BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-194B16
Chromosome7 (Build37)
Map Location 103,677,783 - 103,853,090
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOdz4
Upstream geneFrda-ps, EG666836, LOC670727, LOC666858
Downstream geneNars2, Gab2, LOC100040457, Usp35, EG622320, Alg8, Ndufc2, Thrsp, Kctd14, Ints4, 1810020D17Rik, Rsf1, LOC622994, LOC100040211, Clns1a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-194B16.bB6Ng01-194B16.g
ACCGA016889GA016890
length1,198856
definitionB6Ng01-194B16.b B6Ng01-194B16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(103,677,783 - 103,678,988)(103,852,236 - 103,853,090)
sequence
gaattcacagaatgcctctcctcccaagcagcaagggaggtgtgggtagc
caaggcatacgggagataagattcatatgtaatacatatatattcagtat
aacatttgagggctcaaatctcagctatgctgctttagttaagtactcag
catctctggtcttggcttctcaatcattaaaggagtaggactggtcctgc
ctttggagatgtgcactgcgagaactagatgagcgactagatgcaagcag
agctttttaagctctgcagctctccccagacactgcctctgccagctctc
agtctgctttgcttctgcacaagtgtctgcatactgttgcatctaagcaa
gaagcatcagtcacgctgacaaatctctgtgcccccaggtagtgtttcta
accagttagaggtttggcatttattctcaactgcttgttggtatattttt
caaatagccaagtatttaaataccatcagcctgattgcttctgcagattt
gtagcccttgtcctgcatcagggaaatcctctcacaggctgttgtaacag
aggcagctaccacctagtggaaagggcactaggatgcagagaaaaagatc
aaattccacctctatttcctgccagcaaagtgacctgggactagacatgt
cacctggtggaggcttcatttcttcaatgggaataacacgaatttgtgtt
gttcagtttcaaggccatgtatacctgctggtgtgacacactctaaacct
ctgtgactgtaaaccaagttgtagccaaccaatctccaagttgtagccca
aaacattgaagttcattgtgtaaacctttgaatgccattttccttaacag
tgaagtgataccatgagaagatggttcggtccataaggttcttgccttgc
aagcatggggacttggattgggttccagaactcatgtaaaatacttatgt
ttgcaatcccagcaccagggagcagagcaaggaggatctctgcatgctgc
tagaacaagctagcttaatggctgagctcaggcaagggagagacccttgt
ctcaaatgtaagtggatgctgctaagattgacgccccaaactggtctttc
catcctcaaaggtgtgcacccacatgcaaatgcaatcttcacacaatgac
acagccatactgctatgcgaccttggagtgctctaagacatacccttg
gaattctctacctccctgtctctcacccttgtcacatggaacaacaggag
aggccgacctaccgcccagtcctcctaagttgttatttcatcttagcggc
tctgatctaggacactcatgtcccagaccactatctcagagtcctcattg
ccttgtgcctcagttctagagaaccaacacatgcaaggcagatcctaata
ttccttgccggttcagcctcagaggagagagcggagagcctggaagagct
gccgttatggtgtggacacaggccagaccagtgcaaggcatcttgataca
gcctatgcactatgactgtggtgctggtacagggcctttggcggccctag
ctgcttcgattggtggcccctggccaaatgggagccatggggagctgtgg
gggaggaggaaatgcttacccacaaagtatgcgagcaggatgacgagcgt
agctgagatgaggatggcgctcagcgctgcacacttccagttgcagtact
tggaaggcttcttgaggttaaaggctggtcgggagaaggtgctgcggggc
aggggccggggtgggggcgagtacacggtgctagacgttagggggtaccc
tggggatgtggtgcagaagagcggggaggtgcctccgggcttgaagagga
agtgcctgtggatggagagaggtgggaaggtgtcagggtctgccagctaa
ccaggttcccaggccaacctgcaggaatagaggcgcagaaggagcatgca
gaggagcctggagagagagagaaaagaagagaatcaccacaggccaggtg
acaggtccggaagaagtcacagaccagagcacattgggggcaaaagaaga
cacctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_103677783_103678988
seq2: B6Ng01-194B16.b_46_1243

seq1  GAATTCACAGAATGCCTCTCCTCCCAAGCAGCAAGGGAGGTGTGGGTAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGAATGCCTCTCCTCCCAAGCAGCAAGGGAGGTGTGGGTAGC  50

seq1  CAAGGCATACGGGAGATAAGATTCATATGTAATACATATATATTCAGTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGCATACGGGAGATAAGATTCATATGTAATACATATATATTCAGTAT  100

seq1  AACATTTGAGGGCTCAAATCTCAGCTATGCTGCTTTAGTTAAGTACTCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTGAGGGCTCAAATCTCAGCTATGCTGCTTTAGTTAAGTACTCAG  150

