BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-200O24
Chromosome7 (Build37)
Map Location 128,506,429 - 128,620,204
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHs3st2
Upstream geneAbca15, Abca16, LOC668429, LOC546994, LOC100042914, E130201H02Rik, LOC637957, Uqcrc2, 4930408O21Rik, BC030336, E030013G06Rik, EG436008, LOC100043426, Eef2k, Polr3e, Cdr2, 4933427G17Rik, EG668548, Mettl9, LOC668456, Igsf6, Otoa, LOC668556
Downstream geneUsp31, Scnn1g, Scnn1b, Cog7, Gga2, Ears2, Ubfd1, Ndufab1, Palb2, Dctn5, Plk1, Ern2, 2010110P09Rik, Prkcb1, LOC668486
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-200O24.bB6Ng01-200O24.g
ACCGA021852GA021853
length1,140929
definitionB6Ng01-200O24.b B6Ng01-200O24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,619,053 - 128,620,204)(128,506,429 - 128,507,349)
sequence
gaattctcttctaggaagggattttctttagtagcagcacacctggtgca
gttactgtagatggagtcacagaggcccatgttttcccaagactgttata
gaagtgtaagtagatcttaaccctatgaccttgtatggaaagtaatttct
gattagatacaatgtcaaaggagggaaattagcttctcttctagttgagc
aaagtgtgcaaaaaccctaggatcttcctcattggatgaaggtcttggaa
tgaacgaaggtgtttactgactgccgaagccttccaccagctttaagtat
tgcaattttcctcaaaaatcaattatttcccagaaactaataggggggtc
tccccaaaccccaagtttcatgtaacctcctaattgtggtaaaaacaaaa
caaaacaaaacaaaaaagtcagatgcacatacatacacacatacatatat
acatacacatgcacacatgtacacatacattcacacacatgcacatacat
acttacatacgcacatgcacatatatacatacatacacatgcacacatac
atgcatgcatacatacacgcacacacacatacaaatacatacatacacat
gcatacacacatgaaacaaccctatccataacagacagatctcagttaga
tatatctttctgcaaccccttctctcatggtcttcatgagaatatttttc
aaatcccttcagatcttctaatgcacccccctcccactgcactgctaaag
catatggaaaacagacccaagctgtaatccagtctccatcacttgaagat
tagggtactagtaactctcaaccctctctgaggctcagttcctgtgttta
tgagatgaaggaaggaaaatacactctgcaagcttttgcaaggtttaaat
aaaatacataggcgtgtcagcacagtgccctgcatatggatgatggaatg
ataccctgcactgcctccatctctacttattgtcatggcaaccaagttgg
atttgattgtacattttatcaccaaaattcttgagcagagatctgtgatt
ctccaggctcgcatcttggtttattcaagaatctatacaagattggtctt
gccaccacattcgcattggatgctttcagctagccatacc
gaattcagttttagttacaacctcaggtggcctcactgagacccatctgt
tttagccgtgaggtagggacaataatatccacctggcttgctttgtggat
atctgtaatgatcagctgaattactgtccaccatgacttaactgatagac
agaaatgctttgacatttccacagattgtgaccccataccaaaaatacag
agcaaaatatgtgaaactctataaaggatgcttcatggttccctacatga
gtccccactggaaaatggggtgggagcaggagttctaaataaagggattt
gatacaaaagatggaaagaaggggcctagggagatggcttgtcagtaaag
tgcctgctgcccaaggatgactacctgagttctggtctccagcacctatg
tgaaaaagctggcatagagcctgtatctgaagtcctagcactggaaatgg
gagatgaggaggggcagttcctggacctcactggtccagtgaataagcac
cagcttcagagaaaccctgtctcaaagaataaggtggagttcattgagga
aggcacctgatatcagcctttattcaaatgcatttacatgtgcacactcg
cgtgcgcgcgcgcgcgcacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacgaaggatttaaaaaagtccaaggtgaaggtaaagagttgtaag
cattggctaagaatggtttcagggaggctgtgttgttgttgttggttttt
gtttgtttgtttgtttgtttttttaaagagctaaggtttgcaaaaatgtt
aaggacaaaaaaaatgggatttgggggcacattttgaagcaagcttgata
aatgagcggaattgtgccacaaatgacagattggaagcatgaacttgaag
aattgtagctgcctcccaagggaagaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_128619053_128620204
seq2: B6Ng01-200O24.b_47_1186 (reverse)

seq1  GGTATGGCTAGCTGAAA-AAACAAAAACAAAAATGTGGATGTGTGCAGAC  49
      |||||||||||||||||  | | ||  |   ||||||   |||   ||||
seq2  GGTATGGCTAGCTGAAAGCATCCAATGC--GAATGTG---GTGGCAAGAC  45

