BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-199F21
Chromosome7 (Build37)
Map Location 48,137,419 - 48,178,801
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039094, 2900093B09Rik
Upstream geneEG628161
Downstream gene4930433I11Rik, EG233164, LOC668555, EG627987, LOC100039269, LOC545955, EG628304, LOC668561, EG434172, LOC100039221, LOC668565, AI987944, EG269902, LOC100039375, EG628359, 2610021A01Rik, 2810426N06Rik, LOC668576, Gprc2a-rs5, LOC628372, EG668579, EG628403, EG628422
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-199F21.bB6Ng01-199F21.g
ACCGA020718GA020719
length1,1441,122
definitionB6Ng01-199F21.b B6Ng01-199F21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(48,177,663 - 48,178,801)(48,137,419 - 48,138,546)
sequence
gaattcctgttgtgatgtttagcactgggctacaggtctactctgtatgt
ggggcctgagtctctacctcctagacttccagatgcagccaaaactgttc
actgctttctgaactggtaagtgcaactctgcttgaccttgtagagcaca
agtacacaatgctggatagatgtgtttggctcagctgggatgggctcact
aatctcctttctgacactcgtaggcgactgaatagagactgaatagatag
gtggtaagctgaactgattggatgctaacagcctctcatctatttcttcc
ctttcagaggagaacaaggaatagtgctggagtacacataagtatatgag
tcataataaagctggaaacttgggcagcctggaaggtgaggaaagccctg
ggaagcagtctggctgattcatcttcacctcaaaccaagcactgctgcct
tgatttttcgttgttgttgttgttttttttcaagacagggtttctctgtg
tagtcctggctatcctggaactcactctgtaaaccaggctggcctcgaac
tcagaaatccacctgcctctgcctcccaagtgctgggattaaaggcgtgc
accaccacacctggcttgattgttcttaatgaaactgaactgtctttagc
tcaagatgaaggtaaaaaaaattaatgtttatcatttaggaagtgagaag
gaaaatagatactctggaatcatttaaaagagactctgaatcaagtggag
tggcacataatctcaacacttaggcagaaggattaaacgtttcgtcagcc
tggattacatactgagacctgacaccacgtttgtgtaagaggaggaaaat
gaaaggaggaaaggtagagaggaaaaggaagtagggaaacagaggacgaa
tgggaagtgcagataataaatataatatgaagaaaacccagaaaggaata
catgaatattgggtggatgtgctcgcatgtatatactctctctctctctc
tctctctctcactctctcacacacacacatgcacaccatgcacacatgca
ccacatctcattctagcattcttttgtctgggaaaattcctcattctatt
tatccagccaccaggagaatttctaagcctggtcagaaagtgta
gaattctccttccaacatcttttcacaggcactggtgtggggcataccaa
gcataatccacaatgttaaaacaagtcagataattgtctttcctgcattg
taaattactttcttttaagaaacacattaaagcaaaatgtgtgtgtgtgt
gtgtatgtgtggtttaaaacgaaaagccattttcctcactagtattattt
tagatgagctaaatggtgttagttcttaaattgaaatgaaggggaaaagt
atgcacaagctatggacaattttaattttcaacacttgcagggtgaataa
tactgccgatgtcgtgaagagtttctatggtggtttatactcatttgcct
aaacactccgctccagactgcagtactgaagaattaaaaggtgacttgag
cctgttagtatgttctctacgcttctcagaaaaaagaccctggctgcagc
tattgtcagagtcataaggtatcctgtggccctcataggaaacagccatt
gaagaaggttcatttggtgagcttgattgcagcctgtcaaaaccaaaaga
gagccatgtcactcctgcaaatgattctatggccagccagaagcagcacc
tctcactacaggacatccaaaggggacagtgtagccagcaggatgcaagt
accttaaacccaaagcccattattccacaatgtctgctgatagcttgaaa
agaacacacagtcttcaaatcaagaaagtttctcttcccttcactcagag
ccaggatgaaattaatcaagccacaagatgtatccaggctcagcacattt
ctaccccaaggtcagagcctattctggagtccatcccaagctcaaaagag
ccaggccaaaggaagtgtgtacagcttctcaggacaaagctccttctacg
ttatagagaccagagaccatgggagaacaatcatcagcgtggtcagccac
ctggtggtctatcctcggccacctgtggtctatccccagctctgctccaa
gcacagctcacttataccccactctagtttcatgtaactattctcaagct
ctggatgagtgtttggtcccatggccagtactcttgccttatagtttttc
tgctgctggtgataaacactga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_48177663_48178801
seq2: B6Ng01-199F21.b_44_1187 (reverse)

