BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-189N07
Chromosome7 (Build37)
Map Location 121,294,543 - 121,445,682
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668451, Copb1, Psma1
Upstream geneArntl, A630005I04Rik, Btbd10, Pth, LOC100042736, Mlstd2, EG434228, Spon1, Rras2
Downstream gene4933406I18Rik, Pde3b, Cyp2r1, Calca, LOC100043295, Calcb, Insc, EG627967, LOC668472
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-189N07.bB6Ng01-189N07.g
ACCGA013747GA013748
length1,1501,026
definitionB6Ng01-189N07.b B6Ng01-189N07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(121,444,528 - 121,445,682)(121,294,543 - 121,295,573)
sequence
gaattctgggaggatgtgttgttgatggtaacatgacaaccagaccttaa
gctggttaagaaatcaagagattatctaacaatgcaaagtctggagacag
atatagacaaactacagaataagtagctaaagttgtggcaacagttgact
atgcaggacaaaatcagaggtgggaagtatggccagtgaaccactgtctt
ggtattaaaacctcatatgtgacttttaattatgtacttatatgcagttt
gttagttaaaaattcaggttatgggaaataagagagataaaaatattaga
ggagaaaacactaagctaagtcaagagtaattccaggcccagggtacatt
actgcaactgggaggctaaatttccgttctgagtttgtagcagccagcac
aaagcaggaaacgtaatcatctgtatagtttcacagtgtccaggagacaa
aaacaaaccacttactcaggagaaacagatctatttgtagtaccgaggct
gagagacagttttcccatctgtccacctcagaggacaccatgtgacacag
tcaaccacatcctcaacctgcctacaataaatgtaacggtgacagagaac
tactgctgatcctaagtctcagggtatgctgctggcaaaatgccaacacc
aaggccactgaaaggcgttctggtaggagataaaaacatgttcatggtaa
agcctgtggttagaggacaggccaagcctccaaatctctctccaacaaat
tatttaaccactttgtctatagtcagtgctattatctaaataagataccc
attactcaatatcatgatttgaatatgcttggcccaggaagtagcactat
ttggaggtgtggccttgttgaaataggtatgtcactatagacatgggctt
taagaccctcatccagcctcatagcagccttcagatgaagatgtagaact
ctcagctccacctgcaccatgcctgcctggatgctgccatgcttcccacc
ttgatgatactagactggacacctctggacctgtagccagccccaattaa
tgtttttatagattgcttggttcatggtgtcctgttccacagcagttaaa
cctagttagcacttcaagtgatggcctggtccatgcctgtttccaagcac

gaattcaaggccagcctcacctagacagttagttttagacaaatctgggc
tatgtgagaccctgtctcaaaagagagagagagagagagagagagagaga
gagagaaaggaagaaagagagaaagacaatcccttgttgctctgtcatgt
acaactccagggaggagatggccttggatgaggacactggccttcactag
atctcagtcatgctagtatcctattcttggtcttcactaggcttgcacac
atggtaatataggcctggcacacagtgagtgtttattaggtctctgtgtt
cctacctccttcccaccactcctctggcttctccatatccatctgcacac
atttgaagtatgtgagccttaactacgtactgttcacagaggaacggagg
aaccagacgtctccgagtctttccttcgtacagcacttctaagccagcct
tctccacagtgatctggtctcctccttcatcctacaagcatgacagataa
cacagaacattgtcctgttgttctctagtaccaccagctcctttccctca
ctgggaatgcaaacacagagaggctctaggccatatgctcacagcatcag
ctgtgtttccatggtgaccaacccaccataactagatgtttcagcaaaga
ggagctgtgacactggggagccacagaatgtggcaaactagctattattg
tttctgtcaccccaccctaaagactaaagcaggttggctctggcttgaag
aggtagggaaatttatgtttgcataagtaggggaccaagtttgagagggc
acttggcttcttatcacagcagaaactgttttgtagtttaaaataaatct
aaaagaaaaatagaaattcaatttgaaaataccacaacataggaaacagc
ctgttgtcatgagaacaatatggagattttgatctatcctccgaagaagt
caataaaacttcatttttacaaatccgtcatattttcctctttaaaaatt
aaatgtatgtggtatgtgtgcgtgcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_121444528_121445682
seq2: B6Ng01-189N07.b_45_1194 (reverse)

seq1  GTGCTTGGAAACAGGCATGGCCCAGGGCATCCACTTTGAGTGCCTTACTT  50
      |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  |||| || ||| 
seq2  GTGCTTGGAAACAGGCATGGACCAGGCCAT-CACTTGAAGTG-CTAACT-  47

seq1  AGGGTTTTACTGCTGT-GAACA-GACACCATGACCAAGGCAAATCTTATT  98
        ||||| |||||||| ||||| |||||||||| | | || |||| ||| 
seq2  -AGGTTTAACTGCTGTGGAACAGGACACCATGAACCAAGC-AATC-TATA  94

