BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-167N22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 84,875,365 - 85,041,183
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG244071
Downstream geneA330068G13Rik, Ntrk3, Mrpl46, Mrps11, Det1, Isg20l1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-167N22.bB6Ng01-167N22.g
ACCDH959255DH959256
length9701,112
definitionDH959255|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167N22, 5' end.DH959256|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167N22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,875,365 - 84,876,336)(85,040,067 - 85,041,183)
sequence
gaattcaaagtcatattactcaccaattgtttatgtcatgttgtgcttga
aaaagcattgaccaattcaaaatacccagaaaaagaagcctgaagccaca
ccctagctcccatttttatattaaccctctaaaacagattaccttaagtt
cttcacgttgattaactggtatgtaaaaaataatgaggaccctgcagcta
gggtgaataaccttgagacaaacatgacagaaggcatgtagattagacat
agggatcaccaggcaagaaatggtagatatgtgtctatggaaccagaaat
ctcctgacagcagaacttaggttaggttattttctacaatatcctactgt
ctgatctttactccccccaacaaaaaagccatgctcaatttaaatcatgt
ctaacggttgaattatttctttactctcccgtgagctgaatatgttctat
attagatgttattttattttagatgttatttaattgttcaagaaggtata
tgttataaaagtacagtaatgtaccaaactatttctatctatgcccaaag
gtgctattccttctcctgaaagcacaattgatactagtctcgccgttatc
actccagtttaaaggcaaccacgcttctttttcctatggagtaaagaaat
cacaaaggatcccacatgtaaggatgtattctgattccagaacacagtct
gctcttcttccttctgtattgaataaaagaggctacctatctgcctaaat
ttgttacaatcttttacaactactttcatctcaaatattgattaagaata
aatagaaatgagaacatattgcttttactatcaggaaataaacttcaaag
aaataaaattaagcatgttagatgattttagtttctgattgacatttata
aatcagctattttatttaaatagcttgtttatattgctgtttcaaggaat
tgtagagagatgtgtgtgta
gaattccttagggatgctgtgcctaattgtgttttctgtactgtagaaag
gcatcaaccaagaagcctcattcacagggaactgtgcatttccagtatgc
acacaagacctgatacactggtgtcagtttcccaactcacccatcacatt
caagggggtgagcagaaggcatcagtaagtgcaacaaagaaaccccaggt
tgtgttgggtatgtagctgtaatgagcatcagtagaaagatggggcatag
gagagacctgtgtagaacttagtcacaggatcctctccttcatgaatgcc
cagtaagcatcctagcctccattgggaagaaacgggctcattccttcttg
gaacctagaaaatacaccaaattcacatctttaaggaataaataaaatta
ggagaagcataaaatacgttagtatttttacaagtgacaaaagagggctg
gcaagagtgttgatttgatagtctgactatttatgtaataatattgtatt
catctattatttactttcattcgtggtcctctaagtgagctgtgttttcc
caactctgctctggtgccattttccacaaagtatctgacccattggcagt
acctgccttacttttggaaacactagagtgaatgtgttacctttgttgtg
gcccatgccatttgtggtgttgtcatcatggttgttaatgttttattggt
ttatgttcattatacaaagtgaggtttcaataaagataatttctttcaag
catgtcaactacatcgatcatatatatcccatagtgtctttcccgttttt
ccttccctttttccttccttcttcccttccttcagtaacaccttttactt
atatgaatgcatatatgtatgtatctatgtacatatgtatatatatatat
gtatatatgcatgtgtgtctatcctttacatatttacataaaattcagtc
tataaaatgagagaaacattgtacctttctctttttagatcttttttcac
aggtcttccagttcatctatttttctaaaatattgatatttcattattaa
aaatcagatctattaatgattcctatgatatttctgcttacttcatagat
aaggctagccca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_84875365_84876336
seq2: B6Ng01-167N22.b_49_1018

seq1  GAATTCAAAGTCATATTACTCACCAATTGTTTATGTCATGTTGTGCTTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGTCATATTACTCACCAATTGTTTATGTCATGTTGTGCTTGA  50

seq1  AAAAGCATTGACCAATTCAAAATACCCAGAAAAAGAAGCCTGAAGCCACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCATTGACCAATTCAAAATACCCAGAAAAAGAAGCCTGAAGCCACA  100

seq1  CCCTAGCTCCCATTTTTATATTAACCCTCTAAAACAGATTACCTTAAGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAGCTCCCATTTTTATATTAACCCTCTAAAACAGATTACCTTAAGTT  150

