BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-295G04
Chromosome7 (Build37)
Map Location 103,634,691 - 103,748,465
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOdz4
Upstream geneFrda-ps, EG666836, LOC670727, LOC666858
Downstream geneNars2, Gab2, LOC100040457, Usp35, EG622320, Alg8, Ndufc2, Thrsp, Kctd14, Ints4, 1810020D17Rik, Rsf1, LOC622994
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-295G04.bB6Ng01-295G04.g
ACCGA091262GA091263
length1,1161,068
definitionB6Ng01-295G04.b B6Ng01-295G04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(103,747,353 - 103,748,465)(103,634,691 - 103,635,767)
sequence
gaattcccatctgtctcttgtctcttcaggatgctcactttcaactccct
tcatttcattcacaaagcactcttccaccccaattcttgcttccttatta
tttgagtgaatatttattaaccacctactggatgtcatgttctgtgctat
gtacaaattctttggtagccgttgagagcacaaagacaagacactgcggt
cagcgttaggttcacagactggggagaaaagcctgagggagaggtgagtg
tgcagacagtggcctgtgagaatttgagattggaaaggaggagggcacac
aaaggaccttcctcaaactgggatccccagagaagtgagatagtggcatc
ttagaagaagatcactgatgtgtctgtgaattggggacataaacatgaaa
ggtaaagataggtgtgaaggtggaacagagacctataagcacaggaatag
ctgttgccatttcttactgcattatcctgattctgtgccagctgtatagc
attgtgaggactgtaagactcagtcatcttttcatatacctatagctcat
ctctcgtacccagaatctaatacttccttattaaacaaaacagccaatca
tagcccatatgtaatgcaaaacaaagctcccagtctgccaggatagactt
cactaggttttgtgagtgatacaaagaatcaagagactcccccaccccca
ctgctagcaacagtggctgggactagtctctcagctcggtttaatcatca
attaacactgcagcaagactgaacactaattttacagacattaaaataaa
atataaaataaaaacaacaaaaaaatgctattagaaatttcttcccaaac
gttacactcatgttgttaattctgttttaatattaactatctcatttggg
aaattatatctcaataatggaaaggttatctctactgtaagataaagaat
gagaaagactcacaggcttcaacttgaccatttgaatttctgccactgga
gctgtggtctcatttacgacccacaaactgattaaaatatcagccagcat
gaacatagctttacagcttcagcttcttcttccacctcatcccccaaagc
cctttaaaaccttaga
gaattcactgggacatcgtgcataacatcagtttctgatttataaaccat
agaaggcatgctattcttattgtattcacctccccagatcatacaagagg
cccaagagtcacttctcactgagaatctaatgttacattccatatcccaa
gagtcttatatcttctgaagtttatctttgtagcaacagcagaaaggtgg
tatggtccatgctaatatccagatgaggacctggaggctccttgcaggaa
ataaaaagtcactaaggccttagagttggcatgccagagctaaggatcaa
acccagtggtcttatgccaagacaacatcttgcctgtttctgcagtctct
tgtggtctgacgaactttgaagaaggaaatcattgttgcttccttgtaga
accaaaattgtcagatgcagaaagctgagcttgtgctgctagcaggcatc
ttatttgtcaaaactatacaaaggtgaatttgcctcctgtggatgttgca
cattcacagcacatcctcagaaaatccacagcattaaatagacattaagg
atgtaggtgctgtgctcatagagtctgtgtgagccaaaaacaaattctga
ggccagaggaggctatggaccaggtcagttgtgcttttctggaaaaataa
agggtaggagaaagactattctgctcttccttataacctggcctggtaag
aggacactggttagaaatgtaacggtagtccaattaagttcaaaatacct
cgggtacttattagcttgaccactgctgggatgcagtgatagaaaggcag
tctctggccttgtatagttcagaataatggatccaagatattgaacccac
caatacaggacagtgttaggtgattataagagaaagaaaatggctatgga
ttctagtgaaggtaaatcaaaagagaaatgtagaagtgatagaggctcat
gagaaaaggcctcagggtggatatagacctaagacaataatagagagctc
ttccaggcagctcacacatgagcagagtactgagagctgtgtcatctata
ccagtaatgcctgatgtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_103747353_103748465
seq2: B6Ng01-295G04.b_49_1164 (reverse)

seq1  TCTAAGGTTTTAAA-GGCTTTGGGGGATGAGGTGG-AGAAGAAGCTG-AG  47
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
seq2  TCTAAGGTTTTAAAGGGCTTTGGGGGATGAGGTGGAAGAAGAAGCTGAAG  50

seq1  CTGT-AAGCTATTGTTCATGCTTGGCTGATA-TTTAATCAGTTTGTTGGG  95
      |||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  CTGTAAAGCTA-TGTTCATGC-TGGCTGATATTTTAATCAGTTTG-TGGG  97

