BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-248M19
Chromosome7 (Build37)
Map Location 128,316,446 - 128,410,093
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668556
Upstream geneAnks4b, Crym, Abca14, Abca15, Abca16, LOC668429, LOC546994, LOC100042914, E130201H02Rik, LOC637957, Uqcrc2, 4930408O21Rik, BC030336, E030013G06Rik, EG436008, LOC100043426, Eef2k, Polr3e, Cdr2, 4933427G17Rik, EG668548, Mettl9, LOC668456, Igsf6, Otoa
Downstream geneHs3st2, Usp31, Scnn1g, Scnn1b, Cog7, Gga2, Ears2, Ubfd1, Ndufab1, Palb2, Dctn5, Plk1, Ern2, 2010110P09Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-248M19.bB6Ng01-248M19.g
ACCGA056783GA056784
length9851,097
definitionB6Ng01-248M19.b B6Ng01-248M19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,316,446 - 128,317,431)(128,409,004 - 128,410,093)
sequence
gaattctattttttttccccaacactctgaagaaacccaggaccttgtgt
attttaggcaagtgctctacactgaatacatccctagccaaagaatgatg
ttcgctgggtttttgattctttgtccatttggcagaaaattttaactctt
ttttacttttacccgccccccccaagtcgctgccaaacttcttaagttca
gaagtggagggacctcctctgtgttactatagtccacctttctcggacag
aacagtcaatagggatgtaaaataatgattggttgatggaaaatattcag
aacaagagcctttcagcttattgtgtatctcactactcaataacagctta
atggtattatacatacaaacaaaatccagtccaaatgcccttatggtgtg
caaatcgcgtcacccagttgtgtgtggcacaaccactgtgaaaagctctg
gacattagatgaggtggctgcaggagcagagtgagttagacaaatattgg
ctagagagtcaaggatatgtatctgttgaacttgatgaaatgattttagg
ggctaaggctgtgagatcgtcccggccaaacagtgctgtcgcagtggagc
gtgcctgccatgcttttttcaagcaggtggatcccaggggcagaggcctg
ggacgttcctatggctgccagtggaataaatgtttgcgttcacatcacag
tttgaagcacgtaagctggtgagtagggaaaaacccagcggagcaattac
agtaatgaataaacaaagaaatacgaagggaaaccccaagagatggactt
attaaaaccacaccagactgcggtatgcagggtgacctgctctctgctca
ctctttggctgtgcattataagaacaactttttatatgtttccctgcctc
agaattgcttctcagtgcagcttgccccagacatagctcccaaagtccca
tattaaggcttagttcctgattgatttgtattggg
gaattcacctcatagttctatatcacacaagtctcaagagttaagaggca
acaaaatggggatagaccccaatgtagataaatttcaaagtaattaggtc
aagtgaaggaaatggaagcaaaaaaactacatgctgatccactttgataa
gaacaacatgcaaactactattcctagacggcacacagcatctgagaaga
tggatgagaagcatccaaaaggcacaaggcagggctactaagagggatcc
atcagtgaagggcttgctgaaaaaacatgaggacctaagttctgaggact
gtagtaacagtgtgtgcttacgatcccatccagcactgggatcagccagt
ccaatggcacctgtgaggtctttgctcaatcagacaccttgtctcaaaag
caaagtggagaacaattgagaaggacacccagcatcaacctctgatctcc
acatacatgcacacgaaaacacacacacacacacacacacacacacacaa
agtgagcctgggttgaccaccagtccagtgccaccttcacaggctggcct
tcatgggctcccagggcagggagcaagcaggagacaaaatgaagcccacc
tgaccatgagtccctggagggagtgtacctgagttggccactctgatggg
cccaggtaagaaacaagcccaagatgaccaccagtctggagccatggggc
ccagacagggagctagcctgagatgaccaccagtctggaactgtgcaatc
ctggcagaggtgagggcagaccatgcctgagatgacccccgccccatgcc
ataattcatgggtgggacacagcactcctgaaaacactttctgagatgag
cccagaccccagagcatcctgatgtgagtagccaatgatgccacttagga
tcatggtgtggtcccggcctgtgctggcaccagggttcacatatgggttc
tttgaccttgcagcagcagtgttttgtttaccaccaaaagccccggtaga
tgtctctgggtctgagttgctgccctgggaattgttggatgttctgtgcc
tgtgccagattgctcccaccccctagcctgggcatcattgggagagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_128316446_128317431
seq2: B6Ng01-248M19.b_47_1031

seq1  GAATTCTATTTTTTTTCCCCAACACTCTGAAGAAACCCAGGACCTTGTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATTTTTTTTCCCCAACACTCTGAAGAAACCCAGGACCTTGTGT  50