seq1  CTTCACGTTGATTAACTGGTATGTAAAAAATAATGAGGACCCTGCAGCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACGTTGATTAACTGGTATGTAAAAAATAATGAGGACCCTGCAGCTA  200

seq1  GGGTGAATAACCTTGAGACAAACATGACAGAAGGCATGTAGATTAGACAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGAATAACCTTGAGACAAACATGACAGAAGGCATGTAGATTAGACAT  250

seq1  AGGGATCACCAGGCAAGAAATGGTAGATATGTGTCTATGGAACCAGAAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATCACCAGGCAAGAAATGGTAGATATGTGTCTATGGAACCAGAAAT  300

seq1  CTCCTGACAGCAGAACTTAGGTTAGGTTATTTTCTACAATATCCTACTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGACAGCAGAACTTAGGTTAGGTTATTTTCTACAATATCCTACTGT  350

seq1  CTGATCTTTACTCCCCCCAACAAAAAAGCCATGCTCAATTTAAATCATGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATCTTTACTCCCCCCAACAAAAAAGCCATGCTCAATTTAAATCATGT  400

seq1  CTAACGGTTGAATTATTTCTTTACTCTCCCGTGAGCTGAATATGTTCTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACGGTTGAATTATTTCTTTACTCTCCCGTGAGCTGAATATGTTCTAT  450

seq1  ATTAGATGTTATTTTATTTTAGATGTTATTTAATTGTTCAAGAAGGTATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGATGTTATTTTATTTTAGATGTTATTTAATTGTTCAAGAAGGTATA  500

seq1  TGTTATAAAAGTACAGTAATGTACCAAACTATTTCTATCTATGCCCAAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATAAAAGTACAGTAATGTACCAAACTATTTCTATCTATGCCCAAAG  550

seq1  GTGCTATTCCTTCTCCTGAAAGCACAATTGATACTAGTCTCGCCGTTATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTATTCCTTCTCCTGAAAGCACAATTGATACTAGTCTCGCCGTTATC  600

seq1  ACTCCAGTTTAAAGGCAACCACGCTTCTTTTTCCTATGGAGTAAAGAAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAGTTTAAAGGCAACCACGCTTCTTTTTCCTATGGAGTAAAGAAAT  650

seq1  CACAAAGGATCCCACATGTAAGGATGTATTCTGATTCCAGAACACAGTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAAGGATCCCACATGTAAGGATGTATTCTGATTCCAGAACACAGTCT  700

seq1  GCTCTTCTTCCTTCTGTATTGAATAAAAGAGGCTACCTATCTGCCTAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTCTTCCTTCTGTATTGAATAAAAGAGGCTACCTATCTGCCTAAAT  750

seq1  TTGTTACAATCTTTTACAACTACTTTCATCTCAAATATTGATTAAGAATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTACAATCTTTTACAACTACTTTCATCTCAAATATTGATTAAGAATA  800

seq1  AATAGAAATGAGAACATATTGCTTTTACTATCAGGAAATAAACTTCAAAA  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AATAGAAATGAGAACATATTGCTTTTACTATCAGGAAATAAACTTC-AAA  849

seq1  GAAATAAAATTAAGCATGTTAGATGATTTTAGTTTCTGATTGACATTTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATAAAATTAAGCATGTTAGATGATTTTAGTTTCTGATTGACATTTAT  899

seq1  AAATCAGCTATTTTATTTAAATAGCTTGTTTATATTGCTGTTTCAAGGAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAGCTATTTTATTTAAATAGCTTGTTTATATTGCTGTTTCAAGGAA  949

seq1  TTGTAGGAGAGATGTGTGTGTA  972
      ||||| ||||||||||||||||
seq2  TTGTA-GAGAGATGTGTGTGTA  970

seq1: chr7_85040067_85041183
seq2: B6Ng01-167N22.g_68_1179 (reverse)

seq1  TGGGCTAGGCACTTATCTATG-AGTATAGCAG-AATATCATTAGGAATCA  48
      ||||||||   |||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||
seq2  TGGGCTAG--CCTTATCTATGAAGTA-AGCAGAAATATCA-TAGGAATCA  46

seq1  TTTAATAGATCCTGATCTCTTAATAATGAAATTATCAATTTTTTTAGAAA  98
       ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||   |||
seq2  -TTAATAGAT-CTGAT-TTTTAATAATGAAA-TATCAATATTTTAGAAAA  92

seq1  ATAGATGAACTGG-AGACCTGGTGAAATAGATCT-AAAAGAGAAAGGTTA  146
      ||||||||||||| |||||||   ||| |||||| |||||||||||| ||
seq2  ATAGATGAACTGGAAGACCTGTGAAAAAAGATCTAAAAAGAGAAAGG-TA  141