seq1  TCGTAATTGAGACCACAGCTCCAGTGGCAGAAATTCAAATGGTCAAGTTG  145
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTAAATGAGACCACAGCTCCAGTGGCAGAAATTCAAATGGTCAAGTTG  147

seq1  AAGCCTGTGAGTCTTTCTCATTCTTTATCTTACAGTAGAGATAACCTTTC  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTGTGAGTCTTTCTCATTCTTTATCTTACAGTAGAGATAACCTTTC  197

seq1  CATTATTGAGATATAATTT-CCAAATGAGATAGTTAATATTAAAACAGAA  244
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATTGAGATATAATTTCCCAAATGAGATAGTTAATATTAAAACAGAA  247

seq1  TTAACAACATGAGTGTAACGTTTGGGAAGAAATTTCTAATAGCATTTTTT  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACAACATGAGTGTAACGTTTGGGAAGAAATTTCTAATAGCATTTTTT  297

seq1  TGTTGTTTTTATTTTATATTTTATTTTAATGTCTGTAAAATTAGTGTTCA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTTTTTATTTTATATTTTATTTTAATGTCTGTAAAATTAGTGTTCA  347

seq1  GTCTTGCTGCAGTGTTAATTGATGATTAAACCGAGCTGAGAGACTAGTCC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGCTGCAGTGTTAATTGATGATTAAACCGAGCTGAGAGACTAGTCC  397

seq1  CAGCCACTGTTGCTAGCAGTGGGGGTGGGGGAGTCTCTTGATTCTTTGTA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCACTGTTGCTAGCAGTGGGGGTGGGGGAGTCTCTTGATTCTTTGTA  447

seq1  TCACTCACAAAACCTAGTGAAGTCTATCCTGGCAGACTGGGAGCTTTGTT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTCACAAAACCTAGTGAAGTCTATCCTGGCAGACTGGGAGCTTTGTT  497

seq1  TTGCATTACATATGGGCTATGATTGGCTGTTTTGTTTAATAAGGAAGTAT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCATTACATATGGGCTATGATTGGCTGTTTTGTTTAATAAGGAAGTAT  547

seq1  TAGATTCTGGGTACGAGAGATGAGCTATAGGTATATGAAAAGATGACTGA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTCTGGGTACGAGAGATGAGCTATAGGTATATGAAAAGATGACTGA  597

seq1  GTCTTACAGTCCTCACAATGCTATACAGCTGGCACAGAATCAGGATAATG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTACAGTCCTCACAATGCTATACAGCTGGCACAGAATCAGGATAATG  647

seq1  CAGTAAGAAATGGCAACAGCTATTCCTGTGCTTATAGGTCTCTGTTCCAC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAGAAATGGCAACAGCTATTCCTGTGCTTATAGGTCTCTGTTCCAC  697

seq1  CTTCACACCTATCTTTACCTTTCATGTTTATGTCCCCAATTCACAGACAC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACACCTATCTTTACCTTTCATGTTTATGTCCCCAATTCACAGACAC  747

seq1  ATCAGTGATCTTCTTCTAAGATGCCACTATCTCACTTCTCTGGGGATCCC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGTGATCTTCTTCTAAGATGCCACTATCTCACTTCTCTGGGGATCCC  797

seq1  AGTTTGAGGAAGGTCCTTTGTGTGCCCTCCTCCTTTCCAATCTCAAATTC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGAGGAAGGTCCTTTGTGTGCCCTCCTCCTTTCCAATCTCAAATTC  847

seq1  TCACAGGCCACTGTCTGCACACTCACCTCTCCCTCAGGCTTTTCTCCCCA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGGCCACTGTCTGCACACTCACCTCTCCCTCAGGCTTTTCTCCCCA  897

seq1  GTCTGTGAACCTAACGCTGACCGCAGTGTCTTGTCTTTGTGCTCTCAACG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTGAACCTAACGCTGACCGCAGTGTCTTGTCTTTGTGCTCTCAACG  947

seq1  GCTACCAAAGAATTTGTACATAGCACAGAACATGACATCCAGTAGGTGGT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACCAAAGAATTTGTACATAGCACAGAACATGACATCCAGTAGGTGGT  997

seq1  TAATAAATATTCACTCAAATAATAAGGAAGCAAGAATTGGGGTGGAAGAG  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAAATATTCACTCAAATAATAAGGAAGCAAGAATTGGGGTGGAAGAG  1047

seq1  TGCTTTGTGAATGAAATGAAGGGAGTTGAAAGTGAGCATCCTGAAGAGAC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTGTGAATGAAATGAAGGGAGTTGAAAGTGAGCATCCTGAAGAGAC  1097

seq1  AAGAGACAGATGGGAATTC  1113
      |||||||||||||||||||
seq2  AAGAGACAGATGGGAATTC  1116

seq1: chr7_103634691_103635767
seq2: B6Ng01-295G04.g_68_1135

seq1  GAATTCACTGGGACATCGTGCATAACATCAGTTTCTGATTTATAAACCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGGGACATCGTGCATAACATCAGTTTCTGATTTATAAACCAT  50

