BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-136L24
Chromosome7 (Build37)
Map Location 145,028,817 - 145,165,174
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMgmt, EG621804, Ebf3, 9430038I01Rik, Txnl2
Downstream geneLOC435235, Tcerg1l, LOC100043290, Mapk1ip1, Ppp2r2d, Bnip3, EG668784, LOC669185
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-136L24.bB6Ng01-136L24.g
ACCDH936440DH936441
length1,0681,089
definitionDH936440|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136L24, 5' end.DH936441|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136L24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(145,164,096 - 145,165,174)(145,028,817 - 145,029,907)
sequence
gaattctgggaaggaaaagtgcagcatcgcattaaaggaagcctcattct
gtatctctatcacgacttaaaatgagttcacctttccatggggagtctct
tggccaagtcatcgactctatctaactggaatcttaggtctgcaccaggc
tagagggcttcctctcttatcacaaagagctgcttcttaatgggcctttg
atgttattctaacatacaccccccccccaaccaaccccaaagattcagcc
ccacaatcatttagggatcagatcagagatcagagtcccaaacacatctc
tctaacctctggcaaggatgaagatccccaggacacttggggcttttagg
tcaagaaagaaattagttctttttctttggggtcttcttgtcctaaactg
cctagccaatttctacctcctgttcttatcatccgtctctctgaagagat
aaccctaacagtcgttgtggaattaggacaacagacctggctttgtctag
ctcaatgggtgtgttaggtgtggccattgggatacaggagggaatcttgc
tcaggatttgagaataggaacttgaagttcctatttgaagtctagccaga
tatgtgtgacctttgcaaggtcaaagcctaggggtgtccagtaatgtgtg
ggaagccagaggtactgaagatgtataggggggcacactgacagaaggtc
ctgccacccccatttataaaccttattgttttatttgcattgtagttgtg
gggcactggaagcaagaacttttgtctgacttgagacccctccacttgca
ttatttggaggaatagggtattaaaatattccctagacagctattccttt
tggacttccagagaataagctcttgagtaaagatcttctccaggccaggc
atccttatctactcttgattttatcccacccacttcctgtgtctattctg
ggttttggaagcaaaggactcattggagtgtaggaagggcatcccagctt
tgtcgtgccctgctggctcttaagctcagaacagtagcttatagctcttc
catcacagcactcctggg
gaattcacttaggtctggtttctcacaccccaaccaaactttcttaggac
acatccctattcctcccttcatccagaaagcacaaactacttcttacacg
gggtctcctgggctccccaggaggggcaggttctccttcctgtgcctgag
caaccctgtgttcagtgatctcatcacacagaatggtccagcttcaaccg
agtgcccatcacagtggcagctgctctgtgatgcttatgccttcatggaa
gcacaaacaccaggccagtgcacctagtgtaggttcatggcccaaggatg
agccgcttcactgtgtaatctctgtgtagctgcaaaggcaagggcaccac
cagcaaacgacagtaaatatttaagggaaaattctgtgcacagagtcaga
gcacagcaggtaaaggaacattcttaagtcatttgaaggcctgggagaag
tctgaaatcaattatgtggaaataataaggggaaatgaaattatagacta
atagctgtgtgcactgagatgtgaaagttagtaacagtagattagcatgc
aaaaatttggcaccgtgcacacatgtgtacatataaacaagtcatacttg
atctacatacattctacatgctactgacgttcatagtagctacatagtcc
acatatacatctactacaaaagtacactatacacaaataacacacacaca
gacacatacaaacacacgtgtgtttgtgtgtgtgtgtatactacatattt
caaatatacaccttacacagattttgcatagatcatacacacatacctat
gtgcacatgttggggttgagagaagagttttctggacgtgctcacagact
tcagagaggaaagggaaccatcatgtgttacaggacaatcagaaagggaa
ccttgggacttgggagctcagtgggtgacagtgagaaatagaggaaagag
ctctggactgaagcctgctcccacacatagggtcttaccttgtgcgttcc
tgtgacaaggttagagtatttatcttcagaacatgtggtgcaagcatggg
actgagctcttatctggactgtagcggaggtcagtcatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_145164096_145165174
seq2: B6Ng01-136L24.b_45_1112 (reverse)

seq1  CCCAGGGGTGCTGTGAATGGGAAAGAGGCTAT-AGCTACTGTTCTGGAGC  49
      |||||| |||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||
seq2  CCCAGGAGTGCTGTG-ATGG--AAGA-GCTATAAGCTACTGTTCT-GAGC  45

seq1  TTTAAGGAAGCCAGCCAGGGCAACGACAGAGCTGGGATGCCCTTTCTTAC  99
       |||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||
seq2  -TTAAG--AGCCAG-CAGGGC-ACGACAAAGCTGGGATGCCC-TTCCTAC  89

