BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-236H22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 79,221,920 - 79,382,242
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMctp2, LOC100042873
Upstream geneLOC665535
Downstream geneLOC100042880, LOC233391, LOC665570, LOC100042029, EG384643, LOC625243
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-236H22.bB6Ng01-236H22.g
ACCGA047699GA047700
length8651,140
definitionB6Ng01-236H22.b B6Ng01-236H22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(79,381,372 - 79,382,242)(79,221,920 - 79,223,066)
sequence
gaattcaggtagtaaagggaagggattctcagaaggtagatataggtggt
atgggatgtggctggaggaaccatatgggaggtcctctggctaagagaat
ccaacggccccagaaacgctcactgccctactttgccgcagcattgataa
attatattatttatctcattcaggtttttatgaatttcataaacagttaa
aggaagtttctgctcaaaccaagactttcagataattaattctgccataa
gttaaatcctggaacattgttcagtaaagcggatatctgtgcttgcttct
accatacatacctgtgggttccctgaggcctttgtatctcaaagtccaac
cagggccatagcttgctcacggagccattggagattttatacttaggtga
tccccttagaggagggaagttgttcccattcaattagggtggatacatga
gcaagatgtgttttaagggcagtggaacattgaggagaacacagctcttc
tggggttgaaaatgggaaagcagattccagaagcagatagctgctgtcta
cagaagaagccggggccgggacagatctgcagatggctgtgtgctcagga
ggcttggcactcttctgaaatcatgctgtgtgagaagtgattcttcatgt
gataaggaaactgctcgctttctttctgtacccctctggtttctgaatgg
aaccattaaggatgtggcatgcaggcatcattctgtctgcgtttctccat
tgagctgctgttggacacaggctcctatgaagatgccataactgacatag
tctcctcccattttaatttttatcctggaagttaacttctctcctctcct
ctccctctcccctct
gaattcatttcctcaaactttgatcttaaatcattggctacgacacactg
tttgaaggtaggggacttggacggtagttagaatgaaacaactgcatgat
gacagttgtggttcaatgagagacaagaggtaacacttgccaattcactg
atgctgcagcaggaggtggaaactcagatagcacaaagtcattggtgacc
tcatcagagcaggagaacctggaatggtttgaagagtatcatctactttg
acgtttggggaaagacatttcaaatggaagggataatatgaactgaaccc
agctcagtgagattcccatcatgcccatgacatatggaatattatgcagc
acggctaccaggatacaagcaatactacgtccttccctgattgactagat
tacatagggaaaagcacaaaaactaaaaccaaagacatccaagaggacac
tggccccagttcaggagacaagtctttaagacaagcctttggcagtgtta
taaacatgagtgtgggactaagaagggaactgtgaacacttcacaaggca
tttttaacattcccaattatcttcaaattgaacagtatgaatatgtaatc
tactaatttcaacgaaatcattaagtggatattacatgctctgaataatg
gatctgcattgtgcttcttgtagccaaacttgtcttggatgtgagacaac
gttcaaagtatccacattgcatatactacctacctgttagtcataactgc
caatgtaaaccaatataggaaagacagttatgtactgataaaataattga
ccaagacataaatatataatttattgaaatacactccaataaaacagtga
gtgagtttctatacagagtaaatcatgccagtcacaaaagcaggtggaag
ttattctattgcagcaaaggagaaattacttgggtcctttcattgtggga
cttctgggttggctccatatctgaaggacaggtgaatttcttggtaccct
tgctaagaagaaagttttaacataatacacaagtcatgttttaagactgt
ctttttgtgtagtgtgtaaattattagcttaccgcttcagatgtttgtgt
taagatctggttcatagaaccaggctcataaacactcgtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_79381372_79382242
seq2: B6Ng01-236H22.b_47_911 (reverse)

seq1  AGAGGGGAGAGGGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGAAGTTAACTTCCAGGAT  50
      |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGGAGAG------GGAGAGGAGAGGAGAGAAGTTAACTTCCAGGAT  44

seq1  AAAAATTAAAATGGGAGGAGACTATGTCAGTTATGGCATCTTCATAGGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTAAAATGGGAGGAGACTATGTCAGTTATGGCATCTTCATAGGAG  94

seq1  CCTGTGTCCAACAGCAGCTCAATGGAGAAACGCAGACAGAATGATGCCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGTCCAACAGCAGCTCAATGGAGAAACGCAGACAGAATGATGCCTG  144