seq1  CATGTTTTCTCTCATTTTATAGACTGAATTTTATGTAAATATGTAAAAGG  196
      ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CAATGTTTCTCTCATTTTATAGACTGAATTTTATGTAAATATGT-AAAGG  190

seq1  ATAGACACACATGCATATATACATATATATATATACATATGTACATAGAT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACACACATGCATATATACATATATATATATACATATGTACATAGAT  240

seq1  ACATACATATATGCATTCATATAAGT-AAAGGTGTTACTGAAGGAAGGGA  295
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACATATATGCATTCATATAAGTAAAAGGTGTTACTGAAGGAAGGGA  290

seq1  AGAAGGAAGGAAAAAGGGAAGGAAAAACGGGAAAGACACTATGGGATATA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGAAGGAAAAAGGGAAGGAAAAACGGGAAAGACACTATGGGATATA  340

seq1  TATGATCGATGTAGTTGACATGCTTGAAAGAAATTATCTTTATTGAAACC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATCGATGTAGTTGACATGCTTGAAAGAAATTATCTTTATTGAAACC  390

seq1  TCACTTTGTATAATGAACATAAACCAATAAAACATTAACAACCATGATGA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTTGTATAATGAACATAAACCAATAAAACATTAACAACCATGATGA  440

seq1  CAACACCACAAATGGCATGGGCCACAACAAAGGTAACACATTCACTCTAG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACACCACAAATGGCATGGGCCACAACAAAGGTAACACATTCACTCTAG  490

seq1  TGTTTCCAAAAGTAAGGCAGGTACTGCCAATGGGTCAGATACTTTGTGGA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCCAAAAGTAAGGCAGGTACTGCCAATGGGTCAGATACTTTGTGGA  540

seq1  AAATGGCACCAGAGCAGAGTTGGGAAAACACAGCTCACTTAGAGGACCAC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGCACCAGAGCAGAGTTGGGAAAACACAGCTCACTTAGAGGACCAC  590

seq1  GAATGAAAGTAAATAATAGATGAATACAATATTATTACATAAATAGTCAG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAAAGTAAATAATAGATGAATACAATATTATTACATAAATAGTCAG  640

seq1  ACTATCAAATCAACACTCTTGCCAGCCCTCTTTTGTCACTTGTAAAAATA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATCAAATCAACACTCTTGCCAGCCCTCTTTTGTCACTTGTAAAAATA  690

seq1  CTAACGTATTTTATGCTTCTCCTAATTTTATTTATTCCTTAAAGATGTGA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACGTATTTTATGCTTCTCCTAATTTTATTTATTCCTTAAAGATGTGA  740

seq1  ATTTGGTGTATTTTCTAGGTTCCAAGAAGGAATGAGCCCGTTTCTTCCCA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGGTGTATTTTCTAGGTTCCAAGAAGGAATGAGCCCGTTTCTTCCCA  790

seq1  ATGGAGGCTAGGATGCTTACTGGGCATTCATGAAGGAGAGGATCCTGTGA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGGCTAGGATGCTTACTGGGCATTCATGAAGGAGAGGATCCTGTGA  840

seq1  CTAAGTTCTACACAGGTCTCTCCTATGCCCCATCTTTCTACTGATGCTCA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGTTCTACACAGGTCTCTCCTATGCCCCATCTTTCTACTGATGCTCA  890

seq1  TTACAGCTACATACCCAACACAACCTGGGGTTTCTTTGTTGCACTTACTG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGCTACATACCCAACACAACCTGGGGTTTCTTTGTTGCACTTACTG  940

seq1  ATGCCTTCTGCTCACCCCCTTGAATGTGATGGGTGAGTTGGGAAACTGAC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTTCTGCTCACCCCCTTGAATGTGATGGGTGAGTTGGGAAACTGAC  990

seq1  ACCAGTGTATCAGGTCTTGTGTGCATACTGGAAATGCACAGTTCCCTGTG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTGTATCAGGTCTTGTGTGCATACTGGAAATGCACAGTTCCCTGTG  1040

seq1  AATGAGGCTTCTTGGTTGATGCCTTTCTACAGTACAGAAAACACAATTAG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGGCTTCTTGGTTGATGCCTTTCTACAGTACAGAAAACACAATTAG  1090

seq1  GCACAGCATCCCTAAGGAATTC  1117
      ||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGCATCCCTAAGGAATTC  1112