BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-150O23
Chromosome7 (Build37)
Map Location 66,596,215 - 66,770,132
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040985
Upstream geneAtp10a, LOC621446, LOC668811, LOC668813, LOC668815, EG668818, Ube3a
Downstream geneLOC100041010, LOC100041029, LOC100041051, Pwcr1, LOC664788, Snrpn, Snurf, EG664849
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-150O23.bB6Ng01-150O23.g
ACCDH946884DH946885
length1,0791,177
definitionDH946884|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150O23, 5' end.DH946885|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150O23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(66,769,053 - 66,770,132)(66,596,215 - 66,597,410)
sequence
gaattctgtctaggactgggtcaatgatgacaacccaatgtcatgaagaa
aggtgatgacataaaattcatgctcaataggattacactgaggcccaacc
agggcgacagggtcacaagaggtccgttgactccttggggggctctaggg
tgacttccctgaagtcctcatatgcccttgccctgtttcccatgagagga
aatgtggacatctagggtgcacattggttggcaaacactgcatgccaaca
agcacctagtcccacaatggaaccttgggcatttctgcaaggatcgcccc
ttgctcatgacaatgtcttttctggtgttttgcagtcatctcacatgcca
ccttggaaggcagagaaacacagataatcaggtaagtggtcagaacatgg
taaagcctccacatccaggtgacctcccccttcatgatttggctttcaat
tctcagccagtcattccttttggaattagggataacaaaatggtatacaa
aggtaccaaaggagctcgatttaggctatgttctccgatgtacatcccct
ggtttgtaacgttttaaggaatgtgttcaactcccgataattgttttttc
ataattttgacctacttcttatggagagaggaggatgacattttttgaat
gttgggatctcatactttgatgcttacaattttatggcaaatagctacag
gaggacaacactggcctccagggccttatggtactcttcctttcccttga
caggagaggcccaagtgaccgatcctttcttagggaaaaagaaggattct
atgatatccaaaaaggctgtcctccccaggatgggttcacaaagggcaat
ccctctagcagatattccaaagatctcaccccagagacaatttacccatg
tggatagggtgagatatcatttttaccttggtgcccaccacattccaaat
ttccttcatggtatcattagggcacttactgaacctcactgcagaatcac
tgaggaaaaaaagctcctacacattaggttgttacaggtaggccagggtg
tttaagaaccctatttccactttggattc
gaattccaacaaagctttactgcttcctctagaagcaataggcacatcac
atgtgaccttagcctcacaattttgtggggatcaacactcaagttgagct
cccaaagaactatggacaggacaataaaacacaactacagataggtattt
cgagtgtgattaaagtaaccaatggtttcttattcaaagttcaaaggtgg
catcagaactctgtaagctctatattgcatgacagcactcactgtgaaat
gtgattactgaaaatctcccgagaatcctgggcctagggcacaggacaaa
tgtctagccatggatccatttgtgttaagctgtaatgggttgcccagcct
ctaacacatgaaggtaaccactactgctggatcaaatttgggccttggtg
tcatgaatcaaagtggaattaagttcctttacacctggccttccctgtat
caaccgaatgtataggccattgtttcctcagtgattctgcagtgaggttc
agtaagagccccaaatgataccatgaagaaaatttggaaggtggtggaaa
ccaaggcaaaaatgaaaatctcaccctctccacatgggtgaattccctgt
gggttgaaatctttggaatatttgctaaagggattgctctttgtgaacac
ttcatgtggaggccagccttgttggatatcatagaatccttctctctccc
taagaaaggctctgtcccttgggccttctgtgtcatgggaaaggaagagt
cctaaatggccctggaggcttgtgttgtcatcctgtacctattcaccatg
ggccacataagaatccaagtatgagatcccaacatactaaaaatgtcatc
ttctctccatgagaagtaggtcaaaattatgagaaatctattatcagagt
tgacaattccttaaaacttgcaactaggatctacatgggagacatagcct
aatcgagcttcgtttggtgatgcatactattttcttattcttaaattcaa
aaggccgattggctcagaatgaaaccaaacatgaagggcctggcatatgg
aagggaggctttagccatgatctttcccactaccttgattcttgtgattc
tctggcttcaagtgggcatgtcatagactgcaatgacagaagacgtcatg
agcaatgggccgaggcctgtgcagaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_66769053_66770132
seq2: B6Ng01-150O23.b_48_1126 (reverse)