seq1  ATTTTAGGCAAGTGCTCTACACTGAATACATCCCTAGCCAAAGAATGATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAGGCAAGTGCTCTACACTGAATACATCCCTAGCCAAAGAATGATG  100

seq1  TTCGCTGGGTTTTTGATTCTTTGTCCATTTGGCAGAAAATTTTAACTCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGCTGGGTTTTTGATTCTTTGTCCATTTGGCAGAAAATTTTAACTCTT  150

seq1  TTTTACTTTTACCCGCCCCCCCCAAGTCGCTGCCAAACTTCTTAAGTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTACTTTTACCCGCCCCCCCCAAGTCGCTGCCAAACTTCTTAAGTTCA  200

seq1  GAAGTGGAGGGACCTCCTCTGTGTTACTATAGTCCACCTTTCTCGGACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGGAGGGACCTCCTCTGTGTTACTATAGTCCACCTTTCTCGGACAG  250

seq1  AACAGTCAATAGGGATGTAAAATAATGATTGGTTGATGGAAAATATTCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGTCAATAGGGATGTAAAATAATGATTGGTTGATGGAAAATATTCAG  300

seq1  AACAAGAGCCTTTCAGCTTATTGTGTATCTCACTACTCAATAACAGCTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGAGCCTTTCAGCTTATTGTGTATCTCACTACTCAATAACAGCTTA  350

seq1  ATGGTATTATACATACAAACAAAATCCAGTCCAAATGCCCTTATGGTGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTATTATACATACAAACAAAATCCAGTCCAAATGCCCTTATGGTGTG  400

seq1  CAAATCGCGTCACCCAGTTGTGTGTGGCACAACCACTGTGAAAAGCTCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATCGCGTCACCCAGTTGTGTGTGGCACAACCACTGTGAAAAGCTCTG  450

seq1  GACATTAGATGAGGTGGCTGCAGGAGCAGAGTGAGTTAGACAAATATTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATTAGATGAGGTGGCTGCAGGAGCAGAGTGAGTTAGACAAATATTGG  500

seq1  CTAGAGAGTCAAGGATATGTATCTGTTGAACTTGATGAAATGATTTTAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAGAGTCAAGGATATGTATCTGTTGAACTTGATGAAATGATTTTAGG  550

seq1  GGCTAAGGCTGTGAGATCGTCCCGGCCAAACAGTGCTGTCGCAGTGGAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAAGGCTGTGAGATCGTCCCGGCCAAACAGTGCTGTCGCAGTGGAGC  600

seq1  GTGCCTGCCATGCTTTTTTCAAGCAGGTGGATCCCAGGGGCAGAGGCCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTGCCATGCTTTTTTCAAGCAGGTGGATCCCAGGGGCAGAGGCCTG  650

seq1  GGACGTTCCTATGGCTGCCAGTGGAATAAATGTTTGCGTTCACATCACAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACGTTCCTATGGCTGCCAGTGGAATAAATGTTTGCGTTCACATCACAG  700

seq1  TTTGAAGCACGTAAGCTGGTGAGTAGGGAAAAACCCAGCGGAGCAATTAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAGCACGTAAGCTGGTGAGTAGGGAAAAACCCAGCGGAGCAATTAC  750

seq1  AGTAATGAATAAACAAAGAAATACGAAGGGAAACCCCAAGAGATGGACTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAATGAATAAACAAAGAAATACGAAGGGAAACCCCAAGAGATGGACTT  800

seq1  ATTAAAACCACACCAGACTGCGGTATGCAGGGGTGACCTGCTCTCTGCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAACCACACCAGACTGCGGTATGCA-GGGTGACCTGCTCTCTGCTC  849

seq1  ACTCTTTGGCTGTGCATTATAAGAACAACTTTTTATATGTTTCCCTGCCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTTGGCTGTGCATTATAAGAACAACTTTTTATATGTTTCCCTGCCT  899

seq1  CAGAATTGCTTCTCAGTGCAGCTTGCCCCAGACATAGCTCCCAAAGTCCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATTGCTTCTCAGTGCAGCTTGCCCCAGACATAGCTCCCAAAGTCCC  949

seq1  ATATTAAAGGCTTAGTCCCTGATTGA-TTGTATTGGG  986
      ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  ATATT-AAGGCTTAGTTCCTGATTGATTTGTATTGGG  985

seq1: chr7_128409004_128410093
seq2: B6Ng01-248M19.g_67_1163 (reverse)

seq1  GCTCTCCC-ATGATGCCCAGGCTA-GGGGTGGGAGCAATTCTGCACAGCC  48
      |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |
seq2  GCTCTCCCAATGATGCCCAGGCTAGGGGGTGGGAGCAATCTGGCACAGGC  50

seq1  ACCAGACAT-CAACATTTCCCAGGGCAGCAACTCAGA-CCAGAGACATCT  96
      ||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ACAGAACATCCAACAATTCCCAGGGCAGCAACTCAGACCCAGAGACATCT  100

