BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-212J07
Chromosome7 (Build37)
Map Location 104,156,476 - 104,304,007
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNars2, Gab2
Upstream geneEG666836, Odz4, LOC670727, LOC666858
Downstream geneLOC100040457, Usp35, EG622320, Alg8, Ndufc2, Thrsp, Kctd14, Ints4, 1810020D17Rik, Rsf1, LOC622994, LOC100040211, Clns1a, Aqp11, LOC100040594, Pak1, Gdpd4, Myo7a, Capn5, Omp
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-212J07.bB6Ng01-212J07.g
ACCGA030340GA030341
length1,1241,192
definitionB6Ng01-212J07.b B6Ng01-212J07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(104,156,476 - 104,157,597)(104,302,839 - 104,304,007)
sequence
gaattctgtcttcttttcatagttaataagcttaatgtctgagactccac
ttataatctataaacacaaattataacaattaccattcagagctgttgtg
agaattaattgggtacctgtaaagtctcaaatttgtcacagtgtgggcac
tcaattgttaggtactctgctggtagcagtactgacagctgggacctctg
gaggataggtctagctaaagtagtgtgacctggaagaaacagctgacagg
taattttcaagttgttttacaacagaataaaactaaagttctcagaaagc
aagtgagttgagatagtgaatgagtctgcctggactcagaactcacaaga
caggtcaggttaaaccagagctgcctacaaggaaggaatggattaaggca
cagagcttagatacgtcccgatacctcacagaactatggcaggtttaaga
gcagagtagactgtgcatgactccagcttgagggggatccaatactcttg
gcctctaaggacaccagctcttgtgtgcacatggacatacatatacataa
ttaaaaaataaaagtaaatctcctttaaaagcttggaatactcttctgtt
gatgtgctgaaatattttaagtatgcctgatatatgaaaatgaattctta
tttatcattttcacataagtacgaattcctttttgtgttcatttcaatct
taaggagagattggggcagattgagtgtctatacaactttagaaaatctg
ccagccggcttcctgaagtaagtctctttcctgtgaccagcagcgggtga
gagggagtgaaaggaacactggtgctcatcccagaccagcgaccgtaaag
cagcttctggccaaaccagggtcatcctaccctagatgaccatggataca
gtaaatatctacctttcattagtgttctattttgttttaaaggggactat
ttaatagacggcctgatagggccttagtagaaatgtaagaaatgttatgg
aaagtataataagctttctttaatataaaataaagggcactggggctaga
gagatgatggtcagttgcctaagagcacccatgtgggtgctgggaacaaa
ctgaagtctctaaagaaacagcaa
gaattcaacatggggttctatgcctttgtgctcatttgactaaagcttcc
tccccagactgtacgctgccaaactgtttctggtaagcaactttggaaaa
tgaaaattccctagacattttgaacaagactgtgagaggaagacacacag
gggccagggaactgaaacataccccttcaagtccacttctgccttgagga
gttgggggaggggagctgcagagtagttgttagaggaagcagacttgctg
gattttggctgcaaacaattgggtactgtatccagtggttggctggacag
ctgtcagctcaagatcgggtcaagatttagtctaaagtaggagggtacca
aactctgtttcattagttacagtttctgcactcttacacttaacttcaat
gccagtgttggaagattcatagagatcattttgccagtttaggtctttct
atttctccctgcttccctcttctctgcctcacactccccctttctgtata
ctaaatttggcatagacccacaaactgtaagttaaagctgacatgctctg
gccagaaggggacagacaaaaaggcttgcctgctaagctgcctcacccct
ttagtcctaccatttggaaggcagaggcaggtggacctctgagatagaga
ccagcctggtctacagaacaaactccaggccatttagggttccagagtga
tactgtctcaaaataaaacaaccaagtctatattttggtcttgattctgt
tgattcccagccttggctcacagtaccatggagtctctggctaaaaccta
gatggcctggtcttaagtgttgttctatagacgcacatagatgtgctttg
acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacatat
atatatatattctgatatcaataactcccaatgcttcattttgctattct
acctagaagaagtccttcaccattagaccttaaaaaatttatctacctta
cttagcaaaagaaaggatctaaagtatagcaggaagaaggaaggtgaaaa
gggaatgctgacaggtagggtggggatctagaactccagccagccagaat
ttaagtgcctaagttgaaatagcctgaagaatccaggaaccagaattctc
tctagctcctctcaaggaaaccaattagagaaacttaacaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_104156476_104157597
seq2: B6Ng01-212J07.b_43_1166