seq1  CATGCCACATCCTTAATGGTTCCATTCAGAAACCAGAGGGGTACAGAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCACATCCTTAATGGTTCCATTCAGAAACCAGAGGGGTACAGAAAG  194

seq1  AAAGCGAGCAGTTTCCTTATCACATGAAGAATCACTTCTCACACAGCATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCGAGCAGTTTCCTTATCACATGAAGAATCACTTCTCACACAGCATG  244

seq1  ATTTCAGAAGAGTGCCAAGCCTCCTGAGCACACAGCCATCTGCAGATCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCAGAAGAGTGCCAAGCCTCCTGAGCACACAGCCATCTGCAGATCTG  294

seq1  TCCCGGCCCCGGCTTCTTCTGTAGACAGCAGCTATCTGCTTCTGGAATCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCGGCCCCGGCTTCTTCTGTAGACAGCAGCTATCTGCTTCTGGAATCT  344

seq1  GCTTTCCCATTTTCAACCCCAGAAGAGCTGTGTTCTCCTCAATGTTCCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCCCATTTTCAACCCCAGAAGAGCTGTGTTCTCCTCAATGTTCCAC  394

seq1  TGCCCTTAAAACACATCTTGCTCATGTATCCACCCTAATTGAATGGGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTTAAAACACATCTTGCTCATGTATCCACCCTAATTGAATGGGAAC  444

seq1  AACTTCCCTCCTCTAAGGGGATCACCTAAGTATAAAATCTCCAATGGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCCCTCCTCTAAGGGGATCACCTAAGTATAAAATCTCCAATGGCTC  494

seq1  CGTGAGCAAGCTATGGCCCTGGTTGGACTTTGAGATACAAAGGCCTCAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGAGCAAGCTATGGCCCTGGTTGGACTTTGAGATACAAAGGCCTCAGG  544

seq1  GAACCCACAGGTATGTATGGTAGAAGCAAGCACAGATATCCGCTTTACTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCCACAGGTATGTATGGTAGAAGCAAGCACAGATATCCGCTTTACTG  594

seq1  AACAATGTTCCAGGATTTAACTTATGGCAGAATTAATTATCTGAAAGTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATGTTCCAGGATTTAACTTATGGCAGAATTAATTATCTGAAAGTCT  644

seq1  TGGTTTGAGCAGAAACTTCCTTTAACTGTTTATGAAATTCATAAAAACCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTGAGCAGAAACTTCCTTTAACTGTTTATGAAATTCATAAAAACCT  694

seq1  GAATGAGATAAATAATATAATTTATCAATGCTGCGGCAAAGTAGGGCAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAGATAAATAATATAATTTATCAATGCTGCGGCAAAGTAGGGCAGT  744

seq1  GAGCGTTTCTGGGGCCGTTGGATTCTCTTAGCCAGAGGACCTCCCATATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCGTTTCTGGGGCCGTTGGATTCTCTTAGCCAGAGGACCTCCCATATG  794

seq1  GTTCCTCCAGCCACATCCCATACCACCTATATCTACCTTCTGAGAATCCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCTCCAGCCACATCCCATACCACCTATATCTACCTTCTGAGAATCCC  844

seq1  TTCCCTTTACTACCTGAATTC  871
      |||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTTTACTACCTGAATTC  865

seq1: chr7_79221920_79223066
seq2: B6Ng01-236H22.g_66_1205

seq1  GAATTCATTTCCTCAAACTTTGATCTTAAATCATTGGCTACGACACACTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTCCTCAAACTTTGATCTTAAATCATTGGCTACGACACACTG  50

seq1  TTTGAAGGTAGGGGACTTGGACGGTAGTTAGAATGAAACAACTGCATGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAGGTAGGGGACTTGGACGGTAGTTAGAATGAAACAACTGCATGAT  100

seq1  GACAGTTGTGGTTCAATGAGAGACAAGAGGTAACACTTGCCAATTCACTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTTGTGGTTCAATGAGAGACAAGAGGTAACACTTGCCAATTCACTG  150

seq1  ATGCTGCAGCAGGAGGTGGAAACTCAGATAGCACAAAGTCATTGGTGACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGCAGCAGGAGGTGGAAACTCAGATAGCACAAAGTCATTGGTGACC  200

seq1  TCATCAGAGCAGGAGAACCTGGAATGGTTTGAAGAGTATCATCTACTTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCAGAGCAGGAGAACCTGGAATGGTTTGAAGAGTATCATCTACTTTG  250