seq1  ACC-GGGCCTTTGGTGGTAA--CAAACACTTGCTGCTGCAGGGTCAAAG-  142
      ||| |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||| 
seq2  ACCGGGGCTTTTGGTGGTAAACAAAACAC-TGCTGCTGCAAGGTCAAAGA  149

seq1  ACCCATATGTGGACCCTGGTGCCAGCACAGGCCGGGACCACACCATGATC  192
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATATGTGAACCCTGGTGCCAGCACAGGCCGGGACCACACCATGATC  199

seq1  CTAAGTGGCATCATTGGCTACTCACATCAGGATGCTCTGGGGTCTGGGCT  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGTGGCATCATTGGCTACTCACATCAGGATGCTCTGGGGTCTGGGCT  249

seq1  CATCTCAGAAAGTGTTTTCAGGAGTGCTGTGTCCCACCCATGAATTATGG  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCAGAAAGTGTTTTCAGGAGTGCTGTGTCCCACCCATGAATTATGG  299

seq1  CATGGGGCGGGGGTCATCTCAGGCATGGTCTGCCCTCACCTCTGCCAGGA  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGGCGGGGGTCATCTCAGGCATGGTCTGCCCTCACCTCTGCCAGGA  349

seq1  TTGCACAGTTCCAGACTGGTGGTCATCTCAGGCTAGCTCCCTGTCTGGGC  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCACAGTTCCAGACTGGTGGTCATCTCAGGCTAGCTCCCTGTCTGGGC  399

seq1  CCCATGGCTCCAGACTGGTGGTCATCTTGGGCTTGTTTCTTACCTGGGCC  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGGCTCCAGACTGGTGGTCATCTTGGGCTTGTTTCTTACCTGGGCC  449

seq1  CATCAGAGTGGCCAACTCAGGTACACTCCCTCCAGGGACTCATGGTCAGG  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGAGTGGCCAACTCAGGTACACTCCCTCCAGGGACTCATGGTCAGG  499

seq1  TGGGCTTCATTTTGTCTCCTGCTTGCTCCCTGCCCTGGGAGCCCATGAAG  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTTCATTTTGTCTCCTGCTTGCTCCCTGCCCTGGGAGCCCATGAAG  549

seq1  GCCAGCCTGTGAAGGTGGCACTGGACTGGTGGTCAACCCAGGCTCACTTT  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCCTGTGAAGGTGGCACTGGACTGGTGGTCAACCCAGGCTCACTTT  599

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTCGTGTGCATGTATGTGG  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTCGTGTGCATGTATGTGG  649

seq1  AGATCAGAGGTTGATGCTGGGTGTCCTTCTCAATTGTTCTCCACTTTGCT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCAGAGGTTGATGCTGGGTGTCCTTCTCAATTGTTCTCCACTTTGCT  699

seq1  TTTGAGACAAGGTGTCTGATTGAGCAAAGACCTCACAGGTGCCATTGGAC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGACAAGGTGTCTGATTGAGCAAAGACCTCACAGGTGCCATTGGAC  749

seq1  TGGCTGATCCCAGTGCTGGATGGGATCGTAAGCACACACTGTTACTACAG  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGATCCCAGTGCTGGATGGGATCGTAAGCACACACTGTTACTACAG  799

seq1  TCCTCAGAACTTAGGTCCTCATGTTTTTTCAGCAAGCCCTTCACTGATGG  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCAGAACTTAGGTCCTCATGTTTTTTCAGCAAGCCCTTCACTGATGG  849

seq1  ATCCCTCTTAGTAGCCCTGCCTTGTGCCTTTTGGATGCTTCTCATCCATC  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTCTTAGTAGCCCTGCCTTGTGCCTTTTGGATGCTTCTCATCCATC  899

seq1  TTCTCAGATGCTGTGTGCCGTCTAGGAATAGTAGTTTGCATGTTGTTCTT  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAGATGCTGTGTGCCGTCTAGGAATAGTAGTTTGCATGTTGTTCTT  949

seq1  ATCAAAGTGGATCAGCATGTAGTTTTTTTGCTTCCATTTCCTTCACTTGA  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAGTGGATCAGCATGTAGTTTTTTTGCTTCCATTTCCTTCACTTGA  999

seq1  CCTAATTACTTTGAAATTTATCTACATTGGGGTCTATCCCCATTTTGTTG  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAATTACTTTGAAATTTATCTACATTGGGGTCTATCCCCATTTTGTTG  1049

seq1  CCTCTTAACTCTTGAGACTTGTGTGATATAGAACTATGAGGTGAATTC  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTAACTCTTGAGACTTGTGTGATATAGAACTATGAGGTGAATTC  1097