BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-210I03
Chromosome7 (Build37)
Map Location 144,798,074 - 144,972,842
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC546009, EG621677, EG668771, Mgmt, EG621804, Ebf3, 9430038I01Rik, Txnl2
Downstream geneLOC435235, Tcerg1l, LOC100043290
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-210I03.bB6Ng01-210I03.g
ACCGA028829GA028830
length1,200776
definitionB6Ng01-210I03.b B6Ng01-210I03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(144,971,641 - 144,972,842)(144,798,074 - 144,798,847)
sequence
gaattcctctttatgcattcgcagagagagaccaaatttggggggtagga
ggagagtcagactccatcttggagaacctgacctaagtttgaactcaagt
aaactactaacaggctgatacctagtaccagtttccaggttacctcctcc
ccaataacacctgcatctagcaccagtctccaggttattccaaaaaaaaa
aaaaaaaatctgtacctccaggttataagcccacccctgtctaataacca
ccagggggagaagttaagtttatggtttggctcccagcaccagccaatta
tatcaaaggccacagtagcacccaactagatgcttgccaggctagaaaca
ctcaccccttacttgtcatttcctataaaaccttgttctgatgagcattc
tgggcctttctccaataaaaccatcctgtgggtccgtggcgaattaagcc
caagcttgagcttgtggataataataaaaaaagactcttgtgtgattggc
tcctgattgttcttttggggttcacaaatgcttcctggtactacaccagc
aactcagccccagctgacaatgtacactcatcctgaaaactcctacccac
tccccaattttatatatcccttgtttgccaccaatagagagagctgtttc
accgaaaaccatctcaggagaaggctatttctcccacactcaggccagct
ggagatcctgctaacccacccacccagctaagcttcattccttccagtct
agcctggtgcacaatggtgcctggacatctcaagggcagaagcaaacctg
gccagcacttcccgcaggtattcaaggagtcaaggtcctgatgttggaaa
aagcatgctgactcttgggtgcaggacctcttcctctgcttgggatgctg
ggggagctcagaagtagaagattagtttcctacacacacattgagaaaac
ctatcccctgtttgcctgtcacccacacacatctggctctcacattattg
agaaatgctgtctcccaagcattgtcagcccttatacctacaagaaaccc
ttcaagatttgggccctgtttgaagattccttcataggcaagcttatagg
agggattgtagacccctcccatgaagcaagtcactcctccttctgtgcct
tatatattctaccaagctgcacttggttctctagaggtgttacggcatac

gaattccaggaatagcaaagtcctggagaacctcatgggctctaggaaag
aaatgggggcttctgtctcccagatatgtcattaatgccttttatcacac
taacagtccgatcacatctctcctgctctgtttttctttgattgttgaaa
tgaagctttgatcctgtttctcagttatcactgaaggagttcctggacct
ctactgccggaaggtagattccttcaaagagtcctgattttgtggcaggt
tctaaaaccacgtgctaggagtaggagccctgcccctgggcagcctcagc
tctgtctctgagtgcttggttggagcttgtgacagggatgaaggtgggac
tccctgtgcttgtttctgcagtttgctcaatagcaattctaatatatagg
ggtagtgaggggctgacatcagctcaattcagatgccatccatctgggac
agctcagagccttggtggagagtaaggtcctgtaacaagggcattgctgc
aaatgaggccattggccccacagatttctgcgttttggctgtcgatttca
gggtttccaacccctcctactttatgggagcttctctagaacaaagcttc
tttagaaaaatgctttttaaactggtttaccagtctttaaggcaactaag
tatgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtaatcttctaaaatttta
tcaatggttccaacccttgcaatcaccaaaaatttcatttcaaatatatt
gctccataaagttcaggtgttgctgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_144971641_144972842
seq2: B6Ng01-210I03.b_43_1242 (reverse)

seq1  GTATACCGTAACACCTCTAGAG-ACCAAGTGCAGCTTGGGTAGAATTATA  49
      |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||
seq2  GTATGCCGTAACACCTCTAGAGAACCAAGTGCAGCTT-GGTAGAA-TATA  48

seq1  TAGAGGCACAGGAGGGAAGGAGTGACTTGCCTCTCATGGGA-GGGTCTAA  98
      || |||||||| |||  |||||||||||||   |||||||| |||||| |
seq2  TA-AGGCACAGAAGG--AGGAGTGACTTGC--TTCATGGGAGGGGTCT-A  92

