BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-286C20
Chromosome7 (Build37)
Map Location 122,371,097 - 122,466,040
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCopb1, Psma1, 4933406I18Rik, Pde3b, Cyp2r1, Calca, LOC100043295, Calcb, Insc, EG627967, LOC668472
Downstream geneSox6, LOC100042779, 1110006G14Rik, EG668479, LOC100043313, 1110004F10Rik, Plekha7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-286C20.bB6Ng01-286C20.g
ACCGA084440GA084441
length1,157470
definitionB6Ng01-286C20.b B6Ng01-286C20.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(122,464,884 - 122,466,040)(122,371,097 - 122,371,571)
sequence
gaattcatttagtttctccctgttctgaagccttctttgacttaccgacg
cctcactcacatcaccggagtgtgtcccctcctctcctgtctctcccagg
ttatttattcatctttatcttataacggcatataattctgggttcaaggc
cacctaggccaagatgtatctcctcatgtaagatcctgagcttcaaagat
tgttaccacagctgcaaggatgtgtttctaagtaaggaaacgttggtggg
tttgcggaagtgttacaaagaggtggtgcagcttctgggagagccactgt
ttgccctccccagtcacacaggtggaatcagttccatcttgtcccttatc
ttggtaccacgatctttttcttctgaagtgtctgtcctgacacgggagct
tcctgtttcatcatgtgtctcccacagtgttctcagccagggtgtaaggt
gacatttggagtgaggcagatatttagcacacaggagagaaagtctcatt
accgggcatgcagatttccatggttttgaccccacttaataggagggtga
gttgccagttactttctgttgctctgataaaataccatgaccaaaagaac
ctataaaagaaagagtttattctggcctgacttatggctccagaagggga
gtccataatggcaaggaagatatcgtagcaactggcctgagcaggaagcc
aactgataacacattcataatacagaaagcgaaattcctcattccctatg
atgcactgcatccagcaaggcttcataaaagttttacattcagatcctca
tgtcccccttagataggtagtatccctccggacaggtgttaccaacccaa
gatgaggaccaccagcttaggtttgtctcctttcataggagtgacagctc
tgtgaggactgaggcctgcctgccttgtattccctgagtctctgccaaca
tctggtgctgatgccaatctattattctttcggtgcacacagggagacag
agttacactttctggaaatgtgtgtctgactttgttaagctgtcagctga
agaaagggagtcgtgataaaaaacaatgggctttgatgacgatgaagaaa
tgaatgcatgcagttactgaactctggagcgatgctcatggttaagtgct
tgctgtg
ctcttggtttgggttcccactgctctgctacaactggcttacccatagct
actgtttcttttgttgaaagcaagatgcacagtgttgggggtggataagc
aagggggcaaggtgccctatgttgaccatacagacaaagcctgggtgaga
gggcagtgggttagaacatagctggaaactaacagtgcttccaaccctcc
tactcctgtctgtttggcttgggggcccacccctaccccatgcacctctg
agcaactctctatctctgcaaagcttattatatgaggatgatgcagtttt
cttatccaccttgattgggttggaaaggcttgtttaccaggaaagaaact
cttctgcaatgctctaggctgctggaactctctctctctctctctctctc
tctctctctctctctctctctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_122464884_122466040
seq2: B6Ng01-286C20.b_42_1198 (reverse)

seq1  CACAGCAAGCACTTTACCCACTGAGCCATCGCTCCAGAGGTCAGTAACTG  50
      |||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||| ||||||||||
seq2  CACAGCAAGCACTTAACC--ATGAG-CATCGCTCCAGAGTTCAGTAACTG  47

seq1  CATGCA-TCATTTCTTCATCGTCATCAAGGCCCAT--GTTTTTATCACGA  97
      |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||
seq2  CATGCATTCATTTCTTCATCGTCATCAAAGCCCATTGTTTTTTATCACGA  97

seq1  CTCCC-TTCTTCAGCTGGAACAGCTTAACAAAGTCAGACACACATTTCCA  146
      ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTTTCTTCAGCTG--ACAGCTTAACAAAGTCAGACACACATTTCCA  145

seq1  GAAAGTGTAACTCTGTCTCCCTGTGTGCACCGAAAGAAT-ATAGATTGGC  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GAAAGTGTAACTCTGTCTCCCTGTGTGCACCGAAAGAATAATAGATTGGC  195

seq1  ATCAGCACCAGATGTTGGCAGAGACTCAGGGAATACAAGGCAGGCAGGCC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCACCAGATGTTGGCAGAGACTCAGGGAATACAAGGCAGGCAGGCC  245

seq1  TCAGTCCTCACAGAGCTGTCACTCCTATGAAAGGAGACAAACCTAAGCTG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCCTCACAGAGCTGTCACTCCTATGAAAGGAGACAAACCTAAGCTG  295

seq1  GTGGTCCTCATCTTGGGTTGGTAACACCTGTCCGGAGGGATACTACCTAT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCCTCATCTTGGGTTGGTAACACCTGTCCGGAGGGATACTACCTAT  345

seq1  CTAAGGGGGACATGAGGATCTGAATGTAAAACTTTTATGAAGCCTTGCTG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGGGGACATGAGGATCTGAATGTAAAACTTTTATGAAGCCTTGCTG  395

seq1  GATGCAGTGCATCATAGGGAATGAGGAATTTCGCTTTCTGTATTATGAAT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCAGTGCATCATAGGGAATGAGGAATTTCGCTTTCTGTATTATGAAT  445

