BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-186F10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 103,393,935 - 103,519,436
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOdz4, LOC670727
Upstream geneLOC666823, Frda-ps, EG666836
Downstream geneLOC666858, Nars2, Gab2, LOC100040457, Usp35, EG622320
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-186F10.bB6Ng01-186F10.g
ACCGA011209GA011210
length1,1871,140
definitionB6Ng01-186F10.b B6Ng01-186F10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(103,518,240 - 103,519,436)(103,393,935 - 103,395,083)
sequence
gaattctaggacagactcagatcgtatacaccttgttctgcttagacttc
agctatgtagcataggatgtctgggaaaactcctatgtatccttcaggac
tccatgtggaatgggtttctctggacactgttcggttctgaagtctctct
gcttatatgtctatggtctctcatcatgactaggtggcaaccttgtccat
gcctgggatctattatttatataaagtgctatacctcaccacatcagacc
agctgctcctctggaacagggactcaaatagaatccgttcagacactctg
gtagagggactggcacaggaaaagagcttgatgaataattgctgcattaa
ctaatgaagagactgattgaatgagtgagccaaaggccacatttctgagc
ctctgcgttacaaatgtttgggattgatataatcacctgtattatagtga
aattgctgcacttatgaacataatctaagatgtctattttctgcaacaag
ccattcaagacaagaatattcctttctttatttcacatgttaaacagtaa
caaaaaccaaacccggatctttggtcaacccttaaacactaagctattaa
tacgatgttttgattttcttggatgaccctgatggattcatccaggcatt
ggtctgttctgagtctcttggagaggcctgtctcttatctgtgatggggg
gaaagtctgcttcagcatagaatctatttagacatctgcactgaaatagt
tgcagttatttattctttaaaagcaggaatcccatctgttctacacaccc
tggtctgcagttaagggcctggcataacggcaagagatttacagttctgc
acatggagaaatgttcaagattcaattcaacatcaggtttttgttttcat
tgacttctatttctttctgatacaagcatatgaaaggatgtaaccgtgag
ctgtcaaaacctttatgctcgtcccaacttttgaagttttcaagaaagaa
gcagtgtatacaaatacttcgcaattcttgcagaagtagagaagaagacc
ttttccaagctattttatgatcctgatgccaatgcctcacagaacaacac
aaagagacaatttttacaggttcattcacctccgataatcagatcaaaga
tctcatccaatactattgagtggccataaaacgatac

gaattcatgtgaggattcggtgagtcagagtctgctaaggtgcttagcac
agggccaagtctacgggaagtccccaataaagagcagctagatgctaacc
atgaaatgattaatgtggctatgctggctctgatgagagcctaatgagcg
aatggtttggtttgctttttgggaagtgctggagatcaaacttggagctt
cacgtcagcgaaatgagttttcttccactgcgttatacctgcagcctaat
caacactttgaaatttgtccccttctgaacctcacttgcttcctgttgct
gtgacaaacactatgaccaaaagccagttgagtaggaaagtggttgcttg
gcttgttggtgacagttagtcattgtcaaaagccaaggcaggatttaagg
caggagcttaaggcaaagaccactgaggaagactgtttattagcttgctt
ctcaaacgtacatgaagctatcatttttatacatcccagctacccagtga
tggcacccccccccacatcaattagtaattaagaaaatgacccacagatt
tgcccacaggccaggttctgctgtcaaaacacacttcgagatcttataaa
caaatatcaaaacaaacttccatttctctccctgcatatgtcactgccta
acactgaaaaataaaatcacaagatctcaaatgagataggcatgcaggag
tcatcaggcagtcttggcttagctttactgccaggcttagacacagcaaa
gtattctcccttaacttctagggccatttattcccatgtaaatggagaag
gtcaggtccacgagtattttccacaagggactggtaccaaatggctgtgt
gtggtacctaagcatggtattaaatgtcgttgaatcacatggtgataaag
ctggtttcggttcctcttcattctttgtgatttagtcgaggacgagcctg
attattggggctggttagatattttatacctcagtgacactcgctcagct
ccctgtaccaatgcttgttgtctgggtaggaagcaacagtattcaacttg
ggttccctgaaattacttcttcactctttctcactgtcaatgagatgtct
cttaatgaacacatggatcatgttgcttcttaaataaatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_103518240_103519436
seq2: B6Ng01-186F10.b_32_1218 (reverse)