seq1  CAATCCCTCCTATAAGCTGCCTTATG-AGGAATCTTC-AACAGG--CCCA  144
      ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||  || |
seq2  CAATCCCTCCTATAAGCTTGCCTATGAAGGAATCTTCAAACAGGGCCCAA  142

seq1  ATCCTG-AGGGTTTCTTGTAGGTTATAAGGGCTGAC-ATGCTTGGGAGAC  192
      ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
seq2  ATCTTGAAGGGTTTCTTGTAGG-TATAAGGGCTGACAATGCTTGGGAGAC  191

seq1  AGCATTTCTCAATAATGTGAGAGCCAGATGTGTTGTGGGTGACAGGCAAA  242
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGCATTTCTCAATAATGTGAGAGCCAGATGTG-TGTGGGTGACAGGCAAA  240

seq1  CAGGGGATAGGTTTTCTCAATGTGTGTGTAGGAAACTAATCTTCTACTTC  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGATAGGTTTTCTCAATGTGTGTGTAGGAAACTAATCTTCTACTTC  290

seq1  TGAGCTCCCCCAGCATCCCAAGCAGAGGAAGAGGTCCTGCACCCAAGAGT  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTCCCCCAGCATCCCAAGCAGAGGAAGAGGTCCTGCACCCAAGAGT  340

seq1  CAGCATGCTTTTTCCAACATCAGGACCTTGACTCCTTGAATACCTGCGGG  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATGCTTTTTCCAACATCAGGACCTTGACTCCTTGAATACCTGCGGG  390

seq1  AAGTGCTGGCCAGGTTTGCTTCTGCCCTTGAGATGTCCAGGCACCATTGT  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCTGGCCAGGTTTGCTTCTGCCCTTGAGATGTCCAGGCACCATTGT  440

seq1  GCACCAGGCTAGACTGGAAGGAATGAAGCTTAGCTGGGTGGGTGGGTTAG  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCAGGCTAGACTGGAAGGAATGAAGCTTAGCTGGGTGGGTGGGTTAG  490

seq1  CAGGATCTCCAGCTGGCCTGAGTGTGGGAGAAATAGCCTTCTCCTGAGAT  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATCTCCAGCTGGCCTGAGTGTGGGAGAAATAGCCTTCTCCTGAGAT  540

seq1  GGTTTTCGGTGAAACAGCTCTCTCTATTGGTGGCAAACAAGGGATATATA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTCGGTGAAACAGCTCTCTCTATTGGTGGCAAACAAGGGATATATA  590

seq1  AAATTGGGGAGTGGGTAGGAGTTTTCAGGATGAGTGTACATTGTCAGCTG  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTGGGGAGTGGGTAGGAGTTTTCAGGATGAGTGTACATTGTCAGCTG  640

seq1  GGGCTGAGTTGCTGGTGTAGTACCAGGAAGCATTTGTGAACCCCAAAAGA  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGAGTTGCTGGTGTAGTACCAGGAAGCATTTGTGAACCCCAAAAGA  690

seq1  ACAATCAGGAGCCAATCACACAAGAGTCTTTTTTTATTATTATCCACAAG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCAGGAGCCAATCACACAAGAGTCTTTTTTTATTATTATCCACAAG  740

seq1  CTCAAGCTTGGGCTTAATTCGCCACGGACCCACAGGATGGTTTTATTGGA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGCTTGGGCTTAATTCGCCACGGACCCACAGGATGGTTTTATTGGA  790

seq1  GAAAGGCCCAGAATGCTCATCAGAACAAGGTTTTATAGGAAATGACAAGT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGCCCAGAATGCTCATCAGAACAAGGTTTTATAGGAAATGACAAGT  840

seq1  AAGGGGTGAGTGTTTCTAGCCTGGCAAGCATCTAGTTGGGTGCTACTGTG  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGGTGAGTGTTTCTAGCCTGGCAAGCATCTAGTTGGGTGCTACTGTG  890

seq1  GCCTTTGATATAATTGGCTGGTGCTGGGAGCCAAACCATAAACTTAACTT  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTGATATAATTGGCTGGTGCTGGGAGCCAAACCATAAACTTAACTT  940

seq1  CTCCCCCTGGTGGTTATTAGACAGGGGTGGGCTTATAACCTGGAGGTACA  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCCTGGTGGTTATTAGACAGGGGTGGGCTTATAACCTGGAGGTACA  990

seq1  GATTTTTTTTTTTTTTTTTGGAATAACCTGGAGACTGGTGCTAGATGCAG  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTTTTTTTTTTTTTTGGAATAACCTGGAGACTGGTGCTAGATGCAG  1040

