BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-258N22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 13,346,664 - 13,509,825
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG232875, LOC100043128, LOC100042515, Zfp329, Zfp110, Zfp128, Zscan22, Rps5
Upstream geneEG628898, V1rg5, V1rg6, LOC665999, V1rg4, LOC100042423, LOC628946, LOC100043075, LOC100042433, V1rg7, LOC100042437, V1rg3, LOC100042446, LOC100043092, V1rg9, V1rg12, V1rg8, V1rg11, Zfp551, EG666065, Zfp606, 2900092C05Rik, EG637908, EG666085, Vmn2r55, LOC629079, LOC629081
Downstream gene2310014L17Rik, 1810019N24Rik, Zfp324, Zfp446, Slc27a5, ZBTB45, LOC100042553, Trim28, Chmp2a, Ube2m, Mzf1, V1rj3, LOC100043156, V1rk1, LOC666177, EG232887, V1rj2, 6330408A02Rik, Lig1, Pla2g4c, LOC666225, Cabp5, LOC666232, Gm767, LOC666243, 9230107M04Rik, EG666256, LOC666267, LOC100042624, LOC100043194, Sult2a1, EG620627, EG434121
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-258N22.bB6Ng01-258N22.g
ACCGA064198GA064199
length1,1241,079
definitionB6Ng01-258N22.b B6Ng01-258N22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(13,508,685 - 13,509,825)(13,346,664 - 13,347,755)
sequence
gaattcactatgtagtacagtgtggtcctatacttagagatctgccagag
tgctgggcttaaatgcacacaccattgattcaagatgctaaggacacttg
ggactcctcaaagaagggagggctgtcctgtgtagtttaaggacacttgg
cagcacaccagcacttgacagattattctggaccacctgtgagacaaaac
cacatttattaacctacctgttgcctaagaagttcgaagtgtgtacacac
tgtgtctcagtaacaatgtgtgttggcctagcatgtgaaaaagccctggc
tctaatcgctaacacaaaaaggattgcagacctccccaaataaactcaca
aagtaaactaaacactcactagacaagactgaaaatcttttagattaatg
cctaggtcctgctgtttctttttcccttctattttgggcatgtacgcaag
tcaggggacaatttgcagctgtcagttctattcttctaccttggattcaa
aggattaaacttatattgtcaggctttgtggtaactgtctttataggctg
aaccaccttacaagctcattctgtggtatctttacagacagtagacatac
tttaattcctttgaacaaaatagacaactgggccgaaagatatagctgag
ttggtagggtgcttgctttgtaaaaagccctgggttcaatgtcaagtagt
gggataaacttggaatggtgatatataccttcaatcccagcactcgggac
agaatgcagatattagctttttccactagacagggtttcaggccagtctc
agctatatgagattacctcaaaatgggttatgagggcaaagcaaatagct
cccatactaacttagccataacagtacccatagccaactgacatttttca
ggggagggcagcaggaacattcatagcaccaactggtctcatactcaaat
tcctcttgctgtaggctgatagcagcttaccaactgctttttgacaaggt
gccacatggtcagttgactaagcatctttcattgatacccactaactgaa
tatacaacgaagggacatcagtcagtgtagtggcacattggagaacagag
caagaatctcaagagctcagccag
gaattcacaccaaggaaaaagcctcatgggtgaaatgactcatcactcaa
ccagcatgaaaggacacacactgggcgaaagccctatctgtatcaggact
gtggcaaggccttcaggcagggcacccatcctactcagcaccagaggatc
tacacagaagctgtatgagtgcagacactgcggcaaagccttcacacaca
gcccttctcttaccaagcaccagagaactcatactgagtagacctattcc
acatggaagacttaagccagcccattcagtactagagacaccattatcat
tctcatgagagctaagtatacataagcattagtgtaccaactctcctcag
atgtctgagaagtgacagggaccatcaagctcaaagttgttcctggatcc
aaaaagtaagtaaatgtagacaccataagtactaaggtccatcaacttga
atgttcaataatgtattctagtatcgacaaagaagaaagtgagcaagcat
gtgtctgttgatagctttgtcttcctttgcattcaaggactcaccatagt
ccaaatcagagctgttctatatggtaaaaaaaaaaaatgtaaaagaacta
aatgaagtcagattttgtcattactgcacatcacatgcctgaagtggtgc
taaagaacagttaaatgtgactggaatagtcctagaaaatacaacagcaa
agtgtttccaaaccaaatggcatcctcttcatggaatctcggtgaatact
cactgtctcagcgcacagctgatcagtgccacaaacttcaattccagtcc
aaaataaactagctatcttgtttttaagtagaggtttgtgggggtgcagt
gtggaccaaacctgggccttgaacttgctagacaagctctctaccactaa
gctcagtcaagtcccaacccccctttgggttatcttattttatacaaatt
aatgtacataggatttaagctttgtatagatatttcagacttagactcgt
tactatggagcctcacaaatctagatgactcactttttctcaattttatt
gcagaacacaatggttatagaatgcaggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_13508685_13509825
seq2: B6Ng01-258N22.b_47_1170 (reverse)

