BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-267I24
Chromosome7 (Build37)
Map Location 136,650,728 - 136,745,470
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBrwd2
Upstream geneBag3, EG639030, Inpp5f, LOC100043651, 1110007A13Rik, Sec23ip, LOC210714, LOC100043144, Ppapdc1a
Downstream geneLOC100043150, Fgfr2, LOC546005, Ate1, LOC100043163, Nsmce4a, Tacc2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-267I24.bB6Ng01-267I24.g
ACCGA070651GA070652
length1,201705
definitionB6Ng01-267I24.b B6Ng01-267I24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(136,744,276 - 136,745,470)(136,650,728 - 136,651,455)
sequence
gaattcatctgccaaagtctcactggtttccttcattcatgcccttatcc
cccactgactataatgaacttgtctgactgtgtcctacagccctgaattt
gtcagcaaaccaattagtgggtgtgtacaagtatacacagacaggcctga
actcaatgtattgactttatgtttatagccatgttctccatttaaacttt
taattttctttctctttcaacatacacacacacatacactgcctctctca
ataaacaccgttagataaaatcagaattttgaaacattcaaatccaggga
aaacactataaactacagtcatttctctgcctccttcaagcctctgatca
ttataaaataaagcttgctctggccattaacataataaaacttgacaact
cttagtccccattctactccatctccctcacctgatttttccttcttaat
atcactgatcaccttttcaagattttgagtgtgtgtgtttgtgtcccacc
tgagtgcagctgctgaatcctatgaagctggatttgcaggaggctgtgag
ccatccgatatgagtgccaggaaccgagctagggtcctctgctacaacag
cacatcttcttaactgcagagccactcctccagccccgacttaacatctt
ttaacactacaccttataaactcattcgtcctgtttatagtctgcccgcc
tttcactagaacactaactccacgccgttgggaaactccatctcggttcc
caggatagaaacactggctaaagcagtatctgttgaatcactgcatacgg
agtactttctaaataataaactacacaaataccagtccaaaacaaatctt
atttttagatcatctgacccacaaaacacaaaatgttggtaaaaaccact
tctgcaaaaaaaattctcttaagcgtaatttgtcttttacatgaaaatag
cattaattggaatgatagttttaaaagcaaggagctcaggctacaggatt
aaatgaaatccctgattcaagtttttttaaacgacatccatggaagtctg
aatagaaaataatgcagtagttctctgttcccaagctagtccaatactat
tcatcagcatgaaatcaatgtgtgcaatgcttgctgccataacattccca
cactccaaagataacctcaaacggcgtgggttcaagctcagcatgcagac
t
gaattcaggcctcagtacctacgtaagaagctgggcttgctggtgtgtgc
tggtcatcttagtgctggagaggcagagatttcctaacaggtgagcccat
tggtccactctaatctgttcttgggcttttccatacaacacacacataca
cacacacacacacacacacacacacacacacacacagagagagagagaga
gagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaag
acagagatacatgaaggagacagaaatagagatagagacagagacagaag
tcagtgctggtatctgcagtggggtagtggaagcagaactcggttgtgag
gtgggccttaagaatctacacccacctgacttccagaacccatgttaaca
aaagatggatggatgtgatgatgagtgactgcaaaccagcgctgggcagc
tgaagacaggcagatccctggagaccactgaccagccagcctaactgaat
ctgcaagctctcagctagtgaagactctgaccaacaaaagcagaagagct
tcctgagaacgtgacattactattgacctgtggctcaacaacaccgatct
gtagacaagaccatgcagaattggtatggcaccacctgagctgtagcagc
tcactgctcctactgttcagacacgtgccacacttccacataatgtcacg
tagcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_136744276_136745470
seq2: B6Ng01-267I24.b_46_1246 (reverse)

seq1  AGTCTGCATGCTGA-CTTGTAACCCCACGCTGTTTGAGGT--ACTTT-GA  46
      |||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||   |||| ||
seq2  AGTCTGCATGCTGAGCTTG--AACCCACGCCGTTTGAGGTTATCTTTGGA  48

seq1  GTGTTGGGAATG-TATGGCAGCAAGCCATGCACACATTGAATTCATGGCT  95
      ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||
seq2  GTG-TGGGAATGTTATGGCAGCAAGCATTGCACACATTGATTTCAT-GCT  96