seq1  CATCTCTGGTCTTGGCTTCTCAATCATTAAAGGAGTAGGACTGGTCCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCTGGTCTTGGCTTCTCAATCATTAAAGGAGTAGGACTGGTCCTGC  200

seq1  CTTTGGAGATGTGCACTGCGAGAACTAGATGAGCGACTAGATGCAAGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGAGATGTGCACTGCGAGAACTAGATGAGCGACTAGATGCAAGCAG  250

seq1  AGCTTTTTAAGCTCTGCAGCTCTCCCCAGACACTGCCTCTGCCAGCTCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTTTAAGCTCTGCAGCTCTCCCCAGACACTGCCTCTGCCAGCTCTC  300

seq1  AGTCTGCTTTGCTTCTGCACAAGTGTCTGCATACTGTTGCATCTAAGCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGCTTTGCTTCTGCACAAGTGTCTGCATACTGTTGCATCTAAGCAA  350

seq1  GAAGCATCAGTCACGCTGACAAATCTCTGTGCCCCCAGGTAGTGTTTCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCATCAGTCACGCTGACAAATCTCTGTGCCCCCAGGTAGTGTTTCTA  400

seq1  ACCAGTTAGAGGTTTGGCATTTATTCTCAACTGCTTGTTGGTATATTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTTAGAGGTTTGGCATTTATTCTCAACTGCTTGTTGGTATATTTTT  450

seq1  CAAATAGCCAAGTATTTAAATACCATCAGCCTGATTGCTTCTGCAGATTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAGCCAAGTATTTAAATACCATCAGCCTGATTGCTTCTGCAGATTT  500

seq1  GTAGCCCTTGTCCTGCATCAGGGAAATCCTCTCACAGGCTGTTGTAACAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCCCTTGTCCTGCATCAGGGAAATCCTCTCACAGGCTGTTGTAACAG  550

seq1  AGGCAGCTACCACCTAGTGGAAAGGGCACTAGGATGCAGAGAAAAAGATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGCTACCACCTAGTGGAAAGGGCACTAGGATGCAGAGAAAAAGATC  600

seq1  AAATTCCACCTCTATTTCCTGCCAGCAAAGTGACCTGGGACTAGACATGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCCACCTCTATTTCCTGCCAGCAAAGTGACCTGGGACTAGACATGT  650

seq1  CACCTGGTGGAGGCTTCATTTCTTCAATGGGAATAACACGAATTTGTGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTGGTGGAGGCTTCATTTCTTCAATGGGAATAACACGAATTTGTGTT  700

seq1  GTTCAGTTTCAAGGCCATGTATACCTGCTGGTGTGACACACTCTAAACCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAGTTTCAAGGCCATGTATACCTGCTGGTGTGACACACTCTAAACCT  750

seq1  CTGTGACTGTAAACCAAGTTGTAGCCAACCAATCTCCAAGTTGTAGCCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGACTGTAAACCAAGTTGTAGCCAACCAATCTCCAAGTTGTAGCCCA  800

seq1  AAACATTGAAGTTCATTGTGTAAACCTTTGAATGCCATTTTCCTTAAACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AAACATTGAAGTTCATTGTGTAAACCTTTGAATGCCATTTTCCTT-AACA  849

seq1  GTGAAGTGATACCATGAGAAGATGGTTCGGTCCATAAGGTTCTTGCCTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGTGATACCATGAGAAGATGGTTCGGTCCATAAGGTTCTTGCCTTG  899

seq1  CAAGCATGGGGACTTGGATTGGGTTCCCAGAACTCATGTAAAATACTTAT  950
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCATGGGGACTTGGATTGGGTT-CCAGAACTCATGTAAAATACTTAT  948

seq1  GTTTGCAATCCCAGCACCAGGGAGGCAGAAGCAGGAGGATCTCCTGCATG  1000
      ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||||
seq2  GTTTGCAATCCCAGCACCAGGGA-GCAGAGCAAGGAGGATCT-CTGCATG  996

seq1  CTGGCTAG-ACAAGCCTAGCTTAATGGCTGAGCTCCAGGCCAGGGAGAGA  1049
      || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
seq2  CT-GCTAGAACAAG-CTAGCTTAATGGCTGAGCT-CAGGCAAGGGAGAGA  1043

seq1  CCC-TGTCTCAAATGTAAGTGGATGCTGCCTAAAGATTGACGCCCCAAAC  1098
      ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||
seq2  CCCTTGTCTCAAATGTAAGTGGATGCTGC--TAAGATTGACGCCCCAAAC  1091

seq1  T-GTCTTT-CATCCTTCACATGTGTGCACCCACATGCACATGC-ATCTTC  1145
      | |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||
seq2  TGGTCTTTCCATCC-TCAAAGGTGTGCACCCACATGCAAATGCAATCTTC  1140