seq1  GAATTCTGTCTTCTTTTCATAGTTAATAAGCTTAATGTCTGAGACTCCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTCTTCTTTTCATAGTTAATAAGCTTAATGTCTGAGACTCCAC  50

seq1  TTATAATCTATAAACACAAATTATAACAATTACCATTCAGAGCTGTTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAATCTATAAACACAAATTATAACAATTACCATTCAGAGCTGTTGTG  100

seq1  AGAATTAATTGGGTACCTGTAAAGTCTCAAATTTGTCACAGTGTGGGCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTAATTGGGTACCTGTAAAGTCTCAAATTTGTCACAGTGTGGGCAC  150

seq1  TCAATTGTTAGGTACTCTGCTGGTAGCAGTACTGACAGCTGGGACCTCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTGTTAGGTACTCTGCTGGTAGCAGTACTGACAGCTGGGACCTCTG  200

seq1  GAGGATAGGTCTAGCTAAAGTAGTGTGACCTGGAAGAAACAGCTGACAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATAGGTCTAGCTAAAGTAGTGTGACCTGGAAGAAACAGCTGACAGG  250

seq1  TAATTTTCAAGTTGTTTTACAACAGAATAAAACTAAAGTTCTCAGAAAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTCAAGTTGTTTTACAACAGAATAAAACTAAAGTTCTCAGAAAGC  300

seq1  AAGTGAGTTGAGATAGTGAATGAGTCTGCCTGGACTCAGAACTCACAAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGAGTTGAGATAGTGAATGAGTCTGCCTGGACTCAGAACTCACAAGA  350

seq1  CAGGTCAGGTTAAACCAGAGCTGCCTACAAGGAAGGAATGGATTAAGGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCAGGTTAAACCAGAGCTGCCTACAAGGAAGGAATGGATTAAGGCA  400

seq1  CAGAGCTTAGATACGTCCCGATACCTCACAGAACTATGGCAGGTTTAAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTTAGATACGTCCCGATACCTCACAGAACTATGGCAGGTTTAAGA  450

seq1  GCAGAGTAGACTGTGCATGACTCCAGCTTGAGGGGGATCCAATACTCTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGTAGACTGTGCATGACTCCAGCTTGAGGGGGATCCAATACTCTTG  500

seq1  GCCTCTAAGGACACCAGCTCTTGTGTGCACATGGACATACATATACATAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTAAGGACACCAGCTCTTGTGTGCACATGGACATACATATACATAA  550

seq1  TTAAAAAATAAAAGTAAATCTCCTTTAAAAGCTTGGAATACTCTTCTGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAATAAAAGTAAATCTCCTTTAAAAGCTTGGAATACTCTTCTGTT  600

seq1  GATGTGCTGAAATATTTTAAGTATGCCTGATATATGAAAATGAATTCTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGCTGAAATATTTTAAGTATGCCTGATATATGAAAATGAATTCTTA  650

seq1  TTTATCATTTTCACATAAGTACGAATTCCTTTTTGTGTTCATTTCAATCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCATTTTCACATAAGTACGAATTCCTTTTTGTGTTCATTTCAATCT  700

seq1  TAAGGAGAGATTGGGGCAGATTGAGTGTCTATACAACTTTAGAAAATCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGAGAGATTGGGGCAGATTGAGTGTCTATACAACTTTAGAAAATCTG  750