seq1  AGAAGGCATGCTATTCTTATTGTATTCACCTCCCCAGATCATACAAGAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGCATGCTATTCTTATTGTATTCACCTCCCCAGATCATACAAGAGG  100

seq1  CCCAAGAGTCACTTCTCACTGAGAATCTAATGTTACATTCCATATCCCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGAGTCACTTCTCACTGAGAATCTAATGTTACATTCCATATCCCAA  150

seq1  GAGTCTTATATCTTCTGAAGTTTATCTTTGTAGCAACAGCAGAAAGGTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTTATATCTTCTGAAGTTTATCTTTGTAGCAACAGCAGAAAGGTGG  200

seq1  TATGGTCCATGCTAATATCCAGATGAGGACCTGGAGGCTCCTTGCAGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGTCCATGCTAATATCCAGATGAGGACCTGGAGGCTCCTTGCAGGAA  250

seq1  ATAAAAAGTCACTAAGGCCTTAGAGTTGGCATGCCAGAGCTAAGGATCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAAGTCACTAAGGCCTTAGAGTTGGCATGCCAGAGCTAAGGATCAA  300

seq1  ACCCAGTGGTCTTATGCCAAGACAACATCTTGCCTGTTTCTGCAGTCTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGTGGTCTTATGCCAAGACAACATCTTGCCTGTTTCTGCAGTCTCT  350

seq1  TGTGGTCTGACGAACTTTGAAGAAGGAAATCATTGTTGCTTCCTTGTAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTCTGACGAACTTTGAAGAAGGAAATCATTGTTGCTTCCTTGTAGA  400

seq1  ACCAAAATTGTCAGATGCAGAAAGCTGAGCTTGTGCTGCTAGCAGGCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAAATTGTCAGATGCAGAAAGCTGAGCTTGTGCTGCTAGCAGGCATC  450

seq1  TTATTTGTCAAAACTATACAAAGGTGAATTTGCCTCCTGTGGATGTTGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTGTCAAAACTATACAAAGGTGAATTTGCCTCCTGTGGATGTTGCA  500

seq1  CATTCACAGCACATCCTCAGAAAATCCACAGCATTAAATAGACATTAAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCACAGCACATCCTCAGAAAATCCACAGCATTAAATAGACATTAAGG  550

seq1  ATGTAGGTGCTGTGCTCATAGAGTCTGTGTGAGCCAAAAACAAATTCTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGGTGCTGTGCTCATAGAGTCTGTGTGAGCCAAAAACAAATTCTGA  600

seq1  GGCCAGAGGAGGCTATGGACCAGGTCAGTTGTGCTTTTCTGGAAAAATAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGAGGAGGCTATGGACCAGGTCAGTTGTGCTTTTCTGGAAAAATAA  650

seq1  AGGGTAGGAGAAAGACTATTCTGCTCTTCCTTATAACCTGGCCTGGTAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTAGGAGAAAGACTATTCTGCTCTTCCTTATAACCTGGCCTGGTAAG  700

seq1  AGGACACTGGTTAGAAATGTAACGGTAGTCCAATTAAGTTCAAAATACCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACACTGGTTAGAAATGTAACGGTAGTCCAATTAAGTTCAAAATACCT  750

seq1  CGGGTACTTATTAGCTTGACCACTGCTGGGATGCAGTGATAGAAAGGCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGTACTTATTAGCTTGACCACTGCTGGGATGCAGTGATAGAAAGGCAG  800

seq1  TCTCTGGCCTTGTATAGTTCAGAATAATGGATCCAAGATATTGAACCCAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGGCCTTGTATAGTTCAGAATAATGGATCCAAGATATTGAACCCAC  850

seq1  CAATACAGGACAGTGTTAGGTGATTATAAGAGAAAGAAAATGGCTATGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATACAGGACAGTGTTAGGTGATTATAAGAGAAAGAAAATGGCTATGGA  900

seq1  TTCTAGTGAAGGTAAATCAAAAGAGAAATGTAGAAGTGATAGAGGCTCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGTGAAGGTAAATCAAAAGAGAAATGTAGAAGTGATAGAGGCTCAT  950

seq1  GAG-AAAGGCCTCAGGGGTGGATAATAGACCTAAGACAATAATAGAGAGC  999
      ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAAGGCCTCA-GGGTGGAT-ATAGACCTAAGACAATAATAGAGAGC  998

seq1  TCCTTCCAGGCAGGCTCACAACATGAGCAGAGTACCTGAGAGCTGGTGGC  1049
      | |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||   | 
seq2  T-CTTCCAGGCA-GCTCAC-ACATGAGCAGAGTA-CTGAGAGCTG--TGT  1042

seq1  CATCTATACCAAGTAAATGGCTGATGTC  1077
      |||||||||| ||| |||| ||||||||
seq2  CATCTATACC-AGT-AATGCCTGATGTC  1068