BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-145I22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 119,304,087 - 119,448,063
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMical2
Upstream geneLOC100042658, LOC384658, Galntl4, LOC668399, LOC100042678, Usp47, Dkk3
Downstream geneMicalcl, Parva, LOC627808, Tead1, 4632411J06Rik, LOC434227, Arntl, A630005I04Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-145I22.bB6Ng01-145I22.g
ACCDH942931DH942932
length1,152732
definitionDH942931|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145I22, 5' end.DH942932|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145I22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,446,898 - 119,448,063)(119,304,087 - 119,304,818)
sequence
gaattctctctctcacatgcctcttgggagtgtgactcactctattaaag
catattttattactgacaaaatctagtgagctccctgagcgtaccgtctc
tgctacttgcctctgggctctgtatttcattcattcactcagcagatgtt
tattgtttcatctattacgtgtcaagcatgtaggccctggagacaggtat
tttggcaagcagtgcatcccagggtccatgaccaatgggacttaagacag
atcccagaataagccacaaagcagaccatcatgatctgaatgagaaaggt
cctcatgggctcatttgtgctccatccagtggtaccatttttaggagact
gtagggcctgtaggagatgtgacccagctggaagaagtagatacaggagg
tgtggggagagcttgaagtttatagcctgggcattctgcagggcctttct
ccatttctggatctggccagatatgagctagcagccacaaagctgttggc
ctttttcactttcctgccacgaggggctgagcccaaacaaatgtctcctc
aagctgatccaggtgaagaatttggtctcagccaaagaaagtaactaatt
cacagtcctccaggtaacacctgagagttggatgaatggagcatccatgg
tcaaaggaccatctgggactcctagatgtggcaagatgggtccatgaaca
gtgagacctggatcatcctgaagcaccaagcaccccaccctgagccccac
tcactgatgtggtcgatggagccagcacagaatttcccatagaacttctt
ggcccccaggccccgcagtcatggatagtgaagggccagaggtgcaggac
attgttccgggagaaggtgtccctcttctccaccacaaccactttggctc
ccaggtaggcaagttcaatggcagtgcgcaagccacatggttcttcctcc
gacgatgagacactgtggggggaaagagagaaccttgagtgtctagtcag
tgctgtcacagaggtccacttcacagcacagcattcgtgcatctgccaag
accagtcattcatctggctggtatataattcctgtagtccatcatagaca
tgaacactgtttaaccaggagaacatgcaaggattttagagaaggcactg
ta
gaattctcagcagccttttaaggtttaagccttttggtctcaaacaagaa
cccttccttaagatctcaaactaacaaggagttagatggggatttgaacc
cagtaagccacctccagagcttctactacctttgaacacgatactccttt
gctacacttcggctgggaagtatctgaggtgtctgggagcagaagatgag
caatttccctgggaaaacatagaaaataagtgtctgcgatggtgactgct
gtgtcatgtccatacacctgagtccacagcagtggccgctgagaggaggc
atccctgaggccttcttcctactaggcaactgcttgccattgattcgaga
tgtccgtcctgttctgtaggcagagaatgggaatgaagactcagaaaggc
caggctaccactcagtgacgtagacctgcctctggccaagatgggacacc
cagccactcctcaactggcaggcctctaagtagagactcatagagtccaa
ggaaagctccctcccagcatgctttgctctgccctcctgggtgtctggaa
ggccctgctcagttgcttgttagcttgctggagatggctgaccctgtgca
aggagccttctacttaggctctagatgtcctgcctgtcactgtgcatcag
tgttcactcaccaacagagatgaaagctgacctggggggaaagagagaga
gaaagagagagagagggagagagagagagaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_119446898_119448063
seq2: B6Ng01-145I22.b_46_1197 (reverse)

seq1  TACAGTGCCTTCTCCTAAAATCCCTTTGCATGTTCTCCCTGGGTTTGGAC  50
      ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||  ||  ||
seq2  TACAGTGCCTTCT-CTAAAATCC--TTGCATGTTCT-CCTGG--TTAAAC  44

seq1  AGTG-TCTAGTCTATGATGGGCCTACAGGGAATATATATACTAGGCAGAT  99
      |||| ||  ||||||||| || ||||| ||||| ||||||| || |||||
seq2  AGTGTTCATGTCTATGAT-GGACTACA-GGAAT-TATATACCAGCCAGAT  91

