BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-164B02
Chromosome7 (Build37)
Map Location 62,009,822 - 62,168,150
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLuzp2
Upstream geneLOC668789, Mrps33p, LOC622146
Downstream geneLOC668796, Siglech, Tubgcp5, Cyfip1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-164B02.bB6Ng01-164B02.g
ACCDH956493DH956494
length1,1731,164
definitionDH956493|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-164B02, 5' end.DH956494|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-164B02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(62,166,967 - 62,168,150)(62,009,822 - 62,011,090)
sequence
gaattcagtaatcctcctgcttctgcctcccaagtgctgggattaaaagc
gtgtgccaccactgcccaacttatatctactcttaacatccttgatataa
aatgttattttcctgactccattaatttctcttttaccaattttcctgtt
caaataacacctgtggggtcagcaaggtggcacagctacaaaggctcttg
ctgtcaaggtcaagggcctaaattatatactcagacctacatggtggaag
gagagaggcagaccccagcaagttgtcctctgtcttaacgcttgtgtcat
gacatgtgtactcctttgtccacatacaaaaaagaatgttaaaaaaaata
aatcctatattgaggtcaccacttcatccttgaaatgataccacacttta
tccattcattcattaacgagcaactaaactaatctcacagtgtatttatt
aataatcatggatatgcaagtatctctgaagtgtgctgaccaagaaccac
acatgcacacacatttgagtgatatagctgggtaatatgatagatttgtt
ttaatcttcttgacaaaggtttgccctaatttccaaagtggttatactga
tttagatgctcaacaatagttaacaacataattacaaactggcatcctca
ccagcattgtttgttttctcaatgatcacaggcctggctggagtaaaatg
gagtatcagtgtgcattgacatgggtttacttcatggataactcctttta
tagtatatttgttagccaacaatccttcttatgagaactccatgcttagc
taagtgaacattggtggattatgttttcttctgacttttaatttcttgaa
ttgcttttgtatttaattctgggtatttgactcctgttgacttgagactc
attataagcaaagttccctgtcttggttagtcataacgtgatcaaaagaa
gtgcaactggacacagcttcccaatgctttgacaattagaaataattgtg
tcattttaataaagaattctgttactctatggtgtcagcactgggtttca
gtagcagctcttttaatggatgtcctgcaatttctgccctacaatcctgg
tccgaaattctcctgcgaatgctggaactagaagaatttaatcaattcta
agagttcaggcacagagcttttt
gaattctttatttgactgtgatatgcactttatatgggatgtcaacggaa
tgctgaatgttagaccatctctatttctttaatttaaaattcagtcaaat
ttcaccagatcaaaggctctccgtagaattcatctagaagtgaatagcct
gaagctgacttgggggattggtggatctttaacatcaaaatgaagaagat
gataagatatgattagatggttttgcttctgttttacttctatgcttcag
agtaaatggaaaatgctgagagcagtgccttaaagttccaaacatggaat
ttgtagaatgtggtaataagaagcagaggaaaataacactgtagaaagta
tatctggccctttcaatccaaggtacgggatcataaagagtcaaattgga
agtcatgatagctatcacaatatctcatcaagatagctaaacttatgtac
ataagttttgagatacacacacaaaaatattagtacatatatttgcctcc
caccatctgtaataaactatgggatatcttgaactataacataaatgatt
atccactaatggatagtcagctttaaatatcgacctaattaagctcttga
gctcttgacagttcctcagtaactggcagaaaaatgctatgcctaggtga
agtgggaagatgaacctggcatccccagcataacgccatagaggctcata
caaagaagagtgaagggttgggccagggcttttatatcgtctcaagtttt
agtcccaatgatctcacattttggaaactgccataaattttaatacagaa
aaatcatagatctgcataactgttttattttactttaattgtagaaacat
tatcattttttatggtgagacagaagatacattaccctgaacataggaaa
caggaactataaggcaataaacagaaagtagaaactgtgacttaaatgca
ggaaacagacgattacctaacacaagaggtaacagctatgcctaaagctt
cagaagtagaaatattcccaacaaaggaagttaatctaccagtttaggag
catgacctgtcatgatgaagagtaatgttatcagaattcctgaacaaagt
attcacccagcttatttccaggagaagaaacgaaggccctcttccatggt
aatggccatgagtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_62166967_62168150
seq2: B6Ng01-164B02.b_46_1218 (reverse)

