BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-307I07
Chromosome7 (Build37)
Map Location 145,405,051 - 145,566,302
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTcerg1l
Upstream geneEbf3, 9430038I01Rik, Txnl2, LOC435235
Downstream geneLOC100043290, Mapk1ip1, Ppp2r2d, Bnip3, EG668784, LOC669185, 6330417G02Rik, Dpysl4, Stk32c, LOC100038956, Lrrc27, Pwwp2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-307I07.bB6Ng01-307I07.g
ACCGA100270GA100271
length1,183930
definitionB6Ng01-307I07.b B6Ng01-307I07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(145,405,051 - 145,406,212)(145,565,372 - 145,566,302)
sequence
gaattcttctttggctagcagcaatttacttttcctttccttgtattctt
ctttgattcttgtcttgacaaactgctcgaatatcttaaaacaaatgcac
ggaagaaaaatcatcatgaaactgaatattagaaattaaatcttgttggc
caaagacagcacagaagcccagcatctgaggaaggtggttctttgtcata
gctacaggatctgtaagcaaagctcccctgcccacaaaaccaagacctct
cagtaacacagccttggacggcccagcgtgctccctccacatgggtggca
cttccagaacaatcctcaatcagcctagctcagggtcttgaagtggattt
ggaaagctctgttgtgctctggaagctgggagcccctttgtctgcactcc
ccccacccccgaacccctgcagcttgaactctgaatgatgtttgcaggac
acatgacctacctgcactcacatcattgttaaagtggcttaatctgctaa
actgacatctatggttctgcaatcagcctctgaatctctaaaaatggcat
gaacttggagatataaagaactctggcatctctgagtcccgcactctagt
ttccaggaagcctcatgtctacatgtgggacccagggacatgaagaaggt
tcgggatgcatgaggggcctctctcaaggatgtcaagtggtatctagatg
gtaccagcgatcagggtagagattacaaaggaggaaacctgacccaaagt
gtattttgaataaccaaatagtaaaccctgttccaagtctagggcatgaa
aatattgtctggtgtgcattgagtatccagcactccagaacaggctgttt
tctcttggaaaccaggtaccgcacaggactatggaacctctctctgctcc
ttcccatagaatgctctctctcattgctgttgcttgtttgtttcccttgt
tcagacagggtgtcatgcattctaaggctgactttgaacatgatgccatg
agcttctgatcctcctgcctccaccctcctggaggggtgagggattgcaa
gtgttatgccaactgttgtcctggccttatgccagtgcctaaggaattgt
caatccatttcatatgtttctgggcaagcaaatctgtccaacctgaatta
catggcacagccctcatgacctctccctttgtc
gaattccaaagctggtgaaccaaatatttgtcttggctgtgtgctccagg
gacacggagttgggagaatttcctcagagtggctttaggggtaagaatac
tgtagagccctaaccagtgttgggagatgccgtggagattatactaaccc
tccttaccctcaaggcgcatctacctttaaagcacagggtttacagtaat
cgtctggtgaccttaggttttccctactcaaatgcaagtacctccatata
aacaatgggtagtctctcctttcccatgcagtgcactgtctcagcacagt
aaggctttttccaaactgtaaatgaaccccgaatgccctttgtttgggtg
agtctgtaccttcattgtttaggactgaggcagactcttagctgtgtgtg
gatcacctcagataccaggggcagagggcattcattccctgatgggagat
ctgcatgagatggatccttgtgagttgtctgttggttccctgaaaggagg
actgaattcagttggaaatagattctagaatttctcatgctcactgagag
agcaagggctggtgagctgtggggatagaatgctatgatcttgaggaaga
gacatccggcagcaatgcaggcgagagaagcaaattcgtgcagaggacca
caacggttacttttcaaatgacatttgtgactgcctctgaaaggtcaaga
tatgaatatggacgaatagagagcagggagaggaaggtgaggtggcaggc
ctgctagcggagcctctttgctttccaccagagcacgagcagactggtgg
ctctggctcccagaaggacctgactcaaagcgcctctggatgttgaagtg
tggagagctgggacacaagtgtagcctgtgtacacatgaaagtacacgga
gaacaagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_145405051_145406212
seq2: B6Ng01-307I07.b_42_1224

seq1  GAATTCTTCTTTGGCTAGCAGCAATTTACTTTTCCTTTCCTTGTATTCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCTTTGGCTAGCAGCAATTTACTTTTCCTTTCCTTGTATTCTT  50

seq1  CTTTGATTCTTGTCTTGACAAACTGCTCGAATATCTTAAAACAAATGCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGATTCTTGTCTTGACAAACTGCTCGAATATCTTAAAACAAATGCAC  100

seq1  GGAAGAAAAATCATCATGAAACTGAATATTAGAAATTAAATCTTGTTGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAAAAATCATCATGAAACTGAATATTAGAAATTAAATCTTGTTGGC  150