seq1  TACACTTTTCTGACAGGGCTTTAGAAA-TCTTCT-GTTGCTGGATAAATA  48
      ||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| || || ||||||||||||
seq2  TACAC-TTTCTGACCAGGC-TTAGAAATTCTCCTGGTGGCTGGATAAATA  48

seq1  GAAATGAGGAATTTT-CCAGAC-AAAGGATGCTTAGATTGAGATGT-GTG  95
      | ||||||||||||| |||||| |||| |||| |||| |||||||| |||
seq2  G-AATGAGGAATTTTCCCAGACAAAAGAATGC-TAGAATGAGATGTGGTG  96

seq1  CATGTGTGCAT-GTGTGCATGTGTGTGTGTGAGAGAGTGAGAGAGAGAGA  144
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTGCATGGTGTGCATGTGTGTGTGTGAGAGAGTGAGAGAGAGAGA  146

seq1  GAGAGAGAGAGAGTATATACATGCGAGCACATCCACCC-ATATTCATTGT  193
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
seq2  GAGAGAGAGAGAGTATATACATGCGAGCACATCCACCCAATATTCA-TGT  195

seq1  ATT-CTTTCT-GGTTTTCTTCATTATTATATTTATTATCTGCACTTCCCA  241
      ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTTTCTGGGTTTTCTTCA-TATTATATTTATTATCTGCACTTCCCA  244

seq1  TTCGTCCTCTGTTTCCCTACTTCCTTTTCCTCTCTACC-TTCCTCC-TTC  289
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
seq2  TTCGTCCTCTGTTTCCCTACTTCCTTTTCCTCTCTACCTTTCCTCCTTTC  294

seq1  ATTTTCCTCCTCTTACACAAACGTGGTGTCAGGTCTCAGTATGTAATCCA  339
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCCTCCTCTTACACAAACGTGGTGTCAGGTCTCAGTATGTAATCCA  344

seq1  GGCTGACGAAACGTTTAATCCTTCTGCCTAAGTGTTGAGATTATGTGCCA  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGACGAAACGTTTAATCCTTCTGCCTAAGTGTTGAGATTATGTGCCA  394

seq1  CTCCACTTGATTCAGAGTCTCTTTTAAATGATTCCAGAGTATCTATTTTC  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCACTTGATTCAGAGTCTCTTTTAAATGATTCCAGAGTATCTATTTTC  444

seq1  CTTCTCACTTCCTAAATGATAAACATTAATTTTTTTTACCTTCATCTTGA  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCACTTCCTAAATGATAAACATTAATTTTTTTTACCTTCATCTTGA  494

seq1  GCTAAAGACAGTTCAGTTTCATTAAGAACAATCAAGCCAGGTGTGGTGGT  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAAGACAGTTCAGTTTCATTAAGAACAATCAAGCCAGGTGTGGTGGT  544

seq1  GCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGGATTTCTGA  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGGATTTCTGA  594

seq1  GTTCGAGGCCAGCCTGGTTTACAGAGTGAGTTCCAGGATAGCCAGGACTA  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCGAGGCCAGCCTGGTTTACAGAGTGAGTTCCAGGATAGCCAGGACTA  644