seq1  ACACACATGAACACAG-CATACATGCATATGCAGACC-TGGAGTGCTCTA  1193
      ||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||
seq2  ACACA-ATG-ACACAGCCATAC-TGC-TATGC-GACCTTGGAGTGCTCTA  1185

seq1  GGACAAACCCTTG  1206
       |||| |||||||
seq2  AGACATACCCTTG  1198

seq1: chr7_103852236_103853090
seq2: B6Ng01-194B16.g_68_923 (reverse)

seq1  AACGTGTCTTCTTGTGCCCCATTTGTGCTCTGGTCTGTGAC-TCTTCCTG  49
      || |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||| |
seq2  AAGGTGTCTTCTTTTGCCCCCAATGTGCTCTGGTCTGTGACTTCTTCCGG  50

seq1  ACCCTGTCACCTGCCCTGTGGTGATTCTCTTCTTTTCTCTCTCTCTCCAG  99
      | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-CCTGTCACCTGGCCTGTGGTGATTCTCTTCTTTTCTCTCTCTCTCCAG  99

seq1  GCTCCTCTGCATGCTCCTTCTGCGCCTCTA-TCCTGCAGGTTGGCCTGGG  148
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTCTGCATGCTCCTTCTGCGCCTCTATTCCTGCAGGTTGGCCTGGG  149

seq1  AGCCTGGTTAGCTGGCAGACCCTGACACCTTCCCACCTCTCTCCATCCAC  198
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTGGTTAGCTGGCAGACCCTGACACCTTCCCACCTCTCTCCATCCAC  199

seq1  AGGCACTTCCTCTTCAAGCCCGGAGGCACCTCCCCGCTCTTCTGCACCAC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCACTTCCTCTTCAAGCCCGGAGGCACCTCCCCGCTCTTCTGCACCAC  249

seq1  ATCCCCAGGGTACCCCCTAACGTCTAGCACCGTGTACTCGCCCCCACCCC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCCAGGGTACCCCCTAACGTCTAGCACCGTGTACTCGCCCCCACCCC  299

seq1  GGCCCCTGCCCCGCAGCACCTTCTCCCGACCAGCCTTTAACCTCAAGAAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCCTGCCCCGCAGCACCTTCTCCCGACCAGCCTTTAACCTCAAGAAG  349

seq1  CCTTCCAAGTACTGCAACTGGAAGTGTGCAGCGCTGAGCGCCATCCTCAT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCAAGTACTGCAACTGGAAGTGTGCAGCGCTGAGCGCCATCCTCAT  399

seq1  CTCAGCTACGCTCGTCATCCTGCTCGCATACTTTGTGGGTAAGCATTTCC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCTACGCTCGTCATCCTGCTCGCATACTTTGTGGGTAAGCATTTCC  449

seq1  TCCTCCCCCACAGCTCCCCATGGCTCCCATTTGGCCAGGGGCCACCAATC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCCCCACAGCTCCCCATGGCTCCCATTTGGCCAGGGGCCACCAATC  499

seq1  GAAGCAGCTAGGGCCGCCAAAGGCCCTGTACCAGCACCACAGTCATAGTG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCAGCTAGGGCCGCCAAAGGCCCTGTACCAGCACCACAGTCATAGTG  549

seq1  CATAGGCTGTATCAAGATGCCTTGCACTGGTCTGGCCTGTGTCCACACCA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGGCTGTATCAAGATGCCTTGCACTGGTCTGGCCTGTGTCCACACCA  599

seq1  TAACGGCAGCTCTTCCAGGCTCTCCGCTCTCTCCTCTGAGGCTGAACCGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACGGCAGCTCTTCCAGGCTCTCCGCTCTCTCCTCTGAGGCTGAACCGG  649

seq1  CAAGGAATATTAGGATCTGCCTTGCATGTGTTGGTTCTCTAGAACTGAGG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGAATATTAGGATCTGCCTTGCATGTGTTGGTTCTCTAGAACTGAGG  699

seq1  CACAAGGCAATGAGGACTCTGAGATAGTGGTCTGGGACATGAGTGTCCTA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGGCAATGAGGACTCTGAGATAGTGGTCTGGGACATGAGTGTCCTA  749

seq1  GATCAGAGCCGCTAAGATGAAATAACAACTTAGGAGGACTGGGCGGTAGG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAGAGCCGCTAAGATGAAATAACAACTTAGGAGGACTGGGCGGTAGG  799

seq1  TCGGCCTCTCCTGTTGTTCCATGTGACAAGGGTGAGAGACAGGGAGGTAG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGCCTCTCCTGTTGTTCCATGTGACAAGGGTGAGAGACAGGGAGGTAG  849

seq1  AGAATTC  855
      |||||||
seq2  AGAATTC  856