seq1  CAAAGACAGCACAGAAGCCCAGCATCTGAGGAAGGTGGTTCTTTGTCATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGACAGCACAGAAGCCCAGCATCTGAGGAAGGTGGTTCTTTGTCATA  200

seq1  GCTACAGGATCTGTAAGCAAAGCTCCCCTGCCCACAAAACCAAGACCTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACAGGATCTGTAAGCAAAGCTCCCCTGCCCACAAAACCAAGACCTCT  250

seq1  CAGTAACACAGCCTTGGACGGCCCAGCGTGCTCCCTCCACATGGGTGGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAACACAGCCTTGGACGGCCCAGCGTGCTCCCTCCACATGGGTGGCA  300

seq1  CTTCCAGAACAATCCTCAATCAGCCTAGCTCAGGGTCTTGAAGTGGATTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAGAACAATCCTCAATCAGCCTAGCTCAGGGTCTTGAAGTGGATTT  350

seq1  GGAAAGCTCTGTTGTGCTCTGGAAGCTGGGAGCCCCTTTGTCTGCACTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGCTCTGTTGTGCTCTGGAAGCTGGGAGCCCCTTTGTCTGCACTCC  400

seq1  CCCCACCCCCGAACCCCTGCAGCTTGAACTCTGAATGATGTTTGCAGGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCACCCCCGAACCCCTGCAGCTTGAACTCTGAATGATGTTTGCAGGAC  450

seq1  ACATGACCTACCTGCACTCACATCATTGTTAAAGTGGCTTAATCTGCTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGACCTACCTGCACTCACATCATTGTTAAAGTGGCTTAATCTGCTAA  500

seq1  ACTGACATCTATGGTTCTGCAATCAGCCTCTGAATCTCTAAAAATGGCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGACATCTATGGTTCTGCAATCAGCCTCTGAATCTCTAAAAATGGCAT  550

seq1  GAACTTGGAGATATAAAGAACTCTGGCATCTCTGAGTCCCGCACTCTAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTGGAGATATAAAGAACTCTGGCATCTCTGAGTCCCGCACTCTAGT  600

seq1  TTCCAGGAAGCCTCATGTCTACATGTGGGACCCAGGGACATGAAGAAGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGGAAGCCTCATGTCTACATGTGGGACCCAGGGACATGAAGAAGGT  650

seq1  TCGGGATGCATGAGGGGCCTCTCTCAAGGATGTCAAGTGGTATCTAGATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGGATGCATGAGGGGCCTCTCTCAAGGATGTCAAGTGGTATCTAGATG  700

seq1  GTACCAGCGATCAGGGTAGAGATTACAAAGGAGGAAACCTGACCCAAAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCAGCGATCAGGGTAGAGATTACAAAGGAGGAAACCTGACCCAAAGT  750

seq1  GTATTTTGAATAACCAAATAGTAAACCCTGTTCCAAGTCTAGGGCATGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTTGAATAACCAAATAGTAAACCCTGTTCCAAGTCTAGGGCATGAA  800

seq1  AATATTGTCTGGTGTGCATTGAGTATCCAGCACTCCAGAACAGGCTGTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTGTCTGGTGTGCATTGAGTATCCAGCACTCCAGAACAGGCTGTTT  850

seq1  TCTCTTGGAAACCAGGTACCGCACAGGACTATGGAACCTCTCTCTGCTCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTGGAAACCAGGTACCGCACAGGACTATGGAACCTCTCTCTGCTCC  900

seq1  TTCCCATAGAATGCTCTCTCTCATTGCTGTTGCTTGTTTGTTTCCCTTGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTCCCATAGAATGCTCTCTCTCATTGCTGTTGCTTGTTTGTTTCCCTTG-  949

seq1  TTCAGACAGGGTGTCATGCATTCT-AGGCTGACTTTGAACATGATGCCAT  999
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGACAGGGTGTCATGCATTCTAAGGCTGACTTTGAACATGATGCCAT  999

seq1  GAGCTTCTGATCCTCCTGCCTCCA-CCTCCTG--AGTGTGA-GGATTGCA  1045
      |||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||||||||
seq2  GAGCTTCTGATCCTCCTGCCTCCACCCTCCTGGAGGGGTGAGGGATTGCA  1049

seq1  AGTG-TATGCC-ACTG-TGT-CTGG-CTTATG-CAGTG-CTAGGGA--TG  1086
      |||| |||||| |||| ||| |||| |||||| ||||| ||| |||  ||
seq2  AGTGTTATGCCAACTGTTGTCCTGGCCTTATGCCAGTGCCTAAGGAATTG  1099

seq1  TC-ATCCAATTCATGT-TTTCTGGGCAAGC-AATCTGTC--AACTGAGTT  1131
      || ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||  | |||| ||
seq2  TCAATCCATTTCATATGTTTCTGGGCAAGCAAATCTGTCCAACCTGAATT  1149

seq1  ACAT-GCACAGCCTCAATG--CTCTCCCTTTGTC  1162
      |||| ||||||||   |||  |||||||||||||
seq2  ACATGGCACAGCCCTCATGACCTCTCCCTTTGTC  1183

seq1: chr7_145565372_145566302
seq2: B6Ng01-307I07.g_64_993 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACACACACTTGTTCTCCGTGTACTTTTCATGTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACTTGTTCTCCGTGTAC-TTTCATGTGT  49

seq1  ACACAGGCTACACTTGTGTCCCAGCTCTCCACACTTCAACATCCAGAGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGGCTACACTTGTGTCCCAGCTCTCCACACTTCAACATCCAGAGGC  99

seq1  GCTTTGAGTCAGGTCCTTCTGGGAGCCAGAGCCACCAGTCTGCTCGTGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGAGTCAGGTCCTTCTGGGAGCCAGAGCCACCAGTCTGCTCGTGCT  149

seq1  CTGGTGGAAAGCAAAGAGGCTCCGCTAGCAGGCCTGCCACCTCACCTTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGGAAAGCAAAGAGGCTCCGCTAGCAGGCCTGCCACCTCACCTTCC  199

seq1  TCTCCCTGCTCTCTATTCGTCCATATTCATATCTTGACCTTTCAGAGGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCTGCTCTCTATTCGTCCATATTCATATCTTGACCTTTCAGAGGCA  249

seq1  GTCACAAATGTCATTTGAAAAGTAACCGTTGTGGTCCTCTGCACGAATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACAAATGTCATTTGAAAAGTAACCGTTGTGGTCCTCTGCACGAATTT  299

seq1  GCTTCTCTCGCCTGCATTGCTGCCGGATGTCTCTTCCTCAAGATCATAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTCTCGCCTGCATTGCTGCCGGATGTCTCTTCCTCAAGATCATAGC  349

seq1  ATTCTATCCCCACAGCTCACCAGCCCTTGCTCTCTCAGTGAGCATGAGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTATCCCCACAGCTCACCAGCCCTTGCTCTCTCAGTGAGCATGAGAA  399

seq1  ATTCTAGAATCTATTTCCAACTGAATTCAGTCCTCCTTTCAGGGAACCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTAGAATCTATTTCCAACTGAATTCAGTCCTCCTTTCAGGGAACCAA  449

seq1  CAGACAACTCACAAGGATCCATCTCATGCAGATCTCCCATCAGGGAATGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACAACTCACAAGGATCCATCTCATGCAGATCTCCCATCAGGGAATGA  499

seq1  ATGCCCTCTGCCCCTGGTATCTGAGGTGATCCACACACAGCTAAGAGTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCCTCTGCCCCTGGTATCTGAGGTGATCCACACACAGCTAAGAGTCT  549

seq1  GCCTCAGTCCTAAACAATGAAGGTACAGACTCACCCAAACAAAGGGCATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCAGTCCTAAACAATGAAGGTACAGACTCACCCAAACAAAGGGCATT  599

seq1  CGGGGTTCATTTACAGTTTGGAAAAAGCCTTACTGTGCTGAGACAGTGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGGTTCATTTACAGTTTGGAAAAAGCCTTACTGTGCTGAGACAGTGCA  649

seq1  CTGCATGGGAAAGGAGAGACTACCCATTGTTTATATGGAGGTACTTGCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATGGGAAAGGAGAGACTACCCATTGTTTATATGGAGGTACTTGCAT  699

seq1  TTGAGTAGGGAAAACCTAAGGTCACCAGACGATTACTGTAAACCCTGTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTAGGGAAAACCTAAGGTCACCAGACGATTACTGTAAACCCTGTGC  749

seq1  TTTAAAGGTAGATGCGCCTTGAGGGTAAGGAGGGTTAGTATAATCTCCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAGGTAGATGCGCCTTGAGGGTAAGGAGGGTTAGTATAATCTCCAC  799

seq1  GGCATCTCCCAACACTGGTTAGGGCTCTACAGTATTCTTACCCCTAAAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATCTCCCAACACTGGTTAGGGCTCTACAGTATTCTTACCCCTAAAGC  849

seq1  CACTCTGAGGAAATTCTCCCAACTCCGTGTCCCTGGAGCACACAGCCAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTGAGGAAATTCTCCCAACTCCGTGTCCCTGGAGCACACAGCCAAG  899

seq1  ACAAATATTTGGTTCACCAGCTTTGGAATTC  931
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATATTTGGTTCACCAGCTTTGGAATTC  930