGCCGGTTATGCAG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTAGTGTGTTATAGAGAGAGTACAGGATGAGGGGCCGGTTATGCAG  490

seq1  TAAGTGGTCTAAGGACCATTTGGAGGAGCATTTGTACATCATTTGTGGAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGGTCTAAGGACCATTTGGAGGAGCATTTGTACATCATTTGTGGAG  540

seq1  TGTTGCCTCTTCCTTTATGTCAGCCGTATACTGTTCAGGAGTTTCACTCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCCTCTTCCTTTATGTCAGCCGTATACTGTTCAGGAGTTTCACTCT  590

seq1  AGAATAGTTCAGTAAGTTATATTCATATTAAGGGGCCATGAAGTTGACCC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAGTTCAGTAAGTTATATTCATATTAAGGGGCCATGAAGTTGACCC  640

seq1  AGTGGATAAAGGTGCTTGCTGCCAAGCCTGATGACCTGAATTCCATCCCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGATAAAGGTGCTTGCTGCCAAGCCTGATGACCTGAATTCCATCCCT  690

seq1  AGAAATGAATTCAATTATGACCTTTATAGACATGCTTGTGCAATGTTCAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGAATTCAATTATGACCTTTATAGACATGCTTGTGCAATGTTCAC  740

seq1  ACGCACACACACATATATACAAATGAATACATAGACTATTAAGTGTTATA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCACACACACATATATACAAATGAATACATAGACTATTAAGTGTTATA  790

seq1  TTAATATTGATATATTTTAGGGGTTTCTGTTTTTGTTATAAACAATAACT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATTGATATATTTTAGGGGTTTCTGTTTTTGTTATAAACAATAACT  840

seq1  TTAGAAGATATTTAGGGGTTGGAGAGATGGCTCAATGGTTAAGCCCACTG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAAGATATTTAGGGGTTGGAGAGATGGCTCAATGGTTAAGCCCACTG  890

seq1  GCTGCTCTTCTGAGGACTTGTGTTTATTCCCAGCACTTATGTGGTGGCTC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTCTTCTGAGGACTTGTGTTTATTCCCAGCACTTATGTGGTGGCTC  940

seq1  ACACCATCTGCAGCTTCAGTTCCAGAGGATATGATGCCCTCTGCTGGCCT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCATCTGCAGCTTCAGTTCCAGAGGATATGATGCCCTCTGCTGGCCT  990

seq1  CTGTGGCTACTGCACACGCATGTTGCATGGGCATACATGGGGGCAAGAAC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGCTACTGCACACGCATGTTGCATGGGCATACATGGGGGCAAGAAC  1040

seq1  ACCCAAACATGTGCAATGATTTTTTAAAAAGGAATGTTTACATTGCATCC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAAACATGTGCAATGATTTTTTAAAAAGGAATGTTTACATTGCATCC  1090

seq1  ATTGGTAAATTTGTGAATTC  1119
      ||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTAAATTTGTGAATTC  1110

seq1: chr7_130555878_130556985
seq2: B6Ng01-134G22.g_69_1186

seq1  GAATTCAAAGCAACAGGGCCTACCAGTCTTGAATGGAAGCCTCTAACAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGCAACAGGGCCTACCAGTCTTGAATGGAAGCCTCTAACAAA  50

seq1  CACTGTGTGCTGAAGTAGCCTTTTCTGTATGAGCTGGCTCTCGTGTGTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTGTGCTGAAGTAGCCTTTTCTGTATGAGCTGGCTCTCGTGTGTTA  100

seq1  CAGAGTGGAGAGAGAACACAGTCGGGGAAGTCTGAGGGCATGCCTGGGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTGGAGAGAGAACACAGTCGGGGAAGTCTGAGGGCATGCCTGGGTC  150

seq1  TTCCACTCCATGGATCTCCAATTATAGCATGTAGCATAGTCTCCTTTGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACTCCATGGATCTCCAATTATAGCATGTAGCATAGTCTCCTTTGGC  200

seq1  TGAATATAACGTATTGATTCAAGGACACTGGTTTCCTTAGGCTTGTGCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATATAACGTATTGATTCAAGGACACTGGTTTCCTTAGGCTTGTGCTT  250