seq1  GTAT-GTTTTATGCCAACTCAATAGTATTGTATTGAGAATTTTTTGTATC  49
      |||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||  | |||| |||
seq2  GTATCGTTTTATGGCCACTCAATAGTATTGGA-TGAGA--TCTTTG-ATC  46

seq1  TGGATTTATGGA-GTGGATTGACTTGTAAAAATTGTCTTCCTTTGTGTTG  98
      | ||||   ||| ||| ||  || ||||||||||||||  ||||||||||
seq2  T-GATTATCGGAGGTGAATGAACCTGTAAAAATTGTCT--CTTTGTGTTG  93

seq1  -TCTGTGA-GCATTGGCATCAGGATCATAAAATAGCTTGGAAAGGGTTCT  146
       ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
seq2  TTCTGTGAGGCATTGGCATCAGGATCATAAAATAGCTTGGAAAAGG-TCT  142

seq1  TCCTTCTTCTACTTCTTGCAAGAATTTGCGAAGTATTTGTATACACCTGC  196
      | |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||
seq2  T-CTTC-TCTACTTC-TGCAAGAA-TTGCGAAGTATTTGTATACA-CTGC  187

seq1  TTCTTTCTTGAAAACTTTCAAAAGTTGGGACGAGCATAAAGGTTTTGACA  246
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTCTTGAAAAC-TTCAAAAGTTGGGACGAGCATAAAGGTTTTGACA  236

seq1  GCTCACGGTTACATCCTTTCATATGCTTGTATCAGAAAGAAATAGAAGTC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACGGTTACATCCTTTCATATGCTTGTATCAGAAAGAAATAGAAGTC  286

seq1  AATGAAAACAAAAACCTGATGTTGAATTGAATCTTGAACATTTCTCCATG  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAAACAAAAACCTGATGTTGAATTGAATCTTGAACATTTCTCCATG  336

seq1  TGCAGAACTGTAAATCTCTTGCCGTTATGCCAGGCCCTTAACTGCAGACC  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGAACTGTAAATCTCTTGCCGTTATGCCAGGCCCTTAACTGCAGACC  386

seq1  AGGGTGTGTAGAACAGATGGGATTCCTGCTTTTAAAGAATAAATAACTGC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGTGTAGAACAGATGGGATTCCTGCTTTTAAAGAATAAATAACTGC  436

seq1  AACTATTTCAGTGCAGATGTCTAAATAGATTCTATGCTGAAGCAGACTTT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATTTCAGTGCAGATGTCTAAATAGATTCTATGCTGAAGCAGACTTT  486

seq1  CCCCCCATCACAGATAAGAGACAGGCCTCTCCAAGAGACTCAGAACAGAC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCATCACAGATAAGAGACAGGCCTCTCCAAGAGACTCAGAACAGAC  536

seq1  CAATGCCTGGATGAATCCATCAGGGTCATCCAAGAAAATCAAAACATCGT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGCCTGGATGAATCCATCAGGGTCATCCAAGAAAATCAAAACATCGT  586

seq1  ATTAATAGCTTAGTGTTTAAGGGTTGACCAAAGATCCGGGTTTGGTTTTT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATAGCTTAGTGTTTAAGGGTTGACCAAAGATCCGGGTTTGGTTTTT  636

seq1  GTTACTGTTTAACATGTGAAATAAAGAAAGGAATATTCTTGTCTTGAATG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACTGTTTAACATGTGAAATAAAGAAAGGAATATTCTTGTCTTGAATG  686