seq1  GAAT-CAAAGTGGAATTAGGTTCTTTAAACA-CCTGGCCTAACCCTGTAT  48
      |||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||  |||||| 
seq2  GAATCCAAAGTGGAAATAGGGTTCTTAAACACCCTGGCCTA--CCTGTAA  48

seq1  CAACCTAATGTGTA-GAGCTTTTTTTCCTCAGTGATTCTGCAGTGAGGTT  97
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCTAATGTGTAGGAGCTTTTTTTCCTCAGTGATTCTGCAGTGAGGTT  98

seq1  CAGTAAGTGCCCTAAATGATACCATGAAGGAAATTTGGAATGTGGTGGGT  147
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CAGTAAGTGCCCT-AATGATACCATGAAGGAAATTTGGAATGTGGTGGGC  147

seq1  ACCAAGGTAAAAATGAATATCTCACCCTATCCACATTGGTAAATTGTCTC  197
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  ACCAAGGTAAAAATG-ATATCTCACCCTATCCACATGGGTAAATTGTCTC  196

seq1  TGGGGTGAGATCTTTGGAATATCTGCTAGAGGGATTGCCCTTTGTGAACC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTGAGATCTTTGGAATATCTGCTAGAGGGATTGCCCTTTGTGAACC  246

seq1  CATCCTGGGGAGGACAGCCTTTTTGGATATCATAGAATCCTTCTTTTTCC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTGGGGAGGACAGCCTTTTTGGATATCATAGAATCCTTCTTTTTCC  296

seq1  CTAAGAAAGGATCGGTCACTTGGGCCTCTCCTGTCAAGGGAAAGGAAGGG  347
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CTAAGAAAGGATCGGTCACTTGGGCCTCTCCTGTCAAGGGAAAGGAAGAG  346

seq1  TACCATAAGGCCCTGGAGGCCAGTGTTGTCCTCCTGTAGCTATTTGCCAT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCATAAGGCCCTGGAGGCCAGTGTTGTCCTCCTGTAGCTATTTGCCAT  396

seq1  AAAATTGTAAGCATCAAAGTATGAGATCCCAACATTCAAAAAATGTCATC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTGTAAGCATCAAAGTATGAGATCCCAACATTCAAAAAATGTCATC  446

seq1  CTCCTCTCTCCATAAGAAGTAGGTCAAAATTATGAAAAAACAATTATCGG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCTCTCCATAAGAAGTAGGTCAAAATTATGAAAAAACAATTATCGG  496

seq1  GAGTTGAACACATTCCTTAAAACGTTACAAACCAGGGGATGTACATCGGA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTGAACACATTCCTTAAAACGTTACAAACCAGGGGATGTACATCGGA  546

seq1  GAACATAGCCTAAATCGAGCTCCTTTGGTACCTTTGTATACCATTTTGTT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATAGCCTAAATCGAGCTCCTTTGGTACCTTTGTATACCATTTTGTT  596

seq1  ATCCCTAATTCCAAAAGGAATGACTGGCTGAGAATTGAAAGCCAAATCAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTAATTCCAAAAGGAATGACTGGCTGAGAATTGAAAGCCAAATCAT  646

seq1  GAAGGGGGAGGTCACCTGGATGTGGAGGCTTTACCATGTTCTGACCACTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGGGAGGTCACCTGGATGTGGAGGCTTTACCATGTTCTGACCACTT  696

