BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-268I06
Chromosome7 (Build37)
Map Location 124,913,584 - 125,136,623
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC669758
Upstream geneLOC546993, LOC100043330, Xylt1
Downstream geneRps15a, Arl6ip1, 2610207I05Rik, LOC100043339, Syt17, LOC100042845, E030018N11Rik, Coq7, Tmc7, B230311B06Rik, Tmc5, Mir16, 6330503K22Rik, 9030624J02Rik, 2310008H09Rik, Iqck, Gprc5b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-268I06.bB6Ng01-268I06.g
ACCGA071351GA071352
length1,183658
definitionB6Ng01-268I06.b B6Ng01-268I06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,913,584 - 124,914,767)(125,135,968 - 125,136,623)
sequence
gaattcaaaggagacacagagcacagtatagagacagacagcagctcagg
aggcaaagcaaagcactcttaagggtaagagcagaccatagccaaaggtc
cattgtggagagcaggcccagtggccagagtgaccactgttaccttacat
gttcatgtaggctttatgctatttctaaagtctctggaacacacacactt
cctgagaggagttttcctgtccagtgattgacagacccattgggttgact
tttacaggagagaaaaatggaatgtctttgttcttcactacaaagcctcc
tgctagacagcaatcttgtgatcttttggaccgttcacaatgtcatgtct
ccactcagggccagagcttcaacttgcatcctattctttggaccagttaa
cacttaacagaactgattaaaagaattgaagagagaaaaacatgaagtta
taaaaatgaccatgctttaccaggaggaaatagcattcccttaatgagcc
tccacaaaatctgctttctcccttttctcagatctctggacaacctttca
tatggttctttattctttaaggatgggtggggtgatgcttctgccactct
gtagccatcactatttctcatcggcaaagttagtgtgcaagaagggtctc
tacatgttaagcaagagctctgtcactgagatgcactctggtcctaagtc
acaccactttgttatattcattctcagtagcacaaggaggacgaactcaa
cagtgacagttaaagtgatggtgacagccccaggacactttccagtccct
tactcaagctttgtgctctaataggccaacttctaacatctatgactcaa
ttcacacatcctggacacagcagaacacaaattcctttgttaacaaaata
tgaaccctttttttcaggcaactttcagaatgcacgaactgaaaccatct
ctctattgtagatgttctttaattgacaaataacttatctatttggaatg
cagaatggtagtcagaacatgcgtgcattagtacagcaaaataacacatg
tggaatgctttaaaacttacataccttggagggaaccaaggcatgcatgg
acttgttcataatacagctgatggtgaccttataccgaacatgatcattc
cttcctcaagatacacgtggactattgtaggaa
gaattctttcctcaactttccttcaagatggactgtgagctgtagtataa
tcttgatcttcaggttgcttttggtcttggtgttttatcacagcaaatca
aaacaaagggtcttattacaacactgaagagtaaggccaactcttggtga
caagtgatccagtagattgtatagggagtttctctgaagccagactcggg
atcaagtcactaaatctctctgggtttatgctgttcttctctgttgtatt
ggggggtggagagatggctcagtggttaagagtgcctgctgctcttacag
agaacctaagtttgattcttagtacccacagtgggcagcttatagtcgtt
ggcagctttagctctaggggatccaacaccttcttctggattcctcaggc
actgctcctgtatgctacacacatagacataaaataaatcttacagaaga
ggggttattgtgggattatgggattatggtgaagctcaaattaaggaaat
ctcatggcctgattaatgtagtgtctggcagagatgctggctgtcctcat
gagatgctcagagtacacctgggattagaaatgaagatgggtgacagcct
aaggtatgtcatactgcagggtgacatttttccctttgttgctctagaac
atgtttaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_124913584_124914767
seq2: B6Ng01-268I06.b_45_1227

seq1  GAATTCAAAGGAGACACAGAGCACAGTATAGAGACAGACAGCAGCTCAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGGAGACACAGAGCACAGTATAGAGACAGACAGCAGCTCAGG  50

seq1  AGGCAAAGCAAAGCACTCTTAAGGGTAAGAGCAGACCATAGCCAAAGGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAAGCAAAGCACTCTTAAGGGTAAGAGCAGACCATAGCCAAAGGTC  100