seq1  ACGTTTGGGGAAAGACATTTCAAATGGAAGGGATAATATGAACTGAACCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTTGGGGAAAGACATTTCAAATGGAAGGGATAATATGAACTGAACCC  300

seq1  AGCTCAGTGAGATTCCCATCATGCCCATGACATATGGAATATTATGCAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAGTGAGATTCCCATCATGCCCATGACATATGGAATATTATGCAGC  350

seq1  ACGGCTACCAGGATACAAGCAATACTACGTCCTTCCCTGATTGACTAGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGCTACCAGGATACAAGCAATACTACGTCCTTCCCTGATTGACTAGAT  400

seq1  TACATAGGGAAAAGCACAAAAACTAAAACCAAAGACATCCAAGAGGACAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATAGGGAAAAGCACAAAAACTAAAACCAAAGACATCCAAGAGGACAC  450

seq1  TGGCCCCAGTTCAGGAGACAAGTCTTTAAGACAAGCCTTTGGCAGTGTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCCCAGTTCAGGAGACAAGTCTTTAAGACAAGCCTTTGGCAGTGTTA  500

seq1  TAAACATGAGTGTGGGACTAAGAAGGGAACTGTGAACACTTCACAAGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACATGAGTGTGGGACTAAGAAGGGAACTGTGAACACTTCACAAGGCA  550

seq1  TTTTTAACATTCCCAATTATCTTCAAATTGAACAGTATGAATATGTAATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAACATTCCCAATTATCTTCAAATTGAACAGTATGAATATGTAATC  600

seq1  TACTAATTTCAACGAAATCATTAAGTGGATATTACATGCTCTGAATAATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAATTTCAACGAAATCATTAAGTGGATATTACATGCTCTGAATAATG  650

seq1  GATCTGCATTGTGCTTCTTGTAGCCAAACTTGTCTTGGATGTGAGACAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTGCATTGTGCTTCTTGTAGCCAAACTTGTCTTGGATGTGAGACAAC  700

seq1  GTTCAAAGTATCCACATTGCATATACTACCTACCTGTTAGTCATAACTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAAGTATCCACATTGCATATACTACCTACCTGTTAGTCATAACTGC  750

seq1  CAATGTAAACCAATATAGGAAAGACAGTTATGTACTGATAAAATAATTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTAAACCAATATAGGAAAGACAGTTATGTACTGATAAAATAATTGA  800

seq1  CCAAGACATAAATATATAATTTATTGAAATACACTCCAATAAAACAGTGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGACATAAATATATAATTTATTGAAATACACTCCAATAAAACAGTGA  850

seq1  GTGAGTTTCTATACAGAGTAAATCATGCCAGTCACAAAAGCAGGTGGAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTTTCTATACAGAGTAAATCATGCCAGTCACAAAAGCAGGTGGAAG  900

seq1  TTATTCTATTGCAGGCAAAGGAGAAATTACTT-GGTCCTTTCATTGTGGG  949
      ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTATTCTATTGCA-GCAAAGGAGAAATTACTTGGGTCCTTTCATTGTGGG  949

seq1  ACTTCTGGGTTGGC-CCATATCTGAAGGAACAGGTGAATTTCTTGGTA-C  997
      |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
seq2  ACTTCTGGGTTGGCTCCATATCTGAAGG-ACAGGTGAATTTCTTGGTACC  998

seq1  CTTGCTAAAGAGAAAGTTTTAACATATAACACAAGTCATGTTTTAAAGAC  1047
      ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||
seq2  CTTGCTAAGAAGAAAGTTTTAACATAATACACAAGTCATGTTTT-AAGAC  1047

seq1  TGGCCTTTTGTGTAAAGTGTGTAAATTATTAGGGGTTA-CGCTCCAGATG  1096
      || | ||||||||  ||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||
seq2  TGTCTTTTTGTGT--AGTGTGTAAATTATTA--GCTTACCGCTTCAGATG  1093

seq1  TTTGTGTAAGGAATCTTGGGTCACTAGGGAACCAGGC-CCCAAACACTCG  1145
      ||||||| | | ||| ||| ||| ||  ||||||||| |  |||||||||
seq2  TTTGTGTTAAG-ATC-TGGTTCA-TA--GAACCAGGCTCATAAACACTCG  1138

seq1  TT  1147
      ||
seq2  TT  1140