seq1  AAAACATTTAATTGGGGCTGGCTTACAGGTTCAGAGGTGTCCAGTCTAGT  148
      |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AAAACA-TTAATTGGGGCTGGC-TACAGGTCCAGAGGTGTCCAGTCTAGT  142

seq1  ATCATCAAGGTGGG-AGCATGGCAGCATCCAGGCAGGCATGGTGCAGGTG  197
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCAAGGTGGGAAGCATGGCAGCATCCAGGCAGGCATGGTGCAGGTG  192

seq1  GAGCTGAGAGTTCTACATCTTCATCTGAAGGCTGCTATGAGGCTGGATGA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGAGAGTTCTACATCTTCATCTGAAGGCTGCTATGAGGCTGGATGA  242

seq1  GGGTCTTAAAGCCCATGTCTATAGTGACATACCTATTTCAACAAGGCCAC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCTTAAAGCCCATGTCTATAGTGACATACCTATTTCAACAAGGCCAC  292

seq1  ACCTCCAAATAGTGCTACTTCCTGGGCCAAGCATATTCAAATCATGATAT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCAAATAGTGCTACTTCCTGGGCCAAGCATATTCAAATCATGATAT  342

seq1  TGAGTAATGGGTATCTTATTTAGATAATAGCACTGACTATAGACAAAGTG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTAATGGGTATCTTATTTAGATAATAGCACTGACTATAGACAAAGTG  392

seq1  GTTAAATAATTTGTTGGAGAGAGATTTGGAGGCTTGGCCTGTCCTCTAAC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAATAATTTGTTGGAGAGAGATTTGGAGGCTTGGCCTGTCCTCTAAC  442

seq1  CACAGGCTTTACCATGAACATGTTTTTATCTCCTACCAGAACGCCTTTCA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGCTTTACCATGAACATGTTTTTATCTCCTACCAGAACGCCTTTCA  492

seq1  GTGGCCTTGGTGTTGGCATTTTGCCAGCAGCATACCCTGAGACTTAGGAT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCTTGGTGTTGGCATTTTGCCAGCAGCATACCCTGAGACTTAGGAT  542

seq1  CAGCAGTAGTTCTCTGTCACCGTTACATTTATTGTAGGCAGGTTGAGGAT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGTAGTTCTCTGTCACCGTTACATTTATTGTAGGCAGGTTGAGGAT  592

seq1  GTGGTTGACTGTGTCACATGGTGTCCTCTGAGGTGGACAGATGGGAAAAC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTTGACTGTGTCACATGGTGTCCTCTGAGGTGGACAGATGGGAAAAC  642

seq1  TGTCTCTCAGCCTCGGTACTACAAATAGATCTGTTTCTCCTGAGTAAGTG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCTCAGCCTCGGTACTACAAATAGATCTGTTTCTCCTGAGTAAGTG  692

seq1  GTTTGTTTTTGTCTCCTGGACACTGTGAAACTATACAGATGATTACGTTT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTTTTGTCTCCTGGACACTGTGAAACTATACAGATGATTACGTTT  742

seq1  CCTGCTTTGTGCTGGCTGCTACAAACTCAGAACGGAAATTTAGCCTCCCA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTTTGTGCTGGCTGCTACAAACTCAGAACGGAAATTTAGCCTCCCA  792

seq1  GTTGCAGTAATGTACCCTGGGCCTGGAATTACTCTTGACTTAGCTTAGTG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCAGTAATGTACCCTGGGCCTGGAATTACTCTTGACTTAGCTTAGTG  842

seq1  TTTTCTCCTCTAATATTTTTATCTCTCTTATTTCCCATAACCTGAATTTT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCCTCTAATATTTTTATCTCTCTTATTTCCCATAACCTGAATTTT  892

seq1  TAACTAACAAACTGCATATAAGTACATAATTAAAAGTCACATATGAGGTT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTAACAAACTGCATATAAGTACATAATTAAAAGTCACATATGAGGTT  942

seq1  TTAATACCAAGACAGTGGTTCACTGGCCATACTTCCCACCTCTGATTTTG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATACCAAGACAGTGGTTCACTGGCCATACTTCCCACCTCTGATTTTG  992

seq1  TCCTGCATAGTCAACTGTTGCCACAACTTTAGCTACTTATTCTGTAGTTT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCATAGTCAACTGTTGCCACAACTTTAGCTACTTATTCTGTAGTTT  1042

seq1  GTCTATATCTGTCTCCAGACTTTGCATTGTTAGATAATCTCTTGATTTCT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATATCTGTCTCCAGACTTTGCATTGTTAGATAATCTCTTGATTTCT  1092

seq1  TAACCAGCTTAAGGTCTGGTTGTCATGTTACCATCAACAACACATCCTCC  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCAGCTTAAGGTCTGGTTGTCATGTTACCATCAACAACACATCCTCC  1142