seq1  CTGGCTGCCTGGAGCTCTTTGAGA-TCTTGCCTCTG-TCTCCCATGTGCC  48
      ||||||     |||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||
seq2  CTGGCT-----GAGCTC-TTGAGATTCTTG-CTCTGTTCTCCAATGTGCC  43

seq1  ACTACACCTGACTTGATGTCCCCTTTCGTTTGTATATTCAGTTAGTGGGT  98
      |||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||
seq2  ACTACA-CTGAC-TGATGTCCC--TTCG-TTGTATATTCAGTTAGTGGGT  88

seq1  ATCAATTGAAAAGATGGCTTTAGTCAACTGAACCATGTTGGCACCCTTGT  148
      ||||||   |||||||   ||||||||||| |||||| ||||| ||||||
seq2  ATCAAT--GAAAGATG--CTTAGTCAACTG-ACCATG-TGGCA-CCTTGT  131

seq1  C-AAAAGCAGTTGGTAAGCTGCTATCAGCCTACAGCAAGAGGAATTTGAG  197
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAGCAGTTGGTAAGCTGCTATCAGCCTACAGCAAGAGGAATTTGAG  181

seq1  TATGAGACCAGTTGGTGCTATGAATGTTCCCTGCTGCCCTCCCCTGAAAA  247
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGACCAGTTGGTGCTATGAATGTT-CCTGCTGCCCTCCCCTGAAAA  230

seq1  ATGTCAGTTGGCTATGGGTACTGTTATGGCTAAGTTAGTATGGGAGCTAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCAGTTGGCTATGGGTACTGTTATGGCTAAGTTAGTATGGGAGCTAT  280

seq1  TTGCTTTGCCCTCATAACCCATTTTGAGGTAATCTCATATAGCTGAGACT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTTGCCCTCATAACCCATTTTGAGGTAATCTCATATAGCTGAGACT  330

seq1  GGCCTGAAACCCTGTCTAGTGGAAAAAGCTAATATCTGCATTCTGTCCCG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTGAAACCCTGTCTAGTGGAAAAAGCTAATATCTGCATTCTGTCCCG  380

seq1  AGTGCTGGGATTGAAGGTATATATCACCATTCCAAGTTTATCCCACTACT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTGGGATTGAAGGTATATATCACCATTCCAAGTTTATCCCACTACT  430

seq1  TGACATTGAACCCAGGGCTTTTTACAAAGCAAGCACCCTACCAACTCAGC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATTGAACCCAGGGCTTTTTACAAAGCAAGCACCCTACCAACTCAGC  480

seq1  TATATCTTTCGGCCCAGTTGTCTATTTTGTTCAAAGGAATTAAAGTATGT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATCTTTCGGCCCAGTTGTCTATTTTGTTCAAAGGAATTAAAGTATGT  530