seq1  CACAGAGAAACCCTGTCTTGAAAAAAAACAACAACAACAACGAAAAATCA  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAGAAACCCTGTCTTGAAAAAAAACAACAACAACAACGAAAAATCA  694

seq1  AGGCAGCAGTGCTTGGTTTGAGGTGAAGATGAATCAGCCAGACTGCTTCC  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGCAGTGCTTGGTTTGAGGTGAAGATGAATCAGCCAGACTGCTTCC  744

seq1  CAGGGCTTTCCTCACCTTCCAGGCTGCCCAAGTTTCCAGCTTTATTATGA  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGCTTTCCTCACCTTCCAGGCTGCCCAAGTTTCCAGCTTTATTATGA  794

seq1  CTCATATACTTATGTGTACTCCAGCACTATTCCTTGTTCTCCTCTGAAAG  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATATACTTATGTGTACTCCAGCACTATTCCTTGTTCTCCTCTGAAAG  844

seq1  GGAAGAAATAGATGAGAGGCTGTTAGCATCCAATCAGTTCAGCTTACCAC  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAAATAGATGAGAGGCTGTTAGCATCCAATCAGTTCAGCTTACCAC  894

seq1  CTATCTATTCAGTCTCTATTCAGTCGCCTACGAGTGTCAGAAAGGAGATT  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTATTCAGTCTCTATTCAGTCGCCTACGAGTGTCAGAAAGGAGATT  944

seq1  AGTGAGCCCATCCCAGCTGAGCCAAACACATCTATCCAGCATTGTGTACT  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGCCCATCCCAGCTGAGCCAAACACATCTATCCAGCATTGTGTACT  994

seq1  TGTGCTCTACAAGGTCAAGCAGAGTTGCACTTACCAGTTCAGAAAGCAGT  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTCTACAAGGTCAAGCAGAGTTGCACTTACCAGTTCAGAAAGCAGT  1044

seq1  GAACAGTTTTGGCTGCATCTGGAAGTCTAGGAGGTAGAGACTCAGGCCCC  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGTTTTGGCTGCATCTGGAAGTCTAGGAGGTAGAGACTCAGGCCCC  1094

seq1  ACATACAGAGTAGACCTGTAGCCCAGTGCTAAACATCACAACAGGAATTC  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACAGAGTAGACCTGTAGCCCAGTGCTAAACATCACAACAGGAATTC  1144

seq1: chr7_48137419_48138546
seq2: B6Ng01-199F21.g_60_1181

seq1  GAATTCTCCTTCCAACATCTTTTCACAGGCACTGGTGTGGGGCATACCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTTCCAACATCTTTTCACAGGCACTGGTGTGGGGCATACCAA  50

seq1  GCATAATCCACAATGTTAAAACAAGTCAGATAATTGTCTTTCCTGCATTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAATCCACAATGTTAAAACAAGTCAGATAATTGTCTTTCCTGCATTG  100

seq1  TAAATTACTTTCTTTTAAGAAACACATTAAAGCAAAATGTGTGTGTGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTACTTTCTTTTAAGAAACACATTAAAGCAAAATGTGTGTGTGTGT  150

seq1  GTGTATGTGTGGTTTAAAACGAAAAGCCATTTTCCTCACTAGTATTATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATGTGTGGTTTAAAACGAAAAGCCATTTTCCTCACTAGTATTATTT  200

seq1  TAGATGAGCTAAATGGTGTTAGTTCTTAAATTGAAATGAAGGGGAAAAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGAGCTAAATGGTGTTAGTTCTTAAATTGAAATGAAGGGGAAAAGT  250

seq1  ATGCACAAGCTATGGACAATTTTAATTTTCAACACTTGCAGGGTGAATAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACAAGCTATGGACAATTTTAATTTTCAACACTTGCAGGGTGAATAA  300

seq1  TACTGCCGATGTCGTGAAGAGTTTCTATGGTGGTTTATACTCATTTGCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGCCGATGTCGTGAAGAGTTTCTATGGTGGTTTATACTCATTTGCCT  350

