BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-302I14
Chromosome7 (Build37)
Map Location 81,824,901 - 81,966,763
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG665641
Upstream geneLOC244061, A830073O21Rik, St8sia2, LOC100042127, LOC100042140, LOC546979, Slco3a1, EG665308
Downstream gene0610006L08Rik, Sv2b, 1500012K07Rik, LOC100042171, Akap13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-302I14.bB6Ng01-302I14.g
ACCGA096559GA096560
length1,1531,065
definitionB6Ng01-302I14.b B6Ng01-302I14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,965,611 - 81,966,763)(81,824,901 - 81,825,959)
sequence
gaattctcacttcacttgacctcttagagcctccttccttattcatgaaa
ctgagatagggaatagctaaaagttaaataaatttcactagctgtcatca
catgagcaaaatggcataatgcctactgccatgattgacactgatagtat
gacagaacaacttaagtctcagtggctgaacacagggaaagcttatatct
gtgtcatacagactagataagagagtgtgtgtagcccagatctaatcagt
gtttcagtgattcaagataacacacctactttccagtgtgtgtctccatc
atcctctaagttcagtcaccaactgggaagaggagactggaagaaagacc
agttggggagaaaggatgaaccagtatggaccacttttgctcagaggtgt
gtagttactggagtccattctttccttagagagaacccatcaccacgtgc
aggggtggaaaatactgtgtagtcatgtatccaggaaggcaaggagaaca
tatgatatggaaggctttttagtcacagtcgtatctgtcctggaaagctg
agctgagaatcaggttaatgtcttatgctaaacagccagctgatacatag
tttgtttgtttgttgttgttgttgttattaatttgtctcagagttttgtt
agtgtgaggaggtaccatgaccatggcaactcttgtaaaggaaagcattt
aattggggctgatttatagttcagaagtttagttcattgtcattatggca
ggaaccatggtggcatgcagacagacatgatgctggagagtagttgagag
ttctatatccaaatctgcaggaatcaggaagagagaaaggcactagactt
gtcttgggcatctgaagcctcaaagcccagtcccagtaacagacttcctc
caagtccatgcctactccaacaaggtcacctatcctaatcctttcaaaga
gtgccactctctggtggtcaagcattcaaacctatgagcctatgacagcc
attttttattcaaccaccacaatgttatccattaaagataggcagtgtag
catgtataaattatagcattcattggtatgcacctcatgactgaaggtaa
gcagtaagcttttagagtgtgaccccataagaaacttcaaggtctaggct
acc

gaattcaccttgtttacattttatccctagtgtacctagtacccctagta
cttaggtacattgatttagaaattgaaagtggttgcaaaacaaagaatga
gatggatggaaacaggacagctttcttaggatagacaagagctggtagcc
aagaaaggcattggttgcttcttcctatcatacgtatttctagctaagct
ctcgctgggcagctctgagccacatggctacacaggggccacaacctccc
ctggtgtcactccccatttcctatagcatcatcactgtcttattcatgaa
tggtgagcttcctccacagcagccagtgatagaaagtgtggtctccggga
gagacctattcattgatgtaagattcaagggtccatggctaggcaacctt
agtgtttacatcccagaggagacaactcattcagatgacacagataggta
taaagaagactagtaaatgtaatctagtatctttcccagaatgcctgact
catcccctgatctttgctttagaaagctctagcacggattcccttgctcc
ttggatgtggatggggatgtccagtatgatggcatggtagctttgcagga
gagaagcaagagggaaggacatgaaattgttctcttctctgctttagctg
tgtttcatctacctctttctcttcattgtcctgactttccaacatgatac
ccacacagggtttggtttactggcctatcataacattcttgccttttatc
catctcttcctaggataggggtacctgtctggttttactggtctctggat
cacctcatttcatgtttgcctattcagggagtcagcatgtctcagtaggt
aaaagtgcttacgatcaagccagataatctgtgttcaatacccaagactc
acataatagaagaagataactaactcccataaaaccatattctgactttc
cacttggaactccatttgtgctggttagtttttttacatgagctgaagtt
tttagggaagagggaatctcaactcagaactgcccctccactagatgact
ggtgatgtgttttct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_81965611_81966763
seq2: B6Ng01-302I14.b_47_1199 (reverse)

seq1  GGTAGCCTTAGA-CTTG-AGTTTCTTATGGGG-CACACTCTAAAAACCTA  47
      ||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| || 
seq2  GGTAGCC-TAGACCTTGAAGTTTCTTATGGGGTCACACTCT-AAAAGCTT  48

seq1  ACTCCCTTACC-TCAGTCATGGAGGTGCATAACAATGATTGCTAT-ATTT  95
      |||  |||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||
seq2  ACT-GCTTACCTTCAGTCAT-GAGGTGCATACCAATGAATGCTATAATTT  96

seq1  ATACATGCTAACACTGCCTATCTTT-ATGGATAAACATTGTGGTGGTTTG  144
      ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||
seq2  ATACATGCT-ACACTGCCTATCTTTAATGGAT-AACATTGTGGTGG-TTG  143