seq1  CTACTGTCTGTAAAGATACCACAGAATGAGCTTGTAAGGTGGTTCAGCCT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGTCTGTAAAGATACCACAGAATGAGCTTGTAAGGTGGTTCAGCCT  580

seq1  ATAAAGACAGTTACCACAAAGCCTGACAATATAAGTTTAATCCTTTGAAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGACAGTTACCACAAAGCCTGACAATATAAGTTTAATCCTTTGAAT  630

seq1  CCAAGGTAGAAGAATAGAACTGACAGCTGCAAATTGTCCCCTGACTTGCG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGTAGAAGAATAGAACTGACAGCTGCAAATTGTCCCCTGACTTGCG  680

seq1  TACATGCCCAAAATAGAAGGGAAAAAGAAACAGCAGGACCTAGGCATTAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGCCCAAAATAGAAGGGAAAAAGAAACAGCAGGACCTAGGCATTAA  730

seq1  TCTAAAAGATTTTCAGTCTTGTCTAGTGAGTGTTTAGTTTACTTTGTGAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAAGATTTTCAGTCTTGTCTAGTGAGTGTTTAGTTTACTTTGTGAG  780

seq1  TTTATTTGGGGAGGTCTGCAATCCTTTTTGTGTTAGCGATTAGAGCCAGG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTGGGGAGGTCTGCAATCCTTTTTGTGTTAGCGATTAGAGCCAGG  830

seq1  GCTTTTTCACATGCTAGGCCAACACACATTGTTACTGAGACACAGTGTGT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTTCACATGCTAGGCCAACACACATTGTTACTGAGACACAGTGTGT  880

seq1  ACACACTTCGAACTTCTTAGGCAACAGGTAGGTTAATAAATGTGGTTTTG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTTCGAACTTCTTAGGCAACAGGTAGGTTAATAAATGTGGTTTTG  930

seq1  TCTCACAGGTGGTCCAGAATAATCTGTCAAGTGCTGGTGTGCTGCCAAGT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACAGGTGGTCCAGAATAATCTGTCAAGTGCTGGTGTGCTGCCAAGT  980

seq1  GTCCTTAAACTACACAGGACAGCCCTCCCTTCTTTGAGGAGTCCCAAGTG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTAAACTACACAGGACAGCCCTCCCTTCTTTGAGGAGTCCCAAGTG  1030

seq1  TCCTTAGCATCTTGAATCAATGGTGTGTGCATTTAAGCCCAGCACTCTGG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAGCATCTTGAATCAATGGTGTGTGCATTTAAGCCCAGCACTCTGG  1080

seq1  CAGATCTCTAAGTATAGGACCACACTGTACTACATAGTGAATTC  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCTCTAAGTATAGGACCACACTGTACTACATAGTGAATTC  1124

seq1: chr7_13346664_13347755
seq2: B6Ng01-258N22.g_64_1142

seq1  GAATTCACACCAAGGAAAAAGCCTCATGGGTGAAATGACTCATCACTCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACACCAAGGAAAAAGCCTCATGGGTGAAATGACTCATCACTCAA  50

seq1  CCAGCATGAAAGGACACACACTGGGCGAAAGCCCTATCTGTATCAGGACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCATGAAAGGACACACACTGGGCGAAAGCCCTATCTGTATCAGGACT  100

seq1  GTGGCAAGGCCTTCAGGCAGGGCACCCATCCTACTCAGCACCAGAGGATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCAAGGCCTTCAGGCAGGGCACCCATCCTACTCAGCACCAGAGGATC  150

seq1  TACACAGAAGCTGTATGAGTGCAGACACTGCGGCAAAGCCTTCACACACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACAGAAGCTGTATGAGTGCAGACACTGCGGCAAAGCCTTCACACACA  200

seq1  GCCCTTCTCTTACCAAGCACCAGAGAACTCATACTGAGTAGACCTATTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTTCTCTTACCAAGCACCAGAGAACTCATACTGAGTAGACCTATTCC  250

