BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-302P16
Chromosome7 (Build37)
Map Location 28,857,546 - 28,981,164
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043774, 9530053A07Rik, Fbl, Dyrk1b
Upstream geneCyp2f2, Gm1450, Egln2, Rab4b, Mia1, Snrpa, Itpkc, Adck4, Numbl, Ltbp4, Shkbp1, Spnb4, Blvrb, EG668045, Sertad3, Sertad1, Prx, Hipk4, Pld3, 2310022A10Rik, Akt2, Ttc9b, Map3k10, C030039L03Rik, Zfp60, LOC100043229, LOC100043233, 4933426I21Rik, Zfp59, 4732475C15Rik, Prkcz2, 1700049G17Rik, EG668175, LOC100043771, Zfp780b, C130069I09Rik, LOC100043772, Psmc4
Downstream geneEid2, LOC434156, BC089491, Dll3, Timm50, Supt5h, Rps16, Plekhg2, Zfp36, Ixl, Paf1, Samd4b, 1700085B13Rik, Gmfg, Lrfn1, LOC624672, 1700028B04Rik, EG330496, Il28, Sycn, 1190020J12Rik, Pak4, C330005M16Rik, Fbxo27, Fbxo17, Mrps12, Sars2, EG624918, Nfkbib, Sirt2, 5830482F20Rik, Hnrpl, Ech1, Lgals4, Lgals7, Capn12, Actn4, Eif3s12, Map4k1, Ryr1, Rasgrp4, 1110006G06Rik, Spred3, Ggn, Psmd8, A230107C01Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-302P16.bB6Ng01-302P16.g
ACCGA096892GA096893
length1,1881,148
definitionB6Ng01-302P16.b B6Ng01-302P16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(28,857,546 - 28,858,724)(28,980,022 - 28,981,164)
sequence
gaattcccagcccgagaacagcagtctctgcctcttcatcttcagtctgt
cagagagcactgctgtgtctctatcctcagccaggtcaatgacacctcac
agaaggtcacaggggagtcagtcatggtcaacaccagtgctaaagcagag
atgactgcagtggcacttcccagcatgcagtagtgggtcagagtggacca
ccctatctctaagcccggcacagcagagctaacattgctctggcctgtgg
gagccctgggcacagagtactttgtgctcacattcccagcatctctgacc
aatacgcaaaggagtttgctgtggtggctggcagagcaggtgcctcagtt
actatgggcttgaaggcagcggtgacattccagggcactgtccatccagc
tggtggtgtcataagtgtgacgctgcagccttctgaagtagttcagttac
agagcacagcagatctttctggatcaagggtaacagccagcggcccagtg
gctgtttttgttggtcacagttgtgcctacaagcacacaaattgtaaccg
tgtggtggagcaactgctacccacatctgcttggggaacacactatgtag
tccccactctagcctcccagtcccattgtaggcacccaggccacagagct
aatcatgggggctatcattggttcccagggtctccagggtaacatggttg
agggtcatctccagggtgaatggccaactgggtcattctacctgtctgga
gatgtgggcatcaggttgtgctgtttggcacaggggccataaaggatcaa
gtgactggtgagccttatctagtcctgatcccagataaagcatcctacca
cccggcttgtgtgatcataaatatgccaggcactgagggtgtggccctgc
tggttatacatacaaaggctaccagtgagctaaccattagatgggcaggc
attgggggtcggaactcaacatgagccagctgtgcaaggcagagagtttc
ttttgcagaagttggaccttgggcactactgacatatgcacacagccaag
gcccctaccagctttgggctgctcacctgtggctggccaggctgttgggg
tgtgggacaaagcctgccatgttgacaagaagtgagaatggtactgaatc
cttgcctggcctctggaaatggccttccccatacctct
gaattcctttttcttcaggacaactgaagacaaaggaaagttttagccgc
tggtgaaggaaggcactgaagctcttcctaaagggagaagtcaaaaaaaa
aaaccagagctccaaggaagaaagtggttaaaggcacgcccagaggccca
ggatgcctgcctttctatctgaaaaaggcttgagcctggtcataggcgca
ggcctggagacccagcaggctgggaggtggaagcaggagagtcaggggtc
aaggtcaaactacagtgagtctgaggtaaagctgggctccccagccttgc
cttctctcttttttttttcagacaggtctcactgtgtagcgcccaggtgc
cctggaactctctctatagatccaggctggacctgaattcagagctctgc
ctgcttctagctcccaaatgctgggattaaaggctgatccactatacctg
gcttttaaatagtatcttttgtgtatgaatgttctgcctgcatatatgca
tgtgtgcctggtgactatagaggtcagcagagggcattggagtctctgga
actaaagttatggatggctgtgagccgccacataaagagctgaagctctg
tcctctatagagcatcaagtactcttaattgcctagctgtctctccagct
ccaagactcctgtcttaaacaaaacaggtgataagtttaaactccagatg
ccttattgagagcctgttccaaggtgactgaatcttgtctatggtatggc
tgagtctccaggcccaggccctatccccagcacatcttctgggaagacta
agcagtaactgaacacaagcctacaaaggctcaagcctgtgcctggcttg
gggaagctactgtgacatggtcggcagttattggtatactttgggcttct
gaaaccaggctggcctcaaaacttgtgatcatctgcctctcaagtgctgg
gacaggtctgtgtcacacactggtcattctaagaatggatcaatggccat
actgacagctcatggtcaccaacttgcttgtcctcacagccagactccca
cagtgggcagacttgtatgtcgccaacaccccagaagaatcctgttcagc
tactctgatgctgtgaacacacagcgagccttgaactctaggcaggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_28857546_28858724
seq2: B6Ng01-302P16.b_49_1236

seq1  GAATTCCCAGCCCGAGAACAGCAGTCTCTGCCTCTTCATCTTCAGTCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAGCCCGAGAACAGCAGTCTCTGCCTCTTCATCTTCAGTCTGT  50

seq1  CAGAGAGCACTGCTGTGTCTCTATCCTCAGCCAGGTCAATGACACCTCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGCACTGCTGTGTCTCTATCCTCAGCCAGGTCAATGACACCTCAC  100

seq1  AGAAGGTCACAGGGGAGTCAGTCATGGTCAACACCAGTGCTAAAGCAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGTCACAGGGGAGTCAGTCATGGTCAACACCAGTGCTAAAGCAGAG  150

seq1  ATGACTGCAGTGGCACTTCCCAGCATGCAGTAGTGGGTCAGAGTGGACCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTGCAGTGGCACTTCCCAGCATGCAGTAGTGGGTCAGAGTGGACCA  200

seq1  CCCTATCTCTAAGCCCGGCACAGCAGAGCTAACATTGCTCTGGCCTGTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTATCTCTAAGCCCGGCACAGCAGAGCTAACATTGCTCTGGCCTGTGG  250

seq1  GAGCCCTGGGCACAGAGTACTTTGTGCTCACATTCCCAGCATCTCTGACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCCTGGGCACAGAGTACTTTGTGCTCACATTCCCAGCATCTCTGACC  300

seq1  AATACGCAAAGGAGTTTGCTGTGGTGGCTGGCAGAGCAGGTGCCTCAGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACGCAAAGGAGTTTGCTGTGGTGGCTGGCAGAGCAGGTGCCTCAGTT  350

seq1  ACTATGGGCTTGAAGGCAGCGGTGACATTCCAGGGCACTGTCCATCCAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGGGCTTGAAGGCAGCGGTGACATTCCAGGGCACTGTCCATCCAGC  400

seq1  TGGTGGTGTCATAAGTGTGACGCTGCAGCCTTCTGAAGTAGTTCAGTTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGTGTCATAAGTGTGACGCTGCAGCCTTCTGAAGTAGTTCAGTTAC  450

seq1  AGAGCACAGCAGATCTTTCTGGATCAAGGGTAACAGCCAGCGGCCCAGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCACAGCAGATCTTTCTGGATCAAGGGTAACAGCCAGCGGCCCAGTG  500

seq1  GCTGTTTTTGTTGGTCACAGTTGTGCCTACAAGCACACAAATTGTAACCG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTTTTTGTTGGTCACAGTTGTGCCTACAAGCACACAAATTGTAACCG  550

seq1  TGTGGTGGAGCAACTGCTACCCACATCTGCTTGGGGAACACACTATGTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTGGAGCAACTGCTACCCACATCTGCTTGGGGAACACACTATGTAG  600

seq1  TCCCCACTCTAGCCTCCCAGTCCCATTGTAGGCACCCAGGCCACAGAGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCACTCTAGCCTCCCAGTCCCATTGTAGGCACCCAGGCCACAGAGCT  650

seq1  AATCATGGGGGCTATCATTGGTTCCCAGGGTCTCCAGGGTAACATGGTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCATGGGGGCTATCATTGGTTCCCAGGGTCTCCAGGGTAACATGGTTG  700

seq1  AGGGTCATCTCCAGGGTGAATGGCCAACTGGGTCATTCTACCTGTCTGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTCATCTCCAGGGTGAATGGCCAACTGGGTCATTCTACCTGTCTGGA  750

seq1  GATGTGGGCATCAGGTTGTGCTGTTTGGCACAGGGGCCATAAAGGATCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGGGCATCAGGTTGTGCTGTTTGGCACAGGGGCCATAAAGGATCAA  800

seq1  GTGACTGGTGAGCCTTATCTAGTCCTGATCCCAGATAAAGCATCCTACCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTGGTGAGCCTTATCTAGTCCTGATCCCAGATAAAGCATCCTACCA  850

seq1  CCCGGCTTGTGTGATCATAAATATGCCAGGCACTGAGGGTGTGGCCCTGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGGCTTGTGTGATCATAAATATGCCAGGCACTGAGGGTGTGGCCCTGC  900

seq1  TGGTTATACATACAAAGGCTACCAGTGAGCTAACCA-TAGATGGGCAGGC  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGGTTATACATACAAAGGCTACCAGTGAGCTAACCATTAGATGGGCAGGC  950

seq1  ATTGGGGGTC-GAACTC-ACATGAG-CAGCTGTGCAAGGCAGAGAGTT--  994
      |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  
seq2  ATTGGGGGTCGGAACTCAACATGAGCCAGCTGTGCAAGGCAGAGAGTTTC  1000

seq1  CTTTGCAGAAG-TGGACCTT-GGCACTACTGACAATATGCACACAGCCAA  1042
       |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TTTTGCAGAAGTTGGACCTTGGGCACTACTGAC-ATATGCACACAGCCAA  1049

seq1  GGCCCCTACCAGCTTTGGGCTGCTCACCTGTGGGCTGGCCCAGGCTG-TG  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||
seq2  GGCCCCTACCAGCTTTGGGCTGCTCACCTGT-GGCTGG-CCAGGCTGTTG  1097

seq1  GGGTGTGGGACAAAAGCTGC--TGGTGGCCAG-AGTGAGAGATAGGAAAT  1138
      ||||||||||||||  ||||  || || | || ||||||| || || | |
seq2  GGGTGTGGGACAAAGCCTGCCATGTTGACAAGAAGTGAGA-AT-GGTACT  1145

seq1  GATCCCTTGCCTTGGCCTCTGGCCAT-GCCTTCCC--TACCTCT  1179
      ||  ||||||| ||||||||||  || ||||||||  |||||||
seq2  GAATCCTTGCC-TGGCCTCTGGAAATGGCCTTCCCCATACCTCT  1188

seq1: chr7_28980022_28981164
seq2: B6Ng01-302P16.g_66_1213 (reverse)

seq1  TCCCTGCCTAGAG-TCAGGGCTCTGCTGTGTG-TCACAGCATCCAGAGTA  48
      ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||
seq2  TCCCTGCCTAGAGTTCAAGGCTC-GCTGTGTGTTCACAGCAT-CAGAGTA  48

seq1  GCTG-ACA-GATTC-TCT-GGGTGTTGGCCACATTACAAGTCTG-CCACT  93
      |||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||
seq2  GCTGAACAGGATTCTTCTGGGGTGTTGGCGACA-TACAAGTCTGCCCACT  97

seq1  GT-GGAGTCTGGCTGTGAGGAC-AGCAAGTTGGTGACCATGAGCTGTCAG  141
      || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAGTCTGGCTGTGAGGACAAGCAAGTTGGTGACCATGAGCTGTCAG  147

seq1  TATGGCCATTTGATCCA-TCTTAGAATGACCAGTGTGGTGACACAGACCT  190
      |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TATGGCCA-TTGATCCATTCTTAGAATGACCAGTGT-GTGACACAGACCT  195

seq1  GTCCCAGCACTTGAGAGGCAGATGATCACAAGTTTTGAGGCCAGCCTGGT  240
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAGCACTTGAGAGGCAGATGATCACAAGTTTTGAGGCCAGCCTGGT  245

seq1  TTCAGAAGCCCAAAGTATACCAATAACTGCCGACCATGTCACAGTAGCTT  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAAGCCCAAAGTATACCAATAACTGCCGACCATGTCACAGTAGCTT  295

seq1  CCCCAAGCCAGGCACAGGCTTGAGCCTTTGTAGGCTTGTGTTCAGTTACT  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAAGCCAGGCACAGGCTTGAGCCTTTGTAGGCTTGTGTTCAGTTACT  345

seq1  GCTTAGTCTTCCCAGAAGATGTGCTGGGGATAGGGCCTGGGCCTGGAGAC  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAGTCTTCCCAGAAGATGTGCTGGGGATAGGGCCTGGGCCTGGAGAC  395

seq1  TCAGCCATACCATAGACAAGATTCAGTCACCTTGGAACAGGCTCTCAATA  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCCATACCATAGACAAGATTCAGTCACCTTGGAACAGGCTCTCAATA  445

seq1  AGGCATCTGGAGTTTAAACTTATCACCTGTTTTGTTTAAGACAGGAGTCT  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATCTGGAGTTTAAACTTATCACCTGTTTTGTTTAAGACAGGAGTCT  495

seq1  TGGAGCTGGAGAGACAGCTAGGCAATTAAGAGTACTTGATGCTCTATAGA  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCTGGAGAGACAGCTAGGCAATTAAGAGTACTTGATGCTCTATAGA  545

seq1  GGACAGAGCTTCAGCTCTTTATGTGGCGGCTCACAGCCATCCATAACTTT  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGAGCTTCAGCTCTTTATGTGGCGGCTCACAGCCATCCATAACTTT  595

seq1  AGTTCCAGAGACTCCAATGCCCTCTGCTGACCTCTATAGTCACCAGGCAC  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCAGAGACTCCAATGCCCTCTGCTGACCTCTATAGTCACCAGGCAC  645

seq1  ACATGCATATATGCAGGCAGAACATTCATACACAAAAGATACTATTTAAA  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCATATATGCAGGCAGAACATTCATACACAAAAGATACTATTTAAA  695

seq1  AGCCAGGTATAGTGGATCAGCCTTTAATCCCAGCATTTGGGAGCTAGAAG  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGGTATAGTGGATCAGCCTTTAATCCCAGCATTTGGGAGCTAGAAG  745

seq1  CAGGCAGAGCTCTGAATTCAGGTCCAGCCTGGATCTATAGAGAGAGTTCC  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCAGAGCTCTGAATTCAGGTCCAGCCTGGATCTATAGAGAGAGTTCC  795

seq1  AGGGCACCTGGGCGCTACACAGTGAGACCTGTCTGAAAAAAAAAAGAGAG  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCACCTGGGCGCTACACAGTGAGACCTGTCTGAAAAAAAAAAGAGAG  845

seq1  AAGGCAAGGCTGGGGAGCCCAGCTTTACCTCAGACTCACTGTAGTTTGAC  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAAGGCTGGGGAGCCCAGCTTTACCTCAGACTCACTGTAGTTTGAC  895

seq1  CTTGACCCCTGACTCTCCTGCTTCCACCTCCCAGCCTGCTGGGTCTCCAG  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGACCCCTGACTCTCCTGCTTCCACCTCCCAGCCTGCTGGGTCTCCAG  945

seq1  GCCTGCGCCTATGACCAGGCTCAAGCCTTTTTCAGATAGAAAGGCAGGCA  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGCGCCTATGACCAGGCTCAAGCCTTTTTCAGATAGAAAGGCAGGCA  995

seq1  TCCTGGGCCTCTGGGCGTGCCTTTAACCACTTTCTTCCTTGGAGCTCTGG  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGGCCTCTGGGCGTGCCTTTAACCACTTTCTTCCTTGGAGCTCTGG  1045

seq1  TTTTTTTTTTTGACTTCTCCCTTTAGGAAGAGCTTCAGTGCCTTCCTTCA  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTTTGACTTCTCCCTTTAGGAAGAGCTTCAGTGCCTTCCTTCA  1095

seq1  CCAGCGGCTAAAACTTTCCTTTGTCTTCAGTTGTCCTGAAGAAAAAGGAA  1140
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCGGCTAAAACTTTCCTTTGTCTTCAGTTGTCCTGAAGAAAAAGGAA  1145

seq1  TTC  1143
      |||
seq2  TTC  1148