seq1  CATTGTGGAGAGCAGGCCCAGTGGCCAGAGTGACCACTGTTACCTTACAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTGGAGAGCAGGCCCAGTGGCCAGAGTGACCACTGTTACCTTACAT  150

seq1  GTTCATGTAGGCTTTATGCTATTTCTAAAGTCTCTGGAACACACACACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATGTAGGCTTTATGCTATTTCTAAAGTCTCTGGAACACACACACTT  200

seq1  CCTGAGAGGAGTTTTCCTGTCCAGTGATTGACAGACCCATTGGGTTGACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGAGGAGTTTTCCTGTCCAGTGATTGACAGACCCATTGGGTTGACT  250

seq1  TTTACAGGAGAGAAAAATGGAATGTCTTTGTTCTTCACTACAAAGCCTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAGGAGAGAAAAATGGAATGTCTTTGTTCTTCACTACAAAGCCTCC  300

seq1  TGCTAGACAGCAATCTTGTGATCTTTTGGACCGTTCACAATGTCATGTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAGACAGCAATCTTGTGATCTTTTGGACCGTTCACAATGTCATGTCT  350

seq1  CCACTCAGGGCCAGAGCTTCAACTTGCATCCTATTCTTTGGACCAGTTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCAGGGCCAGAGCTTCAACTTGCATCCTATTCTTTGGACCAGTTAA  400

seq1  CACTTAACAGAACTGATTAAAAGAATTGAAGAGAGAAAAACATGAAGTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAACAGAACTGATTAAAAGAATTGAAGAGAGAAAAACATGAAGTTA  450

seq1  TAAAAATGACCATGCTTTACCAGGAGGAAATAGCATTCCCTTAATGAGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATGACCATGCTTTACCAGGAGGAAATAGCATTCCCTTAATGAGCC  500

seq1  TCCACAAAATCTGCTTTCTCCCTTTTCTCAGATCTCTGGACAACCTTTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACAAAATCTGCTTTCTCCCTTTTCTCAGATCTCTGGACAACCTTTCA  550

seq1  TATGGTTCTTTATTCTTTAAGGATGGGTGGGGTGATGCTTCTGCCACTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGTTCTTTATTCTTTAAGGATGGGTGGGGTGATGCTTCTGCCACTCT  600

seq1  GTAGCCATCACTATTTCTCATCGGCAAAGTTAGTGTGCAAGAAGGGTCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCCATCACTATTTCTCATCGGCAAAGTTAGTGTGCAAGAAGGGTCTC  650

seq1  TACATGTTAAGCAAGAGCTCTGTCACTGAGATGCACTCTGGTCCTAAGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGTTAAGCAAGAGCTCTGTCACTGAGATGCACTCTGGTCCTAAGTC  700

seq1  ACACCACTTTGTTATATTCATTCTCAGTAGCACAAGGAGGACGAACTCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCACTTTGTTATATTCATTCTCAGTAGCACAAGGAGGACGAACTCAA  750

seq1  CAGTGACAGTTAAAGTGATGGTGACAGCCCCAGGACACTTTCCAGTCCCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGACAGTTAAAGTGATGGTGACAGCCCCAGGACACTTTCCAGTCCCT  800

seq1  TACTCAAGCTTTGTGCTCTAATAGGCCAACTTCTAACATCTATGACTCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCAAGCTTTGTGCTCTAATAGGCCAACTTCTAACATCTATGACTCAA  850

seq1  TTCACACATCCTGGACACAGCAGAACACAAATTCCTTTGTTAACAAAATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACACATCCTGGACACAGCAGAACACAAATTCCTTTGTTAACAAAATA  900

seq1  TGAACCCTTTTTTTCAGGGCAACTTTCAGAATGCACGAACTGAAACCATC  950
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACCCTTTTTTTCA-GGCAACTTTCAGAATGCACGAACTGAAACCATC  949

seq1  TCTCTATTGTAGATGTTCTTTTAATTGACAAATAACTTATCTATTTGGAA  1000
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTATTGTAGATGTTC-TTTAATTGACAAATAACTTATCTATTTGGAA  998

