BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-206L05
Chromosome7 (Build37)
Map Location 7,124,952 - 7,242,284
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp418, BC023179, 6430701C03Rik, Clcn4-2
Upstream geneZfp444, Galp, Zfp371, EG627821, Zfp667, Zfp583, LOC100042467, LOC100042459, Zfp78, Zfp28, LOC100042450, Olfr1344, GA_x5J8B7W3DQU-679632-679375, Olfr1336, Olfr1346, Olfr5, Olfr1347, Olfr1348, Olfr1349, LOC665328, Olfr1350, Zim2, Zim1, Peg3, Usp29, LOC627961, Aurkc, LOC628030, LOC100041822, 5730403M16Rik, 2810409K11Rik, Vmn2r-ps35
Downstream geneV2r15, LOC100041866, LOC100042577, Vmn2r31, Vmn2r-ps36, V2r5, LOC100041883, EG628117, Vmn2r33, LOC665470, EG665474, EG628368, LOC100042636, LOC665485, EG625353, Vmn2r-ps40, Vmn2r36, LOC638170, LOC100042662, LOC100041942, LOC100042673, LOC100041949, LOC100042681
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-206L05.bB6Ng01-206L05.g
ACCGA026051GA026052
length1,1231,163
definitionB6Ng01-206L05.b B6Ng01-206L05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,241,165 - 7,242,284)(7,124,952 - 7,126,107)
sequence
gaattcactcatccaaaagccaggcaacgggtctgggtgaatatataacc
cgtgttcctcgttggagtagaactccgttaggcaatgcacaggtccctga
tgcaaagctgggttgaacagagtctgagcccagtcgttacatgggactgc
ctctttggaacaagtatgagaagtaccgaaagttctcgttagagattctg
ctggggatgaaattatgatctgtctgtttgtttccgcagatcacacgttc
atggggactagggctgggcttttaaatctcattgtccttttctgttctag
gtggggtgactaggatgacagtgtctctagtggtcattatgtttgaactg
actggaggtctggagtatattgtacccctgatggcagctgctgtcaccag
caagtgggtggctgatgcctttgggaaagaagggatttatgaagcccaca
tccatctgaatgggtacccatttcttgatgtgaaggatgagttcacccac
cgtacgctggccactgatgtgatgcggccccggaggggagaaccgccatt
atcggtactaacccaggacagcatgactgtggaggacgtggagactctca
tcaaggagacagactacaacggctttcctgtgctcgtctccagagactcg
gagcgtctcatcgggtttgcccagaggcgggagctaatcttggctataag
tgagtatgaacaaggaggctttcacattttcctcagagacagatggtagt
tttgttttattttttgtttttttccatagaatcaacacatgagttccagg
gagttccttgagttgaggacttccttgataggcccccaacatgtctaagt
ctaagtgctcagtccttagcctgtgtacatatgggcaacaaaatggattc
agtaggttgtatgtgcttagtatgtatatgcatatgtatataactataga
cggggagcttagtatgtatatgcatatgtataataactgtagacgagagc
ttagtatgtatatgcattatgtataataacttgtagacgagagcttagca
tgtatatgcatatgtatataacctgtagacgagaagctagtatgtatatt
gcatatgtttaatactgttagac
gaattcatttttgtgggggttcttaagaatggaatgtaacatttagcatg
gaggcatatccctggagtctgaacactagagaggaccaaggcacgttcaa
agccagcctgggatacatggtgagaccctaagaaagaatgagtgattgat
aagatagctcagttggtaaaggcacttgctaccaagcctgagtacttaag
tcagtccccagaacctacatgataaagggagagaactgattcctgaaaat
tgtgccctgcttttctacttgtacactcacatacatatgcatactgggag
aaaataaataaataaataaataaataaataaataaataaataaatacaaa
aagagggagactgagatttcaaaacccagtagtatagtgggaatgtcagc
cgctggctagtcacacagatctacaactctggggaaaattaagcatggag
acatcctgattgctgaaggctgctgtttatccttgaatacgggtggatta
ggaaacagaatcagctttattttattattttaatacttttaaaatgttat
cccccttcccagtttcccctccacaaaccccctatcctatccccctcctc
tctgcttctgtgagggagctctcccacctcactgccttagcattcacctg
ctctgggacatcaagcctccatagaaccaaggatgccattgatgccaaat
aaggccatcctctgctacatatccagctggagtcatgggtccctccatat
gtactctttgattggtggtttagtccctgggagctctagggtgttaggga
gtgtcctgaaggctttttcttaactcctttgatcaggtgatactcctttc
ctgcctcagcctcctaagtgcttatacaatgagagtctgccatcatggcc
aaaaggaagcttggtcttgttagtaataccattagcataacaccatacac
acacacacacacacacacacacacacacacacacacatcgcactcaacat
tttaggaggaattctttgaagtgtcctgaaagtgaagagtttcattctta
ggatggagagccgcaagtgttcatctgggagaatcagtgttatctgccaa
aggaggcccctgtagctagaactttttgtgagcctttgtttagaggaact
gtaaactgttgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_7241165_7242284
seq2: B6Ng01-206L05.b_42_1164 (reverse)

seq1  GTCT-ACAGTTATTATACATATGC-ATATACATACTAAGCTCTCGTCTAC  48
      |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||
seq2  GTCTAACAG-TATTAAACATATGCAATATACATACTAGCTTCTCGTCTAC  49

seq1  AGTTATTATACATATGCATATACATACTAAGCTCTCGTCTAC-AGTTATT  97
      || |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||
seq2  AGGTTATATACATATGCATATACATGCTAAGCTCTCGTCTACAAGTTATT  99

seq1  ATACAT-ATGCATATACATACTAAGCTCTCGTCTACAGTTATTATACATA  146
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATAATGCATATACATACTAAGCTCTCGTCTACAGTTATTATACATA  149

seq1  TGCATATACATACTAAGCT-CTCGTCTATAGTTATTATACATATGCATAT  195
      ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TGCATATACATACTAAGCTCCCCGTCTATAGTTA-TATACATATGCATAT  198

seq1  ACATACTAAGCACATACAACCTACTGAATCCATTTTGTTGCCCATATGTA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACTAAGCACATACAACCTACTGAATCCATTTTGTTGCCCATATGTA  248

seq1  CACAGGCTAAGGACTGAGCACTTAGACTTAGACATGTTGGGGGCCTATCA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGCTAAGGACTGAGCACTTAGACTTAGACATGTTGGGGGCCTATCA  298

seq1  AGGAAGTCCTCAACTCAAGGAACTCCCTGGAACTCATGTGTTGATTCTAT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTCCTCAACTCAAGGAACTCCCTGGAACTCATGTGTTGATTCTAT  348

seq1  GGAAAAAAACAAAAAATAAAACAAAACTACCATCTGTCTCTGAGGAAAAT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAAAACAAAAAATAAAACAAAACTACCATCTGTCTCTGAGGAAAAT  398

seq1  GTGAAAGCCTCCTTGTTCATACTCACTTATAGCCAAGATTAGCTCCCGCC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAGCCTCCTTGTTCATACTCACTTATAGCCAAGATTAGCTCCCGCC  448

seq1  TCTGGGCAAACCCGATGAGACGCTCCGAGTCTCTGGAGACGAGCACAGGA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGCAAACCCGATGAGACGCTCCGAGTCTCTGGAGACGAGCACAGGA  498

seq1  AAGCCGTTGTAGTCTGTCTCCTTGATGAGAGTCTCCACGTCCTCCACAGT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCGTTGTAGTCTGTCTCCTTGATGAGAGTCTCCACGTCCTCCACAGT  548

seq1  CATGCTGTCCTGGGTTAGTACCGATAATGGCGGTTCTCCCCTCCGGGGCC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTGTCCTGGGTTAGTACCGATAATGGCGGTTCTCCCCTCCGGGGCC  598

seq1  GCATCACATCAGTGGCCAGCGTACGGTGGGTGAACTCATCCTTCACATCA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCACATCAGTGGCCAGCGTACGGTGGGTGAACTCATCCTTCACATCA  648

seq1  AGAAATGGGTACCCATTCAGATGGATGTGGGCTTCATAAATCCCTTCTTT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGGGTACCCATTCAGATGGATGTGGGCTTCATAAATCCCTTCTTT  698

seq1  CCCAAAGGCATCAGCCACCCACTTGCTGGTGACAGCAGCTGCCATCAGGG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAAGGCATCAGCCACCCACTTGCTGGTGACAGCAGCTGCCATCAGGG  748

seq1  GTACAATATACTCCAGACCTCCAGTCAGTTCAAACATAATGACCACTAGA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAATATACTCCAGACCTCCAGTCAGTTCAAACATAATGACCACTAGA  798

seq1  GACACTGTCATCCTAGTCACCCCACCTAGAACAGAAAAGGACAATGAGAT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACTGTCATCCTAGTCACCCCACCTAGAACAGAAAAGGACAATGAGAT  848

seq1  TTAAAAGCCCAGCCCTAGTCCCCATGAACGTGTGATCTGCGGAAACAAAC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAGCCCAGCCCTAGTCCCCATGAACGTGTGATCTGCGGAAACAAAC  898

seq1  AGACAGATCATAATTTCATCCCCAGCAGAATCTCTAACGAGAACTTTCGG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGATCATAATTTCATCCCCAGCAGAATCTCTAACGAGAACTTTCGG  948

seq1  TACTTCTCATACTTGTTCCAAAGAGGCAGTCCCATGTAACGACTGGGCTC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCTCATACTTGTTCCAAAGAGGCAGTCCCATGTAACGACTGGGCTC  998

seq1  AGACTCTGTTCAACCCAGCTTTGCATCAGGGACCTGTGCATTGCCTAACG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCTGTTCAACCCAGCTTTGCATCAGGGACCTGTGCATTGCCTAACG  1048

seq1  GAGTTCTACTCCAACGAGGAACACGGGTTATATATTCACCCAGACCCGTT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCTACTCCAACGAGGAACACGGGTTATATATTCACCCAGACCCGTT  1098

seq1  GCCTGGCTTTTGGATGAGTGAATTC  1120
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGCTTTTGGATGAGTGAATTC  1123

seq1: chr7_7124952_7126107
seq2: B6Ng01-206L05.g_66_1228

seq1  GAATTCATTTTTGTGGGGGTTCTTAAGAATGGAATGTAACATTTAGCATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTTTGTGGGGGTTCTTAAGAATGGAATGTAACATTTAGCATG  50

seq1  GAGGCATATCCCTGGAGTCTGAACACTAGAGAGGACCAAGGCACGTTCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCATATCCCTGGAGTCTGAACACTAGAGAGGACCAAGGCACGTTCAA  100

seq1  AGCCAGCCTGGGATACATGGTGAGACCCTAAGAAAGAATGAGTGATTGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGCCTGGGATACATGGTGAGACCCTAAGAAAGAATGAGTGATTGAT  150

seq1  AAGATAGCTCAGTTGGTAAAGGCACTTGCTACCAAGCCTGAGTACTTAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATAGCTCAGTTGGTAAAGGCACTTGCTACCAAGCCTGAGTACTTAAG  200

seq1  TCAGTCCCCAGAACCTACATGATAAAGGGAGAGAACTGATTCCTGAAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCCCCAGAACCTACATGATAAAGGGAGAGAACTGATTCCTGAAAAT  250

seq1  TGTGCCCTGCTTTTCTACTTGTACACTCACATACATATGCATACTGGGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCCCTGCTTTTCTACTTGTACACTCACATACATATGCATACTGGGAG  300

seq1  AAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATACAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATACAAA  350