seq1  AAT-AAAAATGGCTGTCATAGGCTCATAGGTTTGAATGCTTGACCACCAG  193
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAAAATGGCTGTCATAGGCTCATAGGTTTGAATGCTTGACCACCAG  193

seq1  AGAGTGGCACTCTTTGAAGGGATTAGGATAGGTGACCTTGTTGGAGTAGG  243
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGGCACTCTTTGAAAGGATTAGGATAGGTGACCTTGTTGGAGTAGG  243

seq1  CATGGACTTGGAGGAAGTCTGTTACTGGGACTGGGCTTTGAGGCTTCAGA  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGACTTGGAGGAAGTCTGTTACTGGGACTGGGCTTTGAGGCTTCAGA  293

seq1  TGCCCAAGACAAGTCTAGTGCCTTTCTCTCTTCCTGATTCCTGCAGATTT  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAAGACAAGTCTAGTGCCTTTCTCTCTTCCTGATTCCTGCAGATTT  343

seq1  GGATATAGAACTCTCAACTACTCTCCAGCATCATGTCTGTCTGCATGCCA  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATAGAACTCTCAACTACTCTCCAGCATCATGTCTGTCTGCATGCCA  393

seq1  CCATGGTTCCTGCCATAATGACAATGAACTAAACTTCTGAACTATAAATC  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGTTCCTGCCATAATGACAATGAACTAAACTTCTGAACTATAAATC  443

seq1  AGCCCCAATTAAATGCTTTCCTTTACAAGAGTTGCCATGGTCATGGTACC  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCAATTAAATGCTTTCCTTTACAAGAGTTGCCATGGTCATGGTACC  493

seq1  TCCTCACACTAACAAAACTCTGAGACAAATTAATAACAACAACAACAACA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCACACTAACAAAACTCTGAGACAAATTAATAACAACAACAACAACA  543

seq1  AACAAACAAACTATGTATCAGCTGGCTGTTTAGCATAAGACATTAACCTG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAACAAACTATGTATCAGCTGGCTGTTTAGCATAAGACATTAACCTG  593

seq1  ATTCTCAGCTCAGCTTTCCAGGACAGATACGACTGTGACTAAAAAGCCTT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTCAGCTCAGCTTTCCAGGACAGATACGACTGTGACTAAAAAGCCTT  643

seq1  CCATATCATATGTTCTCCTTGCCTTCCTGGATACATGACTACACAGTATT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATCATATGTTCTCCTTGCCTTCCTGGATACATGACTACACAGTATT  693

seq1  TTCCACCCCTGCACGTGGTGATGGGTTCTCTCTAAGGAAAGAATGGACTC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACCCCTGCACGTGGTGATGGGTTCTCTCTAAGGAAAGAATGGACTC  743

seq1  CAGTAACTACACACCTCTGAGCAAAAGTGGTCCATACTGGTTCATCCTTT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAACTACACACCTCTGAGCAAAAGTGGTCCATACTGGTTCATCCTTT  793

seq1  CTCCCCAACTGGTCTTTCTTCCAGTCTCCTCTTCCCAGTTGGTGACTGAA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCAACTGGTCTTTCTTCCAGTCTCCTCTTCCCAGTTGGTGACTGAA  843

seq1  CTTAGAGGATGATGGAGACACACACTGGAAAGTAGGTGTGTTATCTTGAA  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAGGATGATGGAGACACACACTGGAAAGTAGGTGTGTTATCTTGAA  893

seq1  TCACTGAAACACTGATTAGATCTGGGCTACACACACTCTCTTATCTAGTC  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGAAACACTGATTAGATCTGGGCTACACACACTCTCTTATCTAGTC  943

seq1  TGTATGACACAGATATAAGCTTTCCCTGTGTTCAGCCACTGAGACTTAAG  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGACACAGATATAAGCTTTCCCTGTGTTCAGCCACTGAGACTTAAG  993

seq1  TTGTTCTGTCATACTATCAGTGTCAATCATGGCAGTAGGCATTATGCCAT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCTGTCATACTATCAGTGTCAATCATGGCAGTAGGCATTATGCCAT  1043

seq1  TTTGCTCATGTGATGACAGCTAGTGAAATTTATTTAACTTTTAGCTATTC  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTCATGTGATGACAGCTAGTGAAATTTATTTAACTTTTAGCTATTC  1093

seq1  CCTATCTCAGTTTCATGAATAAGGAAGGAGGCTCTAAGAGGTCAAGTGAA  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATCTCAGTTTCATGAATAAGGAAGGAGGCTCTAAGAGGTCAAGTGAA  1143

seq1  GTGAGAATTC  1153
      ||||||||||
seq2  GTGAGAATTC  1153


seq1: chr7_81824901_81825959
seq2: B6Ng01-302I14.g_67_1131

seq1  GAATTCACCTTGTTTACATTTTATCCCTAGTGTACCTAGTACCCCTAGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCTTGTTTACATTTTATCCCTAGTGTACCTAGTACCCCTAGTA  50