seq1  CCAGCCGGCTTCCTGAAGTAAGTCTCTTTCCTGTGACCAGCAGCGGGTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCGGCTTCCTGAAGTAAGTCTCTTTCCTGTGACCAGCAGCGGGTGA  800

seq1  GAGGGAGTGAAAGGAACACTGGTGCTCATCCCAGACCAGCGACCGTAAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGAGTGAAAGGAACACTGGTGCTCATCCCAGACCAGCGACCGTAAAG  850

seq1  CAGCTTCTGGCCAAACCAGGGTCATCCTAACCTAGATGACCATGGATACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTCTGGCCAAACCAGGGTCATCCTACCCTAGATGACCATGGATACA  900

seq1  GTAAATATCTACC-TTCATTAGTGTTCTA-TTTGTTTT-AAGGGGACTAT  947
      ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
seq2  GTAAATATCTACCTTTCATTAGTGTTCTATTTTGTTTTAAAGGGGACTAT  950

seq1  TTAATAGACGGCCTGATA-GGCCTTAGTAGAAATGTAAGAAATGTTATGG  996
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATAGACGGCCTGATAGGGCCTTAGTAGAAATGTAAGAAATGTTATGG  1000

seq1  AAAGTATTAATAAGCTTTCTTTAATATAAAATAAAGGGCACTGGGGCTAG  1046
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTA-TAATAAGCTTTCTTTAATATAAAATAAAGGGCACTGGGGCTAG  1049

seq1  AGAGATGATGGTTCAG-TGGCTAAGAGCACCCATGTGGGTGCTGGGAACA  1095
      ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATGATGG-TCAGTTGCCTAAGAGCACCCATGTGGGTGCTGGGAACA  1098

seq1  AACTGGAGTCCTCTATAAGAACAGCAA  1122
      ||||| ||| ||||| |  ||||||||
seq2  AACTGAAGT-CTCTAAAGAAACAGCAA  1124

seq1: chr7_104302839_104304007
seq2: B6Ng01-212J07.g_66_1257 (reverse)

seq1  TCTGTTATG-TTCTCTAATGGG--TCCTTG-GA-GAGCTAGAGA----TC  41
      ||||||| | ||||||||| ||  |||||| || ||||||||||    ||
seq2  TCTGTTAAGTTTCTCTAATTGGTTTCCTTGAGAGGAGCTAGAGAGAATTC  50

seq1  TGG-TCCT-GAATCTTCAGACTATTTCAAACTAAGCACTTAAATTCT-GC  88
      ||| |||| || ||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||
seq2  TGGTTCCTGGATTCTTCAGGCTATTTCAACTTAGGCACTTAAATTCTGGC  100

seq1  T-GCTGGAGTTCTAGATCCCCA-CCTACTTGTCAGCA-TCCCTTTTCA-C  134
      | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |
seq2  TGGCTGGAGTTCTAGATCCCCACCCTACCTGTCAGCATTCCCTTTTCACC  150

seq1  TTCC-TCTTCCTGCTATACTTTAGATCCTTTC-TTTGCTAAGT-AGGTAG  181
      |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
seq2  TTCCTTCTTCCTGCTATACTTTAGATCCTTTCTTTTGCTAAGTAAGGTAG  200

seq1  ATAAATTTTTTAAAGGTCTAAT-GTGAA-GAC-TCTTCTAGGTAGAATAG  228
      ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||
seq2  ATAAATTTTTT-AAGGTCTAATGGTGAAGGACTTCTTCTAGGTAGAATAG  249

seq1  C-AAATGAAGCATTGGGAGTTATTGATATCAGAATATATATATATATGTG  277
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATGAAGCATTGGGAGTTATTGATATCAGAATATATATATATATGTG  299

