BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-273G06
Chromosome7 (Build37)
Map Location 109,454,833 - 109,534,930
singlet/doubletdoublet
Overlap geneStim1
Upstream geneStard10, Centd2, Pde2a, Art2a, EG630138, Art2b, Clpb, Phox2a, Inppl1, Folr2, Folr1, 3200002M19Rik, F930017I19Rik, 2400001E08Rik, Lrrc51, LOC667222, Numa1, Il18bp, Rnf121, Trpc2, Art5, Art1, Chrna10, Nup98, Frag1, Rhog
Downstream geneRrm1, Olfr543, Olfr544, Olfr545, LOC667284, Olfr547, Olfr548-ps1, Olfr549, Trim21, LOC384699, Olfr550, Olfr551, Olfr552, Olfr553, Olfr554, LOC100040840, Olfr555, Olfr556, Trim68, Olfr557, Olfr558, Olfr33, Olfr559, Olfr78, Olfr560, Olfr561, Olfr562-ps1, Olfr563-ps1, Olfr564, Olfr565-ps1, Olfr566, GA_x5J8B7W5P47-379997-380552, Olfr567-ps1, Olfr568, Olfr569, Olfr570, Olfr571, Olfr572, Olfr573-ps1, Olfr574, Olfr575, Olfr576, Olfr577, Olfr578, Olfr1527-ps1, Olfr579-ps1, Olfr580-ps1, Olfr581-ps1, Olfr582, Olfr583, Olfr584, Olfr585, Olfr586, Olfr587-ps1, Olfr588-ps1, Olfr589, Olfr590-ps1, Olfr591, Olfr592, Olfr593, Olfr594, Olfr595-ps1, Usp17, Dub2a, LOC100041187, Olfr597, GA_x5J8B7TU1BB-380-666, Olfr598, Olfr599, Olfr600, Olfr601, Olfr602-ps1, Olfr604, Olfr596-ps1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-273G06.bB6Ng01-273G06.g
ACCGA074975GA074976
length1,089839
definitionB6Ng01-273G06.b B6Ng01-273G06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(109,533,844 - 109,534,930)(109,454,833 - 109,455,671)
sequence
gaattcaagacatcctaatgaaggacaacttcaaatccctttcccagcat
gactgtaatttggtcttattccatgactctatagaatgatttcagtaact
tacttcttgttaagcattttttgttgtccatgtccttctaaggacagtat
ctattcatcctctctctctctctaaacctttaacaaccacaaccaacaac
ccggctgcctgttaccttctgatgacttccacgccttccacaggtcctcc
acgctgataagcttatcctcaccatggaaggtgctatgtttcactgttgg
gtcatggtaattgaggtcttcccttaggaactgtaagagaaaagcacaca
agtcacaggagatacttgtgaaccagcccaccaagatctccacaagtcac
ttgtctccagctatatataacacagttccaatgcactacttataaacccc
actcctgtatctttctatgtgaatgcctcagttgctggtaaaaacaattt
ttcacttagttacatgtttcatataaaaaagacaagtatgtttgaattct
tccctcactattattattattattattatgtattgaaagagtgacagtgg
actcaacaagccacaagggaaacaaagaagagttaatgtttaaaaaaatg
tgcagtctgtctgtgcatgcctgtgcacacatgtacatttgcaaatgtca
caggcaacattcaccttaccttttgagacagggtctcactgaacctggaa
aatactaatctggctaggctgactggccagcaagcccccaaaatccacct
gtccacccacagcagccctgaagttacagatatgtgctgcagtgctcgac
tttttatatggatgctggggattaacactcgggtcctcacaactgtgtga
caggcactgtaccaactgagctaggttcccagtagctccaactctagttt
gtctggttggtgttttttgtttggttgtttaatatagtcaaagtcttata
aagcccaggctaacctggatgtcgtatgtacctgaggatgactctggact
ctttttttgtgggggagggggagtaaaattagggagagg
gaattctctatgatgctgaggatgatattgaactctgtatcctcctctct
acctcccaattgctgggattactagtatgcattactatgcctggcataat
acatagttttggcatatgtataataaaatttgtcaaatgcttggtgaatt
aatgtgtgtccctgttgtctagatcaaatacatacaggactaggaatgta
gcttagtactatattacttatatagcatatacaatccctgcccaccctca
gtgcaaattcacatataaatacctaagcaagcaagcaagcaaataaagcc
aagatgtggatacatttctgtatctctacagtctagcagagaagtcagaa
acaatttcttgcgatgggccaaatagtaagtacttcagactttatggagt
cacatagcaagttgttggaaggaagcagctgcaggcagtgtaaatgaata
ggcatggttatgttttaataaaacttacaaaaataagtattagtcagtat
ttggctgaggtatagtgagaacactagaaatttggtttcttttaaaaaca
taaatattataagaatatgtttttgtcttaatcccaggtgtggggatatg
gggctgcttctctagagtatgatttgcctcatgcactaacagaggcatgg
ttagatagtatctgcagttgcagatagtttctatgattgtgtgacatttg
gaattctcgagaggaggggctgttggttgttggtcattcagggggttggt
tatgatttgttaagagttgtgtttgttcaaagaagaaacaagaataaaga
aagttggattcttcacagatctatctcctaccccctctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_109533844_109534930
seq2: B6Ng01-273G06.b_41_1129 (reverse)