seq1  AAAACGCTCTGTTGCTTGGAGACTCTTAGAAATGATTAAAATTCTTCCCT  50
      |||| |||||| ||| ||   |||||||||| ||||| |||||||||   
seq2  AAAAAGCTCTG-TGCCTG--AACTCTTAGAATTGATT-AAATTCTTC---  43

seq1  TAGGTTCAGCAATCACCAGGAG-ATGTCTGAGACAGAGATTGTAGGGCAG  99
      ||| | ||||| ||  |||||| || || ||  ||| |||||||||||| 
seq2  TAGTTCCAGCATTC-GCAGGAGAATTTCGGA-CCAG-GATTGTAGGGCA-  89

seq1  GAAATTGCAGGGACCATCCCATTACAAAGAGCTGCTACTGAAACACAGTG  149
      |||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||
seq2  GAAATTGCAGG--ACAT-CCATTA-AAAGAGCTGCTACTGAAACCCAGTG  135

seq1  CTGACACCATAGAGGTAACAGAA-TCTTTA-TAAAATGACACAAATAATT  197
      ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||
seq2  CTGACACCATAGA-GTAACAGAATTCTTTATTAAAATGACAC-AATTATT  183

seq1  TCTAA-TGTCAAAGCATTGGGAGGCTGTGTCCAGTTGCACT--CTATGAT  244
      ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||
seq2  TCTAATTGTCAAAGCATTGGGAAGCTGTGTCCAGTTGCACTTCTTTTGAT  233

seq1  CACGTTATGACTAACCAAGACAGGGAACTTTGCTTATAATGAGTCTCAAG  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGTTATGACTAACCAAGACAGGGAACTTTGCTTATAATGAGTCTCAAG  283

seq1  TCAACAGGAGTCAAATACCCAGAATTAAATACAAAAGCAATTCAAGAAAT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACAGGAGTCAAATACCCAGAATTAAATACAAAAGCAATTCAAGAAAT  333

seq1  TAAAAGTCAGAAGAAAACATAATCCACCAATGTTCACTTAGCTAAGCATG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGTCAGAAGAAAACATAATCCACCAATGTTCACTTAGCTAAGCATG  383

seq1  GAGTTCTCATAAGAAGGATTGTTGGCTAACAAATATACTATAAAAGGAGT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCTCATAAGAAGGATTGTTGGCTAACAAATATACTATAAAAGGAGT  433

seq1  TATCCATGAAGTAAACCCATGTCAATGCACACTGATACTCCATTTTACTC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCATGAAGTAAACCCATGTCAATGCACACTGATACTCCATTTTACTC  483

seq1  CAGCCAGGCCTGTGATCATTGAGAAAACAAACAATGCTGGTGAGGATGCC  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGGCCTGTGATCATTGAGAAAACAAACAATGCTGGTGAGGATGCC  533

seq1  AGTTTGTAATTATGTTGTTAACTATTGTTGAGCATCTAAATCAGTATAAC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGTAATTATGTTGTTAACTATTGTTGAGCATCTAAATCAGTATAAC  583

seq1  CACTTTGGAAATTAGGGCAAACCTTTGTCAAGAAGATTAAAACAAATCTA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTGGAAATTAGGGCAAACCTTTGTCAAGAAGATTAAAACAAATCTA  633

seq1  TCATATTACCCAGCTATATCACTCAAATGTGTGTGCATGTGTGGTTCTTG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATTACCCAGCTATATCACTCAAATGTGTGTGCATGTGTGGTTCTTG  683

seq1  GTCAGCACACTTCAGAGATACTTGCATATCCATGATTATTAATAAATACA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGCACACTTCAGAGATACTTGCATATCCATGATTATTAATAAATACA  733

