BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-192F17
Chromosome7 (Build37)
Map Location 145,027,698 - 145,028,822
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneMgmt, EG621804, Ebf3, 9430038I01Rik, Txnl2
Downstream geneLOC435235, Tcerg1l, LOC100043290, Mapk1ip1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-192F17.b
ACCGA015617
length1,131
definitionB6Ng01-192F17.b
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattccccaaaggcaaggagaacaaagtcatttccttccagtaagatgg
accacaagacactcccacaggtcattttgcaggttgagggacaaatgatg
gggtcgagtgcttcctaatctgctctgtgtgtcagctggtcacagcagag
aacttactgcaaagaaaaaacacagctaaggagggaaatggtttgcagtg
gaaagcctctccttacagagcatcctatttcattactcagaagttaacct
accacagaaacagaaggcaagtgcccaggacacagggatgatgcccaagg
caggacagcagcttacgtgagggtagggtcactgtgtctctaaaaagtgt
ctttgattgttaaaaatactccagatgtttgtattcacatctttgaaaag
attagatgcactaacatgggagggggaaaatttcatggggccacaacctt
gcacaaagaactgcaggcaactaagtgatcatccctgaaaccatatacat
tccagtagcattgtatgggctaagcagattgtgtttatttatttaagaac
atattattatggatatataatatcaattaacaagaggtcattaatttgag
tcacagaatggggaggggaatacaggacaagggttggagggagaaaacgg
aaggggcaaatgatgtaactatattttaattccaaaaataaaaaagctaa
gatatgtcagccttccaaatggagatttataagaatggaatgaagtgaag
ctaacctgtgcacatcactgtgtacagtgggaggggcttggaggaaggat
gtgtgcagcccagtataccaatatacatggagtaagatttatcagaatgt
cttacatttaagctcagaagatcaataacagcaccaagatagatgtgtgg
tttagcaacgtgtaaggagcccacaaggtcaagacaggtgtgtggtttga
tggggtataaataccacaaggtttagaacaaatgcgtggtttgaataggc
tattgaacataccacaaggtcagataggatgtgtggttttagtgggcctg
tagaacagatatggtcaagttgcaatcagtggtatgatggctgattagtt
gaaagtaaccttgagccatgggcatgatggc
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_145027698_145028822
seq2: B6Ng01-192F17.b_46_1176 (reverse)

seq1  GCCATCATGCCCAATGCTCAGGGTTTACTTTCAACTTATCAG-CATCATA  49
      |||||||||||||  ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||
seq2  GCCATCATGCCCATGGCTCAAGG-TTACTTTCAACTAATCAGCCATCATA  49

seq1  CAACTGA-TGCAACTTGACCCATATCTG-TCTACA-GCCCACT-AAACCA  95
      | ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||
seq2  CCACTGATTGCAACTTGA-CCATATCTGTTCTACAGGCCCACTAAAACCA  98

seq1  CACAT-CTATCTTGACCTTGTGGTATGTTC-ATAGCCTATTC-AACCACG  142
      ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
seq2  CACATCCTATC-TGACCTTGTGGTATGTTCAATAGCCTATTCAAACCACG  147

seq1  CATTTG-TCTTAACCTTGTGGTATTTATACCCCATCAAACCACACACCTG  191
      |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTTCTAAACCTTGTGGTATTTATACCCCATCAAACCACACACCTG  197

seq1  TCTTGACCTTGTGGGCTCCTTACACGTTGCTAAACCACACATCTATCTTG  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGACCTTGTGGGCTCCTTACACGTTGCTAAACCACACATCTATCTTG  247

seq1  GTGCTGTTATTGATCTTCTGAGCTTAAATGTAAGACATTCTGATAAATCT  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGTTATTGATCTTCTGAGCTTAAATGTAAGACATTCTGATAAATCT  297

seq1  TACTCCATGTATATTGGTATACTGGGCTGCACACATCCTTCCTCCAAGCC  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCCATGTATATTGGTATACTGGGCTGCACACATCCTTCCTCCAAGCC  347

seq1  CCTCCCACTGTACACAGTGATGTGCACAGGTTAGCTTCACTTCATTCCAT  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCACTGTACACAGTGATGTGCACAGGTTAGCTTCACTTCATTCCAT  397

seq1  TCTTATAAATCTCCATTTGGAAGGCTGACATATCTTAGCTTTTTTATTTT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATAAATCTCCATTTGGAAGGCTGACATATCTTAGCTTTTTTATTTT  447

seq1  TGGAATTAAAATATAGTTACATCATTTGCCCCTTCCGTTTTCTCCCTCCA  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATTAAAATATAGTTACATCATTTGCCCCTTCCGTTTTCTCCCTCCA  497

seq1  ACCCTTGTCCTGTATTCCCCTCCCCATTCTGTGACTCAAATTAATGACCT  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTGTCCTGTATTCCCCTCCCCATTCTGTGACTCAAATTAATGACCT  547

seq1  CTTGTTAATTGATATTATATATCCATAATAATATGTTCTTAAATAAATAA  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTAATTGATATTATATATCCATAATAATATGTTCTTAAATAAATAA  597

seq1  ACACAATCTGCTTAGCCCATACAATGCTACTGGAATGTATATGGTTTCAG  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAATCTGCTTAGCCCATACAATGCTACTGGAATGTATATGGTTTCAG  647

seq1  GGATGATCACTTAGTTGCCTGCAGTTCTTTGTGCAAGGTTGTGGCCCCAT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGATCACTTAGTTGCCTGCAGTTCTTTGTGCAAGGTTGTGGCCCCAT  697

seq1  GAAATTTTCCCCCTCCCATGTTAGTGCATCTAATCTTTTCAAAGATGTGA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTTTCCCCCTCCCATGTTAGTGCATCTAATCTTTTCAAAGATGTGA  747

seq1  ATACAAACATCTGGAGTATTTTTAACAATCAAAGACACTTTTTAGAGACA  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAACATCTGGAGTATTTTTAACAATCAAAGACACTTTTTAGAGACA  797

seq1  CAGTGACCCTACCCTCACGTAAGCTGCTGTCCTGCCTTGGGCATCATCCC  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGACCCTACCCTCACGTAAGCTGCTGTCCTGCCTTGGGCATCATCCC  847

seq1  TGTGTCCTGGGCACTTGCCTTCTGTTTCTGTGGTAGGTTAACTTCTGAGT  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCCTGGGCACTTGCCTTCTGTTTCTGTGGTAGGTTAACTTCTGAGT  897

seq1  AATGAAATAGGATGCTCTGTAAGGAGAGGCTTTCCACTGCAAACCATTTC  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAATAGGATGCTCTGTAAGGAGAGGCTTTCCACTGCAAACCATTTC  947

seq1  CCTCCTTAGCTGTGTTTTTTCTTTGCAGTAAGTTCTCTGCTGTGACCAGC  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTTAGCTGTGTTTTTTCTTTGCAGTAAGTTCTCTGCTGTGACCAGC  997

seq1  TGACACACAGAGCAGATTAGGAAGCACTCGACCCCATCATTTGTCCCTCA  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACACACAGAGCAGATTAGGAAGCACTCGACCCCATCATTTGTCCCTCA  1047

seq1  ACCTGCAAAATGACCTGTGGGAGTGTCTTGTGGTCCATCTTACTGGAAGG  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGCAAAATGACCTGTGGGAGTGTCTTGTGGTCCATCTTACTGGAAGG  1097

seq1  AAATGACTTTGTTCTCCTTGCCTTTGGGGAATTC  1125
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGACTTTGTTCTCCTTGCCTTTGGGGAATTC  1131