seq1  CCTCTCCCTATTTTTACTCCCC--TCCCCAC-AAAAAAGAGTCCAGAGTC  47
      |||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCCCTAATTTTACTCCCCCTCCCCCACAAAAAAAGAGTCCAGAGTC  50

seq1  ATCCTCAGGTACATACGACATTCCAGGTTAGCCTGGGCTTTATAAGACTT  97
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTCAGGTACATACGACA-TCCAGGTTAGCCTGGGCTTTATAAGACTT  99

seq1  TGACTATATTAAACAACCAAACAAAAAACACCAACCAGACAAACTAGAGT  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTATATTAAACAACCAAACAAAAAACACCAACCAGACAAACTAGAGT  149

seq1  TGGAGCTACTGGGAACCTAGCTCAGTTGGTACAGTGCCTGTCACACAGTT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCTACTGGGAACCTAGCTCAGTTGGTACAGTGCCTGTCACACAGTT  199

seq1  GTGAGGACCCGAGTGTTAATCCCCAGCATCCATATAAAAAGTCGAGCACT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGGACCCGAGTGTTAATCCCCAGCATCCATATAAAAAGTCGAGCACT  249

seq1  GCAGCACATATCTGTAACTTCAGGGCTGCTGTGGGTGGACAGGTGGATTT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCACATATCTGTAACTTCAGGGCTGCTGTGGGTGGACAGGTGGATTT  299

seq1  TGGGGGCTTGCTGGCCAGTCAGCCTAGCCAGATTAGTATTTTCCAGGTTC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGCTTGCTGGCCAGTCAGCCTAGCCAGATTAGTATTTTCCAGGTTC  349

seq1  AGTGAGACCCTGTCTCAAAAGGTAAGGTGAATGTTGCCTGTGACATTTGC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGACCCTGTCTCAAAAGGTAAGGTGAATGTTGCCTGTGACATTTGC  399

seq1  AAATGTACATGTGTGCACAGGCATGCACAGACAGACTGCACATTTTTTTA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTACATGTGTGCACAGGCATGCACAGACAGACTGCACATTTTTTTA  449

seq1  AACATTAACTCTTCTTTGTTTCCCTTGTGGCTTGTTGAGTCCACTGTCAC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTAACTCTTCTTTGTTTCCCTTGTGGCTTGTTGAGTCCACTGTCAC  499

seq1  TCTTTCAATACATAATAATAATAATAATAATAGTGAGGGAAGAATTCAAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCAATACATAATAATAATAATAATAATAGTGAGGGAAGAATTCAAA  549

seq1  CATACTTGTCTTTTTTATATGAAACATGTAACTAAGTGAAAAATTGTTTT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTTGTCTTTTTTATATGAAACATGTAACTAAGTGAAAAATTGTTTT  599

seq1  TACCAGCAACTGAGGCATTCACATAGAAAGATACAGGAGTGGGGTTTATA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGCAACTGAGGCATTCACATAGAAAGATACAGGAGTGGGGTTTATA  649

seq1  AGTAGTGCATTGGAACTGTGTTATATATAGCTGGAGACAAGTGACTTGTG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGTGCATTGGAACTGTGTTATATATAGCTGGAGACAAGTGACTTGTG  699

seq1  GAGATCTTGGTGGGCTGGTTCACAAGTATCTCCTGTGACTTGTGTGCTTT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATCTTGGTGGGCTGGTTCACAAGTATCTCCTGTGACTTGTGTGCTTT  749

seq1  TCTCTTACAGTTCCTAAGGGAAGACCTCAATTACCATGACCCAACAGTGA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTACAGTTCCTAAGGGAAGACCTCAATTACCATGACCCAACAGTGA  799

seq1  AACATAGCACCTTCCATGGTGAGGATAAGCTTATCAGCGTGGAGGACCTG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATAGCACCTTCCATGGTGAGGATAAGCTTATCAGCGTGGAGGACCTG  849

seq1  TGGAAGGCGTGGAAGTCATCAGAAGGTAACAGGCAGCCGGGTTGTTGGTT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGGCGTGGAAGTCATCAGAAGGTAACAGGCAGCCGGGTTGTTGGTT  899

