BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-310G16
Chromosome7 (Build37)
Map Location 98,540,305 - 98,661,250
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlg2
Upstream geneSytl2, Ccdc89, Crebzf, Tmem126a, Tmem126b, B230218P12Rik, LOC666689, LOC621816, LOC100039943
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-310G16.bB6Ng01-310G16.g
ACCGA102399GA102400
length1,2001,128
definitionB6Ng01-310G16.b B6Ng01-310G16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(98,660,042 - 98,661,250)(98,540,305 - 98,541,432)
sequence
gaattcacttgtcatgtaactgttttatatatatgttcatatatatatat
atgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat
atatatatgtgaatggaaatccatagttgaagatcagcctggactacact
gtaaggcctattttaaaacaaaaaaatcaaaacaatgcatattttagttt
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ttattttgccatacattaataagctgagtgaatcccaagtagaaaggttt
gatctcattgactcaaatgaaaatacttattattgtagagtatgccataa
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taacatggtatacttattatatattata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_98660042_98661250
seq2: B6Ng01-310G16.b_45_1244 (reverse)

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      |||||||||   |||||   || ||||||| |||||||||||   |||||
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      |||||||| || | |||||||||| ||||||| |||| || |||||| | 
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       || ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||
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      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TATGCATTTGGGATCTTATTTCTTCATTATAATTTTATCTAAAGGATCTC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CATAGCTTTATCTCAGGAGAATGGCATTTCCCTTTCTTTTTCTTTTGATG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AATTAAAGTTGAAGGGTAGATACTTACTATCTTTATACTAATCACTGCAG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAAGTTGAAGGGTAGATACTTACTATCTTTATACTAATCACTGCAG  637

seq1  CACCATAATCAATGTTTCATTGCATTGGCAATGAAAATAGCAATTAAATT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATAATCAATGTTTCATTGCATTGGCAATGAAAATAGCAATTAAATT  687

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTATTTATTTTACGTATGATCTTTCTATAAAGTTTCAATTTATTAAG  737

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTTTAATTAACAATCTTGAAGATGAATAATTTGTTTCACACCTGTA  837

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAACGGGAACAAACTAAAATATGCATTGTTTTGATTTTTTTGTTTTA  1037

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      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AAATAGGCCTTACAGTGTAGTCCAGGCTGATCTTCAACTATGGATTTCCA  1087

seq1  TTCAC--ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA  1146
      |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA  1137

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATACATATATATATATATGAACATATATATAAAACAGTTACAT  1187

seq1  GACAAGTGAATTC  1209
      |||||||||||||
seq2  GACAAGTGAATTC  1200

seq1: chr7_98540305_98541432
seq2: B6Ng01-310G16.g_67_1194

seq1  GAATTCTGGCTAATATTTTCATTATTCTACTTTGGGGGTTGTCCTTTTAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATATTCTGATTTTAAAATGTGTAGATTAATAATTATTTTAGACATG  100

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GGATGCTAGGGAAGTGCGTTTAGATGGAGGCAGAGCATAGCCTAACAATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCTAGGGAAGTGCGTTTAGATGGAGGCAGAGCATAGCCTAACAATG  300

seq1  AAATAACAGAAATAATAATTTTATATAATCACATAGAAATTATATATGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CAGTACAAATTTGAGAAAAAATATAATTAAATGATGATAAACCACTCCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACAAATTTGAGAAAAAATATAATTAAATGATGATAAACCACTCCCT  400

seq1  TTGGAATGAATTTAAGAACCAGGTAAGGATAGTGCAGTTTAGAAGCATGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAATGAATTTAAGAACCAGGTAAGGATAGTGCAGTTTAGAAGCATGA  450

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGTTTAGGAGACAATGAAAAGTTCTGGGGCTTTTTACAGATGATAA  550

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTGACAATAACAAAACAGTGTGAATTAAAGCAATATAATATCACAT  650

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATATGGCAAGAATGCAAATGTGTATTTAAATATTGTATACTCTTGC  750

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      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
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seq1  AAAAAATTATCTTATGTAATATTATCCTTGTGCAGCGCCATACTAATCTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TTCTGTTTCATTCTTCTTTGAGTATATGGGCTGCTGCAGTAACTACTCAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTTTCATTCTTCTTTGAGTATATGGGCTGCTGCAGTAACTACTCAT  900

seq1  ACATCATATATATATCTAATGATCAATTATATATTTATGTGCTTGAATAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
seq2  TTATTTTGCCATACATTAATAAGCTG-AGTGAATCCCAAGTAGAAAGGTT  999

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      ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | || |||||||||||
seq2  TGATCTCATTGACTC-AAATGAAAATACTTATTATTGT-AGAGTATGCCA  1047

seq1  TAAATCAAGAAGTTAAAATGATATTGATATATATATATATGTATATATAT  1097
      |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
seq2  TAAATCA--GAGTT-AAATGATATTGATATATATATATATGCATATA-AT  1093

seq1  GTATATAT-ACAT-GTATACATA-TATATA-TATA  1128
      |||||||| |||| |||||| || |||||| ||||
seq2  GTATATATAACATGGTATACTTATTATATATTATA  1128