seq1  AAACACTCCGCTCCAGACTGCAGTACTGAAGAATTAAAAGGTGACTTGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACTCCGCTCCAGACTGCAGTACTGAAGAATTAAAAGGTGACTTGAG  400

seq1  CCTGTTAGTATGTTCTCTACGCTTCTCAGAAAAAAGACCCTGGCTGCAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTAGTATGTTCTCTACGCTTCTCAGAAAAAAGACCCTGGCTGCAGC  450

seq1  TATTGTCAGAGTCATAAGGTATCCTGTGGCCCTCATAGGAAACAGCCATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGTCAGAGTCATAAGGTATCCTGTGGCCCTCATAGGAAACAGCCATT  500

seq1  GAAGAAGGTTCATTTGGTGAGCTTGATTGCAGCCTGTCAAAACCAAAAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAGGTTCATTTGGTGAGCTTGATTGCAGCCTGTCAAAACCAAAAGA  550

seq1  GAGCCATGTCACTCCTGCAAATGATTCTATGGCCAGCCAGAAGCAGCACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCATGTCACTCCTGCAAATGATTCTATGGCCAGCCAGAAGCAGCACC  600

seq1  TCTCACTACAGGACATCCAAAGGGGACAGTGTAGCCAGCAGGATGCAAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACTACAGGACATCCAAAGGGGACAGTGTAGCCAGCAGGATGCAAGT  650

seq1  ACCTTAAACCCAAAGCCCATTATTCCACAATGTCTGCTGATAGCTTGAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTAAACCCAAAGCCCATTATTCCACAATGTCTGCTGATAGCTTGAAA  700

seq1  AGAACACACAGTCTTCAAATCAAGAAAGTTTCTCTTCCCTTCACTCAGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACACACAGTCTTCAAATCAAGAAAGTTTCTCTTCCCTTCACTCAGAG  750

seq1  CCAGGATGAAATTAATCAAGCCACAAGATGTATCCAGGCTCAGCACATTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGATGAAATTAATCAAGCCACAAGATGTATCCAGGCTCAGCACATTT  800

seq1  CTACCCCAAGGTCAGAGCCTATTCTGGAGTCCATCCCAAGCTCAAAAGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCCCAAGGTCAGAGCCTATTCTGGAGTCCATCCCAAGCTCAAAAGAG  850

seq1  CCAGGCCAAAGGAAGTGTGTACAGCTTCTCAGGACAAAGCTCCTTCTACG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCCAAAGGAAGTGTGTACAGCTTCTCAGGACAAAGCTCCTTCTACG  900

seq1  TTATAGAGACCAGAGACCATGGGAGAACAATCATCAGCGTGGGTCAGCCA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTATAGAGACCAGAGACCATGGGAGAACAATCATCAGCGT-GGTCAGCCA  949

seq1  CCT-GTGGTCTATCCTCGGCCACCTGTGGTCTATCCCCAGCTCTGCTCCA  999
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTGGTCTATCCTCGGCCACCTGTGGTCTATCCCCAGCTCTGCTCCA  999

seq1  AGCACAGCTCACTTATACCCCACTCTAGTTTCAATGTTAACTATTCTCAA  1049
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||
seq2  AGCACAGCTCACTTATACCCCACTCTAGTTTC-ATG-TAACTATTCTCAA  1047

seq1  AGGCTCCTGAATTGAGTGTTTGGTCCCCAATGG-CAGTACTCTGCCCTAA  1098
        ||||  ||  |||||||||||||||  |||| |||||||||  ||| |
seq2  --GCTCTGGA--TGAGTGTTTGGTCCC--ATGGCCAGTACTCTTGCCTTA  1091

seq1  TTAGTTTTCTGCTGCT-GTGATAAACACTGA  1128
      |   |||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TAGTTTTTCTGCTGCTGGTGATAAACACTGA  1122