BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-256K09
Chromosome7 (Build37)
Map Location 108,695,950 - 108,837,446
singlet/doubletdoublet
Overlap geneArt2a, EG630138, Art2b, Clpb
Upstream geneMrpl48, LOC100041155, Rab6, LOC100041167, Plekhb1, B930006L02Rik, LOC100041204, Tnfrsf19l, Arhgef17, P2ry6, P2ry2, LOC100049539, EG435996, Fchsd2, EG622673, Atg16l2, Stard10, Centd2, Pde2a
Downstream genePhox2a, Inppl1, Folr2, Folr1, 3200002M19Rik, F930017I19Rik, 2400001E08Rik, Lrrc51, LOC667222, Numa1, Il18bp, Rnf121, Trpc2, Art5, Art1, Chrna10, Nup98, Frag1, Rhog, Stim1, Rrm1, Olfr543, Olfr544, Olfr545, LOC667284, Olfr547, Olfr548-ps1, Olfr549, Trim21, LOC384699, Olfr550, Olfr551, Olfr552, Olfr553, Olfr554, LOC100040840, Olfr555, Olfr556, Trim68
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-256K09.bB6Ng01-256K09.g
ACCGA062552GA062553
length1,1291,095
definitionB6Ng01-256K09.b B6Ng01-256K09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(108,836,316 - 108,837,446)(108,695,950 - 108,697,040)
sequence
gaattcagggccgcaagcatgccaggcaagcaagcactctaccactgaag
tacatcaccagcatgtatctattacctttaaaagataaaggcttggagct
gaggatggcaaataaggaaacagagtcattgggaccaagttcatgataaa
agcaaagagagacctatctcaaggagagctacaggttcaggtgatctgaa
gcagattgcctcctgaaaattccagcttggtggctttcctccacatttca
gattcttccaaagtggccagaactagcagataagagctttaaagacctgc
ttgatgggagaattaaaattggttcctccaactatcaatttgagtagctt
ctactgaagggtccagtagttctctgaaagcacccctttaaagctggcgt
gtctcactggcttgtcttgcatgcctgaagccctaggttcaattcccagt
actacatgaaaaagtctaaaaacatctttttgttgtataatttctatcat
acaatgactatatacttggatccatcagacttctaaagaccttggggcag
aaaccagaacagcctgggctggagcactaggcggaagtactgacatacag
aacagaatgcacaccacggatgctgggttaacctaactacctaacttcag
gtaaaccactgttttctctctgtgcttctgtttcttcaaaattagagtaa
caacatagattttggggagtggctctgaaattgacctatgctacttctgg
tgtgtgttgtgtgtgcctgaccatgtgctcatccctggaggaggggcagc
actaggggcaaatgtgaggtccaatgatttatttatttattaaagttttg
agacagggtctcattatataaccctagttgggcctagaactagctatgta
gaccaggctaactataaactcagagatctaccagcctctgccctcctgac
tgctgggattaaagacccatgccaccatgcctagcctaatccaccttatg
tttacacatggtcctcatggacctggactccactgactgatcagctggct
gcagagtctgggattcacttgcctcttgtttcccacgcccttctcattgc
tgggctaacagaatgcactgcttgtacac
gaattccaataagctcaaaggaattcttagtataagtaggtaggtcatga
gggggggtcaagaaacatgttgattataacatggttcaaaactttgactt
tgggattttcttagagaaaggggtctagtcttttgtaagtttagtcagtt
gtgttgaacttcttggttctcagccaacatgagacttaaatcagatccaa
gtggtgggctcttttcctgtgtcccctctcctttagttccactgtcatct
tagcctacttcaatagaacttgtcttacgaagttgtggtggtttgtgtag
gcatggaccccagaaactcatgtgtttaaatgcttggctcacagggagtg
gccctattaggtgtggccttgttggaggaagtgtgtcactgtgggcacag
gctttatatatgctctagttatgccccgtgtgactcatagtctctttctg
ctcctgcagatcaagatgcagaactctcagctccttctccagcaccatgt
ctgcctgcatgctgccatgacgataatggactaaacctctgaaactgtaa
gccagccccaatgaaatgtttttatttatatgtgttgccatggttgctgg
gtgggggtgatgcatgcctttaatcccagcacttgggaggcagaggtagg
cagatctctctgtaagtttagccaaagctacacaaagaaaccctgtctta
taataataataataataataataataataataataataataaaaaaagag
ttgccatggtcatgttgtctcctcacagcaataaaactctaactaagaca
gaagttatgaaaaaaatttcattgactttttattcatgtacttgtttatg
ggtgtgtgtgtgcaggtacaggcacagtgacatgtgtgtggaggtcagag
ggcaaccctggaggcagtgttctccctccaccatgtgagtccttcagatg
taactgatgagagttagttagtaactggcagatgctgcactatattggta
gccttattctttgagatgaaatctgtaagtcttttgtcacagtgagtgcc
gaatattacggtaagttacccaggtcacttttaactgttcatatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_108836316_108837446
seq2: B6Ng01-256K09.b_49_1177 (reverse)