seq1  ACTTCCAATGAGTCCTTTGCTTCCAAAA-CCAGAATAGAACACAGGAAGT  148
      || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  AC-TCCAATGAGTCCTTTGCTTCCAAAACCCAGAATAG-ACACAGGAAGT  137

seq1  GGGTGGGATAAAATCAAGAGTAGATAAGGATGCCTGGCCTGGAGAAGATC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGGGATAAAATCAAGAGTAGATAAGGATGCCTGGCCTGGAGAAGATC  187

seq1  TTTACTCAAGAGCTTATTCTCTGGAAGTCCAAAAGGAATAGCTGTCTAGG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTCAAGAGCTTATTCTCTGGAAGTCCAAAAGGAATAGCTGTCTAGG  237

seq1  GAATATTTTAATACCCTATTCCTCCAAATAATGCAAGTGGAGGGGTCTCA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATATTTTAATACCCTATTCCTCCAAATAATGCAAGTGGAGGGGTCTCA  287

seq1  AGTCAGACAAAAGTTCTTGCTTCCAGTGCCCCACAACTACAATGCAAATA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGACAAAAGTTCTTGCTTCCAGTGCCCCACAACTACAATGCAAATA  337

seq1  AAACAATAAGGTTTATAAATGGGGGTGGCAGGACCTTCTGTCAGTGTGCC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAATAAGGTTTATAAATGGGGGTGGCAGGACCTTCTGTCAGTGTGCC  387

seq1  CCCCTATACATCTTCAGTACCTCTGGCTTCCCACACATTACTGGACACCC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTATACATCTTCAGTACCTCTGGCTTCCCACACATTACTGGACACCC  437

seq1  CTAGGCTTTGACCTTGCAAAGGTCACACATATCTGGCTAGACTTCAAATA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCTTTGACCTTGCAAAGGTCACACATATCTGGCTAGACTTCAAATA  487

seq1  GGAACTTCAAGTTCCTATTCTCAAATCCTGAGCAAGATTCCCTCCTGTAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTTCAAGTTCCTATTCTCAAATCCTGAGCAAGATTCCCTCCTGTAT  537

seq1  CCCAATGGCCACACCTAACACACCCATTGAGCTAGACAAAGCCAGGTCTG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAATGGCCACACCTAACACACCCATTGAGCTAGACAAAGCCAGGTCTG  587

seq1  TTGTCCTAATTCCACAACGACTGTTAGGGTTATCTCTTCAGAGAGACGGA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCCTAATTCCACAACGACTGTTAGGGTTATCTCTTCAGAGAGACGGA  637

seq1  TGATAAGAACAGGAGGTAGAAATTGGCTAGGCAGTTTAGGACAAGAAGAC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAAGAACAGGAGGTAGAAATTGGCTAGGCAGTTTAGGACAAGAAGAC  687

seq1  CCCAAAGAAAAAGAACTAATTTCTTTCTTGACCTAAAAGCCCCAAGTGTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAAGAAAAAGAACTAATTTCTTTCTTGACCTAAAAGCCCCAAGTGTC  737

seq1  CTGGGGATCTTCATCCTTGCCAGAGGTTAGAGAGATGTGTTTGGGACTCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGATCTTCATCCTTGCCAGAGGTTAGAGAGATGTGTTTGGGACTCT  787

seq1  GATCTCTGATCTGATCCCTAAATGATTGTGGGGCTGAATCTTTGGGGTTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCTGATCTGATCCCTAAATGATTGTGGGGCTGAATCTTTGGGGTTG  837

seq1  GTTGGGGGGGGGGTGTATGTTAGAATAACATCAAAGGCCCATTAAGAAGC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGGGGGGGGGTGTATGTTAGAATAACATCAAAGGCCCATTAAGAAGC  887

seq1  AGCTCTTTGTGATAAGAGAGGAAGCCCTCTAGCCTGGTGCAGACCTAAGA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTTTGTGATAAGAGAGGAAGCCCTCTAGCCTGGTGCAGACCTAAGA  937

seq1  TTCCAGTTAGATAGAGTCGATGACTTGGCCAAGAGACTCCCCATGGAAAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGTTAGATAGAGTCGATGACTTGGCCAAGAGACTCCCCATGGAAAG  987

seq1  GTGAACTCATTTTAAGTCGTGATAGAGATACAGAATGAGGCTTCCTTTAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAACTCATTTTAAGTCGTGATAGAGATACAGAATGAGGCTTCCTTTAA  1037

seq1  TGCGATGCTGCACTTTTCCTTCCCAGAATTC  1079
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGATGCTGCACTTTTCCTTCCCAGAATTC  1068

seq1: chr7_145028817_145029907
seq2: B6Ng01-136L24.g_69_1157

seq1  GAATTCACTTAGGTCTGGTTTCTCACACCCCAACCAAACTTTCTTAGGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTAGGTCTGGTTTCTCACACCCCAACCAAACTTTCTTAGGAC  50