seq1  CCAAATCTTTGTATAGATTCTTGGAATTAAACAAAGGAGCGAGCCCTGAG  99
      |  |||| |||||||||||||||  | ||||| |||  |||||||  |||
seq2  C--AATC-TTGTATAGATTCTTG--AATAAACCAAGATGCGAGCCTGGAG  90

seq1  AACAACAGAACCTTCTGGCTCAAGAATTTTGGTGAT-AAATGTACAATCA  148
      ||  ||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| 
seq2  AATCACAGATC--TCT-GCTCAAGAATTTTGGTGATAAAATGTACAATC-  136

seq1  AAATCCAACTTGGTTGCCATGACAATAAGTAGAGATGGAGGCAGTGCAGG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCCAACTTGGTTGCCATGACAATAAGTAGAGATGGAGGCAGTGCAGG  186

seq1  GTATCATTCCATCATCCATATGCAGGGCACTGTGCTGACACCGCCTATGT  248
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GTATCATTCCATCATCCATATGCAGGGCACTGTGCTGACA-CGCCTATGT  235

seq1  ATTTTATTTAAACCTTGCAAAAGCTTGCAGAGTGTATTTTCCTTCCTTCA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTATTTAAACCTTGCAAAAGCTTGCAGAGTGTATTTTCCTTCCTTCA  285

seq1  TCTCATAAACACAGGAACTGAGCCTCAGAGA-GGTTGAGAGTTACTAGTA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCTCATAAACACAGGAACTGAGCCTCAGAGAGGGTTGAGAGTTACTAGTA  335

seq1  CCCTAATCTTCAAGTGATGGAGACTGGATTACAGCTTGGGTCTGTTTTCC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAATCTTCAAGTGATGGAGACTGGATTACAGCTTGGGTCTGTTTTCC  385

seq1  ATATGCTTTAGCAGTGCAGTGGGAGGGGGGTGCATTAGAAGATCTGAAGG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCTTTAGCAGTGCAGTGGGAGGGGGGTGCATTAGAAGATCTGAAGG  435

seq1  GATTTGAAAAATATTCTCATGAAGACCATGAGAGAAGGGGTTGCAGAAAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGAAAAATATTCTCATGAAGACCATGAGAGAAGGGGTTGCAGAAAG  485

seq1  ATATATCTAACTGAGATCTGTCTGTTATGGATAGGGTTGTTTCATGTGTG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATCTAACTGAGATCTGTCTGTTATGGATAGGGTTGTTTCATGTGTG  535

seq1  TATGCATGTGTATGTATGTATTTGTATGTGTGTGTGCGTGTATGTATGCA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCATGTGTATGTATGTATTTGTATGTGTGTGTGCGTGTATGTATGCA  585

seq1  TGCATGTATGTGTGCATGTGTATGTATGTATATATGTGCATGTGCGTATG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGTATGTGTGCATGTGTATGTATGTATATATGTGCATGTGCGTATG  635

seq1  TAAGTATGTATGTGCATGTGTGTGAATGTATGTGTACATGTGTGCATGTG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTATGTATGTGCATGTGTGTGAATGTATGTGTACATGTGTGCATGTG  685

seq1  TATGTATATATGTATGTGTGTATGTATGTGCATCTGACTTTTTTGTTTTG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATATATGTATGTGTGTATGTATGTGCATCTGACTTTTTTGTTTTG  735

seq1  TTTTGTTTTGTTTTTACCACAATTAGGAGGTTACATGAAACTTGGGGTTT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTTTTGTTTTTACCACAATTAGGAGGTTACATGAAACTTGGGGTTT  785

seq1  GGGGAGACCCCCCTATTAGTTTCTGGGAAATAATTGATTTTTGAGGAAAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGACCCCCCTATTAGTTTCTGGGAAATAATTGATTTTTGAGGAAAA  835

seq1  TTGCAATACTTAAAGCTGGTGGAAGGCTTCGGCAGTCAGTAAACACCTTC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAATACTTAAAGCTGGTGGAAGGCTTCGGCAGTCAGTAAACACCTTC  885

seq1  GTTCATTCCAAGACCTTCATCCAATGAGGAAGATCCTAGGGTTTTTGCAC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATTCCAAGACCTTCATCCAATGAGGAAGATCCTAGGGTTTTTGCAC  935

seq1  ACTTTGCTCAACTAGAAGAGAAGCTAATTTCCCTCCTTTGACATTGTATC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGCTCAACTAGAAGAGAAGCTAATTTCCCTCCTTTGACATTGTATC  985

seq1  TAATCAGAAATTACTTTCCATACAAGGTCATAGGGTTAAGATCTACTTAC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCAGAAATTACTTTCCATACAAGGTCATAGGGTTAAGATCTACTTAC  1035

seq1  ACTTCTATAACAGTCTTGGGAAAACATGGGCCTCTGTGACTCCATCTACA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTATAACAGTCTTGGGAAAACATGGGCCTCTGTGACTCCATCTACA  1085

seq1  GTAACTGCACCAGGTGTGCTGCTACTAAAGAAAATCCCTTCCTAGAAGAG  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACTGCACCAGGTGTGCTGCTACTAAAGAAAATCCCTTCCTAGAAGAG  1135

seq1  AATTC  1152
      |||||
seq2  AATTC  1140

seq1: chr7_128506429_128507349
seq2: B6Ng01-200O24.g_68_996

seq1  GAATTCAGTTTTAGTTACAACCTCAGGTGGCCTCACTGAGACCCATCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTTTAGTTACAACCTCAGGTGGCCTCACTGAGACCCATCTGT  50

seq1  TTTAGCCGTGAGGTAGGGACAATAATATCCACCTGGCTTGCTTTGTGGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCCGTGAGGTAGGGACAATAATATCCACCTGGCTTGCTTTGTGGAT  100

seq1  ATCTGTAATGATCAGCTGAATTACTGTCCACCATGACTTAACTGATAGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTAATGATCAGCTGAATTACTGTCCACCATGACTTAACTGATAGAC  150

seq1  AGAAATGCTTTGACATTTCCACAGATTGTGACCCCATACCAAAAATACAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGCTTTGACATTTCCACAGATTGTGACCCCATACCAAAAATACAG  200

seq1  AGCAAAATATGTGAAACTCTATAAAGGATGCTTCATGGTTCCCTACATGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAAATATGTGAAACTCTATAAAGGATGCTTCATGGTTCCCTACATGA  250

seq1  GTCCCCACTGGAAAATGGGGTGGGAGCAGGAGTTCTAAATAAAGGGATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCCACTGGAAAATGGGGTGGGAGCAGGAGTTCTAAATAAAGGGATTT  300

seq1  GATACAAAAGATGGAAAGAAGGGGCCTAGGGAGATGGCTTGTCAGTAAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACAAAAGATGGAAAGAAGGGGCCTAGGGAGATGGCTTGTCAGTAAAG  350

seq1  TGCCTGCTGCCCAAGGATGACTACCTGAGTTCTGGTCTCCAGCACCTATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGCTGCCCAAGGATGACTACCTGAGTTCTGGTCTCCAGCACCTATG  400

seq1  TGAAAAAGCTGGCATAGAGCCTGTATCTGAAGTCCTAGCACTGGAAATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAAAGCTGGCATAGAGCCTGTATCTGAAGTCCTAGCACTGGAAATGG  450

seq1  GAGATGAGGAGGGGCAGTTCCTGGACCTCACTGGTCCAGTGAATAAGCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGAGGAGGGGCAGTTCCTGGACCTCACTGGTCCAGTGAATAAGCAC  500

seq1  CAGCTTCAGAGAAACCCTGTCTCAAAGAATAAGGTGGAGTTCATTGAGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTCAGAGAAACCCTGTCTCAAAGAATAAGGTGGAGTTCATTGAGGA  550

seq1  AGGCACCTGATATCAGCCTTTATTCAAATGCATTTACATGTGCACACTCG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCACCTGATATCAGCCTTTATTCAAATGCATTTACATGTGCACACTCG  600

seq1  CGTGCGCGCGCGCGCGCACACACACACACACACACACACACACACACACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGCGCGCGCGCGCGCACACACACACACACACACACACACACACACACA  650

seq1  CACACACGAAGGATTTAAAAAAGTCCAAGGTGAAGGTAAAGAGTTGTAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACGAAGGATTTAAAAAAGTCCAAGGTGAAGGTAAAGAGTTGTAAG  700

seq1  CATTGGCTAAGAATGGTTTCAGGGAGGCTGTGTTGTTGTTGTTGGTTTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGCTAAGAATGGTTTCAGGGAGGCTGTGTTGTTGTTGTTGGTTTTT  750

seq1  GTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTAAAGAGCTAAGGTTTGCAAAAATGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTAAAGAGCTAAGGTTTGCAAAAATGTT  800

seq1  AAGGACAAGAAAAAT-GGATTTGGGGGCACA-TTTGAAGCAAGC-TGATA  847
      |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||
seq2  AAGGACAAAAAAAATGGGATTTGGGGGCACATTTTGAAGCAAGCTTGATA  850

seq1  AATGA-CAGGATTGTGCCACAAATGACAGATTGGAAGCA-GAACTTG-AG  894
      ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
seq2  AATGAGCGGAATTGTGCCACAAATGACAGATTGGAAGCATGAACTTGAAG  900

seq1  GATTGTAGCTG-CTCCC-AGTGAAGAAAA  921
       |||||||||| ||||| || ||||||||
seq2  AATTGTAGCTGCCTCCCAAGGGAAGAAAA  929