BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-273N02
Chromosome7 (Build37)
Map Location 86,177,824 - 86,341,282
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAcan, Hapln3, Mfge8
Upstream geneA330068G13Rik, Ntrk3, Mrpl46, Mrps11, Det1, Isg20l1, Isg20
Downstream geneAbhd2, Rlbp1, BC025462, Polg, AI854517, Rhcg, 5730590G19Rik, Plin, Pex11a, EG626359, EG665900, Mesp1, Mesp2, Anpep, Ap3s2, 2610034B18Rik, Zfp710, Idh2, Sema4b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-273N02.bB6Ng01-273N02.g
ACCGA075289GA075290
length1,0891,145
definitionB6Ng01-273N02.b B6Ng01-273N02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,340,195 - 86,341,282)(86,177,824 - 86,178,966)
sequence
gaattcattcacagcttgggcatcactgatctgtgaacagtgtccctgtc
tgcagggacatctgcagactttttcttgtcattattcaccaaacaataca
agtacaataactgtttacatagcacttccattgtatttggtgttacaaat
caactacacaggaaactgtggatggcttacatacaggtactacccagttt
cacataaggggtctgaacatccttagattttggtatctgagaaagcctct
gtaaccaatcaatctccagggatcctaaagatgatttttctaagagtatg
caagtatgcaaggccacactacggtccttaagtcttggctggtgacaaaa
agtaggctagcatctcaagaagacttgatgcttaaggtcatgggcacagt
gtttttaaaggttgaaaaaaaaaaaaaaccaacccaacccaacccaaccc
aacccaaaacaaccaccactaccaccaccaccaccaccaccaccaccacc
accaccaccaccaccaccaccaccaccaccatgcagaacacaactgtatc
aatcctagttgagggtgagagtaaccttgctacatctttcagacataaca
caacaattttcatttgtgcccttaacagttgtttatgcttgatttgtaca
aacactacttacatctggaccatggtcagggtcatggaaaaccccaaatt
tgttgccaaaagtagaagtggttattgagggggttagagagatgagaaat
atctaaactgacacaaaatggagtcaggacaagatggtgtcaccataggc
actttaatattacagatagggaaatcgaagttgatttgaacttgggtctg
gtctgtgcttaagttaggactggccctttcccctgttcactggcctgtga
ccccttgctcattgtggaggacatcccaatagagacaatttatgcacaca
cctgcaaatatatatataaatgacaccccccctctggaatggggggggtc
accctgtattctgcaactgactttttttgctgctttccaccattttttta
aagctgttgtgaatgcagtttttccgaattgcaactggt
gaattccttcttctctcctctgtgttccttgtctgaaaatcctaaaagtc
cctcccctgtccccttgcctaaccaatggccactagctctttatgaatta
atcgaaaaaccaattggggacaaggaacctcatcatctggacacttagat
tcccatgtgattttaggagccaaattaagacgaagcattagaaccaatct
ccaagaggcaatatcagttgatatcacacatataaataaaaccttttagg
gagacctcaatttcattccagatagtaatacacttacatcctaaccaagt
ctgaaggagatgcagctcacacagtggcatgaaaccgcaattgtcatgtt
tgtgcggcacaaaaaaaggttcaaggcctttcattgcattcagttatttt
ccctagctgccgccacagccaaggatatcaaatgttcgagagcattcata
agacagaaaggtctgagcatcccttacttaaattcagccagaatacatct
ttcgggatcaaatatgggtttggcctcccctgaagcacacaagcaaagga
cacctggaaactccccggtgttctctgaggaaagagagattgagtcttca
tgggtaccaagcagtctggtatcaccactgcagagtgaattctgacctga
attgaggattcctggatggcaggaagtccaggtcacattgtggtaggagg
tgcgtgtagaggacggagtccttgctcttgaagaacaaggagagcttgtg
agatgtgaggcactcactctgctgaactttaccacttcttctgcccatgg
acatccaccagctgtgtgagcccttctcagtgaagcaagcatttcaatct
ccttacaacacatcctcatttcatttctcacatatttttaatttgaaaaa
ttcgctgccaccaatttagttctcctgcctaaacatatagtcataccact
tccttatcagaacctctgaaaactccagtcaggtggtgcacactgtgtaa
tgcattcttgacatgccacttaggagattttccaccacagtggccccaaa
attgtctgccttagactcagactaggttttgtctaggagtagagtatgtg
ctctccgagtcaggcatctgggttcagccctcttctacaagcaac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_86340195_86341282
seq2: B6Ng01-273N02.b_50_1138 (reverse)

seq1  ACCAGTTTTGC-ATTCGGAAAAACTTGCATTCACCACCAGCTTTTAAAAA  49
      |||||  |||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||
seq2  ACCAG--TTGCAATTCGGAAAAAC-TGCATTCA-CAACAGC-TTTAAAAA  45

seq1  AATGGTGGAAGGCAGCAAAAAAAGGCCAGGTGCAGAATACAGGGTGA-CC  98
      |||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||
seq2  AATGGTGGAAAGCAGCAAAAAAA-GTCAGTTGCAGAATACAGGGTGACCC  94

