BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-307G02
Chromosome7 (Build37)
Map Location 145,107,517 - 145,215,562
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC435235
Upstream geneMgmt, EG621804, Ebf3, 9430038I01Rik, Txnl2
Downstream geneTcerg1l, LOC100043290, Mapk1ip1, Ppp2r2d, Bnip3, EG668784, LOC669185, 6330417G02Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-307G02.bB6Ng01-307G02.g
ACCGA100168GA100169
length1,1561,078
definitionB6Ng01-307G02.b B6Ng01-307G02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(145,214,422 - 145,215,562)(145,107,517 - 145,108,589)
sequence
gaattcaccttctaagttcaaaataccagtaatgctactgcagcatcttc
tcaggttttcttgtgccatcgatgctgtctgccatatcgctgtgtctcct
acacagcctccagctataacgccatgcctgtttagctgtattccccacaa
gcccagtcatttgtgtatcccttgtgtttgcaggtaaaaactttaacaca
ggcaggaaacttgtatactctacctttgtttagtggagtacaaccccagg
accctgagatataagagtgttcctgcccaatgctctgtctgtgaagcttg
agagctacatgtaaccttctaagaacagaggcagttaaatgacgcccatc
ccacttcctaatgacaacctctatcaatgttaacactaatatacgtcttt
cctcctatggcctatggactagaaaccatgggtatgagggtgaaatttgt
tttaacagaattaaacatatctctgtgttgtacgtgttttaagcttaact
tcactaaaaccaagcagaaaagtggtgggatctaggagcgctaggtaggc
atctgcattcttcattgtttgcttcacaatggagccttctgagatttaaa
gtcagagacctgagaagccaagcttccctacctgtgttgaaatttaactc
agagatgagacactcacgcctctggaaggagagatttagaagcatggcgt
tttggtcactcatttcctgacgtctgttggtgtgggcattctgattgtta
ctgccagagttgataaaacactcgctcatggcccgagactctcccggctt
cttatccttcttatcagagctgtaggcagaaggattggcgctcaccatga
aagcttccatcccacagatttctcatgctgggcaactccattttttattc
atctcttgacttccaaaattcagcagtaagataaatatttcagatatgtg
gaggtgtttctgggttctttcatacccttttaacactctctgccacgggt
aacatttcagaaattgcttttcatgatcactttccactgatctactttgg
tagcagaaaagttgaccaaggaagtttatcaccatcttgtagtgttctgt
gttccatttgtccctgtaccattcgttcagtgaaagactggtctatgatc
acagat
gaattccaggacagccaagagaaaccctgtctcaaaaaaccaagagagag
agagagagagagagagagagagagagagattgatccatgtccccttccat
ataggtggcccacagcagaactgacaccatgcatagtctgactgagggaa
taggggaagtgtgctgacctgagggatcatgggaagttgaccccatgagg
tctctatcatagccttctactcatcctctttgtggggagatacctgtcct
tattattgtgagatctaggtcagctagctagagtctggaatcttcattgc
cgatgatggcagagaaacagggggcaatggcagcattctttatttgacct
tgggttcttcagaccaaatccttcatacatgtgacctactttccctcctg
tgtggggcttggattcaggaggtgagtcaggtacgggtcaggacaaaaga
gatgtgaacaggactccaaggcctcctccctctgtggccccatgccctca
tggactgatgcagtgtttcccccccccccccaaacttaataggaaccagg
aagctatgctccctgaccaaatattgccctattttgtgtggcatcaagct
gaggatgtttgtcactatgttggctttcacagaaaactcacactgagccc
tggtttgtgtcccaggaatctccagcttggttgaaactctcttctatctt
ccattgccattcattggccgtacatttctacaccctggagaggtgtcagt
ggacaggagggataactacaggcagataggcttccaaggagctttgagag
gcctggagccctgctgtgtagagcatgtggtgtgacatgttggctccacc
tttggcaggacacagtaggagaagggaaatattagcattcatgtgggcct
ctgcttacctctgcatctgggaaaaccctttcttttgaaagccctagagt
gaaggaacagaaattgccaagaaaattctgactggaaaagtaggcttgtt
aatgactgaaagcacacctttaacacctatctctcttcctgtttgttaag
gtgcagctttgccacagaacagcagcag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_145214422_145215562
seq2: B6Ng01-307G02.b_47_1202 (reverse)

seq1  ATCTG-GATCATAGA-CAGTCTTCCACTGAAAGGAAATGTACAGAGACAA  48
      ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || |||  |||||| |||||
seq2  ATCTGTGATCATAGACCAGTCTTTCACTG-AACGAATGGTACAGGGACAA  49

seq1  --TGAACACAG-ACACCTC-AGATTGTTATAA--CTCCCTGGTC-ACTTT  91
         |||||||| ||||  | |||| || ||||   ||| ||||| |||||
seq2  ATGGAACACAGAACACTACAAGATGGTGATAAACTTCCTTGGTCAACTTT  99

seq1  TCTGCTACCAAAGTAGA-CAGTGGGAAGTGATCATG-AAAGC-ATTTCTG  138
      ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||
seq2  TCTGCTACCAAAGTAGATCAGTGGAAAGTGATCATGAAAAGCAATTTCTG  149

seq1  -AATG-TACCCGTGGCAGAGAGTGTT-AAAGGGTATGAAAGAACCCAGAA  185
       |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTTACCCGTGGCAGAGAGTGTTAAAAGGGTATGAAAGAACCCAGAA  199

seq1  ACACCTCCACATATCCTGAAATATTTATCTTACTGCTGAATTTTGGAAGT  235
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTCCACATAT-CTGAAATATTTATCTTACTGCTGAATTTTGGAAGT  248

seq1  CAAGAGATGAAT-AAAAATGGAGTTGCCCAGCATGAGAAATCTGTGGGAT  284
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGATGAATAAAAAATGGAGTTGCCCAGCATGAGAAATCTGTGGGAT  298

seq1  GGAAGC-TTCATGGTGAGCGCCAATCCTTCTGCCTACAGCTCTGATAAGA  333
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCTTTCATGGTGAGCGCCAATCCTTCTGCCTACAGCTCTGATAAGA  348

seq1  AGGATAAGAAGCCGGGAGAGTCTCGGGCCATGAGCGAGTGTTTTATCAAC  383
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATAAGAAGCCGGGAGAGTCTCGGGCCATGAGCGAGTGTTTTATCAAC  398

seq1  TCTGGCAGTAACAATCAGAATGCCCACACCAACAGACGTCAGGAAATGAG  433
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCAGTAACAATCAGAATGCCCACACCAACAGACGTCAGGAAATGAG  448

seq1  TGACCAAAACGCCATGCTTCTAAATCTCTCCTTCCAGAGGCGTGAGTGTC  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCAAAACGCCATGCTTCTAAATCTCTCCTTCCAGAGGCGTGAGTGTC  498

seq1  TCATCTCTGAGTTAAATTTCAACACAGGTAGGGAAGCTTGGCTTCTCAGG  533
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTCTGAGTTAAATTTCAACACAGGTAGGGAAGCTTGGCTTCTCAGG  548

seq1  TCTCTGACTTTAAATCTCAGAAGGCTCCATTGTGAAGCAAACAATGAAGA  583
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGACTTTAAATCTCAGAAGGCTCCATTGTGAAGCAAACAATGAAGA  598

seq1  ATGCAGATGCCTACCTAGCGCTCCTAGATCCCACCACTTTTCTGCTTGGT  633
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGATGCCTACCTAGCGCTCCTAGATCCCACCACTTTTCTGCTTGGT  648

seq1  TTTAGTGAAGTTAAGCTTAAAACACGTACAACACAGAGATATGTTTAATT  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTGAAGTTAAGCTTAAAACACGTACAACACAGAGATATGTTTAATT  698

seq1  CTGTTAAAACAAATTTCACCCTCATACCCATGGTTTCTAGTCCATAGGCC  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTAAAACAAATTTCACCCTCATACCCATGGTTTCTAGTCCATAGGCC  748

seq1  ATAGGAGGAAAGACGTATATTAGTGTTAACATTGATAGAGGTTGTCATTA  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGAGGAAAGACGTATATTAGTGTTAACATTGATAGAGGTTGTCATTA  798

seq1  GGAAGTGGGATGGGCGTCATTTAACTGCCTCTGTTCTTAGAAGGTTACAT  833
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTGGGATGGGCGTCATTTAACTGCCTCTGTTCTTAGAAGGTTACAT  848

seq1  GTAGCTCTCAAGCTTCACAGACAGAGCATTGGGCAGGAACACTCTTATAT  883
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTCTCAAGCTTCACAGACAGAGCATTGGGCAGGAACACTCTTATAT  898

seq1  CTCAGGGTCCTGGGGTTGTACTCCACTAAACAAAGGTAGAGTATACAAGT  933
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGGTCCTGGGGTTGTACTCCACTAAACAAAGGTAGAGTATACAAGT  948

seq1  TTCCTGCCTGTGTTAAAGTTTTTACCTGCAAACACAAGGGATACACAAAT  983
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGCCTGTGTTAAAGTTTTTACCTGCAAACACAAGGGATACACAAAT  998

seq1  GACTGGGCTTGTGGGGAATACAGCTAAACAGGCATGGCGTTATAGCTGGA  1033
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGGGCTTGTGGGGAATACAGCTAAACAGGCATGGCGTTATAGCTGGA  1048

seq1  GGCTGTGTAGGAGACACAGCGATATGGCAGACAGCATCGATGGCACAAGA  1083
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTGTAGGAGACACAGCGATATGGCAGACAGCATCGATGGCACAAGA  1098

seq1  AAACCTGAGAAGATGCTGCAGTAGCATTACTGGTATTTTGAACTTAGAAG  1133
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTGAGAAGATGCTGCAGTAGCATTACTGGTATTTTGAACTTAGAAG  1148

seq1  GTGAATTC  1141
      ||||||||
seq2  GTGAATTC  1156

seq1: chr7_145107517_145108589
seq2: B6Ng01-307G02.g_63_1140

seq1  GAATTCCAGGACAGCCAAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACCAAGAGAGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGACAGCCAAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACCAAGAGAGAG  50

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGATCCATGTCCCCTTCCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGATCCATGTCCCCTTCCAT  100

seq1  ATAGGTGGCCCACAGCAGAACTGACACCATGCATAGTCTGACTGAGGGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGTGGCCCACAGCAGAACTGACACCATGCATAGTCTGACTGAGGGAA  150

seq1  TAGGGGAAGTGTGCTGACCTGAGGGATCATGGGAAGTTGACCCCATGAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGGAAGTGTGCTGACCTGAGGGATCATGGGAAGTTGACCCCATGAGG  200

seq1  TCTCTATCATAGCCTTCTACTCATCCTCTTTGTGGGGAGATACCTGTCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTATCATAGCCTTCTACTCATCCTCTTTGTGGGGAGATACCTGTCCT  250

seq1  TATTATTGTGAGATCTAGGTCAGCTAGCTAGAGTCTGGAATCTTCATTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATTGTGAGATCTAGGTCAGCTAGCTAGAGTCTGGAATCTTCATTGC  300

seq1  CGATGATGGCAGAGAAACAGGGGGCAATGGCAGCATTCTTTATTTGACCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATGATGGCAGAGAAACAGGGGGCAATGGCAGCATTCTTTATTTGACCT  350

seq1  TGGGTTCTTCAGACCAAATCCTTCATACATGTGACCTACTTTCCCTCCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTCTTCAGACCAAATCCTTCATACATGTGACCTACTTTCCCTCCTG  400

seq1  TGTGGGGCTTGGATTCAGGAGGTGAGTCAGGTACGGGTCAGGACAAAAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGGCTTGGATTCAGGAGGTGAGTCAGGTACGGGTCAGGACAAAAGA  450

seq1  GATGTGAACAGGACTCCAAGGCCTCCTCCCTCTGTGGCCCCATGCCCTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGAACAGGACTCCAAGGCCTCCTCCCTCTGTGGCCCCATGCCCTCA  500

seq1  TGGACTGATGCAGTGTTTCCCCCCCCCCCCCAAACTTAATAGGAACCAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTGATGCAGTGTTTCCCCCCCCCCCCCAAACTTAATAGGAACCAGG  550

seq1  AAGCTATGCTCCCTGACCAAATATTGCCCTATTTTGTGTGGCATCAAGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTATGCTCCCTGACCAAATATTGCCCTATTTTGTGTGGCATCAAGCT  600

seq1  GAGGATGTTTGTCACTATGTTGGCTTTCACAGAAAACTCACACTGAGCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATGTTTGTCACTATGTTGGCTTTCACAGAAAACTCACACTGAGCCC  650

seq1  TGGTTTGTGTCCCAGGAATCTCCAGCTTGGTTGAAACTCTCTTCTATCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTGTGTCCCAGGAATCTCCAGCTTGGTTGAAACTCTCTTCTATCTT  700

seq1  CCATTGCCATTCATTGGCCGTACATTTCTACACCCTGGAGAGGTGTCAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTGCCATTCATTGGCCGTACATTTCTACACCCTGGAGAGGTGTCAGT  750

seq1  GGACAGGAGGGATAACTACAGGCAGATAGGCTTCCAAGGAGCTTTGAGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGGAGGGATAACTACAGGCAGATAGGCTTCCAAGGAGCTTTGAGAG  800

seq1  GCCTGGAG-CCTGCTGTGTAGAGCATGTGGTGTGACATGTTGGCTCCACC  849
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGAGCCCTGCTGTGTAGAGCATGTGGTGTGACATGTTGGCTCCACC  850

seq1  TTTGGCAGGACACAGTAGGAGAA-GGAAATATTAGCATTCATGT-GGCCT  897
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
seq2  TTTGGCAGGACACAGTAGGAGAAGGGAAATATTAGCATTCATGTGGGCCT  900

seq1  CTGCTTACCTCTGCATCT-GGAAAACCCTTTC-TTTGAAAGCCCTAGAGT  945
      |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CTGCTTACCTCTGCATCTGGGAAAACCCTTTCTTTTGAAAGCCCTAGAGT  950

seq1  G-AGGAACAG-AATTGCCAAG-AAATTCTGACTGG-AAAGTAGGCTTG-T  990
      | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
seq2  GAAGGAACAGAAATTGCCAAGAAAATTCTGACTGGAAAAGTAGGCTTGTT  1000

seq1  AATGACCTTGAAAGCACACCTTAACAACCTATCTCTCCTCCCTGTTTGTT  1040
      ||||||  |||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||| |
seq2  AATGAC--TGAAAGCACACCTTTAACACCTATCTCT-CTTCCTGTTTG-T  1046

seq1  TTAGGTGCCAGCTTTGCCACCAGACAGCAGCAG  1073
      | ||||| ||||||||||||   ||||||||||
seq2  TAAGGTG-CAGCTTTGCCACAGAACAGCAGCAG  1078