seq1  TGCAGAATGGTAGTTCAGAACATGCGTGCATTAGTAACAGC-AAATAACA  1049
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
seq2  TGCAGAATGGTAG-TCAGAACATGCGTGCATTAGT-ACAGCAAAATAACA  1046

seq1  CATGTGGATTGCTTTTAAAACTTACATACCTTGGA-GGAACCAGGGCATG  1098
      |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
seq2  CATGTGGAATGC-TTTAAAACTTACATACCTTGGAGGGAACCAAGGCATG  1095

seq1  CAT-GACTTGTTCATAATACAAGCTTGAT-GTGA-CTTATACGGAACATG  1145
      ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||
seq2  CATGGACTTGTTCATAATAC-AGC-TGATGGTGACCTTATACCGAACATG  1143

seq1  ATCATTCCTTCCTCAAAGAAACAC-AGGACTATTG-AGGAA  1184
      |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||
seq2  ATCATTCCTTCCTC-AAGATACACGTGGACTATTGTAGGAA  1183

seq1: chr7_125135968_125136623
seq2: B6Ng01-268I06.g_68_725 (reverse)

seq1  TTAAACATGTTCTAGAGCAACAA--GGGAAAATGTCACCCTGCAGTATGA  48
      |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACATGTTCTAGAGCAACAAAGGGAAAAATGTCACCCTGCAGTATGA  50

seq1  CATACCTTAGGCTGTCACCCATCTTCATTTCTTATCCCAGGTGTACTCTG  98
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CATACCTTAGGCTGTCACCCATCTTCATTTCTAATCCCAGGTGTACTCTG  100

seq1  AGCATCTCATGAGGACAGCCAGCATCTCTGCCAGACACTACATTAATCAG  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCTCATGAGGACAGCCAGCATCTCTGCCAGACACTACATTAATCAG  150

seq1  GCCATGAGATTTCCTTAATTTGAGCTTCACCATAATCCCATAATCCCACA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGAGATTTCCTTAATTTGAGCTTCACCATAATCCCATAATCCCACA  200

seq1  ATAACCCCTCTTCTGTAAGATTTATTTTATGTCTATGTGTGTAGCATACA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACCCCTCTTCTGTAAGATTTATTTTATGTCTATGTGTGTAGCATACA  250

seq1  GGAGCAGTGCCTGAGGAATCCAGAAGAAGGTGTTGGATCCCCTAGAGCTA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCAGTGCCTGAGGAATCCAGAAGAAGGTGTTGGATCCCCTAGAGCTA  300

seq1  AAGCTGCCAACGACTATAAGCTGCCCACTGTGGGTACTAAGAATCAAACT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGCCAACGACTATAAGCTGCCCACTGTGGGTACTAAGAATCAAACT  350

seq1  TAGGTTCTCTGTAAGAGCAGCAGGCACTCTTAACCACTGAGCCATCTCTC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTCTCTGTAAGAGCAGCAGGCACTCTTAACCACTGAGCCATCTCTC  400

seq1  CACCCCCCAATACAACAGAGAAGAACAGCATAAACCCAGAGAGATTTAGT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCCCAATACAACAGAGAAGAACAGCATAAACCCAGAGAGATTTAGT  450

seq1  GACTTGATCCCGAGTCTGGCTTCAGAGAAACTCCCTATACAATCTACTGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGATCCCGAGTCTGGCTTCAGAGAAACTCCCTATACAATCTACTGG  500

seq1  ATCACTTGTCACCAAGAGTTGGCCTTACTCTTCAGTGTTGTAATAAGACC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTTGTCACCAAGAGTTGGCCTTACTCTTCAGTGTTGTAATAAGACC  550

seq1  CTTTGTTTTGATTTGCTGTGATAAAACACCAAGACCAAAAGCAACCTGAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTTTTGATTTGCTGTGATAAAACACCAAGACCAAAAGCAACCTGAA  600

seq1  GATCAAGATTATACTACAGCTCACAGTCCATCTTGAAGGAAAGTTGAGGA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAAGATTATACTACAGCTCACAGTCCATCTTGAAGGAAAGTTGAGGA  650

seq1  AAGAATTC  656
      ||||||||
seq2  AAGAATTC  658