seq1  AGAGAGCATGTTAGTGAGAGTCACAGGGAATGGAATCGGATGTCCTACCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGCATGTTAGTGAGAGTCACAGGGAATGGAATCGGATGTCCTACCT  300

seq1  GAGCATAGTGCCAACCTTTTAATGAACTAGCTATTTGACAATGGTCCTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCATAGTGCCAACCTTTTAATGAACTAGCTATTTGACAATGGTCCTTT  350

seq1  AAAATATATTTTTTAATTTATTTGGTCCTTAGTTCTTTTCTACATTGTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATATTTTTTAATTTATTTGGTCCTTAGTTCTTTTCTACATTGTGA  400

seq1  AATGGGATAAATACTGTATCACCAAATGGATTTGAAGATTTGATGAAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGATAAATACTGTATCACCAAATGGATTTGAAGATTTGATGAAGAA  450

seq1  ATGCATGTGAGGGTGGGAGAACAGAAAGAAGTGTGCACTGGTTACTTATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATGTGAGGGTGGGAGAACAGAAAGAAGTGTGCACTGGTTACTTATG  500

seq1  GAGTAAGCCACGCCTCAGTCTGACTTCAGCTCTAGGGACCTGTGGCTTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAAGCCACGCCTCAGTCTGACTTCAGCTCTAGGGACCTGTGGCTTCT  550

seq1  GCAGTGGTGGGACAGAGCAGGGAATCACCAGCTCGTGAGCGAGCTGACGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGGTGGGACAGAGCAGGGAATCACCAGCTCGTGAGCGAGCTGACGA  600

seq1  CGGGGGAATTGGCCTCCCTTTTGGAACTCAGTACCAATGGAGAAGAGCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGGGAATTGGCCTCCCTTTTGGAACTCAGTACCAATGGAGAAGAGCAG  650

seq1  TGTTACAACAAGTGTGAGAGCTGTGCTGATTTCCCAGGTGGCTTCCTTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTACAACAAGTGTGAGAGCTGTGCTGATTTCCCAGGTGGCTTCCTTAT  700

seq1  CTTTTCACTGCTTGCTTTTCCATCTGTTTTGAAAAGTCGGGATCCTGAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCACTGCTTGCTTTTCCATCTGTTTTGAAAAGTCGGGATCCTGAAC  750

seq1  TGAGCCATGTGGCTCATGCTGGCCATCCCAGTACTTGGGAATCTGAGGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCATGTGGCTCATGCTGGCCATCCCAGTACTTGGGAATCTGAGGCA  800

seq1  GGTAAGTCACTGTGAGTTCGAGGGCAGCTGGGGTTACATAGCACACAGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GGTAAGTCACTGTGAGTTCGAGGGCAGCTGGGGTT-CATAGCACACAGTA  849

seq1  GGTGAGAGCTTGTCTTTAAAAAAAAATCAAATGTTAATCCTGGTTTTAAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GGTGAGAGCTTGTCTTTAAAAAAAAATCAAATGTTAATCCTGG-TTTAAT  898

seq1  GTTAATGAGTACCTTAAAAGTAGTTTTTTGGGGCTGTAGAGCTGGCTCAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATGAGTACCTTAAAAGTAGTTTTTTGGGGCTGTAGAGCTGGCTCAG  948

seq1  CAGTTAAGAGCTC-TTCCAGAGATCCTGAGTTCAATTCCCAACAACGACA  999
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||
seq2  CAGTTAAGAGCTCTTTCCAGAGATCCTGAGTTCAATTCCCAACACGAACA  998

seq1  TGGTGG-CTCACAATCA-TCTGTAATGG-TATCCAACACCCTC--TTCTG  1044
      |||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  | |||
seq2  TGGTGGCCTCACAATCATTTTGTAATGGTTATCCAACACCCTCCTTCCTG  1048

seq1  GT-GAG-TCTGAA-GAGAGCAATAGTGTCC-GCA-TATACGTAGAATAAA  1089
      || ||| |||||| |||| | ||   |||| ||| ||| |  ||||||||
seq2  GTGGAGTTCTGAAGGAGAACCATTAGGTCCGGCATTATCCTAAGAATAAA  1098

seq1  TAAATA-AAATCTTTAAAAA  1108
      |||||| |  ||||||||||
seq2  TAAATACATCTCTTTAAAAA  1118