BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-240P03
Chromosome7 (Build37)
Map Location 78,183,992 - 78,185,119
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneNr2f2, LOC100042833, B130024G19Rik, LOC100042838, LOC665486, LOC100041957
Downstream geneLOC665535
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-240P03.g
ACCGA050984
length1,130
definitionB6Ng01-240P03.g
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattctgttgactgaatccatatccatagccctgatggactatggaagg
atccacaggaaactggtggcaccctggtggatgcttcacagccacaatca
gacacaccaaaggtgttcctggtcttcctttccctttgacatgcttcaag
gtattttgcatggagggccaaagacatgaaaacataaatagctagtgcca
gaaaagggtcatgcttggttgatgaaatgacaagcagtattgatggggaa
gtcccccaggtcctgtgtgtgcacatgcacaggcacacacacacacacac
acacacacacacacacacacacacacacacacaaacatacacacacacat
gcacacacacttgtacacacatagagatgaggaagatggggataattata
agcaactaaaggatataaccatgggaaaaggtgggaagggaaatgtgcag
actgggccatggatcacctcacataggctgaggtcatgaaaagctaaagg
cttttccagggaggcgatggtgtggttcagacctgtgggagtataaggat
taccaaggctgacagaagggttaaaagaaaaaggctaggaactgtaagaa
gtaggggtgattcaaggatataccctaaaggttcaggtgttgaaagctag
gtcttcagtgcggaaggaagtagagggacatctaatagaaggtggtgctg
ctcctgtatgtgctgtcctggagatgaactaagtagcacctggtgggttc
tcactggtgtgtggtaattaaagagggtggcgtgtggagcgtcttaaact
cccatggcagcacggaatctccccatctcccacgtgccactgtgatccca
ttcaataagaaatgagctgataccagagcaagccctttcacatccttaat
tgtgagctaagaaaatgattttttccccctcctaaagcacccatcgttgg
ggatttcattatagtgacagtgcctgagccatggatgagtgttaccgcag
tgactggcatcctcttggatcttgccaaactcgacacgttagtctgttag
agaattagccatctctcgtctaaaggctattgctggactgtcatcagtta
ttccaggtcaggacacgtaatgagcttctg
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_78183992_78185119
seq2: B6Ng01-240P03.g_62_1191

seq1  GAATTCTGTTGACTGAATCCATATCCATAGCCCTGATGGACTATGGAAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTTGACTGAATCCATATCCATAGCCCTGATGGACTATGGAAGG  50

seq1  ATCCACAGGAAACTGGTGGCACCCTGGTGGATGCTTCACAGCCACAATCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCACAGGAAACTGGTGGCACCCTGGTGGATGCTTCACAGCCACAATCA  100

seq1  GACACACCAAAGGTGTTCCTGGTCTTCCTTTCCCTTTGACATGCTTCAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACACCAAAGGTGTTCCTGGTCTTCCTTTCCCTTTGACATGCTTCAAG  150

seq1  GTATTTTGCATGGAGGGCCAAAGACATGAAAACATAAATAGCTAGTGCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTTGCATGGAGGGCCAAAGACATGAAAACATAAATAGCTAGTGCCA  200

seq1  GAAAAGGGTCATGCTTGGTTGATGAAATGACAAGCAGTATTGATGGGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGGGTCATGCTTGGTTGATGAAATGACAAGCAGTATTGATGGGGAA  250

seq1  GTCCCCCAGGTCCTGTGTGTGCACATGCACAGGCACACACACACACACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCCCAGGTCCTGTGTGTGCACATGCACAGGCACACACACACACACAC  300

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACAAACATACACACACACAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACAAACATACACACACACAT  350

seq1  GCACACACACTTGTACACACATAGAGATGAGGAAGATGGGGATAATTATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACACACACTTGTACACACATAGAGATGAGGAAGATGGGGATAATTATA  400

seq1  AGCAACTAAAGGATATAACCATGGGAAAAGGTGGGAAGGGAAATGTGCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACTAAAGGATATAACCATGGGAAAAGGTGGGAAGGGAAATGTGCAG  450

seq1  ACTGGGCCATGGATCACCTCACATAGGCTGAGGTCATGAAAAGCTAAAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGGCCATGGATCACCTCACATAGGCTGAGGTCATGAAAAGCTAAAGG  500

seq1  CTTTTCCAGGGAGGCGATGGTGTGGTTCAGACCTGTGGGAGTATAAGGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCCAGGGAGGCGATGGTGTGGTTCAGACCTGTGGGAGTATAAGGAT  550

seq1  TACCAAGGCTGACAGAGGGGTTAAAAGAAAAAGGCTAGGAACTGTAAGAA  600
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAAGGCTGACAGAAGGGTTAAAAGAAAAAGGCTAGGAACTGTAAGAA  600

seq1  GTAGGGGTGATTCAAGGATATACCCTAAAGGTTCAGGTGTTGAAAGCTAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGGGTGATTCAAGGATATACCCTAAAGGTTCAGGTGTTGAAAGCTAG  650

seq1  GTCTTCAGTGCGGAAGGAAGTAGAGGGACATCTAAGAGAAGGTGGTGCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GTCTTCAGTGCGGAAGGAAGTAGAGGGACATCTAATAGAAGGTGGTGCTG  700

seq1  CTCCTGTATGTGCTGTCCTGGAGATGAACTAAGTAGCACCTGGTGGGTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGTATGTGCTGTCCTGGAGATGAACTAAGTAGCACCTGGTGGGTTC  750

seq1  TCACTGGTGTGTGGTAATTAAAGAGGGTGGCGTGTGGAGCGTCTTAGACT  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TCACTGGTGTGTGGTAATTAAAGAGGGTGGCGTGTGGAGCGTCTTAAACT  800

seq1  CCCATGGCAGCACGGAATCTCCCCATCTCCCACGTGCCACTGTGATCCCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGGCAGCACGGAATCTCCCCATCTCCCACGTGCCACTGTGATCCCA  850

seq1  TTCAATAGGAAAGGAGCTGATACCAGAGCAAGCCCTTCCACATCCTTAAT  900
      ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TTCAATAAGAAATGAGCTGATACCAGAGCAAGCCCTTTCACATCCTTAAT  900

seq1  TGTGAGCTAAGAAAATGATTTTTTCCCCCTCCTAAAGCACCCATCGTTGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCTAAGAAAATGATTTTTTCCCCCTCCTAAAGCACCCATCGTTGG  950

seq1  GGATTTCATTATAGTGACAGTGCCCTGAG-CATGGATGAGTGT--ACGCA  997
      |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||
seq2  GGATTTCATTATAGTGACAGTG-CCTGAGCCATGGATGAGTGTTACCGCA  999

seq1  GGTGAACTGG--ACCTCCTTGGTCTTGCAAAACTC-ACAC-TTAGTCTGT  1043
       ||| |||||   |||| | | |||||| |||||| |||| |||||||||
seq2  -GTG-ACTGGCATCCTCTTGGATCTTGCCAAACTCGACACGTTAGTCTGT  1047

seq1  TAGAGA--TAAGCATCTCTCCTTCTAAAGGCTA-TGTTGGGAACT-ACAT  1089
      ||||||  ||  ||||||| | ||||||||||| || |||  |||  |||
seq2  TAGAGAATTAGCCATCTCT-CGTCTAAAGGCTATTGCTGG--ACTGTCAT  1094

seq1  CAAGTAATTCAAGGTCAGGACACAGTAATGAGCCTTCTG  1128
      | ||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||
seq2  C-AGTTATTCCAGGTCAGGACAC-GTAATGAG-CTTCTG  1130