BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-284O11
Chromosome7 (Build37)
Map Location 151,449,328 - 151,589,592
singlet/doubletdoublet
Overlap geneShank2
Upstream geneKcnq1, Cdkn1c, Slc22a18, Phlda2, Nap1l4, Cars, Tnfrsf26, Tnfrsf22, Tnfrsf23, Osbpl5, Mrgprg, Mrgpre, Nadsyn1, Dhcr7, Gm498
Downstream geneCttn, Ppfia1, Fadd, Tmem16a, LOC669079, LOC677315, Fgf3, Fgf4, Fgf15, Oraov1, Ccnd1, 1810010D01Rik, LOC100040049, Tpcn2, Mrgprf, Mrgprd
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-284O11.bB6Ng01-284O11.g
ACCGA083491GA083492
length1,1661,073
definitionB6Ng01-284O11.b B6Ng01-284O11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,588,355 - 151,589,592)(151,449,328 - 151,450,398)
sequence
gaattcagcctccagagattggtcaggcaattgctcagctcccaactcca
gcagcagtgaggacacttggagctcaaatcagccatgtccttggcccctg
agtctcaaaaccaaaccttcactctcctaggctttggcacttctgctgaa
gtgtctatcatcttcttactaaccttccttactaacagaactggtggacc
tcgtcctgtgccatgtgatataggccatgcccacctgcctccatctctgc
catctttctccaggggtccagattggctcttacggctgagatcaaacttc
tttctgggtagtccccactgtccacttgccagcctactttggtgagccag
ccagaacacactggtctagcttgatctacatcccaaccccatactctagg
tctcttagcactggtgatttggcctagctttagctgaggtgtgcccatgg
tatgttctttcgaggaaggagttgagctctctctagcaatggagagctat
gtcccagcactgcagtgggcactgggcagaaaacactgcgttcactctag
aaactactctcctctcctcagtgatacttgctctgaacccacagaggctt
agcatggggacacactatcctgaatctcaaatgtgggtcaagtggaagcc
actgagttatgaggcctgtctgggtatttcatatggagagctctggagac
ctgcaagaatctagccacctctaacctgagcgaaccttgagatgggaagg
cccctgctggctgtgtgggtagcctaccttgcttgccctgtgagtagttg
ggtaggactatcaaggagaggtgtggttgagctccaggaagctcctgttt
ttcctaccccataaaactggtctttgtcgaattcaatggctaatggtagc
agctgggcaagagaagttgtgggccagacacttggaggatcagataagag
acacagggtcatagtcctactaggaggccttgggcacaagctcagaataa
ggagtgattggccagagtcttgctgtgtaagggcctggtctgggcaacat
gtaaacaatgacacttagaagaatgaaccaacctgctgtagagttgtgat
cacttgaaagtcttcccaggccgagcctggcaggttgccattctcccctc
ccaatcagtgggcaat
gaattcttcccagatagaacctctcttgataaattcctgaggctttctaa
gagaaagactctgtctatgtgataccgtgagaagcctctatatggaggga
ggggtatgctctgtgtacacattcatgtatgtgcatatgggtgtgtagga
gttgggacactagtacatgtgtgctcatacatgcagaagccaaagatcaa
tttgagtatcttcctctggcaccattcatctcattgtaaaattattttta
agctttattttatttaagtatgtatgtgtttctatgtgtattattattat
ttgcaacagagcagctcacaagcctgagattcacaaatttagcaaggtct
gatgtccagtgtgctccagggagtcttgtgaggcactctcccctcactcc
agccctgggattacaggtgtgtgttaccacacctagctttgtatgggtat
tggagatctggactcagggcatcatgattgtgtggtgaatattggctgac
ccattttcccagtcgctacaaacccttttaaaactcttgaaaaaagataa
ataaaaactgcccgcgttccctcccagactgtctagctgaatcaccctgt
gaccttgggcagctcacctcctgtctccgagtcttcaaattgctatctgc
aagacagaaacacacttaaacctgttccctgtctccagttgggttcctgc
taagaacaaatgagaaaatgtgttaagggcttgcagcaccaagaggcctg
cactgtatagatccagtgggctgcaagctgtaagtgctgccggtgggcac
ctggctttcccctgacacctctcgccgtgtgttctagagcaccgcccttg
gaaaggaggaatggtaagaaagagcgactgccccacttctttcttccaac
attatttgtgttccgttcgttgctattgtttttagtcagacttgaagaaa
agagcaccaagactgagtgtgtacagggcagatacagagggagcatcctc
ctgctgggctgatgactggttcaggtaatttattgtggcacttgcaaagc
tggctgctaggaacatagtttgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_151588355_151589592
seq2: B6Ng01-284O11.b_50_1215 (reverse)

seq1  ATTGCCCACTCCTGCTGGACATGTGAAGATGCCACAGGCACCCACGTGCC  50
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  0

seq1  AGGCAGTAGACCCACATGCCACCGGGGAGTGGGGGAGGGGAGAATGCACA  100
                     ||  | ||   || |  ||||||||||||||  ||
seq2  ---------------ATTGC-CCACTGATT--GGGAGGGGAGAATG-GCA  31

seq1  CACTGCCAGCTTCTGCCTGGG-AGACTCTC-AGTGATTCCACAACTCTTC  148
        |||||||  || ||||||| ||||| || ||||||  ||||||||| |
seq2  ACCTGCCAGGCTCGGCCTGGGAAGACTTTCAAGTGAT--CACAACTCTAC  79

seq1  AGCACGTGTGTTCATTCTTCT-AGTGTCCTTTGTTTTCCATG-TGCCCAG  196
      |||| ||  |||||||||||| |||||| ||   ||| |||| |||||||
seq2  AGCAGGTTGGTTCATTCTTCTAAGTGTCATT--GTTTACATGTTGCCCAG  127

seq1  ACCCAGGCCC-TACACAGC-AGACTCTGGCCAATCACCTCCTTATTCTGA  244
      | |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  A-CCAGGCCCTTACACAGCAAGACTCTGGCCAATCA-CTCCTTATTCTGA  175

seq1  GCCTGTGCCCAAGGCCCTCCTAGTAGGACTATGACCCTGTGTCTCTTATC  294
      || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTGCCCAAGG-CCTCCTAGTAGGACTATGACCCTGTGTCTCTTATC  224

seq1  TGATCCTCCAAGTTGTCTGGCCCACAACCTTCTCTTGCCCAGCTGCTACC  344
      |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCCTCCAAG-TGTCTGGCCCACAA-CTTCTCTTGCCCAGCTGCTACC  272

seq1  ATTAGCCATTGAATTCGACAAAGACCAGTTTTATGGGGTAGGAAAAACAG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGCCATTGAATTCGACAAAGACCAGTTTTATGGGGTAGGAAAAACAG  322

seq1  GAGCTTCCTGGAGCTCAACCACACCTCTCCTTGATAGTCCTACCCAACTA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTTCCTGGAGCTCAACCACACCTCTCCTTGATAGTCCTACCCAACTA  372

seq1  CTCACAGGGCAAGCAAGGTAGGCTACCCACACAGCCAGCAGGGGCCTTCC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAGGGCAAGCAAGGTAGGCTACCCACACAGCCAGCAGGGGCCTTCC  422

seq1  CATCTCAAGGTTCGCTCAGGTTAGAGGTGGCTAGATTCTTGCAGGTCTCC  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCAAGGTTCGCTCAGGTTAGAGGTGGCTAGATTCTTGCAGGTCTCC  472

seq1  AGAGCTCTCCATATGAAATACCCAGACAGGCCTCATAACTCAGTGGCTTC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTCTCCATATGAAATACCCAGACAGGCCTCATAACTCAGTGGCTTC  522

seq1  CACTTGACCCACATTTGAGATTCAGGATAGTGTGTCCCCATGCTAAGCCT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGACCCACATTTGAGATTCAGGATAGTGTGTCCCCATGCTAAGCCT  572

seq1  CTGTGGGTTCAGAGCAAGTATCACTGAGGAGAGGAGAGTAGTTTCTAGAG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGGTTCAGAGCAAGTATCACTGAGGAGAGGAGAGTAGTTTCTAGAG  622

seq1  TGAACGCAGTGTTTTCTGCCCAGTGCCCACTGCAGTGCTGGGACATAGCT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACGCAGTGTTTTCTGCCCAGTGCCCACTGCAGTGCTGGGACATAGCT  672

seq1  CTCCATTGCTAGAGAGAGCTCAACTCCTTCCTCGAAAGAACATACCATGG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATTGCTAGAGAGAGCTCAACTCCTTCCTCGAAAGAACATACCATGG  722

seq1  GCACACCTCAGCTAAAGCTAGGCCAAATCACCAGTGCTAAGAGACCTAGA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACACCTCAGCTAAAGCTAGGCCAAATCACCAGTGCTAAGAGACCTAGA  772

seq1  GTATGGGGTTGGGATGTAGATCAAGCTAGACCAGTGTGTTCTGGCTGGCT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGGGGTTGGGATGTAGATCAAGCTAGACCAGTGTGTTCTGGCTGGCT  822

seq1  CACCAAAGTAGGCTGGCAAGTGGACAGTGGGGACTACCCAGAAAGAAGTT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAAAGTAGGCTGGCAAGTGGACAGTGGGGACTACCCAGAAAGAAGTT  872

seq1  TGATCTCAGCCGTAAGAGCCAATCTGGACCCCTGGAGAAAGATGGCAGAG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCTCAGCCGTAAGAGCCAATCTGGACCCCTGGAGAAAGATGGCAGAG  922

seq1  ATGGAGGCAGGTGGGCATGGCCTATATCACATGGCACAGGACGAGGTCCA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGGCAGGTGGGCATGGCCTATATCACATGGCACAGGACGAGGTCCA  972

seq1  CCAGTTCTGTTAGTAAGGAAGGTTAGTAAGAAGATGATAGACACTTCAGC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTCTGTTAGTAAGGAAGGTTAGTAAGAAGATGATAGACACTTCAGC  1022

seq1  AGAAGTGCCAAAGCCTAGGAGAGTGAAGGTTTGGTTTTGAGACTCAGGGG  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTGCCAAAGCCTAGGAGAGTGAAGGTTTGGTTTTGAGACTCAGGGG  1072

seq1  CCAAGGACATGGCTGATTTGAGCTCCAAGTGTCCTCACTGCTGCTGGAGT  1194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGACATGGCTGATTTGAGCTCCAAGTGTCCTCACTGCTGCTGGAGT  1122

seq1  TGGGAGCTGAGCAATTGCCTGACCAATCTCTGGAGGCTGAATTC  1238
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGCTGAGCAATTGCCTGACCAATCTCTGGAGGCTGAATTC  1166

seq1: chr7_151449328_151450398
seq2: B6Ng01-284O11.g_69_1141

seq1  GAATTCTTCCCAGATAGAACCTCTCTTGATAAATTCCTGAGGCTTTCTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCCAGATAGAACCTCTCTTGATAAATTCCTGAGGCTTTCTAA  50

seq1  GAGAAAGACTCTGTCTATGTGATACCGTGAGAAGCCTCTATATGGAGGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAGACTCTGTCTATGTGATACCGTGAGAAGCCTCTATATGGAGGGA  100

seq1  GGGGTATGCTCTGTGTACACATTCATGTATGTGCATATGGGTGTGTAGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTATGCTCTGTGTACACATTCATGTATGTGCATATGGGTGTGTAGGA  150

seq1  GTTGGGACACTAGTACATGTGTGCTCATACATGCAGAAGCCAAAGATCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGGACACTAGTACATGTGTGCTCATACATGCAGAAGCCAAAGATCAA  200

seq1  TTTGAGTATCTTCCTCTGGCACCATTCATCTCATTGTAAAATTATTTTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGTATCTTCCTCTGGCACCATTCATCTCATTGTAAAATTATTTTTA  250

seq1  AGCTTTATTTTATTTAAGTATGTATGTGTTTCTATGTGTATTATTATTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTATTTTATTTAAGTATGTATGTGTTTCTATGTGTATTATTATTAT  300

seq1  TTGCAACAGAGCAGCTCACAAGCCTGAGATTCACAAATTTAGCAAGGTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAACAGAGCAGCTCACAAGCCTGAGATTCACAAATTTAGCAAGGTCT  350

seq1  GATGTCCAGTGTGCTCCAGGGAGTCTTGTGAGGCACTCTCCCCTCACTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCCAGTGTGCTCCAGGGAGTCTTGTGAGGCACTCTCCCCTCACTCC  400

seq1  AGCCCTGGGATTACAGGTGTGTGTTACCACACCTAGCTTTGTATGGGTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTGGGATTACAGGTGTGTGTTACCACACCTAGCTTTGTATGGGTAT  450

seq1  TGGAGATCTGGACTCAGGGCATCATGATTGTGTGGTGAATATTGGCTGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGATCTGGACTCAGGGCATCATGATTGTGTGGTGAATATTGGCTGAC  500

seq1  CCATTTTCCCAGTCGCTACAAACCCTTTTAAAACTCTTGAAAAAAGATAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTTCCCAGTCGCTACAAACCCTTTTAAAACTCTTGAAAAAAGATAA  550

seq1  ATAAAAACTGCCCGCGTTCCCTCCCAGACTGTCTAGCTGAATCACCCTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAACTGCCCGCGTTCCCTCCCAGACTGTCTAGCTGAATCACCCTGT  600

seq1  GACCTTGGGCAGCTCACCTCCTGTCTCCGAGTCTTCAAATTGCTATCTGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTTGGGCAGCTCACCTCCTGTCTCCGAGTCTTCAAATTGCTATCTGC  650

seq1  AAGACAGAAACACACTTAAACCTGTTCCCTGTCTCCAGTTGGGTTCCTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAGAAACACACTTAAACCTGTTCCCTGTCTCCAGTTGGGTTCCTGC  700

seq1  TAAGAACAAATGAGAAAATGTGTTAAGGGCTTGCAGCACCAAGAGGCCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAACAAATGAGAAAATGTGTTAAGGGCTTGCAGCACCAAGAGGCCTG  750

seq1  CACTGTATAGATCCAGTGGGCTGCAAGCTGTAAGTGCTGCCGGTGGGCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTATAGATCCAGTGGGCTGCAAGCTGTAAGTGCTGCCGGTGGGCAC  800

seq1  CTGGCTTTCCCCTGACACCTCTCGCCGTGTGTTCTAGAGCACCGCCCTTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTTTCCCCTGACACCTCTCGCCGTGTGTTCTAGAGCACCGCCCTTG  850

seq1  GAAAGGAGGAATGGTAAGAAAGAGCGACTGCCCCACT--CTTCTTCCAAC  898
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||
seq2  GAAAGGAGGAATGGTAAGAAAGAGCGACTGCCCCACTTCTTTCTTCCAAC  900

seq1  ATTATTTTGTGTT-CGTTCGTTGCTATTGTTTTTAGTCAGACTTGAAGAA  947
      |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTA-TTTGTGTTCCGTTCGTTGCTATTGTTTTTAGTCAGACTTGAAGAA  949

seq1  AAGAGCACCAAGACTGAGTGTGTACAGGGCAGATACAGAAGGGAGCATCC  997
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AAGAGCACCAAGACTGAGTGTGTACAGGGCAGATACAG-AGGGAGCATCC  998

seq1  T-CTGCTTGGCTGATGACTGGTTCAGGTAATTAATGGTGGCACTTGCAAA  1046
      | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
seq2  TCCTGCTGGGCTGATGACTGGTTCAGGTAATTTATTGTGGCACTTGCAAA  1048

seq1  GCT-GCTGCCTAGGGACATAGTTTGG  1071
      ||| |||| ||||| |||||||||||
seq2  GCTGGCTG-CTAGGAACATAGTTTGG  1073