seq1  GTGTTATTGGGGAGGAGGTAACCTGGAAACTGGTACTAGGTATCAGCCTG  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTATTGGGGAGGAGGTAACCTGGAAACTGGTACTAGGTATCAGCCTG  1090

seq1  TTAGTAGTTTACTTGAGTTCAAACTTAGGTCAGGTTCTCCAAGATGGAGT  1142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTAGTTTACTTGAGTTCAAACTTAGGTCAGGTTCTCCAAGATGGAGT  1140

seq1  CTGACTCTCCTCCTACCCCCCAAATTTGGTCTCTCTCTGCGAATGCATAA  1192
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTCTCCTCCTACCCCCCAAATTTGGTCTCTCTCTGCGAATGCATAA  1190

seq1  AGAGGAATTC  1202
      ||||||||||
seq2  AGAGGAATTC  1200

seq1: chr7_144798074_144798847
seq2: B6Ng01-210I03.g_64_839

seq1  GAATTCCAGGAATAGCAAAGTCCTGGAGAACCTCATGGGCTCTAGGAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGAATAGCAAAGTCCTGGAGAACCTCATGGGCTCTAGGAAAG  50

seq1  AAATGGGGGCTTCTGTCTCCCAGATATGTCATTAATGCCTTTTATCACAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGGGGCTTCTGTCTCCCAGATATGTCATTAATGCCTTTTATCACAC  100

seq1  TAACAGTCCGATCACATCTCTCCTGCTCTGTTTTTCTTTGATTGTTGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGTCCGATCACATCTCTCCTGCTCTGTTTTTCTTTGATTGTTGAAA  150

seq1  TGAAGCTTTGATCCTGTTTCTCAGTTATCACTGAAGGAGTTCCTGGACCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCTTTGATCCTGTTTCTCAGTTATCACTGAAGGAGTTCCTGGACCT  200

seq1  CTACTGCCGGAAGGTAGATTCCTTCAAAGAGTCCTGATTTTGTGGCAGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGCCGGAAGGTAGATTCCTTCAAAGAGTCCTGATTTTGTGGCAGGT  250

seq1  TCTAAAACCACGTGCTAGGAGTAGGAGCCCTGCCCCTGGGCAGCCTCAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAACCACGTGCTAGGAGTAGGAGCCCTGCCCCTGGGCAGCCTCAGC  300

seq1  TCTGTCTCTGAGTGCTTGGTTGGAGCTTGTGACAGGGATGAAGGTGGGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTCTGAGTGCTTGGTTGGAGCTTGTGACAGGGATGAAGGTGGGAC  350

seq1  TCCCTGTGCTTGTTTCTGCAGTTTGCTCAATAGCAATTCTAATATATAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGTGCTTGTTTCTGCAGTTTGCTCAATAGCAATTCTAATATATAGG  400

seq1  GGTAGTGAGGGGCTGACATCAGCTCAATTCAGATGCCATCCATCTGGGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGTGAGGGGCTGACATCAGCTCAATTCAGATGCCATCCATCTGGGAC  450

seq1  AGCTCAGAGCCTTGGTGGAGAGTAAGGTCCTGTAACAAGGGCATTGCTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAGAGCCTTGGTGGAGAGTAAGGTCCTGTAACAAGGGCATTGCTGC  500

seq1  AAATGAGGCCATTGGCCCCACAGATTTCTGCGTTTTGGCTGTCGATTTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAGGCCATTGGCCCCACAGATTTCTGCGTTTTGGCTGTCGATTTCA  550

seq1  GGGTTTCCAACCCCTCCTACTTTATGGGAGCTTCTCTAGAACAAAGCTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTCCAACCCCTCCTACTTTATGGGAGCTTCTCTAGAACAAAGCTTC  600

seq1  TTTAGAAAAATGCTTTTTAAACTGGTTTACCAGTCTTTAAGGCAACTAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAAAAATGCTTTTTAAACTGGTTTACCAGTCTTTAAGGCAACTAAG  650

seq1  TATGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAATC-TCTAAAAATTTA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
seq2  TATGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAATCTTCTAAAATTTTA  700

seq1  TCAATGGTTTCCAACCATGCAATCACCAAAAA-TTCATTTCAAATAAAAT  748
      ||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |
seq2  TCAATGGTTCCAACCCTTGCAATCACCAAAAATTTCATTTCAAATATATT  750

seq1  GCTCCATAAAGTCAGGGTGTTGCTGG  774
      ||||||||||||   |||||||||||
seq2  GCTCCATAAAGTTCAGGTGTTGCTGG  776