seq1  GAATGAATAGTATTGGACTAGCTTGGG-ACAGAGAACTACTGCATTA--T  142
      | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |
seq2  G-ATGAATAGTATTGGACTAGCTTGGGAACAGAGAACTACTGCATTATTT  145

seq1  TCTATTCAGACTTCCATGGATGTCGTTT-AAAAAACTTGAATCAGGGATT  191
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTCAGACTTCCATGGATGTCGTTTAAAAAAACTTGAATCAGGGATT  195

seq1  TCATTTAAT-CTGTAGCCTGAGCT-CTTGCTTTTAAAACTATCATTCCAA  239
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTAATCCTGTAGCCTGAGCTCCTTGCTTTTAAAACTATCATTCCAA  245

seq1  TTAATGCTA-TTTCATGTAAAAGACAAATTACGCTTAAGAGAATTTTTTT  288
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TTAATGCTATTTTCATGTAAAAGACAAATTACGCTTAAGAGAA-TTTTTT  294

seq1  TTGCAGAAGTGGTTTTTACCAACATTTTGTGTTTTGTGGGTCAGATGATC  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGAAGTGGTTTTTACCAACATTTTGTGTTTTGTGGGTCAGATGATC  344

seq1  TAAAAATAAGATTTGTTTTGGACTGGTATTTGTGTAGTTTATTATTTAGA  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATAAGATTTGTTTTGGACTGGTATTTGTGTAGTTTATTATTTAGA  394

seq1  AAGTACTCCGTATGCAGTGATTCAACAGATACTGCTTTAGCCAGTGTTTC  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTACTCCGTATGCAGTGATTCAACAGATACTGCTTTAGCCAGTGTTTC  444

seq1  TATCCTGGGAACCGAGATGGAGTTTCCCAACGGCGTGGAGTTAGTGTTCT  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCTGGGAACCGAGATGGAGTTTCCCAACGGCGTGGAGTTAGTGTTCT  494

seq1  AGTGAAAGGCGGGCAGACTATAAACAGGACGAATGAGTTTATAAGGTGTA  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAAAGGCGGGCAGACTATAAACAGGACGAATGAGTTTATAAGGTGTA  544

seq1  GTGTTAAAAGATGTTAAGTCGGGGCTGGAGGAGTGGCTCTGCAGTTAAGA  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTAAAAGATGTTAAGTCGGGGCTGGAGGAGTGGCTCTGCAGTTAAGA  594

seq1  AGATGTGCTGTTGTAGCAGAGGACCCTAGCTCGGTTCCTGGCACTCATAT  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTGCTGTTGTAGCAGAGGACCCTAGCTCGGTTCCTGGCACTCATAT  644

seq1  CGGATGGCTCACAGCCTCCTGCAAATCCAGCTTCATAGGATTCAGCAGCT  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGATGGCTCACAGCCTCCTGCAAATCCAGCTTCATAGGATTCAGCAGCT  694

seq1  GCACTCAGGTGGGACACAAACACACACACTCAAAATCTTGAAAAGGTGAT  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCAGGTGGGACACAAACACACACACTCAAAATCTTGAAAAGGTGAT  744

seq1  CAGTGATATTAAGAAGGAAAAATCAGGTGAGGGAGATGGAGTAGAATGGG  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGATATTAAGAAGGAAAAATCAGGTGAGGGAGATGGAGTAGAATGGG  794

seq1  GACTAAGAGTTGTCAAGTTTTATTATGTTAATGGCCAGAGCAAGCTTTAT  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAAGAGTTGTCAAGTTTTATTATGTTAATGGCCAGAGCAAGCTTTAT  844

seq1  TTTATAATGATCAGAGGCTTGAAGGAGGCAGAGAAATGACTGTAGTTTAT  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAATGATCAGAGGCTTGAAGGAGGCAGAGAAATGACTGTAGTTTAT  894

seq1  AGTGTTTTCCCTGGATTTGAATGTTTCAAAATTCTGATTTTATCTAACGG  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTTCCCTGGATTTGAATGTTTCAAAATTCTGATTTTATCTAACGG  944

seq1  TGTTTATTGAGAGAGGCAGTGTATGTGTGTGTGTATGTTGAAAGAGAAAG  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTATTGAGAGAGGCAGTGTATGTGTGTGTGTATGTTGAAAGAGAAAG  994