seq1  CTTAGGTACATTGATTTAGAAATTGAAAGTGGTTGCAAAACAAAGAATGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGGTACATTGATTTAGAAATTGAAAGTGGTTGCAAAACAAAGAATGA  100

seq1  GATGGATGGAAACAGGACAGCTTTCTTAGGATAGACAAGAGCTGGTAGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGATGGAAACAGGACAGCTTTCTTAGGATAGACAAGAGCTGGTAGCC  150

seq1  AAGAAAGGCATTGGTTGCTTCTTCCTATCATACGTATTTCTAGCTAAGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGGCATTGGTTGCTTCTTCCTATCATACGTATTTCTAGCTAAGCT  200

seq1  CTCGCTGGGCAGCTCTGAGCCACATGGCTACACAGGGGCCACAACCTCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGCTGGGCAGCTCTGAGCCACATGGCTACACAGGGGCCACAACCTCCC  250

seq1  CTGGTGTCACTCCCCATTTCCTATAGCATCATCACTGTCTTATTCATGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGTCACTCCCCATTTCCTATAGCATCATCACTGTCTTATTCATGAA  300

seq1  TGGTGAGCTTCCTCCACAGCAGCCAGTGATAGAAAGTGTGGTCTCCGGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGAGCTTCCTCCACAGCAGCCAGTGATAGAAAGTGTGGTCTCCGGGA  350

seq1  GAGACCTATTCATTGATGTAAGATTCAAGGGTCCATGGCTAGGCAACCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCTATTCATTGATGTAAGATTCAAGGGTCCATGGCTAGGCAACCTT  400

seq1  AGTGTTTACATCCCAGAGGAGACAACTCATTCAGATGACACAGATAGGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTACATCCCAGAGGAGACAACTCATTCAGATGACACAGATAGGTA  450

seq1  TAAAGAAGACTAGTAAATGTAATCTAGTATCTTTCCCAGAATGCCTGACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAAGACTAGTAAATGTAATCTAGTATCTTTCCCAGAATGCCTGACT  500

seq1  CATCCCCTGATCTTTGCTTTAGAAAGCTCTAGCACGGATTCCCTTGCTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCCTGATCTTTGCTTTAGAAAGCTCTAGCACGGATTCCCTTGCTCC  550

seq1  TTGGATGTGGATGGGGATGTCCAGTATGATGGCATGGTAGCTTTGCAGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATGTGGATGGGGATGTCCAGTATGATGGCATGGTAGCTTTGCAGGA  600

seq1  GAGAAGCAAGAGGGAAGGACATGAAATTGTTCTCTTCTCTGCTTTAGCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGCAAGAGGGAAGGACATGAAATTGTTCTCTTCTCTGCTTTAGCTG  650

seq1  TGTTTCATCTACCTCTTTCTCTTCATTGTCCTGACTTTCCAACATGATAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCATCTACCTCTTTCTCTTCATTGTCCTGACTTTCCAACATGATAC  700

seq1  CCACACAGGGTTTGGTTTACTGGCCTATCATAACATTCTTGCCTTTTATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACAGGGTTTGGTTTACTGGCCTATCATAACATTCTTGCCTTTTATC  750

seq1  CATCTCTTCCTAGGATAGGGGTACCTGTCTGGTTTTACTGGTCTCTGGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCTTCCTAGGATAGGGGTACCTGTCTGGTTTTACTGGTCTCTGGAT  800

seq1  CACCTCATTTCATGTTTGCCTATTCAGGGAGTCAGCATGTCTCAGTAGGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTCATTTCATGTTTGCCTATTCAGGGAGTCAGCATGTCTCAGTAGGT  850

seq1  AAAAGTGCTTACGATCAAGCCAGATAATCTGTGTTCAATACCCAAGACTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTGCTTACGATCAAGCCAGATAATCTGTGTTCAATACCCAAGACTC  900

seq1  ACATAATAGAAGAAGATAACTAACTCCCAT-AAACCATATTCTGAC-TTC  948
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
seq2  ACATAATAGAAGAAGATAACTAACTCCCATAAAACCATATTCTGACTTTC  950

seq1  CACTT-GAACTCCA-TTGTGCTGGTTAG-TTTTTTACATGAGCTGAAGTT  995
      ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGAACTCCATTTGTGCTGGTTAGTTTTTTTACATGAGCTGAAGTT  1000

seq1  TTTA-GGAAGAGGGAATCTCAACTCAGGAACTGCCC--TCACTAGATTGG  1042
      |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| || 
seq2  TTTAGGGAAGAGGGAATCTCAACTCA-GAACTGCCCCTCCACTAGA-TGA  1048

seq1  CCTGTGATGTGTTTTCT  1059
      |  ||||||||||||||
seq2  CTGGTGATGTGTTTTCT  1065


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |