BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-209F12
Chromosome7 (Build37)
Map Location 136,137,570 - 136,278,665
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC210714, LOC100043144
Upstream geneTrim72, LOC436010, EG668675, Itgam, Itgax, Itgad, Cox6a2, LOC100043133, Armc5, Tgfb1i1, Slc5a2, BC017158, EG628781, Rgs10, LOC100043643, Tial1, Bag3, EG639030, Inpp5f, LOC100043651, 1110007A13Rik, Sec23ip
Downstream genePpapdc1a, Brwd2, LOC100043150
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-209F12.bB6Ng01-209F12.g
ACCGA027985GA027986
length2471,061
definitionB6Ng01-209F12.b B6Ng01-209F12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(136,137,570 - 136,137,816)(136,277,612 - 136,278,665)
sequence
attagggaataaggcagatgtgtcgctagagatgtgttattagggaataa
ggcagatgttgcttaataaagaaaccaggcagaaagcaaacatggaaggc
catcctgactatgatagagacatggagatgagagaggaagacaagaatgt
cagaacaaactctgacaggagatggcatttaggtagaggaagcagggaga
agctggcaaagaataggagggaaacgtgaagtgccaggttgtgtgtg
gaattcaagtccaagtccagagcaccctgtttccctccagctaaaccctg
acgcctttttaaacgatttgactctagtgatgtagcagggtgagaagctt
agagtgagtatttatgccaggagttcactgggcccctgcaggtcaaaggt
tatgcacattgaatatgaatgaagcagtgacatttaactgagagaactca
acatgcaagacccaggagttggaaacatcacaacacaaacagaatagagc
aacaaagtcactgccactataccctagagatacttgtgacatttttaagg
tgatgattgtatgtttaattatgctggcatcgtctcagagacaatgaacc
tctttgaaatgagcctcaaagcacagtgggcactcactggcagagggaaa
ggacagaaaagactgcaaatatatttcagaaaataggacccataagaggg
catctttgtctactggccctgctttcaaagtgtctctatcatccctttcc
ccaggctggcaactagaaactttctcctctctttaataagcaaaactcat
acccaggtcgctcctttgcaactcggtaggaattaacaattcaatgtgag
ctacctctggccttgctgggcctcttaatgaatggagcatggataactgc
cccatcatccacatccagaacatgtgggcagttgccttttattctgtgaa
agctgagaaaaaaggggccagtgagcagttaaagctccaatcaacagagt
cacagcctgtggagccaggaagtagctagcatcctgcttcagctatgggc
tttcaaacaacaacaatgagagataaaaagacttgacaaagagccagcag
gaatttaagaaaaccttttactgcaactagggaatctttgccacctctct
cttcttgctctcctaacaactgtataacaccttggagagatgactttgcc
aaatctagagctaccagtttgtttttgagacagggtttcactgtataata
ttagccttggttgatctgaaactcacctatgtagaccagggaaggcttca
aacctcataga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_136137570_136137816
seq2: B6Ng01-209F12.b_53_299

seq1  ATTAGGGAATAAGGCAGATGTGTCGCTAGAGATGTGTTATTAGGGAATAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGGGAATAAGGCAGATGTGTCGCTAGAGATGTGTTATTAGGGAATAA  50

seq1  GGCAGATGTTGCTTAATAAAGAAACCAGGCAGAAAGCAAACATGGAAGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGATGTTGCTTAATAAAGAAACCAGGCAGAAAGCAAACATGGAAGGC  100

seq1  CATCCTGACTATGATAGAGACATGGAGATGAGAGAGGAAGACAAGAATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTGACTATGATAGAGACATGGAGATGAGAGAGGAAGACAAGAATGT  150

seq1  CAGAACAAACTCTGACAGGAGATGGCATTTAGGTAGAGGAAGCAGGGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACAAACTCTGACAGGAGATGGCATTTAGGTAGAGGAAGCAGGGAGA  200

seq1  AGCTGGCAAAGAATAGGAGGGAAACGTGAAGTGCCAGGTTGTGTGTG  247
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGCAAAGAATAGGAGGGAAACGTGAAGTGCCAGGTTGTGTGTG  247

seq1: chr7_136277612_136278665
seq2: B6Ng01-209F12.g_66_1126 (reverse)

seq1  TCTATGA-GTTTGAGGCCTTTCCTTGGTCTACATA-GTGAGTTTCAGATC  48
      ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TCTATGAGGTTTGAAGCC-TTCCCTGGTCTACATAGGTGAGTTTCAGATC  49

seq1  AACCAAGGCT-ATA-TATACAGTGAAACCCTGTCTC-AAAACAAACTGGT  95
      |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AACCAAGGCTAATATTATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAACAAACTGGT  99