seq1  GAATGACTGGTCTTGGCAGATGCACAGAATGCTGTGGCTGGTGAGGTGGG  149
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || ||
seq2  GAATGACTGGTCTTGGCAGATGCAC-GAATGCTGT-GCT-GTGAAGT-GG  137

seq1  ACCTCTGTGACAGCACTGCCTAGACACTCAAGGTTTCTCTCCTTTCCCCC  199
      |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||
seq2  ACCTCTGTGACAGCACTGACTAGACACTCAAGG-TTCTCT-CTTTCCCCC  185

seq1  CACAGTGTCTCATCGTCGGAGG-AGGACCATGTGGCTTGCGCACTGCCAT  248
      |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTGTCTCATCGTCGGAGGAAGAACCATGTGGCTTGCGCACTGCCAT  235

seq1  TGAACTTGCCTACCTGGGAGCCAAAGTGGTTGTGGTGGAGAAGAGGGACA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTTGCCTACCTGGGAGCCAAAGTGGTTGTGGTGGAGAAGAGGGACA  285

seq1  CCTTCTCCCGGAACAATGTCCTGCACCTCTGGCCCTTCACTATCCATGAC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CCTTCTCCCGGAACAATGTCCTGCACCTCTGGCCCTTCACTATCCATGA-  334

seq1  CTGCGGGGCCTGGGGGCCAAGAAGTTCTATGGGAAATTCTGTGCTGGCTC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCGGGGCCTGGGGGCCAAGAAGTTCTATGGGAAATTCTGTGCTGGCTC  384

seq1  CATCGACCACATCAGTGAGTGGGGCTCAGGGTGGGGTGCTTGGTGCTTCA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCGACCACATCAGTGAGTGGGGCTCAGGGTGGGGTGCTTGGTGCTTCA  434

seq1  GGATGATCCAGGTCTCACTGTTCATGGACCCATCTTGCCACATCTAGGAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGATCCAGGTCTCACTGTTCATGGACCCATCTTGCCACATCTAGGAG  484

seq1  TCCCAGATGGTCCTTTGACCATGGATGCTCCATTCATCCAACTCTCAGGT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGATGGTCCTTTGACCATGGATGCTCCATTCATCCAACTCTCAGGT  534

seq1  GTTACCTGGAGGACTGTGAATTAGTTACTTTCTTTGGCTGAGACCAAATT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACCTGGAGGACTGTGAATTAGTTACTTTCTTTGGCTGAGACCAAATT  584

seq1  CTTCACCTGGATCAGCTTGAGGAGACATTTGTTTGGGCTCAGCCCCTCGT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACCTGGATCAGCTTGAGGAGACATTTGTTTGGGCTCAGCCCCTCGT  634

seq1  GGCAGGAAAGTGAAAAAGGCCAACAGCTTTGTGGCTGCTAGCTCATATCT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGAAAGTGAAAAAGGCCAACAGCTTTGTGGCTGCTAGCTCATATCT  684

seq1  GGCCAGATCCAGAAATGGAGAAAGGCCCTGCAGAATGCCCAGGCTATAAA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGATCCAGAAATGGAGAAAGGCCCTGCAGAATGCCCAGGCTATAAA  734

seq1  CTTCAAGCTCTCCCCACACCTCCTGTATCTACTTCTTCCAGCTGGGTCAC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAAGCTCTCCCCACACCTCCTGTATCTACTTCTTCCAGCTGGGTCAC  784

seq1  ATCTCCTACAGGCCCTACAGTCTCCTAAAAATGGTACCACTGGATGGAGC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCCTACAGGCCCTACAGTCTCCTAAAAATGGTACCACTGGATGGAGC  834

seq1  ACAAATGAGCCCATGAGGACCTTTCTCATTCAGATCATGATGGTCTGCTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATGAGCCCATGAGGACCTTTCTCATTCAGATCATGATGGTCTGCTT  884

seq1  TGTGGCTTATTCTGGGATCTGTCTTAAGTCCCATTGGTCATGGACCCTGG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCTTATTCTGGGATCTGTCTTAAGTCCCATTGGTCATGGACCCTGG  934

seq1  GATGCACTGCTTGCCAAAATACCTGTCTCCAGGGCCTACATGCTTGACAC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCACTGCTTGCCAAAATACCTGTCTCCAGGGCCTACATGCTTGACAC  984

seq1  GTAATAGATGAAACAATAAACATCTGCTGAGTGAATGAATGAAATACAGA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATAGATGAAACAATAAACATCTGCTGAGTGAATGAATGAAATACAGA  1034

seq1  GCCCAGAGGCAAGTAGCAGAGACGGTACGCTCAGGGAGCTCACTAGATTT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGAGGCAAGTAGCAGAGACGGTACGCTCAGGGAGCTCACTAGATTT  1084

seq1  TGTCAGTAATAAAATATGCTTTAATAGAGTGAGTCACACTCCCAAGAGGC  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGTAATAAAATATGCTTTAATAGAGTGAGTCACACTCCCAAGAGGC  1134

seq1  ATGTGAGAGAGAGAATTC  1166
      ||||||||||||||||||
seq2  ATGTGAGAGAGAGAATTC  1152

seq1: chr7_119304087_119304818
seq2: B6Ng01-145I22.g_69_800

seq1  GAATTCTCAGCAGCCTTTTAAGGTTTAAGCCTTTTGGTCTCAAACAAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGCAGCCTTTTAAGGTTTAAGCCTTTTGGTCTCAAACAAGAA  50

seq1  CCCTTCCTTAAGATCTCAAACTAACAAGGAGTTAGATGGGGATTTGAACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCCTTAAGATCTCAAACTAACAAGGAGTTAGATGGGGATTTGAACC  100

seq1  CAGTAAGCCACCTCCAGAGCTTCTACTACCTTTGAACACGATACTCCTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAGCCACCTCCAGAGCTTCTACTACCTTTGAACACGATACTCCTTT  150

seq1  GCTACACTTCGGCTGGGAAGTATCTGAGGTGTCTGGGAGCAGAAGATGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACACTTCGGCTGGGAAGTATCTGAGGTGTCTGGGAGCAGAAGATGAG  200

seq1  CAATTTCCCTGGGAAAACATAGAAAATAAGTGTCTGCGATGGTGACTGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTCCCTGGGAAAACATAGAAAATAAGTGTCTGCGATGGTGACTGCT  250

seq1  GTGTCATGTCCATACACCTGAGTCCACAGCAGTGGCCGCTGAGAGGAGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCATGTCCATACACCTGAGTCCACAGCAGTGGCCGCTGAGAGGAGGC  300

seq1  ATCCCTGAGGCCTTCTTCCTACTAGGCAACTGCTTGCCATTGATTCGAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTGAGGCCTTCTTCCTACTAGGCAACTGCTTGCCATTGATTCGAGA  350

seq1  TGTCCGTCCTGTTCTGTAGGCAGAGAATGGGAATGAAGACTCAGAAAGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCGTCCTGTTCTGTAGGCAGAGAATGGGAATGAAGACTCAGAAAGGC  400

seq1  CAGGCTACCACTCAGTGACGTAGACCTGCCTCTGGCCAAGATGGGACACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTACCACTCAGTGACGTAGACCTGCCTCTGGCCAAGATGGGACACC  450

seq1  CAGCCACTCCTCAACTGGCAGGCCTCTAAGTAGAGACTCATAGAGTCCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCACTCCTCAACTGGCAGGCCTCTAAGTAGAGACTCATAGAGTCCAA  500

seq1  GGAAAGCTCCCTCCCAGCATGCTTTGCTCTGCCCTCCTGGGTGTCTGGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGCTCCCTCCCAGCATGCTTTGCTCTGCCCTCCTGGGTGTCTGGAA  550

seq1  GGCCCTGCTCAGTTGCTTGTTAGCTTGCTGGAGATGGCTGACCCTGTGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCTGCTCAGTTGCTTGTTAGCTTGCTGGAGATGGCTGACCCTGTGCA  600

seq1  AGGAGCCTTCTACTTAGGCTCTAGATGTCCTGCCTGTCACTGTGCATCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCCTTCTACTTAGGCTCTAGATGTCCTGCCTGTCACTGTGCATCAG  650

seq1  TGTTCACTCACCAACAGAGATGAAAGCTGACCTGGGGGGAAAGAGAGAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCACTCACCAACAGAGATGAAAGCTGACCTGGGGGGAAAGAGAGAGA  700

seq1  GAAAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGA  732
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGA  732