seq1  CAGAATTC  1155
      ||||||||
seq2  CAGAATTC  1150

seq1: chr7_121294543_121295573
seq2: B6Ng01-189N07.g_67_1092

seq1  GAATTCAAGGCCAGCCTCACCTAGACAGTTAGTTTTAGACAAATCTGGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGCCAGCCTCACCTAGACAGTTAGTTTTAGACAAATCTGGGC  50

seq1  TATGTGAGACCCTGTCTCAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGAGACCCTGTCTCAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  100

seq1  GAGAGAAAGGAAGAAAGAGAGAAAGACAATCCCTTGTTGCTCTGTCATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAAAGGAAGAAAGAGAGAAAGACAATCCCTTGTTGCTCTGTCATGT  150

seq1  ACAACTCCAGGGAGGAGATGGCCTTGGATGAGGACACTGGCCTTCACTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTCCAGGGAGGAGATGGCCTTGGATGAGGACACTGGCCTTCACTAG  200

seq1  ATCTCAGTCATGCTAGTATCCTATTCTTGGTCTTCACTAGGCTTGCACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAGTCATGCTAGTATCCTATTCTTGGTCTTCACTAGGCTTGCACAC  250

seq1  ATGGTAATATAGGCCTGGCACACAGTGAGTGTTTATTAGGTCTCTGTGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTAATATAGGCCTGGCACACAGTGAGTGTTTATTAGGTCTCTGTGTT  300

seq1  CCTACCTCCTTCCCACCACTCCTCTGGCTTCTCCATATCCATCTGCACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCTCCTTCCCACCACTCCTCTGGCTTCTCCATATCCATCTGCACAC  350

seq1  ATTTGAAGTATGTGAGCCTTAACTACGTACTGTTCACAGAGGAACGGAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAAGTATGTGAGCCTTAACTACGTACTGTTCACAGAGGAACGGAGG  400

seq1  AACCAGACGTCTCCGAGTCTTTCCTTCGTACAGCACTTCTAAGCCAGCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAGACGTCTCCGAGTCTTTCCTTCGTACAGCACTTCTAAGCCAGCCT  450

seq1  TCTCCACAGTGATCTGGTCTCCTCCTTCATCCTACAAGCATGACAGATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCACAGTGATCTGGTCTCCTCCTTCATCCTACAAGCATGACAGATAA  500

seq1  CACAGAACATTGTCCTGTTGTTCTCTAGTACCACCAGCTCCTTTCCCTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAACATTGTCCTGTTGTTCTCTAGTACCACCAGCTCCTTTCCCTCA  550

seq1  CTGGGAATGCAAACACAGAGAGGCTCTAGGCCATATGCTCACAGCATCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGAATGCAAACACAGAGAGGCTCTAGGCCATATGCTCACAGCATCAG  600

seq1  CTGTGTTTCCATGGTGACCAACCCACCATAACTAGATGTTTCAGCAAAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTTTCCATGGTGACCAACCCACCATAACTAGATGTTTCAGCAAAGA  650

seq1  GGAGCTGTGACACTGGGGAGCCACAGAATGTGGCAAACTAGCTATTATTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTGTGACACTGGGGAGCCACAGAATGTGGCAAACTAGCTATTATTG  700

seq1  TTTCTGTCACCCCACCCTAAAGACTAAAGCAGGTTGGCTCTGGCTTGAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTCACCCCACCCTAAAGACTAAAGCAGGTTGGCTCTGGCTTGAAG  750

seq1  AGGTAGGGAAATTTATGTTTGCATAAGTAGGGGACCAAGTTTGAGAGGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGGGAAATTTATGTTTGCATAAGTAGGGGACCAAGTTTGAGAGGGC  800

seq1  ACTTGGCTTCTTATCACAGCAGAAACTGTTTTGTAGTTTAAAATAAATCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGCTTCTTATCACAGCAGAAACTGTTTTGTAGTTTAAAATAAATCT  850

seq1  AAAAGAAAAATAGAAATTCAA-TTGAAAATACCACAACATAGGAAACAGC  899
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAAAAATAGAAATTCAATTTGAAAATACCACAACATAGGAAACAGC  900

seq1  CTGTTGTCATGAGAACAATATGGAGATTTTGATCTAATTCCTCCGAAGAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
seq2  CTGTTGTCATGAGAACAATATGGAGATTTTGATCTA--TCCTCCGAAGAA  948

seq1  GGTCAATAAAACTTCATTTTTACAAATCCCGTCATATTTTTCCTCTTAAA  999
       |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||
seq2  -GTCAATAAAACTTCATTTTTACAAAT-CCGTCATA-TTTTCCTCTTTAA  995

seq1  AAATTTAAATGTTATGT-GTATGTGTGTGTGCC  1031
      ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||
seq2  AAA-TTAAATG-TATGTGGTATGTGTGCGTGCC  1026