seq1  AGCTCTAGATTT-GCAAAGTCATCTCTCCAAGGTGTTATACAGTTGTTAG  144
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTAGATTTGGCAAAGTCATCTCTCCAAGGTGTTATACAGTTGTTAG  149

seq1  GAGAGCAAGAAGAGAGAGGTGGC-AAGATTCCCTAGTTGCAGT-AAAGGT  192
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GAGAGCAAGAAGAGAGAGGTGGCAAAGATTCCCTAGTTGCAGTAAAAGGT  199

seq1  TTTCTTAATTCCCTGCTGGCTCTTTGTCAAGTCTTTTTATCTCTCATTGT  242
      |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTAAATTCCTGCTGGCTCTTTGTCAAGTCTTTTTATCTCTCATTGT  249

seq1  TGTTGTTTGAAAGCCCATAGCTGAAGCAGGATGCTAGCTACTTCCTGGCT  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTTTGAAAGCCCATAGCTGAAGCAGGATGCTAGCTACTTCCTGGCT  299

seq1  CCACAGGCTGTGACTCTGTTGATTGGAGCTTTAACTGCTCACTGGCCCCT  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGGCTGTGACTCTGTTGATTGGAGCTTTAACTGCTCACTGGCCCCT  349

seq1  TTTTTCTCAGCTTTCACAGAATAAAAGGCAACTGCCCACATGTTCTGGAT  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTCAGCTTTCACAGAATAAAAGGCAACTGCCCACATGTTCTGGAT  399

seq1  GTGGATGATGGGGCAGTTATCCATGCTCCATTCATTAAGAGGCCCAGCAA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGATGATGGGGCAGTTATCCATGCTCCATTCATTAAGAGGCCCAGCAA  449

seq1  GGCCAGAGGTAGCTCACATTGAATTGTTAATTCCTACCGAGTTGCAAAGG  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGAGGTAGCTCACATTGAATTGTTAATTCCTACCGAGTTGCAAAGG  499

seq1  AGCGACCTGGGTATGAGTTTTGCTTATTAAAGAGAGGAGAAAGTTTCTAG  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGACCTGGGTATGAGTTTTGCTTATTAAAGAGAGGAGAAAGTTTCTAG  549

seq1  TTGCCAGCCTGGGGAAAGGGATGATAGAGACACTTTGAAAGCAGGGCCAG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCAGCCTGGGGAAAGGGATGATAGAGACACTTTGAAAGCAGGGCCAG  599

seq1  TAGACAAAGATGCCCTCTTATGGGTCCTATTTTCTGAAATATATTTGCAG  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACAAAGATGCCCTCTTATGGGTCCTATTTTCTGAAATATATTTGCAG  649

seq1  TCTTTTCTGTCCTTTCCCTCTGCCAGTGAGTGCCCACTGTGCTTTGAGGC  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTCTGTCCTTTCCCTCTGCCAGTGAGTGCCCACTGTGCTTTGAGGC  699

seq1  TCATTTCAAAGAGGTTCATTGTCTCTGAGACGATGCCAGCATAATTAAAC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTCAAAGAGGTTCATTGTCTCTGAGACGATGCCAGCATAATTAAAC  749

seq1  ATACAATCATCACCTTAAAAATGTCACAAGTATCTCTAGGGTATAGTGGC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAATCATCACCTTAAAAATGTCACAAGTATCTCTAGGGTATAGTGGC  799

seq1  AGTGACTTTGTTGCTCTATTCTGTTTGTGTTGTGATGTTTCCAACTCCTG  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGACTTTGTTGCTCTATTCTGTTTGTGTTGTGATGTTTCCAACTCCTG  849

seq1  GGTCTTGCATGTTGAGTTCTCTCAGTTAAATGTCACTGCTTCATTCATAT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTGCATGTTGAGTTCTCTCAGTTAAATGTCACTGCTTCATTCATAT  899

seq1  TCAATGTGCATAACCTTTGACCTGCAGGGGCCCAGTGAACTCCTGGCATA  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGTGCATAACCTTTGACCTGCAGGGGCCCAGTGAACTCCTGGCATA  949

seq1  AATACTCACTCTAAGCTTCTCACCCTGCTACATCACTAGAGTCAAATCGT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTCACTCTAAGCTTCTCACCCTGCTACATCACTAGAGTCAAATCGT  999

seq1  TTAAAAAGGCGTCAGGGTTTAGCTGGAGGGAAACAGGGTGCTCTGGACTT  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAGGCGTCAGGGTTTAGCTGGAGGGAAACAGGGTGCTCTGGACTT  1049

seq1  GGACTTGAATTC  1054
      ||||||||||||
seq2  GGACTTGAATTC  1061