seq1  CTGTGAGATTAGTTTAGTTGCTCGTTAATGAATGAATGGATAAAGTGTGG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGATTAGTTTAGTTGCTCGTTAATGAATGAATGGATAAAGTGTGG  783

seq1  TATCATTTCAAGGATGAAGTGGTGACCTCAATATAGGATTTATTTTTTTT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATTTCAAGGATGAAGTGGTGACCTCAATATAGGATTTATTTTTTTT  833

seq1  AACATTCTTTTTTGTATGTGGACAAAGGAGTACACATGTCATGACACAAG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTCTTTTTTGTATGTGGACAAAGGAGTACACATGTCATGACACAAG  883

seq1  CGTTAAGACAGAGGACAACTTGCTGGGGTCTGCCTCTCTCCTTCCACCAT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTAAGACAGAGGACAACTTGCTGGGGTCTGCCTCTCTCCTTCCACCAT  933

seq1  GTAGGTCTGAGTATATAATTTAGGCCCTTGACCTTGACAGCAAGAGCCTT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGTCTGAGTATATAATTTAGGCCCTTGACCTTGACAGCAAGAGCCTT  983

seq1  TGTAGCTGTGCCACCTTGCTGACCCCACAGGTGTTATTTGAACAGGAAAA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGCTGTGCCACCTTGCTGACCCCACAGGTGTTATTTGAACAGGAAAA  1033

seq1  TTGGTAAAAGAGAAATTAATGGAGTCAGGAAAATAACATTTTATATCAAG  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTAAAAGAGAAATTAATGGAGTCAGGAAAATAACATTTTATATCAAG  1083

seq1  GATGTTAAGAGTAGATATAAGTTGGGCAGTGGTGGCACACGCTTTTAATC  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTAAGAGTAGATATAAGTTGGGCAGTGGTGGCACACGCTTTTAATC  1133

seq1  CCAGCACTTGGGAGGCAGAAGCAGGAGGATTACTGAATTC  1184
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCACTTGGGAGGCAGAAGCAGGAGGATTACTGAATTC  1173

seq1: chr7_62009822_62011090
seq2: B6Ng01-164B02.g_68_1231

seq1  GAATTCTTTATTTGACTGTGATATGCACTTTATATGGGATGTCAACGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTATTTGACTGTGATATGCACTTTATATGGGATGTCAACGGAA  50

seq1  TGCTGAATGTTAGACCATCTCTATTTCTTTAATTTAAAATTCAGTCAAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAATGTTAGACCATCTCTATTTCTTTAATTTAAAATTCAGTCAAAT  100

seq1  TTCACCAGATCAAAGGCTCTCCGTAGAATTCATCTAGAAGTGAATAGCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACCAGATCAAAGGCTCTCCGTAGAATTCATCTAGAAGTGAATAGCCT  150

seq1  GAAGCTGACTTGGGGGATTGGTGGATCTTTAACATCAAAATGAAGAAGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTGACTTGGGGGATTGGTGGATCTTTAACATCAAAATGAAGAAGAT  200

seq1  GATAAGATATGATTAGATGGTTTTGCTTCTGTTTTACTTCTATGCTTCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGATATGATTAGATGGTTTTGCTTCTGTTTTACTTCTATGCTTCAG  250

seq1  AGTAAATGGAAAATGCTGAGAGCAGTGCCTTAAAGTTCCAAACATGGAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAATGGAAAATGCTGAGAGCAGTGCCTTAAAGTTCCAAACATGGAAT  300

seq1  TTGTAGAATGTGGTAATAAGAAGCAGAGGAAAATAACACTGTAGAAAGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAGAATGTGGTAATAAGAAGCAGAGGAAAATAACACTGTAGAAAGTA  350

seq1  TATCTGGCCCTTTCAATCCAAGGTACGGGATCATAAAGAGTCAAATTGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTGGCCCTTTCAATCCAAGGTACGGGATCATAAAGAGTCAAATTGGA  400