seq1  ACATCCCTATTCCTCCCTTCATCCAGAAAGCACAAACTACTTCTTACACG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCCCTATTCCTCCCTTCATCCAGAAAGCACAAACTACTTCTTACACG  100

seq1  GGGTCTCCTGGGCTCCCCAGGAGGGGCAGGTTCTCCTTCCTGTGCCTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCTCCTGGGCTCCCCAGGAGGGGCAGGTTCTCCTTCCTGTGCCTGAG  150

seq1  CAACCCTGTGTTCAGTGATCTCATCACACAGAATGGTCCAGCTTCAACCG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCCTGTGTTCAGTGATCTCATCACACAGAATGGTCCAGCTTCAACCG  200

seq1  AGTGCCCATCACAGTGGCAGCTGCTCTGTGATGCTTATGCCTTCATGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCCCATCACAGTGGCAGCTGCTCTGTGATGCTTATGCCTTCATGGAA  250

seq1  GCACAAACACCAGGCCAGTGCACCTAGTGTAGGTTCATGGCCCAAGGATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAAACACCAGGCCAGTGCACCTAGTGTAGGTTCATGGCCCAAGGATG  300

seq1  AGCCGCTTCACTGTGTAATCTCTGTGTAGCTGCAAAGGCAAGGGCACCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCGCTTCACTGTGTAATCTCTGTGTAGCTGCAAAGGCAAGGGCACCAC  350

seq1  CAGCAAACGACAGTAAATATTTAAGGGAAAATTCTGTGCACAGAGTCAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAACGACAGTAAATATTTAAGGGAAAATTCTGTGCACAGAGTCAGA  400

seq1  GCACAGCAGGTAAAGGAACATTCTTAAGTCATTTGAAGGCCTGGGAGAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGCAGGTAAAGGAACATTCTTAAGTCATTTGAAGGCCTGGGAGAAG  450

seq1  TCTGAAATCAATTATGTGGAAATAATAAGGGGAAATGAAATTATAGACTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAAATCAATTATGTGGAAATAATAAGGGGAAATGAAATTATAGACTA  500

seq1  ATAGCTGTGTGCACTGAGATGTGAAAGTTAGTAACAGTAGATTAGCATGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTGTGTGCACTGAGATGTGAAAGTTAGTAACAGTAGATTAGCATGC  550

seq1  AAAAATTTGGCACCGTGCACACATGTGTACATATAAACAAGTCATACTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTTGGCACCGTGCACACATGTGTACATATAAACAAGTCATACTTG  600

seq1  ATCTACATACATTCTACATGCTACTGACGTTCATAGTAGCTACATAGTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTACATACATTCTACATGCTACTGACGTTCATAGTAGCTACATAGTCC  650

seq1  ACATATACATCTACTACAAAAGTACACTATACACAAATAACACACACACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATACATCTACTACAAAAGTACACTATACACAAATAACACACACACA  700

seq1  GACACATACAAACACACGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTATACTACATA-TT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GACACATACAAACACACGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTATACTACATATTT  750

seq1  CAAATATACACCTTACACAGATTTTGCATAGATCATACACACATACCTAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATATACACCTTACACAGATTTTGCATAGATCATACACACATACCTAT  800

seq1  GTGCACATGTTGGGGTTGAGAGAAGAGTTTTCTGGACGTGCTCACAGACT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCACATGTTGGGGTTGAGAGAAGAGTTTTCTGGACGTGCTCACAGACT  850

seq1  TCAGAGAGGAAAGGGAACCATCATGTGTTACAGGACAATCAGAAAGGGAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGAGGAAAGGGAACCATCATGTGTTACAGGACAATCAGAAAGGGAA  900

seq1  CCTTGGGACTTGGGAGCTCAGTGGGTGACAGTGAGAAATAGAGGAAAGAG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGGACTTGGGAGCTCAGTGGGTGACAGTGAGAAATAGAGGAAAGAG  950

seq1  CTCTGGACTGAAGCCTGCTCCCACACATAGGGTCTTACCTTGTGCGTTTC  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CTCTGGACTGAAGCCTGCTCCCACACATAGGGTCTTACCTTGTGCG-TTC  999

seq1  CTGTGACAAGGTTAGAAGTATTTATCTTCAGAACATGTGGTGCAAAGCAT  1049
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CTGTGACAAGGTTAG-AGTATTTATCTTCAGAACATGTGGTGC-AAGCAT  1047

seq1  GGGACCTGAGCTC-TATCTGGACTGTAGCAGAGGTCAGTCATG  1091
      |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GGGA-CTGAGCTCTTATCTGGACTGTAGCGGAGGTCAGTCATG  1089