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTC-AAGCA  326
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAAAGCA  349

seq1  CATCTATGTGCGTCTATAGAACAACACTTAAGACCAGGCCATCTAGGTTT  376
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTATGTGCGTCTATAGAACAACACTTAAGACCAGGCCATCTAGGTTT  399

seq1  TAGCCAGAGACTCCATGGTACTGTGAGCCAAGGCTGGGAATCAACAGAAT  426
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCAGAGACTCCATGGTACTGTGAGCCAAGGCTGGGAATCAACAGAAT  449

seq1  CAAGACCAAAATATAGACTTGGTTGTTTTATTTTGAGACAGTATCACTCT  476
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACCAAAATATAGACTTGGTTGTTTTATTTTGAGACAGTATCACTCT  499

seq1  GGAACCCTAAATGGCCTGGAGTTTGTTCTGTAGACCAGGCTGGTCTCTAT  526
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACCCTAAATGGCCTGGAGTTTGTTCTGTAGACCAGGCTGGTCTCTAT  549

seq1  CTCAGAGGTCCACCTGCCTCTGCCTTCCAAATGGTAGGACTAAAGGGGTG  576
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAGGTCCACCTGCCTCTGCCTTCCAAATGGTAGGACTAAAGGGGTG  599

seq1  AGGCAGCTTAGCAGGCAAGCCTTTTTGTCTGTCCCCTTCTGGCCAGAGCA  626
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGCTTAGCAGGCAAGCCTTTTTGTCTGTCCCCTTCTGGCCAGAGCA  649

seq1  TGTCAGCTTTAACTTACAGTTTGTGGGTCTATGCCAAATTTAGTATACAG  676
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGCTTTAACTTACAGTTTGTGGGTCTATGCCAAATTTAGTATACAG  699

seq1  AAAGGGGGAGTGTGAGGCAGAGAAGAGGGAAGCAGGGAGAAATAGAAAGA  726
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGGGAGTGTGAGGCAGAGAAGAGGGAAGCAGGGAGAAATAGAAAGA  749

seq1  CCTAAACTGGCAAAATGATCTCTATGAATCTTCCAACACTGGCATTGAAG  776
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAACTGGCAAAATGATCTCTATGAATCTTCCAACACTGGCATTGAAG  799

seq1  TTAAGTGTAAGAGTGCAGAAACTGTAACTAATGAAACAGAGTTTGGTACC  826
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTGTAAGAGTGCAGAAACTGTAACTAATGAAACAGAGTTTGGTACC  849

seq1  CTCCTACTTTAGACTAAATCTTGACCCGATCTTGAGCTGACAGCTGTCCA  876
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTACTTTAGACTAAATCTTGACCCGATCTTGAGCTGACAGCTGTCCA  899

seq1  GCCAACCACTGGATACAGTACCCAATTGTTTGCAGCCAAAATCCAGCAAG  926
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAACCACTGGATACAGTACCCAATTGTTTGCAGCCAAAATCCAGCAAG  949

seq1  TCTGCTTCCTCTAACAACTACTCTGCAGCTCCCCTCCCCCAACTCCTCAA  976
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTTCCTCTAACAACTACTCTGCAGCTCCCCTCCCCCAACTCCTCAA  999

seq1  GGCAGAAGTGGACTTGAAGGGGTATGTTTCAGTTCCCTGGCCCCTGTGTG  1026
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGAAGTGGACTTGAAGGGGTATGTTTCAGTTCCCTGGCCCCTGTGTG  1049

seq1  TCTTCCTCTCACAGTCTTGTTCAAAATGTCTAGGGAATTTTCATTTTCCA  1076
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCTCTCACAGTCTTGTTCAAAATGTCTAGGGAATTTTCATTTTCCA  1099

seq1  AAGTTGCTTACCAGAAACAGTTTGGCAGCGTACAGTCTGGGGAGGAAGCT  1126
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGCTTACCAGAAACAGTTTGGCAGCGTACAGTCTGGGGAGGAAGCT  1149

seq1  TTAGTCAAATGAGCACAAAGGCATAGAACCCCATGTTGAATTC  1169
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCAAATGAGCACAAAGGCATAGAACCCCATGTTGAATTC  1192