seq1  GTGTACAAGCCAAGTGCA-TCTGTAGCCCCAGCACTGAGAGGGTTGTGGG  49
      ||||||||||  |||||| |||||   ||||||| ||||| ||  |||||
seq2  GTGTACAAGC--AGTGCATTCTGTTAGCCCAGCAATGAGAAGGGCGTGGG  48

seq1  AA--CAGAGGCAAGTGAATCCCAGGACTCTGCAGCCAGCTGATCAGTCAG  97
      ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAGAGGCAAGTGAATCCCA-GACTCTGCAGCCAGCTGATCAGTCAG  97

seq1  TGAGTTCCAGGTTCCATGAGGGCCATGTGTAAAACATAAGGTGAATTAGG  147
      ||   |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||
seq2  TGGAGTCCAGG-TCCATGAGGACCATGTGT-AAACATAAGGTGGATTAGG  145

seq1  CTAGGCATGGTGGCATGGGTCTTTAATCCCAGCAGTCAGGAGGGCAGAGG  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCATGGTGGCATGGGTCTTTAATCCCAGCAGTCAGGAGGGCAGAGG  195

seq1  CTGGTAGATCTCCTGAGTTTATAGTTAGCCTGGTCTACATAGCTAGTTCT  247
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTAGATCT-CTGAGTTTATAGTTAGCCTGGTCTACATAGCTAGTTCT  244

seq1  AGG-CCAACTAGGGTTATATAATGAGACCCTGTCTCAAAACTTTAATAAA  296
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCCAACTAGGGTTATATAATGAGACCCTGTCTCAAAACTTTAATAAA  294

seq1  TAAATAAATCATTGGACCTCACATTTGCCCCTAGTGCTGCCCCTCCTCCA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATAAATCATTGGACCTCACATTTGCCCCTAGTGCTGCCCCTCCTCCA  344

seq1  GGGATGAGCACATGGTCAGGCACACACAACACACACCAGAAGTAGCATAG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGAGCACATGGTCAGGCACACACAACACACACCAGAAGTAGCATAG  394

seq1  GTCAATTTCAGAGCCACTCCCCAAAATCTATGTTGTTACTCTAATTTTGA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAATTTCAGAGCCACTCCCCAAAATCTATGTTGTTACTCTAATTTTGA  444

seq1  AGAAACAGAAGCACAGAGAGAAAACAGTGGTTTACCTGAAGTTAGGTAGT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACAGAAGCACAGAGAGAAAACAGTGGTTTACCTGAAGTTAGGTAGT  494

seq1  TAGGTTAACCCAGCATCCGTGGTGTGCATTCTGTTCTGTATGTCAGTACT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTAACCCAGCATCCGTGGTGTGCATTCTGTTCTGTATGTCAGTACT  544