seq1  AGTCATGATAGCTATCACAATATCTCATCAAGATAGCTAAACTTATGTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATGATAGCTATCACAATATCTCATCAAGATAGCTAAACTTATGTAC  450

seq1  ATAAGTTTTGAGATACACACACAAAAATATTAGTACATATATTTGCCTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGTTTTGAGATACACACACAAAAATATTAGTACATATATTTGCCTCC  500

seq1  CACCATCTGTAATAAACTATGGGATATCTTGAACTATAACATAAATGATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATCTGTAATAAACTATGGGATATCTTGAACTATAACATAAATGATT  550

seq1  ATCCACTAATGGATAGTCAGCTTTAAATATCGACCTAATTAAGCTCTTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCACTAATGGATAGTCAGCTTTAAATATCGACCTAATTAAGCTCTTGA  600

seq1  GCTCTTGACAGTTCCTCAGTAACTGGCAGAAAAATGCTATGCCTAGGTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTGACAGTTCCTCAGTAACTGGCAGAAAAATGCTATGCCTAGGTGA  650

seq1  AGTGGGAAGATGAACCTGGCATCCCCAGCATAACGCCATAGAGGCTCATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGAAGATGAACCTGGCATCCCCAGCATAACGCCATAGAGGCTCATA  700

seq1  CAAAGAAGAGTGAAGGGTTGGGCCAGGGCTTTTATATCGTCTCAAGTTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAAGAGTGAAGGGTTGGGCCAGGGCTTTTATATCGTCTCAAGTTTT  750

seq1  AGTCCCAATGATCTCACATTTTGGAAACTGCCATAAATTTTAATACAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCCAATGATCTCACATTTTGGAAACTGCCATAAATTTTAATACAGAA  800

seq1  AAATCATAGATCTGCATAACTG-TTTATTTCACTTTAATTGTAGAAACAT  849
      |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AAATCATAGATCTGCATAACTGTTTTATTTTACTTTAATTGTAGAAACAT  850

seq1  TATCATTTTTTATGGTGAGACAGAAGATACATTACCCTGAACATAGGAAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATTTTTTATGGTGAGACAGAAGATACATTACCCTGAACATAGGAAA  900

seq1  CAGGAACTATAA-GCAATAAACAGAAAGTAGAAACTGTGACTTAAATGCA  948
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAACTATAAGGCAATAAACAGAAAGTAGAAACTGTGACTTAAATGCA  950

seq1  GGAAACAGGAACGATTACCTAAACACAAGAGGTAACAGCTATGCCTAAAG  998
      ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACAG--ACGATTACCT-AACACAAGAGGTAACAGCTATGCCTAAAG  997

seq1  CTCAGGAGGTAAGAAATATTCCCCAAACAAAGGAAGTTTAATCTACAAGT  1048
      ||   || || ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||
seq2  CTTCAGAAGT-AGAAATATTCCC--AACAAAGGAAG-TTAATCTACCAGT  1043

seq1  TTAGGAGCATGACCTGTCAATGATGGAAGAGTAATGTTTATCAG-ATTCT  1097
      |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| 
seq2  TTAGGAGCATGACCTGTC-ATGAT-GAAGAGTAATG-TTATCAGAATTCC  1090

seq1  AGAAC-AAGTAATCACCTAGCTATTTTCCAGGAGAAGAAACAGAGGCCCT  1146
       |||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||
seq2  TGAACAAAGTATTCACCCAGCTTATTTCCAGGAGAAGAAACGAAGGCCCT  1140

seq1  CTTACAATGGGGAAATGGCCAAATGAGCCTGATATCATGGCACTATTGAG  1196
      ||| ||    || |||||||  ||||| |                     
seq2  CTTCCA---TGGTAATGGCC--ATGAGTC---------------------  1164

seq1  TTATCCCAGGACTAAGGACATGGAAGGAGAAAGATCTCTGACTAGGCAAT  1246
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  1164

seq1  ACAGAAATCCTATGCCATGAGTC  1269
                             
seq2  -----------------------  1164