seq1  GTGGTTGTTAAAGGTTTAGAGAGAGAGAGAGGATGAATAGATACTGTCCT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTTGTTAAAGGTTTAGAGAGAGAGAGAGGATGAATAGATACTGTCCT  949

seq1  TAGAAGGACATGGACAACAAAAAATGCTTAACAAGAAGTAAGTTACTGAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGGACATGGACAACAAAAAATGCTTAACAAGAAGTAAGTTACTGAA  999

seq1  ATCATTCTATAGAGTCATGGAATAAGACCAAATTACAGTCATGCTGGGAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTCTATAGAGTCATGGAATAAGACCAAATTACAGTCATGCTGGGAA  1049

seq1  AGGGATTTGAAGTTGTCCTTCATTAGGATGTCTTGAATTC  1087
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATTTGAAGTTGTCCTTCATTAGGATGTCTTGAATTC  1089

seq1: chr7_109454833_109455671
seq2: B6Ng01-273G06.g_66_904

seq1  GAATTCTCTATGATGCTGAGGATGATATTGAACTCTGTATCCTCCTCTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTATGATGCTGAGGATGATATTGAACTCTGTATCCTCCTCTCT  50

seq1  ACCTCCCAATTGCTGGGATTACTAGTATGCATTACTATGCCTGGCATAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCCAATTGCTGGGATTACTAGTATGCATTACTATGCCTGGCATAAT  100

seq1  ACATAGTTTTGGCATATGTATAATAAAATTTGTCAAATGCTTGGTGAATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGTTTTGGCATATGTATAATAAAATTTGTCAAATGCTTGGTGAATT  150

seq1  AATGTGTGTCCCTGTTGTCTAGATCAAATACATACAGGACTAGGAATGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGTGTCCCTGTTGTCTAGATCAAATACATACAGGACTAGGAATGTA  200

seq1  GCTTAGTACTATATTACTTATATAGCATATACAATCCCTGCCCACCCTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAGTACTATATTACTTATATAGCATATACAATCCCTGCCCACCCTCA  250

seq1  GTGCAAATTCACATATAAATACCTAAGCAAGCAAGCAAGCAAATAAAGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAAATTCACATATAAATACCTAAGCAAGCAAGCAAGCAAATAAAGCC  300

seq1  AAGATGTGGATACATTTCTGTATCTCTACAGTCTAGCAGAGAAGTCAGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGTGGATACATTTCTGTATCTCTACAGTCTAGCAGAGAAGTCAGAA  350

seq1  ACAATTTCTTGCGATGGGCCAAATAGTAAGTACTTCAGACTTTATGGAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTTCTTGCGATGGGCCAAATAGTAAGTACTTCAGACTTTATGGAGT  400

seq1  CACATAGCAAGTTGTTGGAAGGAAGCAGCTGCAGGCAGTGTAAATGAATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATAGCAAGTTGTTGGAAGGAAGCAGCTGCAGGCAGTGTAAATGAATA  450

seq1  GGCATGGTTATGTTTTAATAAAACTTACAAAAATAAGTATTAGTCAGTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATGGTTATGTTTTAATAAAACTTACAAAAATAAGTATTAGTCAGTAT  500

seq1  TTGGCTGAGGTATAGTGAGAACACTAGAAATTTGGTTTCTTTTAAAAACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTGAGGTATAGTGAGAACACTAGAAATTTGGTTTCTTTTAAAAACA  550

seq1  TAAATATTATAAGAATATGTTTTTGTCTTAATCCCAGGTGTGGGGATATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATATTATAAGAATATGTTTTTGTCTTAATCCCAGGTGTGGGGATATG  600

seq1  GGGCTGCTTCTCTAGAGTATGATTTGCCTCATGCACTAACAGAGGCATGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGCTTCTCTAGAGTATGATTTGCCTCATGCACTAACAGAGGCATGG  650

seq1  TTAGATAGTATCTGCAGTTGCAGATAGTTTCTATGATTGTGTGACATTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATAGTATCTGCAGTTGCAGATAGTTTCTATGATTGTGTGACATTTG  700

seq1  GAATTCTCGAGAGGAGGGGCTGTTGGTTGTTGGTCATTCAGGGGGTTGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCGAGAGGAGGGGCTGTTGGTTGTTGGTCATTCAGGGGGTTGGT  750

seq1  TATGATTTGTTAAGAGTTGTGTTTGTTCAAAGAAGAAACAAGAATAAAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATTTGTTAAGAGTTGTGTTTGTTCAAAGAAGAAACAAGAATAAAGA  800

seq1  AAGTTGGATTCTTCACAGATCTATCTCCTACCCCCTCTC  839
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGGATTCTTCACAGATCTATCTCCTACCCCCTCTC  839