seq1  TCCGCCTAGTGCTCCAGCCCAGGCTGTTCTGGTTTCTGCCCCAAGGTCTT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGCCTAGTGCTCCAGCCCAGGCTGTTCTGGTTTCTGCCCCAAGGTCTT  594

seq1  TAGAAGTCTGATGGATCCAAGTATATAGTCATTGTATGATAGAAATTATA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGTCTGATGGATCCAAGTATATAGTCATTGTATGATAGAAATTATA  644

seq1  CAACAAAAAGATGTTTTTAGACTTTTTCATGTAGTACTGGGAATTGAACC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAAAAGATGTTTTTAGACTTTTTCATGTAGTACTGGGAATTGAACC  694

seq1  TAGGGCTTCAGGCATGCAAGACAAGCCAGTGAGACACGCCAGCTTTAAAG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGCTTCAGGCATGCAAGACAAGCCAGTGAGACACGCCAGCTTTAAAG  744

seq1  GGGTGCTTTCAGAGAACTACTGGACCCTTCAGTAGAAGCTACTCAAATTG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGCTTTCAGAGAACTACTGGACCCTTCAGTAGAAGCTACTCAAATTG  794

seq1  ATAGTTGGAGGAACCAATTTTAATTCTCCCATCAAGCAGGTCTTTAAAGC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTGGAGGAACCAATTTTAATTCTCCCATCAAGCAGGTCTTTAAAGC  844

seq1  TCTTATCTGCTAGTTCTGGCCACTTTGGAAGAATCTGAAATGTGGAGGAA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATCTGCTAGTTCTGGCCACTTTGGAAGAATCTGAAATGTGGAGGAA  894

seq1  AGCCACCAAGCTGGAATTTTCAGGAGGCAATCTGCTTCAGATCACCTGAA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACCAAGCTGGAATTTTCAGGAGGCAATCTGCTTCAGATCACCTGAA  944

seq1  CCTGTAGCTCTCCTTGAGATAGGTCTCTCTTTGCTTTTATCATGAACTTG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTAGCTCTCCTTGAGATAGGTCTCTCTTTGCTTTTATCATGAACTTG  994

seq1  GTCCCAATGACTCTGTTTCCTTATTTGCCATCCTCAGCTCCAAGCCTTTA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAATGACTCTGTTTCCTTATTTGCCATCCTCAGCTCCAAGCCTTTA  1044

seq1  TCTTTTAAAGGTAATAGATACATGCTGGTGATGTACTTCAGTGGTAGAGT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTAAAGGTAATAGATACATGCTGGTGATGTACTTCAGTGGTAGAGT  1094

seq1  GCTTGCTTGCCTGGCATGCTTGCGGCCCTGAATTC  1131
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCTTGCCTGGCATGCTTGCGGCCCTGAATTC  1129

seq1: chr7_108695950_108697040
seq2: B6Ng01-256K09.g_65_1159

seq1  GAATTCCAATAAGCTCAAAGGAATTCTTAGTATAAGTAGGTAGGTCATGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAATAAGCTCAAAGGAATTCTTAGTATAAGTAGGTAGGTCATGA  50

seq1  GGGGGGGTCAAGAAACATGTTGATTATAACATGGTTCAAAACTTTGACTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGGTCAAGAAACATGTTGATTATAACATGGTTCAAAACTTTGACTT  100

seq1  TGGGATTTTCTTAGAGAAAGGGGTCTAGTCTTTTGTAAGTTTAGTCAGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATTTTCTTAGAGAAAGGGGTCTAGTCTTTTGTAAGTTTAGTCAGTT  150

seq1  GTGTTGAACTTCTTGGTTCTCAGCCAACATGAGACTTAAATCAGATCCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGAACTTCTTGGTTCTCAGCCAACATGAGACTTAAATCAGATCCAA  200