seq1  ACATGGAAGACTTAAGCCAGCCCATTCAGTACTAGAGACACCATTATCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGAAGACTTAAGCCAGCCCATTCAGTACTAGAGACACCATTATCAT  300

seq1  TCTCATGAGAGCTAAGTATACATAAGCATTAGTGTACCAACTCTCCTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATGAGAGCTAAGTATACATAAGCATTAGTGTACCAACTCTCCTCAG  350

seq1  ATGTCTGAGAAGTGACAGGGACCATCAAGCTCAAAGTTGTTCCTGGATCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTGAGAAGTGACAGGGACCATCAAGCTCAAAGTTGTTCCTGGATCC  400

seq1  AAAAAGTAAGTAAATGTAGACACCATAAGTACTAAGGTCCATCAACTTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGTAAGTAAATGTAGACACCATAAGTACTAAGGTCCATCAACTTGA  450

seq1  ATGTTCAATAATGTATTCTAGTATCGACAAAGAAGAAAGTGAGCAAGCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCAATAATGTATTCTAGTATCGACAAAGAAGAAAGTGAGCAAGCAT  500

seq1  GTGTCTGTTGATAGCTTTGTCTTCCTTTGCATTCAAGGACTCACCATAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTGTTGATAGCTTTGTCTTCCTTTGCATTCAAGGACTCACCATAGT  550

seq1  CCAAATCAGAGCTGTTCTATATGGTAAAAAAAAAAAATGTAAAAGAACTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATCAGAGCTGTTCTATATGGTAAAAAAAAAAAATGTAAAAGAACTA  600

seq1  AATGAAGTCAGATTTTGTCATTACTGCACATCACATGCCTGAAGTGGTGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAGTCAGATTTTGTCATTACTGCACATCACATGCCTGAAGTGGTGC  650

seq1  TAAAGAACAGTTAAATGTGACTGGAATAGTCCTAGAAAATACAACAGCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAACAGTTAAATGTGACTGGAATAGTCCTAGAAAATACAACAGCAA  700

seq1  AGTGTTTCCAAACCAAATGGCATCCTCTTCATGGAATCTCGGTGAATACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTCCAAACCAAATGGCATCCTCTTCATGGAATCTCGGTGAATACT  750

seq1  CACTGTCTCAGCGCACAGCTGATCAGTGCCACAAACTTCAATTCCAGTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTCTCAGCGCACAGCTGATCAGTGCCACAAACTTCAATTCCAGTCC  800

seq1  AAAATAAACTAGCTATCTTGTTTTTAAGTAGAGGTTTGTGGGGGTGCAGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAACTAGCTATCTTGTTTTTAAGTAGAGGTTTGTGGGGGTGCAGT  850

seq1  GTGGACCAAACCTGGGCCTTGAACTTGCTAGACAAGCTCTCTACCACTAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGACCAAACCTGGGCCTTGAACTTGCTAGACAAGCTCTCTACCACTAA  900

seq1  GCTCAGTCAAGTCCCAACCCCCCTTTGGGTTATCTTAATTTTATAACAAA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
seq2  GCTCAGTCAAGTCCCAACCCCCCTTTGGGTTATCTT-ATTTTAT-ACAAA  948

seq1  TTAATGTACAATAGGATTTAAAGGCTTTGTATAAGAATATTTCAGACTTA  1000
      ||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||
seq2  TTAATGTAC-ATAGGATTTAA--GCTTTGTATA--GATATTTCAGACTTA  993

seq1  GAACTCGTTACTATGGAGCCTCACAAATTCTTAGATGACTTCACTCTTTC  1050
      | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||
seq2  G-ACTCGTTACTATGGAGCCTCACAAAT--CTAGATGAC-TCACTTTTTC  1039

seq1  TCAAATTTTATTGCAGAACACATGGGTATTAGAAATGCAGGT  1092
      || |||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||
seq2  TC-AATTTTATTGCAGAACACAATGGTTATAG-AATGCAGGT  1079