seq1  ACCTGATTATCTGTGTTTCTCTGCCTTCCAAGGTGGCATGTGAGATGACT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGATTATCTGTGTTTCTCTGCCTTCCAAGGTGGCATGTGAGATGACT  746

seq1  GCAAAACACCAGAAAAGACATTGTCATGAGCAAGGGGCGATCCTTGCAGA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAACACCAGAAAAGACATTGTCATGAGCAAGGGGCGATCCTTGCAGA  796

seq1  AATGCCCAAGGTTCCATTGTGGGACTAGGTGCTTGTTGGCATGCAGTGTT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCCAAGGTTCCATTGTGGGACTAGGTGCTTGTTGGCATGCAGTGTT  846

seq1  TGCCAACCAATGTGCACCCTAGATGTCCACATTTCCTCTCATGGGAAACA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAACCAATGTGCACCCTAGATGTCCACATTTCCTCTCATGGGAAACA  896

seq1  GGGCAAGGGCATATGAGGACTTCAGGGAAGTCACCCTAGAGCCCCCCAAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAGGGCATATGAGGACTTCAGGGAAGTCACCCTAGAGCCCCCCAAG  946

seq1  GAGTCAACGGACCTCTTGTGACCCTGTCGCCCTGGTTGGGCCTCAGTGTA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCAACGGACCTCTTGTGACCCTGTCGCCCTGGTTGGGCCTCAGTGTA  996

seq1  ATCCTATTGAGCATGAATTTTATGTCATCACCTTTCTTCATGACATTGGG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTATTGAGCATGAATTTTATGTCATCACCTTTCTTCATGACATTGGG  1046

seq1  TTGTCATCATTGACCCAGTCCTAGACAGAATTC  1080
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCATCATTGACCCAGTCCTAGACAGAATTC  1079

seq1: chr7_66596215_66597410
seq2: B6Ng01-150O23.g_66_1242

seq1  GAATTCCAACAAAGCTTTACTGCTTCCTCTAGAAGCAATAGGCACATCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAACAAAGCTTTACTGCTTCCTCTAGAAGCAATAGGCACATCAC  50

seq1  ATGTGACCTTAGCCTCACAATTTTGTGGGGATCAACACTCAAGTTGAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGACCTTAGCCTCACAATTTTGTGGGGATCAACACTCAAGTTGAGCT  100

seq1  CCCAAAGAACTATGGACAGGACAATAAAACACAACTACAGATAGGTATTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAAGAACTATGGACAGGACAATAAAACACAACTACAGATAGGTATTT  150

seq1  CGAGTGTGATTAAAGTAACCAATGGTTTCTTATTCAAAGTTCAAAGGTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGTGTGATTAAAGTAACCAATGGTTTCTTATTCAAAGTTCAAAGGTGG  200

seq1  CATCAGAACTCTGTAAGCTCTATATTGCATGACAGCACTCACTGTGAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGAACTCTGTAAGCTCTATATTGCATGACAGCACTCACTGTGAAAT  250

seq1  GTGATTACTGAAAATCTCCCGAGAATCCTGGGCCTAGGGCACAGGACAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTACTGAAAATCTCCCGAGAATCCTGGGCCTAGGGCACAGGACAAA  300

seq1  TGTCTAGCCATGGATCCATTTGTGTTAAGCTGTAATGGGTTGCCCAGCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTAGCCATGGATCCATTTGTGTTAAGCTGTAATGGGTTGCCCAGCCT  350

seq1  CTAACACATGAAGGTAACCACTACTGCTGGATCAAATTTGGGCCTTGGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACACATGAAGGTAACCACTACTGCTGGATCAAATTTGGGCCTTGGTG  400

seq1  TCATGAATCAAAGTGGAATTAAGTTCCTTTACACCTGGCCTTCCCTGTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGAATCAAAGTGGAATTAAGTTCCTTTACACCTGGCCTTCCCTGTAT  450