seq1  GTGGTGGGCTCTTTTCCTGTGTCCCCTCTCCTTTAGTTCCACTGTCATCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTGGGCTCTTTTCCTGTGTCCCCTCTCCTTTAGTTCCACTGTCATCT  250

seq1  TAGCCTACTTCAATAGAACTTGTCTTACGAAGTTGTGGTGGTTTGTGTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTACTTCAATAGAACTTGTCTTACGAAGTTGTGGTGGTTTGTGTAG  300

seq1  GCATGGACCCCAGAAACTCATGTGTTTAAATGCTTGGCTCACAGGGAGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGACCCCAGAAACTCATGTGTTTAAATGCTTGGCTCACAGGGAGTG  350

seq1  GCCCTATTAGGTGTGGCCTTGTTGGAGGAAGTGTGTCACTGTGGGCACAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTATTAGGTGTGGCCTTGTTGGAGGAAGTGTGTCACTGTGGGCACAG  400

seq1  GCTTTATATATGCTCTAGTTATGCCCCGTGTGACTCATAGTCTCTTTCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTATATATGCTCTAGTTATGCCCCGTGTGACTCATAGTCTCTTTCTG  450

seq1  CTCCTGCAGATCAAGATGCAGAACTCTCAGCTCCTTCTCCAGCACCATGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGCAGATCAAGATGCAGAACTCTCAGCTCCTTCTCCAGCACCATGT  500

seq1  CTGCCTGCATGCTGCCATGACGATAATGGACTAAACCTCTGAAACTGTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTGCATGCTGCCATGACGATAATGGACTAAACCTCTGAAACTGTAA  550

seq1  GCCAGCCCCAATGAAATGTTTTTATTTATATGTGTTGCCATGGTTGCTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCCCCAATGAAATGTTTTTATTTATATGTGTTGCCATGGTTGCTGG  600

seq1  GTGGGGGTGATGCATGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGTAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGGTGATGCATGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGTAGG  650

seq1  CAGATCTCTCTGTAAGTTTAGCCAAAGCTACACAAAGAAACCCTGTCTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCTCTCTGTAAGTTTAGCCAAAGCTACACAAAGAAACCCTGTCTTA  700

seq1  TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAAAGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAAAGAG  750

seq1  TTGCCATGGTCATGTTGTCTCCTCACAGCAATAAAACTCTAACTAAGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCATGGTCATGTTGTCTCCTCACAGCAATAAAACTCTAACTAAGACA  800

seq1  GAAGTTATGAAAAAAATTTCATTGACTTTTTATTCATGTACTTGTTTATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTATGAAAAAAATTTCATTGACTTTTTATTCATGTACTTGTTTATG  850

seq1  GGTGTGTGTGTGCAGGTACAGGCACAGTGACATGTGTGTGGAGGTCAGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGTGTGTGCAGGTACAGGCACAGTGACATGTGTGTGGAGGTCAGAG  900

seq1  GGCAA-CCTGGAGGCAGTGTTCTCCCTCCACCATGTGAGTCCTTCAGATG  949
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAACCCTGGAGGCAGTGTTCTCCCTCCACCATGTGAGTCCTTCAGATG  950

seq1  TAACTGATGAGAGTTAGTTAGTTAACTGGCAGATGCTGCACTATATTGGT  999
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGATGAGAGTTAGTTAG-TAACTGGCAGATGCTGCACTATATTGGT  999

seq1  AGCCCTAT--CTTGAGAATGAAATCTGTAAGGTCTTTGTCACAGTGAGTG  1047
      |||| |||   ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||
seq2  AGCCTTATTCTTTGAG-ATGAAATCTGTAAGTCTTTTGTCACAGTGAGTG  1048

seq1  CCCGATA-TACGGTTAG-TAACCAGTTCAC-TTTAACTGTTCATATT  1091
      ||  ||| |||||| || || |||| |||| ||||||||||||||||
seq2  CCGAATATTACGGTAAGTTACCCAGGTCACTTTTAACTGTTCATATT  1095