seq1  AAAATTAAAAGTTTAAATGGAGAACATGGCTATAAACATAAAGTCAATAC  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTAAAAGTTTAAATGGAGAACATGGCTATAAACATAAAGTCAATAC  1044

seq1  ATTGAGTTCAGGCCTGTCTGTGTATACTTGTACACACCCACTAATTGGTT  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGTTCAGGCCTGTCTGTGTATACTTGTACACACCCACTAATTGGTT  1094

seq1  TGCTGACAAATTCAGGGCTGTAGGACACAGTCAGACAAGTTCATTATAGT  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGACAAATTCAGGGCTGTAGGACACAGTCAGACAAGTTCATTATAGT  1144

seq1  CAGTGGGGGATAAGGGCATGAATGAAGGAAACCAGTGAGACTTTGGCAGA  1188
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGGGGATAAGGGCATGAATGAAGGAAACCAGTGAGACTTTGGCAGA  1194

seq1  TGAATTC  1195
      |||||||
seq2  TGAATTC  1201

seq1: chr7_136650728_136651455
seq2: B6Ng01-267I24.g_67_771

seq1  GAATTCAGGCCTCAGTACCTACGTAAGAAGCTGGGCTTGCTGGTGTGTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGCCTCAGTACCTACGTAAGAAGCTGGGCTTGCTGGTGTGTGC  50

seq1  TGGTCATCTTAGTGCTGGAGAGGCAGAGATTTCCTAACAGGTGAGCCCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCATCTTAGTGCTGGAGAGGCAGAGATTTCCTAACAGGTGAGCCCAT  100

seq1  TGGTCCACTCTAATCTGTTCTTGGGCTTTTCCATACAACACACACATACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCCACTCTAATCTGTTCTTGGGCTTTTCCATACAACACACACATACA  150

seq1  CACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGA  200

seq1  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAG  250

seq1  ACAGAGATACATGAAGGAGACAGAAATAGAGATAGAGACAGAGACAGAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGATACATGAAGGAGACAGAAATAGAGATAGAGACAGAGACAGAAG  300

seq1  TCAGTGCTGGTATCTGCAGTGGGGTAGTGGAAGCAGAACTCGGTTGTGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGCTGGTATCTGCAGTGGGGTAGTGGAAGCAGAACTCGGTTGTGAG  350

seq1  GTGGGCCTTAAGAATCTACACCCACCTGACTTCCAGAACCCATGTTAACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGCCTTAAGAATCTACACCCACCTGACTTCCAGAACCCATGTTAACA  400

seq1  AAAGATGGATGGATGTGATGATGAGTGACTGCAAACCAGCGCTGGGCAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATGGATGGATGTGATGATGAGTGACTGCAAACCAGCGCTGGGCAGC  450

seq1  TGAAGACAGGCAGATCCCTGGAGACCACTGACCAGCCAGCCTAACTGAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGACAGGCAGATCCCTGGAGACCACTGACCAGCCAGCCTAACTGAAT  500

seq1  CTGCAAGCTCTCAGCTAGTGAAAGACTCTGACCAACAAAAAGCAGAAGAG  550
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CTGCAAGCTCTCAGCTAGTG-AAGACTCTGACCAAC-AAAAGCAGAAGAG  548

seq1  CTTTCCTGAGAAACGGTGACATTTACTATTGACCTGTGGCCTCAAACAAA  600
      | ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||   ||
seq2  C-TTCCTGAGAA--CGTGACA-TTACTATTGACCTGTGG-CTCAA--CAA  591

seq1  CACCGATCCTGTAGGACAAAGGACCATGCCAGGAAATTTGGTATGGCACC  650
      ||||||| ||||| |||||  ||||||||    | | ||||||||||| |
seq2  CACCGAT-CTGTA-GACAA--GACCATGC----AGAATTGGTATGGCA-C  632

seq1  CACCTGAGCTGTAGGCAGCTCACTGCTCCCTACTTGTTCCAGACACGTGC  700
      ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||
seq2  CACCTGAGCTGTA-GCAGCTCACTGCT-CCTAC-TGTT-CAGACACGTGC  678

seq1  CACACTTCCCACATAAGGTCACGTAGCC  728
      ||||||| |||||||| |||||||||||
seq2  CACACTT-CCACATAATGTCACGTAGCC  705