seq1  CCCCCATTCCAG-GAGGGGGTGTCATTTATATATATATTTGCAGGTGTGT  147
      |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCATTCCAGAGGGGGGGTGTCATTTATATATATATTTGCAGGTGTGT  144

seq1  GCATAAATTGTCTCTATTTGGATGTCCTCCACAATGAGCAAGGGGTCACA  197
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAAATTGTCTCTATTGGGATGTCCTCCACAATGAGCAAGGGGTCACA  194

seq1  -GCCAGTGAACAGGGG-AAGGGCCAGTCCTAAC-TAAGCACAGACCAGA-  243
       ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| 
seq2  GGCCAGTGAACAGGGGAAAGGGCCAGTCCTAACTTAAGCACAGACCAGAC  244

seq1  CCAAGTTCAAATCAACTTCGATTTCCCTATCTGTAATATTAAAGTGCCTA  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTTCAAATCAACTTCGATTTCCCTATCTGTAATATTAAAGTGCCTA  294

seq1  TGGTGACACCATCTTGTCCTGACTCCATTTTGTGTCAGTTTAGATATTTC  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGACACCATCTTGTCCTGACTCCATTTTGTGTCAGTTTAGATATTTC  344

seq1  TCATCTCTCTAACCCCCTCAATAACCACTTCTACTTTTGGCAACAAATTT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTCTCTAACCCCCTCAATAACCACTTCTACTTTTGGCAACAAATTT  394

seq1  GGGGTTTTCCATGACCCTGACCATGGTCCAGATGTAAGTAGTGTTTGTAC  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTTTTCCATGACCCTGACCATGGTCCAGATGTAAGTAGTGTTTGTAC  444

seq1  AAATCAAGCATAAACAACTGTTAAGGGCACAAATGAAAATTGTTGTGTTA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAAGCATAAACAACTGTTAAGGGCACAAATGAAAATTGTTGTGTTA  494

seq1  TGTCTGAAAGATGTAGCAAGGTTACTCTCACCCTCAACTAGGATTGATAC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGAAAGATGTAGCAAGGTTACTCTCACCCTCAACTAGGATTGATAC  544

seq1  AGTTGTGTTCTGCATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTGTTCTGCATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGG  594

seq1  TGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTTGTTTTGGGTTGGGTT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTTGTTTTGGGTTGGGTT  644

seq1  GGGTTGGGTTGGGTTGGTTTTTTTTTTTTTTCAACCTTTAAAAACACTGT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGGGTTGGGTTGGTTTTTTTTTTTTTTCAACCTTTAAAAACACTGT  694

seq1  GCCCATGACCTTAAGCATCAAGTCTTCTTGAGATGCTAGCCTACTTTTTG  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCATGACCTTAAGCATCAAGTCTTCTTGAGATGCTAGCCTACTTTTTG  744

seq1  TCACCAGCCAAGACTTAAGGACCGTAGTGTGGCCTTGCATACTTGCATAC  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAGCCAAGACTTAAGGACCGTAGTGTGGCCTTGCATACTTGCATAC  794

seq1  TCTTAGAAAAATCATCTTTAGGATCCCTGGAGATTGATTGGTTACAGAGG  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGAAAAATCATCTTTAGGATCCCTGGAGATTGATTGGTTACAGAGG  844

seq1  CTTTCTCAGATACCAAAATCTAAGGATGTTCAGACCCCTTATGTGAAACT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCAGATACCAAAATCTAAGGATGTTCAGACCCCTTATGTGAAACT  894

seq1  GGGTAGTACCTGTATGTAAGCCATCCACAGTTTCCTGTGTAGTTGATTTG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGTACCTGTATGTAAGCCATCCACAGTTTCCTGTGTAGTTGATTTG  944

seq1  TAACACCAAATACAATGGAAGTGCTATGTAAACAGTTATTGTACTTGTAT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACCAAATACAATGGAAGTGCTATGTAAACAGTTATTGTACTTGTAT  994

seq1  TGTTTGGTGAATAATGACAAGAAAAAGTCTGCAGATGTCCCTGCAGACAG  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGGTGAATAATGACAAGAAAAAGTCTGCAGATGTCCCTGCAGACAG  1044

seq1  GGACACTGTTCACAGATCAGTGATGCCCAAGCTGTGAATGAATTC  1088
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACTGTTCACAGATCAGTGATGCCCAAGCTGTGAATGAATTC  1089

seq1: chr7_86177824_86178966
seq2: B6Ng01-273N02.g_69_1213

seq1  GAATTCCTTCTTCTCTCCTCTGTGTTCCTTGTCTGAAAATCCTAAAAGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCTTCTCTCCTCTGTGTTCCTTGTCTGAAAATCCTAAAAGTC  50

seq1  CCTCCCCTGTCCCCTTGCCTAACCAATGGCCACTAGCTCTTTATGAATTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCCTGTCCCCTTGCCTAACCAATGGCCACTAGCTCTTTATGAATTA  100

seq1  ATCGAAAAACCAATTGGGGACAAGGAACCTCATCATCTGGACACTTAGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGAAAAACCAATTGGGGACAAGGAACCTCATCATCTGGACACTTAGAT  150

seq1  TCCCATGTGATTTTAGGAGCCAAATTAAGACGAAGCATTAGAACCAATCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATGTGATTTTAGGAGCCAAATTAAGACGAAGCATTAGAACCAATCT  200

seq1  CCAAGAGGCAATATCAGTTGATATCACACATATAAATAAAACCTTTTAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAGGCAATATCAGTTGATATCACACATATAAATAAAACCTTTTAGG  250

seq1  GAGACCTCAATTTCATTCCAGATAGTAATACACTTACATCCTAACCAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCTCAATTTCATTCCAGATAGTAATACACTTACATCCTAACCAAGT  300

seq1  CTGAAGGAGATGCAGCTCACACAGTGGCATGAAACCGCAATTGTCATGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGGAGATGCAGCTCACACAGTGGCATGAAACCGCAATTGTCATGTT  350

seq1  TGTGCGGCACAAAAAAAGGTTCAAGGCCTTTCATTGCATTCAGTTATTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCGGCACAAAAAAAGGTTCAAGGCCTTTCATTGCATTCAGTTATTTT  400

seq1  CCCTAGCTGCCGCCACAGCCAAGGATATCAAATGTTCGAGAGCATTCATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAGCTGCCGCCACAGCCAAGGATATCAAATGTTCGAGAGCATTCATA  450

seq1  AGACAGAAAGGTCTGAGCATCCCTTACTTAAATTCAGCCAGAATACATCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAAAGGTCTGAGCATCCCTTACTTAAATTCAGCCAGAATACATCT  500

seq1  TTCGGGATCAAATATGGGTTTGGCCTCCCCTGAAGCACACAAGCAAAGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGGGATCAAATATGGGTTTGGCCTCCCCTGAAGCACACAAGCAAAGGA  550

seq1  CACCTGGAAACTCCCCGGTGTTCTCTGAGGAAAGAGAGATTGAGTCTTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTGGAAACTCCCCGGTGTTCTCTGAGGAAAGAGAGATTGAGTCTTCA  600

seq1  TGGGTACCAAGCAGTCTGGTATCACCACTGCAGAGTGAATTCTGACCTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTACCAAGCAGTCTGGTATCACCACTGCAGAGTGAATTCTGACCTGA  650

seq1  ATTGAGGATTCCTGGATGGCAGGAAGTCCAGGTCACATTGTGGTAGGAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGGATTCCTGGATGGCAGGAAGTCCAGGTCACATTGTGGTAGGAGG  700

seq1  TGCGTGTAGAGGACGGAGTCCTTGCTCTTGAAGAACAAGGAGAGCTTGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGTGTAGAGGACGGAGTCCTTGCTCTTGAAGAACAAGGAGAGCTTGTG  750

seq1  AGATGTGAGGCACTCACTCTGCTGAACTTTACCACTTCTTCTGCCCATGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTGAGGCACTCACTCTGCTGAACTTTACCACTTCTTCTGCCCATGG  800

seq1  ACATCCACCAGCTGTGTGAGCCCTTCTCAGTGAAGCAAGCATTTCAATCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCCACCAGCTGTGTGAGCCCTTCTCAGTGAAGCAAGCATTTCAATCT  850

seq1  CCTTACAACACATCCTCATTTCATTTCTCACATATTTTTAAATTGAAAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CCTTACAACACATCCTCATTTCATTTCTCACATATTTTTAATTTGAAAAA  900

seq1  TTCGCTGCCACCAATTTAGTTCTCCTGCCTAAACATATAGTCATACCACT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGCTGCCACCAATTTAGTTCTCCTGCCTAAACATATAGTCATACCACT  950

seq1  TCCTTATCAGAACCTCTGAAAACTCCAGTCAG--TGTGCACACTGTGTAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||
seq2  TCCTTATCAGAACCTCTGAAAACTCCAGTCAGGTGGTGCACACTGTGTAA  1000

seq1  TGGCATTCTTGACATG-CACTTA-GAGA-TTTCCA-CACAGTGGCCCCCA  1044
      | |||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||| |
seq2  T-GCATTCTTGACATGCCACTTAGGAGATTTTCCACCACAGTGGCCCCAA  1049

seq1  AATTGTCTGCC-TAGACTTCCAGACTAAG-TTTGTCTAGGAGTTAAGAGT  1092
      ||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||  |||||
seq2  AATTGTCTGCCTTAGACT--CAGACTAGGTTTTGTCTAGGAGT--AGAGT  1095

seq1  ATGTGCTCT-CGAGCCAGGCCATCTGGTGTTCAGCCCTCTTTCTAC-AGC  1140
      ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||
seq2  ATGTGCTCTCCGAGTCAGG-CATCTGG-GTTCAGCCCTC-TTCTACAAGC  1142

seq1  AAC  1143
      |||
seq2  AAC  1145