seq1  GTGTTATCAGTTGGCTTCCTGCTCAGGCCAGTTGCTACGATATCTTCCTT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTATCAGTTGGCTTCCTGCTCAGGCCAGTTGCTACGATATCTTCCTT  495

seq1  GCCATTATGGACTCCCCTTCTGGAGCCATAAGTCAGGCCAGAATAAACTC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATTATGGACTCCCCTTCTGGAGCCATAAGTCAGGCCAGAATAAACTC  545

seq1  TTTCTTTTATAGGTTCTTTTGGTCATGGTATTTTATCAGAGCAACAGAAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTTATAGGTTCTTTTGGTCATGGTATTTTATCAGAGCAACAGAAA  595

seq1  GTAACTGGCAACTCACCCTCCTATTAAGTGGGGTCAAAACCATGGAAATC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACTGGCAACTCACCCTCCTATTAAGTGGGGTCAAAACCATGGAAATC  645

seq1  TGCATGCCCGGTAATGAGACTTTCTCTCCTGTGTGCTAAATATCTGCCTC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGCCCGGTAATGAGACTTTCTCTCCTGTGTGCTAAATATCTGCCTC  695

seq1  ACTCCAAATGTCACCTTACACCCTGGCTGAGAACACTGTGGGAGACACAT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAAATGTCACCTTACACCCTGGCTGAGAACACTGTGGGAGACACAT  745

seq1  GATGAAACAGGAAGCTCCCGTGTCAGGACAGACACTTCAGAAGAAAAAGA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAAACAGGAAGCTCCCGTGTCAGGACAGACACTTCAGAAGAAAAAGA  795

seq1  TCGTGGTACCAAGATAAGGGACAAGATGGAACTGATTCCACCTGTGTGAC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTGGTACCAAGATAAGGGACAAGATGGAACTGATTCCACCTGTGTGAC  845

seq1  TGGGGAGGGCAAACAGTGGCTCTCCCAGAAGCTGCACCACCTCTTTGTAA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGAGGGCAAACAGTGGCTCTCCCAGAAGCTGCACCACCTCTTTGTAA  895

seq1  CACTTCCGCAAACCCACCAACGTTTCCTTACTTAGAAACACATCCTTGCA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCCGCAAACCCACCAACGTTTCCTTACTTAGAAACACATCCTTGCA  945

seq1  GCTGTGGTAACAATCTTTGAAGCTCAGGATCTTACATGAGGAGATACATC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGGTAACAATCTTTGAAGCTCAGGATCTTACATGAGGAGATACATC  995

seq1  TTGGCCTAGGTGGCCTTGAACCCAGAATTATATGCCGTTATAAGATAAAG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCCTAGGTGGCCTTGAACCCAGAATTATATGCCGTTATAAGATAAAG  1045

seq1  ATGAATAAATAACCTGGGAGAGACAGGAGAGGAGGGGACACACTCCGGTG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATAAATAACCTGGGAGAGACAGGAGAGGAGGGGACACACTCCGGTG  1095

seq1  ATGTGAGTGAGGCGTCGGTAAGTCAAAGAAGGCTTCAGAACAGGGAGAAA  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGAGTGAGGCGTCGGTAAGTCAAAGAAGGCTTCAGAACAGGGAGAAA  1145

seq1  CTAAATGAATTC  1157
      ||||||||||||
seq2  CTAAATGAATTC  1157

seq1: chr7_122371097_122371571
seq2: B6Ng01-286C20.g_67_541

seq1  GAATTCCTCTTGGTTTGGGTTCCCACTGCTCTGCTACAACTGGCTTACCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCTTGGTTTGGGTTCCCACTGCTCTGCTACAACTGGCTTACCC  50

seq1  ATAGCTACTGTTTCTTTTGTTGAAAGCAAGATGCACAGTGTTGGGGGTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTACTGTTTCTTTTGTTGAAAGCAAGATGCACAGTGTTGGGGGTGG  100

seq1  ATAAGCAAGGGGGCAAGGTGCCCTATGTTGACCATACAGACAAAGCCTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCAAGGGGGCAAGGTGCCCTATGTTGACCATACAGACAAAGCCTGG  150

seq1  GTGAGAGGGCAGTGGGTTAGAACATAGCTGGAAACTAACAGTGCTTCCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGAGGGCAGTGGGTTAGAACATAGCTGGAAACTAACAGTGCTTCCAA  200

seq1  CCCTCCTACTCCTGTCTGTTTGGCTTGGGGGCCCACCCCTACCCCATGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCTACTCCTGTCTGTTTGGCTTGGGGGCCCACCCCTACCCCATGCA  250

seq1  CCTCTGAGCAACTCTCTATCTCTGCAAAGCTTATTATATGAGGATGATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGAGCAACTCTCTATCTCTGCAAAGCTTATTATATGAGGATGATGC  300

seq1  AGTTTTCTTATCCACCTTGATTGGGTTGGAAAGGCTTGTTTACCAGGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTCTTATCCACCTTGATTGGGTTGGAAAGGCTTGTTTACCAGGAAA  350

seq1  GAAACTCTTCTGCAATGCTCTAGGCTGCTGGAACTCTCTCTCTCTCTCTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTCTTCTGCAATGCTCTAGGCTGCTGGAACTCTCTCTCTCTCTCTC  400

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTG  450
      |||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTG  450

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  475
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  475