seq1  CAACCGAATGTATAGGCCATTGTTTCCTCAGTGATTCTGCAGTGAGGTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCGAATGTATAGGCCATTGTTTCCTCAGTGATTCTGCAGTGAGGTTC  500

seq1  AGTAAGAGCCCCAAATGATACCATGAAGAAAATTTGGAAGGTGGTGGAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAGAGCCCCAAATGATACCATGAAGAAAATTTGGAAGGTGGTGGAAA  550

seq1  CCAAGGCAAAAATGAAAATCTCACCCTCTCCACATGGGTGAATTCCCTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGCAAAAATGAAAATCTCACCCTCTCCACATGGGTGAATTCCCTGT  600

seq1  GGGTTGAAATCTTTGGAATATTTGCTAAAGGGATTGCTCTTTGTGAACAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGAAATCTTTGGAATATTTGCTAAAGGGATTGCTCTTTGTGAACAC  650

seq1  TTCATGTGGAGGCCAGCCTTGTTGGATATCATAGAATCCTTCTCTCTCCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGTGGAGGCCAGCCTTGTTGGATATCATAGAATCCTTCTCTCTCCC  700

seq1  TAAGAAAGGCTCTGTCCCTTGGGCCTTCTGTGTCATGGGAAAGGAAGAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAAGGCTCTGTCCCTTGGGCCTTCTGTGTCATGGGAAAGGAAGAGT  750

seq1  CCTAAATGGCCCTGGAGGCTTGTGTTGTCATCCTGTACCTATTCACCAT-  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CCTAAATGGCCCTGGAGGCTTGTGTTGTCATCCTGTACCTATTCACCATG  800

seq1  GGCCACATAAGAATCCAAGTATGAGATCCCAACATACTAAAAATGTCATC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCACATAAGAATCCAAGTATGAGATCCCAACATACTAAAAATGTCATC  850

seq1  TTCTCTCCATGAGAAGTAGGTCAAAATTATGAGAAATCTATTATCAGGAG  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTCTCTCCATGAGAAGTAGGTCAAAATTATGAGAAATCTATTATCA-GAG  899

seq1  TTGAACAAATTCCTTAAAACTTTGCAAACTAGGGATCTACATGGGAGAAC  949
      ||||   ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||
seq2  TTGA--CAATTCCTTAAAAC-TTGC-AACTA-GGATCTACATGGGAG-AC  943

seq1  ATAGCCTAAATCGAGCTTCGTTTGGTGATTGCATACTATTTTCTTATTCC  999
      ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| 
seq2  ATAGCCT-AATCGAGCTTCGTTTGGTGA-TGCATACTATTTTCTTATTCT  991

seq1  TAAATTCCAAAAGGGCCGATTGGCTCAGAATTGAAACCAAAACATGAAGG  1049
      |||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
seq2  TAAATTC--AAAAGGCCGATTGGCTCAGAA-TGAAACC-AAACATGAAGG  1037

seq1  GCCTGGGCATATGGAAGGGGAGGCTTTAGCCATGATCTTTCCACATACC-  1098
      |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| 
seq2  GCCT-GGCATATGGAA-GGGAGGCTTTAGCCATGATCTTTCCCACTACCT  1085

seq1  TGATATCTGTGGTTCTCTGCTTTCCAAGGTGGCATGTCATATGACTGCAA  1148
      ||||   |||| |||||||  || ||||  ||||||||||| ||||||  
seq2  TGATTCTTGTGATTCTCTGGCTT-CAAGTGGGCATGTCATA-GACTGC--  1131

seq1  AAAAGACCAGAAAAGACAGTCATGAGCAATGGGC--AGGCCT-TGCAGAA  1195
       || |||   | ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||
seq2  -AATGAC---AGAAGAC-GTCATGAGCAATGGGCCGAGGCCTGTGCAGAA  1176

seq1  A  1196
      |
seq2  A  1177