seq1  GCTTGTTGCAGAAAATAGACATCTTAGATTATGTTCATAAGTGCAGCAAT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTTGCAGAAAATAGACATCTTAGATTATGTTCATAAGTGCAGCAAT  736

seq1  TTCACTATAATACAGGTGATTATATCAATCCCAAACATTTGTAACGCAGA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACTATAATACAGGTGATTATATCAATCCCAAACATTTGTAACGCAGA  786

seq1  GGCTCAGAAATGTGGCCTTTGGCTCACTCATTCAATCAGTCTCTTCATTA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCAGAAATGTGGCCTTTGGCTCACTCATTCAATCAGTCTCTTCATTA  836

seq1  GTTAATGCAGCAATTATTCATCAAGCTCTTTTCCTGTGCCAGTCCCTCTA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATGCAGCAATTATTCATCAAGCTCTTTTCCTGTGCCAGTCCCTCTA  886

seq1  CCAGAGTGTCTGAACGGATTCTATTTGAGTCCCTGTTCCAGAGGAGCAGC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGTGTCTGAACGGATTCTATTTGAGTCCCTGTTCCAGAGGAGCAGC  936

seq1  TGGTCTGATGTGGTGAGGTATAGCACTTTATATAAATAATAGATCCCAGG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTGATGTGGTGAGGTATAGCACTTTATATAAATAATAGATCCCAGG  986

seq1  CATGGACAAGGTTGCCACCTAGTCATGATGAGAGACCATAGACATATAAG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGACAAGGTTGCCACCTAGTCATGATGAGAGACCATAGACATATAAG  1036

seq1  CAGAGAGACTTCAGAACCGAACAGTGTCCAGAGAAACCCATTCCACATGG  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGACTTCAGAACCGAACAGTGTCCAGAGAAACCCATTCCACATGG  1086

seq1  AGTCCTGAAGGATACATAGGAGTTTTCCCAGACATCCTATGCTACATAGC  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTGAAGGATACATAGGAGTTTTCCCAGACATCCTATGCTACATAGC  1136

seq1  TGAAGTCTAAGCAGAACAAGGTGTATACGATCTGAGTCTGTCCTAGAATT  1196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTCTAAGCAGAACAAGGTGTATACGATCTGAGTCTGTCCTAGAATT  1186

seq1  C  1197
      |
seq2  C  1187


seq1: chr7_103393935_103395083
seq2: B6Ng01-186F10.g_64_1203

seq1  GAATTCATGTGAGGATTCGGTGAGTCAGAGTCTGCTAAGGTGCTTAGCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGTGAGGATTCGGTGAGTCAGAGTCTGCTAAGGTGCTTAGCAC  50

seq1  AGGGCCAAGTCTACGGGAAGTCCCCAATAAAGAGCAGCTAGATGCTAACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCCAAGTCTACGGGAAGTCCCCAATAAAGAGCAGCTAGATGCTAACC  100

seq1  ATGAAATGATTAATGTGGCTATGCTGGCTCTGATGAGAGCCTAATGAGCG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAATGATTAATGTGGCTATGCTGGCTCTGATGAGAGCCTAATGAGCG  150

seq1  AATGGTTTGGTTTGCTTTTTGGGAAGTGCTGGAGATCAAACTTGGAGCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTTTGGTTTGCTTTTTGGGAAGTGCTGGAGATCAAACTTGGAGCTT  200

seq1  CACGTCAGCGAAATGAGTTTTCTTCCACTGCGTTATACCTGCAGCCTAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGTCAGCGAAATGAGTTTTCTTCCACTGCGTTATACCTGCAGCCTAAT  250

seq1  CAACACTTTGAAATTTGTCCCCTTCTGAACCTCACTTGCTTCCTGTTGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACACTTTGAAATTTGTCCCCTTCTGAACCTCACTTGCTTCCTGTTGCT  300

seq1  GTGACAAACACTATGACCAAAAGCCAGTTGAGTAGGAAAGTGGTTGCTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACAAACACTATGACCAAAAGCCAGTTGAGTAGGAAAGTGGTTGCTTG  350

