BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-147L04
Chromosome7 (Build37)
Map Location 68,282,217 - 68,384,192
singlet/doubletdoublet
Overlap geneD0Kist2, LOC100041248
Upstream geneSnrpn, EG664849, LOC100041201, LOC100041211, LOC664896, LOC100041229, LOC625287
Downstream geneLOC100041259, EG664943, B230209E15Rik, EG620934, LOC100041293
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-147L04.bB6Ng01-147L04.g
ACCDH944502DH944503
length1,0721,038
definitionDH944502|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147L04, 5' end.DH944503|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147L04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,282,217 - 68,283,296)(68,383,143 - 68,384,192)
sequence
gaattctgcaactacatacaacatttaaaaagactgcctaactatgattc
gatatatagacatcctctgccctgtcagccttacattagatattatgcca
attactattgtactaattagtcatgttcctaccattattaatcttaacta
aaatttaaggaactatcatgtaaacatcttgcaatcaaattaaactccct
tgctcaactagatttcagttggctgtctcaatccttacacaaggatagca
tgaattctcttggaaaatcaatattgcaatcgaaattatcacaaacattt
cctaactgttgaataaaattaattttcctggtgaaatgcataatcatgtg
ccatactgcatttagtggaaaaccagtttaaaatatcaccaaaatttcgt
ctgaggaacagatgaggattttaggcttatttacaaagtaaaggaaatgg
ggtatttactgggtcattacaactctaaaacaaaagttgcatcaaagcat
attttcttagtagagatcacagtctttttattgacacagtctccactata
atttcctgtcaaatatattatacaccactttagatcaggtgtggagagag
atgtacaaagggccagaatattggccatatgtttgtagaagtgggggatt
ggtaactcacagatcatatgaaggttacttagaaataagaccaaatttta
tttttcattgtcttgtttttaattacatacattctttatttaaatttcaa
atattaccacctttcctagttttccctcctaaaaccctctatctcatctg
ccctttccatgttcaacaacctaccaactcccactttgctgtcctggaat
gcccctacattgagacattgagccttcacagtaccaatggtctctcctct
cattgatattcaacaagtccatcctctccttcatattcagctgtagaaat
gccccccccccccctgccccatgtgtactctttgggtgtgctttattccc
tgaatattgatgatcatattgttttcctccatggggctgcaaacccttta
gctcctgtgtcaattctgtagc
gaattcacctcctctgtatctgtgaggtataattttatctccaaatgtag
agattcccccttaatacttctggggaaaatgtctatagaaaagaatccaa
catttaaatattttttgatgttttcataacagtgtgcatgtgcactctac
atatatctgggcattctgaagttgttaataaactcaagattttaatccct
attgtaaactcagatacagagcatattacttagaagtacataatgtagcc
tcccaatactagattgccttgacaaatgcaggctatcacatttttgtgtt
ttgtaatcctgacttttcttattgttttctgatatactaaatgtagatat
tactaagtttgctttaagttcaaggttggactggttatggaatcaacaga
aagcaactttaatatgttaggatggatgccttggtctctctcttgtaaaa
tgtgttgggggacagcagtccttacttgttttaatatgtccttgagaaat
cacagtcctactagaagacagtccttatatgttctttgagatgtcattat
ttgaggcatgaacaattttaatcaatgggttgtcaccacagtgctgatgc
atagtatgggatgtgtgcctttaatgacatctacatagggaatgtgatgt
gacatttttaggaggtatgtggtacagcagatgaaggacatttggcttga
atatttgggaattgttaggcttgcccttagagatgtcacctctttagatg
agcactgactttattgtgtgctgctttcttccatactgtgtataaagaat
gaaaagatatgtggttcagtgaccacatgtgttgcgggccgccagcagct
cgcacatgaacggttcgactgagaaggctactcgagctgtaagctgagtt
tgtatctcttcagaagcatttgtaatccctatcagccagggcctttcgta
gtctcataacacaaaagcaaatctgggggtcctttcccgccatcagacat
catctgtgaatgatgatgtaatattggcatgttgtcta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_68282217_68283296
seq2: B6Ng01-147L04.b_49_1120

seq1  GAATTCTGCAACTACATACAACATTTAAAAAGACTGCCTAACTATGATTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCAACTACATACAACATTTAAAAAGACTGCCTAACTATGATTC  50

seq1  GATATATAGACATCCTCTGCCCTGTCAGCCTTACATTAGATATTATGCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATATAGACATCCTCTGCCCTGTCAGCCTTACATTAGATATTATGCCA  100

seq1  ATTACTATTGTACTAATTAGTCATGTTCCTACCATTATTAATCTTAACTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACTATTGTACTAATTAGTCATGTTCCTACCATTATTAATCTTAACTA  150

seq1  AAATTTAAGGAACTATCATGTAAACATCTTGCAATCAAATTAAACTCCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTAAGGAACTATCATGTAAACATCTTGCAATCAAATTAAACTCCCT  200

seq1  TGCTCAACTAGATTTCAGTTGGCTGTCTCAATCCTTACACAAGGATAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCAACTAGATTTCAGTTGGCTGTCTCAATCCTTACACAAGGATAGCA  250

seq1  TGAATTCTCTTGGAAAATCAATATTGCAATCGAAATTATCACAAACATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTCTCTTGGAAAATCAATATTGCAATCGAAATTATCACAAACATTT  300

seq1  CCTAACTGTTGAATAAAATTAATTTTCCTGGTGAAATGCATAATCATGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAACTGTTGAATAAAATTAATTTTCCTGGTGAAATGCATAATCATGTG  350

seq1  CCATACTGCATTTAGTGGAAAACCAGTTTAAAATATCACCAAAATTTCGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATACTGCATTTAGTGGAAAACCAGTTTAAAATATCACCAAAATTTCGT  400

seq1  CTGAGGAACAGATGAGGATTTTAGGCTTATTTACAAAGTAAAGGAAATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGAACAGATGAGGATTTTAGGCTTATTTACAAAGTAAAGGAAATGG  450

seq1  GGTATTTACTGGGTCATTACAACTCTAAAACAAAAGTTGCATCAAAGCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATTTACTGGGTCATTACAACTCTAAAACAAAAGTTGCATCAAAGCAT  500

seq1  ATTTTCTTAGTAGAGATCACAGTCTTTTTATTGACACAGTCTCCACTATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTTAGTAGAGATCACAGTCTTTTTATTGACACAGTCTCCACTATA  550

seq1  ATTTCCTGTCAAATATATTATACACCACTTTAGATCAGGTGTGGAGAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCTGTCAAATATATTATACACCACTTTAGATCAGGTGTGGAGAGAG  600

seq1  ATGTACAAAGGGCCAGAATATTGGCCATATGTTTGTAGAAGTGGGGGATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACAAAGGGCCAGAATATTGGCCATATGTTTGTAGAAGTGGGGGATT  650

seq1  GGTAACTCACAGATCATATGAAGGTTACTTAGAAATAAGACCAAATTTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAACTCACAGATCATATGAAGGTTACTTAGAAATAAGACCAAATTTTA  700

seq1  TTTTTCATTGTCTTGTTTTTAATTACATACATTCTTTATTTAAATTTCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCATTGTCTTGTTTTTAATTACATACATTCTTTATTTAAATTTCAA  750

seq1  ATATTACCACCTTTCCTAGTTTTCCCTCCTAAAACCCTCTATCTCATCTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTACCACCTTTCCTAGTTTTCCCTCCTAAAACCCTCTATCTCATCTG  800

seq1  CCCTTTCCATGTTCAACAACCTACCAACTCCCACTTTGCTGTCCTGGAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTCCATGTTCAACAACCTACCAACTCCCACTTTGCTGTCCTGGAAT  850

seq1  GCCCCTACATTGAGACATTGAGCCTTCACAGTACCAATGGTCTCTCCTCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTACATTGAGACATTGAGCCTTCACAGTACCAATGGTCTCTCCTCT  900

seq1  CATTGATATTCAACAAGTCCATCCTCTCCTTCATATTCAGCTGTAGAAAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGATATTCAACAAGTCCATCCTCTCCTTCATATTCAGCTGTAGAAAT  950

seq1  GCCCCCCCCCCCCCTGCCCCATGTGTACTCTTTGGTTGTTGCTTTATTCC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
seq2  GCCCCCCCCCCCCCTGCCCCATGTGTACTCTTTGGGTG-TGCTTTATTCC  999

seq1  CTGGAATATTGATTGGTTCATATTGTTTTTCCTCCCATGGGGCTGCAAAC  1050
      || ||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| 
seq2  CT-GAATATTGAT--GATCATATTG-TTTTCCT-CCATGGGGCTGCAAA-  1043

seq1  CCCTTTAGCTCCTTGTGTCAATTCTGTAGC  1080
      |||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CCCTTTAGCTCC-TGTGTCAATTCTGTAGC  1072

seq1: chr7_68383143_68384192
seq2: B6Ng01-147L04.g_68_1105 (reverse)

seq1  TAGACAACAATGGCCAAATATTTACATCATTCATTTCACAGATGATGTCT  50
      |||||||| |||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| 
seq2  TAGACAAC-ATG--CCAATA-TTACATCA-TCA-TTCACAGATGATGTC-  43

seq1  TGATGGCGGGAAAGGACCCCCAAGATTTGCTTTTGTGTTATGGAGACTTA  100
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||
seq2  TGATGGCGGGAAAGGACCCCC-AGATTTGCTTTTGTGTTAT-GAGAC-TA  90

seq1  CGAAAGGCCCTGGCTGATAAGGGATTACAAATTGCTTCTGAAGAGATACA  150
      |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CGAAAGGCCCTGGCTGAT-AGGGATTACAAA-TGCTTCTGAAGAGATACA  138

seq1  AACTCAGCTTACAGCTCGAGTAGCCTTCTCAGTCGAACCGTTCATGTTGC  200
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AACTCAGCTTACAGCTCGAGTAGCCTTCTCAGTCGAACCGTTCATG-TGC  187

seq1  GAGCTGCTGGCGG-CCGCAACACATGTGGTCACTGAACCACATATCTTTT  249
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGCTGGCGGCCCGCAACACATGTGGTCACTGAACCACATATCTTTT  237

seq1  CATTCTTTATACACAGTATGGAAGAAAGCAGCACACAATAAAGTCAGTGC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTTTATACACAGTATGGAAGAAAGCAGCACACAATAAAGTCAGTGC  287

seq1  TCATCTAAAGAGGTGACATCTCTAAGGGCAAGCCTAACAATTCCCAAATA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTAAAGAGGTGACATCTCTAAGGGCAAGCCTAACAATTCCCAAATA  337

seq1  TTCAAGCCAAATGTCCTTCATCTGCTGTACCACATACCTCCTAAAAATGT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGCCAAATGTCCTTCATCTGCTGTACCACATACCTCCTAAAAATGT  387

seq1  CACATCACATTCCCTATGTAGATGTCATTAAAGGCACACATCCCATACTA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCACATTCCCTATGTAGATGTCATTAAAGGCACACATCCCATACTA  437

seq1  TGCATCAGCACTGTGGTGACAACCCATTGATTAAAATTGTTCATGCCTCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCAGCACTGTGGTGACAACCCATTGATTAAAATTGTTCATGCCTCA  487

seq1  AATAATGACATCTCAAAGAACATATAAGGACTGTCTTCTAGTAGGACTGT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATGACATCTCAAAGAACATATAAGGACTGTCTTCTAGTAGGACTGT  537

seq1  GATTTCTCAAGGACATATTAAAACAAGTAAGGACTGCTGTCCCCCAACAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCTCAAGGACATATTAAAACAAGTAAGGACTGCTGTCCCCCAACAC  587

seq1  ATTTTACAAGAGAGAGACCAAGGCATCCATCCTAACATATTAAAGTTGCT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTACAAGAGAGAGACCAAGGCATCCATCCTAACATATTAAAGTTGCT  637

seq1  TTCTGTTGATTCCATAACCAGTCCAACCTTGAACTTAAAGCAAACTTAGT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTTGATTCCATAACCAGTCCAACCTTGAACTTAAAGCAAACTTAGT  687

seq1  AATATCTACATTTAGTATATCAGAAAACAATAAGAAAAGTCAGGATTACA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCTACATTTAGTATATCAGAAAACAATAAGAAAAGTCAGGATTACA  737

seq1  AAACACAAAAATGTGATAGCCTGCATTTGTCAAGGCAATCTAGTATTGGG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACAAAAATGTGATAGCCTGCATTTGTCAAGGCAATCTAGTATTGGG  787

seq1  AGGCTACATTATGTACTTCTAAGTAATATGCTCTGTATCTGAGTTTACAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTACATTATGTACTTCTAAGTAATATGCTCTGTATCTGAGTTTACAA  837

seq1  TAGGGATTAAAATCTTGAGTTTATTAACAACTTCAGAATGCCCAGATATA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGATTAAAATCTTGAGTTTATTAACAACTTCAGAATGCCCAGATATA  887

seq1  TGTAGAGTGCACATGCACACTGTTATGAAAACATCAAAAAATATTTAAAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGAGTGCACATGCACACTGTTATGAAAACATCAAAAAATATTTAAAT  937

seq1  GTTGGATTCTTTTCTATAGACATTTTCCCCAGAAGTATTAAGGGGGAATC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGATTCTTTTCTATAGACATTTTCCCCAGAAGTATTAAGGGGGAATC  987

seq1  TCTACATTTGGAGATAAAATTATACCTCACAGATACAGAGGAGGTGAATT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACATTTGGAGATAAAATTATACCTCACAGATACAGAGGAGGTGAATT  1037

seq1  C  1050
      |
seq2  C  1038