seq1  AAGAGGGAGACTGAGATTTCAAAACCCAGTAGTATAGTGGGAATGTCAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGGAGACTGAGATTTCAAAACCCAGTAGTATAGTGGGAATGTCAGC  400

seq1  CGCTGGCTAGTCACACAGATCTACAACTCTGGGGAAAATTAAGCATGGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTGGCTAGTCACACAGATCTACAACTCTGGGGAAAATTAAGCATGGAG  450

seq1  ACATCCTGATTGCTGAAGGCTGCTGTTTATCCTTGAATACGGGTGGATTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCCTGATTGCTGAAGGCTGCTGTTTATCCTTGAATACGGGTGGATTA  500

seq1  GGAAACAGAATCAGCTTTATTTTATTATTTTAATACTTTTAAAATGTTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACAGAATCAGCTTTATTTTATTATTTTAATACTTTTAAAATGTTAT  550

seq1  CCCCCTTCCCAGTTTCCCCTCCACAAACCCCCTATCCTATCCCCCTCCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCTTCCCAGTTTCCCCTCCACAAACCCCCTATCCTATCCCCCTCCTC  600

seq1  TCTGCTTCTGTGAGGGAGCTCTCCCACCTCACTGCCTTAGCATTCACCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTTCTGTGAGGGAGCTCTCCCACCTCACTGCCTTAGCATTCACCTG  650

seq1  CTCTGGGACATCAAGCCTCCATAGAACCAAGGATGCCATTGATGCCAAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGGACATCAAGCCTCCATAGAACCAAGGATGCCATTGATGCCAAAT  700

seq1  AAGGCCATCCTCTGCTACATATCCAGCTGGAGTCATGGGTCCCTCCATAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCATCCTCTGCTACATATCCAGCTGGAGTCATGGGTCCCTCCATAT  750

seq1  GTACTCTTTGATTGGTGGTTTAGTCCCTGGGAGCTCTAGGGTGTTAGGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTCTTTGATTGGTGGTTTAGTCCCTGGGAGCTCTAGGGTGTTAGGGA  800

seq1  GTGTCCTGAAGGCTTTTTCTTAACTCCTTTGATCAGGTGATACTCC-TTC  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GTGTCCTGAAGGCTTTTTCTTAACTCCTTTGATCAGGTGATACTCCTTTC  850

seq1  CTGCCTCAGCCTCCTAAGTGCTTATACAATGAGAGTCTGCCATCATGGCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCAGCCTCCTAAGTGCTTATACAATGAGAGTCTGCCATCATGGCC  900

seq1  AAAAGGAAGC-TGGTCTTGTTAGTAATACCATAAGCATAACACCATACAC  948
      |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AAAAGGAAGCTTGGTCTTGTTAGTAATACCATTAGCATAACACCATACAC  950

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACATCGCAC-CAACA-  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| 
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACATCGCACTCAACAT  1000

seq1  TTTAGGAAGGATTC-TTGAAGTGTCTGAAAAGTGAAGAGTTTCATTCTAG  1045
      ||||||| | |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||  
seq2  TTTAGGAGGAATTCTTTGAAGTGTCCTGAAAGTGAAGAGTTTCATTCTTA  1050

seq1  GAATTGAGAGCGCAAAGTGTTCATCTGGGAGAATCAGTG-TATCTG-CAG  1093
      | || ||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| || 
seq2  GGATGGAGAGCCGCAAGTGTTCATCTGGGAGAATCAGTGTTATCTGCCAA  1100

seq1  AGGAGGCCCCTGTAGCTAG-ACTTTTTGGTAGAGCTTTG-TTAGAGGAAA  1141
      ||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||| ||||||||| 
seq2  AGGAGGCCCCTGTAGCTAGAACTTTTTGTGAG-CCTTTGTTTAGAGGAA-  1148

seq1  CCTGT-GACTGTTGAA  1156
       ||||  |||||||||
seq2  -CTGTAAACTGTTGAA  1163