seq1  GCTTGTTGGTGACAGTTAGTCATTGTCAAAAGCCAAGGCAGGATTTAAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTTGGTGACAGTTAGTCATTGTCAAAAGCCAAGGCAGGATTTAAGG  400

seq1  CAGGAGCTTAAGGCAAAGACCACTGAGGAAGACTGTTTATTAGCTTGCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGCTTAAGGCAAAGACCACTGAGGAAGACTGTTTATTAGCTTGCTT  450

seq1  CTCAAACGTACATGAAGCTATCATTTTTATACATCCCAGCTACCCAGTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAACGTACATGAAGCTATCATTTTTATACATCCCAGCTACCCAGTGA  500

seq1  TGGCACCCCCCCCCACATCAATTAGTAATTAAGAAAATGACCCACAGATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACCCCCCCCCACATCAATTAGTAATTAAGAAAATGACCCACAGATT  550

seq1  TGCCCACAGGCCAGGTTCTGCTGTCAAAACACACTTCGAGATCTTATAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCACAGGCCAGGTTCTGCTGTCAAAACACACTTCGAGATCTTATAAA  600

seq1  CAAATATCAAAACAAACTTCCATTTCTCTCCCTGCATATGTCACTGCCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATATCAAAACAAACTTCCATTTCTCTCCCTGCATATGTCACTGCCTA  650

seq1  ACACTGAAAAATAAAATCACAAGATCTCAAATGAGATAGGCATGCAGGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGAAAAATAAAATCACAAGATCTCAAATGAGATAGGCATGCAGGAG  700

seq1  TCATCAGGCAGTCTTGGCTTAGCTTTACTGCCAGGCTTAGACACAGCAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCAGGCAGTCTTGGCTTAGCTTTACTGCCAGGCTTAGACACAGCAAA  750

seq1  GTATTCTCCCTTAACTTCTAGGGCCATTTATTCCCATGTAAATGGAGAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTCTCCCTTAACTTCTAGGGCCATTTATTCCCATGTAAATGGAGAAG  800

seq1  GTCAGGTCCACGAGTATTTTCCACAAGGGACTGGTACCAAATGGCTGTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGTCCACGAGTATTTTCCACAAGGGACTGGTACCAAATGGCTGTGT  850

seq1  GTGGTACCTAAGCATGGTATTAAATGTCGTTGAATCACATGGTGATAAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTACCTAAGCATGGTATTAAATGTCGTTGAATCACATGGTGATAAAG  900

seq1  CTGGTTTCGGTTCCTCTTCATTCTTTGTGATTTAGTCGAGGACGGAGCCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CTGGTTTCGGTTCCTCTTCATTCTTTGTGATTTAGTCGAGGAC-GAGCCT  949

seq1  GA-TATTGGGGCTGG-TAGATATTTAATACCTCAGTGACACTCGCTCAGC  998
      || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATTGGGGCTGGTTAGATATTTTATACCTCAGTGACACTCGCTCAGC  999

seq1  TCCCTGTTAACAAAGGCCTG-TGTCTGGGTAAGGAAGCAACAGTA-TCCA  1046
      |||||||  || || || || ||||||||| |||||||||||||| || |
seq2  TCCCTGT--ACCAATGCTTGTTGTCTGGGT-AGGAAGCAACAGTATTCAA  1046

seq1  CTTGGTTTCCCTGAAATTTACTCTTCAACTCTTTCTCACTGTCCACATGA  1096
      ||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||   ||||
seq2  CTTGGGTTCCCTGAAATTACTTCTTC-ACTCTTTCTCACTGTC--AATGA  1093

seq1  GGATGTCTCTTAAATGACCACAATGGGATACATGTTGCTTCTTAAAATAA  1146
       |||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||| ||||||
seq2  -GATGTCTCTT-AATGAACACA--TGGAT-CATGTTGCTTCTT-AAATAA  1137

seq1  ATT  1149
      |||
seq2  ATT  1140


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |