BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-320G17
Chromosome7 (Build37)
Map Location 33,306,775 - 33,429,902
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG384591, LOC668398, EG384596
Upstream geneLOC100043834, LOC546947, LOC677233, LOC100043337, LOC546949, LOC100043836, EG626305, EG668342, EG626330, LOC100043340, LOC100043343, EG626358, LOC668351, EG384593, LOC100043351, LOC100043352, LOC100043353, EG384594, LOC100043838, EG668361, LOC668362, EG624584, LOC100043355, LOC546951, EG626740, EG668371, EG668377, LOC100043842, LOC634929, EG668379, EG668381, LOC668386, LOC626373, EG384589, EG668393, EG330689, LOC100043362, LOC100043365
Downstream geneLOC100043370, LOC434161, EG270499, LOC100043845, LOC100043373, LOC668410, EG624439, LOC100043376, LOC100043379, LOC100043383, EG668411, LOC100043850, LOC100043386, LOC668416, EG668526, LOC100043388, LOC270234, EG668419, EG668422, EG546954, LOC100043856, LOC100043857, EG545947, EG434676, EG668431, Abpd, EG545948, LOC435963, LOC435962, EG626970, LOC100043859, LOC627004, LOC100043398, LOC100043401, Scgb2b1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-320G17.bB6Ng01-320G17.g
ACCGA109789GA109790
length1,153882
definitionB6Ng01-320G17.b B6Ng01-320G17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,428,749 - 33,429,902)(33,306,775 - 33,307,669)
sequence
gaattccaagtcaagggagaacagaattaaaatcaaatataattagcccc
agggctatctataacagccttcttggttttgctgccctcaatttttacta
attaaacattgtgtttggatatatttgtgtcaagctgtaatgtgcttatt
ctatacctgatatcattgaaggaatatacatgaagtcctatgtgttaggt
ttcaaatactgttcaacatgatacataccaggtcccaggagtgagcaagc
ttcagtcacaggatttatagtgatagaccttttgagggggttttatgcag
attacaagagcaacatggctaataacccctctcacatatatgacctccat
agcttatatctccatgcttatgtcaatatatgggtgatggctatataaca
aaggccactttggcaatcatttttgcttccaggcattaagctgtctctat
aggtcacacactccatgaacttcaaggtcttactccaaagtaaatcttct
cccatcgaaggagggagagccagtacctcaaggtctccttcagtgtgagc
tctttaatatatgaagaggatgactttttgtgatggtttgtatatgcttg
gcccagggagtggcactattagtaggtatggctctgttggagtaggtgtg
gtcttgttggagtaggtgtgtcactgtggaaatgggctttaagaattcat
cctagctgtcttaaagccagtattgtgctagcagactttagatgaagatg
tagaactctcagcaactcctgtaccatgtctgcctgaatgctgccatgtt
cctacttttatgataatggactgaacttctgaacctgaaagtcagcccca
attcagtgctgtttttataagagttgccttggtcatggtgtctgttcaca
gttgtaagaccctaactaagacacttttaaaacagagacatgggtgtgat
gtggagatggagcagagactgagggaatgaccaaccataatgggtacaat
ttgagatccatcccatgggcagtatcagtcactcacactattaatgatat
tctatctgcttgcagaacacgagtctaagtacagcctgtctctgagaagt
caaatagcaatctggactcttacaggttcaggcacccacagcttaacagt
gga
gaattcactgaattcgtgggtgacctttagggaaaggaaaaccactaaat
gcctatggacgttcaaactatttacgtttagaagcagatgaatcctaacg
tttcatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat
gccttatatatatgtacatacatatataatttaactcttattatttgtaa
tcaatatattatattatattatattatattataaaatacattataatata
taatattacaatgtaatatatatatatatatatatatatatatatatata
tatatatatatgtaatttaactcttgggcttgaaatgtagctatatgtac
agagttcttgcctaagatgcactagtccctgggtttaatgttcagaactc
aacaaaaatgtgatggtggcataaatctgagtaaccaggacatggaggta
cagattggatgatcagaagttctaagtcatccttagctacatagcacatt
tgagggcaccctgagatacagcaaagctccacttaaaaaattattcttaa
aaatctcacttttggagttaaatgtgttagatgtgttaatggttaagaga
actagctggtcattcagaggactcaggtttattcccagctaccacagggc
tgatcacaacctgctatgataaaaatgacataatccatcataatacacaa
taaaacataatacatgatttgactctctctgccttgggaatttagactga
tatggtgcatgatggaaaaaggaggtgttttggaaatagaaaaataacag
gaccggggaaaggacatagatgaacattacttggggtgatttatggttta
catatattttaggagagagggggggtgaaatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_33428749_33429902
seq2: B6Ng01-320G17.b_48_1200 (reverse)

seq1  TCCACTGTTATGCTGTGGGTGCCTGAACCTGTAAGAGT-CAGA-TGCTAT  48
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||
seq2  TCCACTGTTAAGCTGTGGGTGCCTGAACCTGTAAGAGTCCAGATTGCTAT  50

seq1  TTGGACCTTCTCAGAGGACA-GCTGTAC-TAGACTCGTG-TCTGCAAGCA  95
      |||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||
seq2  TTG--ACTTCTCAGA-GACAGGCTGTACTTAGACTCGTGTTCTGCAAGCA  97

seq1  GATTAGAATATCATTAATAGTGTGAGTGACTGATACTTGCCCATGGGATG  145
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GA-TAGAATATCATTAATAGTGTGAGTGACTGATAC-TGCCCATGGGATG  145

seq1  GATCTCAAATTGTACCCATTATTGGTTGGTCATTCCCTCAGTCTCTGCTC  195
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCAAATTGTACCCATTA-TGGTTGGTCATTCCCTCAGTCTCTGCTC  194

seq1  CATCTCCACATCACACCCATGTCTCTGTTTTAAAAGTGTCTTAGTTAGGG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCCACATCACACCCATGTCTCTGTTTTAAAAGTGTCTTAGTTAGGG  244

seq1  TCTTACAACTGTGAACAGACACCATGACCAAGGCAACTCTTATAAAAACA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACAACTGTGAACAGACACCATGACCAAGGCAACTCTTATAAAAACA  294

seq1  GCACTGAATTGGGGCTGACTTTCAGGTTCAGAAGTTCAGTCCATTATCAT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGAATTGGGGCTGACTTTCAGGTTCAGAAGTTCAGTCCATTATCAT  344

seq1  AAAAGTAGGAACATGGCAGCATTCAGGCAGACATGGTACAGGAGTTGCTG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTAGGAACATGGCAGCATTCAGGCAGACATGGTACAGGAGTTGCTG  394

seq1  AGAGTTCTACATCTTCATCTAAAGTCTGCTAGCACAATACTGGCTTTAAG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTCTACATCTTCATCTAAAGTCTGCTAGCACAATACTGGCTTTAAG  444

seq1  ACAGCTAGGATGAATTCTTAAAGCCCATTTCCACAGTGACACACCTACTC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTAGGATGAATTCTTAAAGCCCATTTCCACAGTGACACACCTACTC  494

seq1  CAACAAGACCACACCTACTCCAACAGAGCCATACCTACTAATAGTGCCAC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAGACCACACCTACTCCAACAGAGCCATACCTACTAATAGTGCCAC  544

seq1  TCCCTGGGCCAAGCATATACAAACCATCACAAAAAGTCATCCTCTTCATA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGGGCCAAGCATATACAAACCATCACAAAAAGTCATCCTCTTCATA  594

seq1  TATTAAAGAGCTCACACTGAAGGAGACCTTGAGGTACTGGCTCTCCCTCC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAAAGAGCTCACACTGAAGGAGACCTTGAGGTACTGGCTCTCCCTCC  644

seq1  TTCGATGGGAGAAGATTTACTTTGGAGTAAGACCTTGAAGTTCATGGAGT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGATGGGAGAAGATTTACTTTGGAGTAAGACCTTGAAGTTCATGGAGT  694

seq1  GTGTGACCTATAGAGACAGCTTAATGCCTGGAAGCAAAAATGATTGCCAA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGACCTATAGAGACAGCTTAATGCCTGGAAGCAAAAATGATTGCCAA  744

seq1  AGTGGCCTTTGTTATATAGCCATCACCCATATATTGACATAAGCATGGAG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGCCTTTGTTATATAGCCATCACCCATATATTGACATAAGCATGGAG  794

seq1  ATATAAGCTATGGAGGTCATATATGTGAGAGGGGTTATTAGCCATGTTGC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAGCTATGGAGGTCATATATGTGAGAGGGGTTATTAGCCATGTTGC  844

seq1  TCTTGTAATCTGCATAAAACCCCCTCAAAAGGTCTATCACTATAAATCCT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTAATCTGCATAAAACCCCCTCAAAAGGTCTATCACTATAAATCCT  894

seq1  GTGACTGAAGCTTGCTCACTCCTGGGACCTGGTATGTATCATGTTGAACA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTGAAGCTTGCTCACTCCTGGGACCTGGTATGTATCATGTTGAACA  944

seq1  GTATTTGAAACCTAACACATAGGACTTCATGTATATTCCTTCAATGATAT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTGAAACCTAACACATAGGACTTCATGTATATTCCTTCAATGATAT  994

seq1  CAGGTATAGAATAAGCACATTACAGCTTGACACAAATATATCCAAACACA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTATAGAATAAGCACATTACAGCTTGACACAAATATATCCAAACACA  1044

seq1  ATGTTTAATTAGTAAAAATTGAGGGCAGCAAAACCAAGAAGGCTGTTATA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTAATTAGTAAAAATTGAGGGCAGCAAAACCAAGAAGGCTGTTATA  1094

seq1  GATAGCCCTGGGGCTAATTATATTTGATTTTAATTCTGTTCTCCCTTGAC  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGCCCTGGGGCTAATTATATTTGATTTTAATTCTGTTCTCCCTTGAC  1144

seq1  TTGGAATTC  1154
      |||||||||
seq2  TTGGAATTC  1153

seq1: chr7_33306775_33307669
seq2: B6Ng01-320G17.g_65_945

seq1  GAATTCACTGAATTCGTGGGTGACCTTTAGGGAAAGGAAAACCACTAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGAATTCGTGGGTGACCTTTAGGGAAAGGAAAACCACTAAAT  50

seq1  GCCTATGGACGTTCAAACTATTTACGTTTAGAAGCAGATGAATCCTAACG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTATGGACGTTCAAACTATTTACGTTTAGAAGCAGATGAATCCTAACG  100

seq1  TTTCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT  150
      ||||                ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTC----------------ATATATATATATATATATATATATATATAT  134

seq1  ATATATATATATATATGCCTTATATATATGTACATACATATATAATTTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATATATATGCCTTATATATATGTACATACATATATAATTTAA  184

seq1  CTCTTATTATTTGTAATCAATATATTATATTATATTATATTATATTATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTATTATTTGTAATCAATATATTATATTATATTATATTATATTATAA  234

seq1  AATACATTATAATATATAATATTACAATGTAATATATATATATATATATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACATTATAATATATAATATTACAATGTAATATATATATATATATATA  284

seq1  TATATATATATATATATATATATATATGTAATTTAACTCTTGGGCTTGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATATATATATATATATGTAATTTAACTCTTGGGCTTGAA  334

seq1  ATGTAGCTATATGTACAGAGTTCTTGCCTAAGATGCACTAGTCCCTGGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGCTATATGTACAGAGTTCTTGCCTAAGATGCACTAGTCCCTGGGT  384

seq1  TTAATGTTCAGAACTCAACAAAAATGTGATGGTGGCATAAATCTGAGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGTTCAGAACTCAACAAAAATGTGATGGTGGCATAAATCTGAGTAA  434

seq1  CCAGGACATGGAGGTACAGATTGGATGATCAGAAGTTCTAAGTCATCCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACATGGAGGTACAGATTGGATGATCAGAAGTTCTAAGTCATCCTT  484

seq1  AGCTACATAGCACATTTGAGGGCACCCTGAGATACAGCAAAGCTCCACTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTACATAGCACATTTGAGGGCACCCTGAGATACAGCAAAGCTCCACTT  534

seq1  AAAAAATTATTCTTAAAAATCTCACTTTTGGAGTTAAATGTGTTAGATGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAATTATTCTTAAAAATCTCACTTTTGGAGTTAAATGTGTTAGATGT  584

seq1  GTTAATGGTTAAGAGAACTAGCTGGTCATTCAGAGGACTCAGGTTTATTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATGGTTAAGAGAACTAGCTGGTCATTCAGAGGACTCAGGTTTATTC  634

seq1  CCAGCTACCACAGGGCTGATCACAACCTGCTATGATAAAAATGACATAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTACCACAGGGCTGATCACAACCTGCTATGATAAAAATGACATAAT  684

seq1  CCATCATAATACACAATAAAACATAATACATGATTTGACTCTCTCTGCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCATAATACACAATAAAACATAATACATGATTTGACTCTCTCTGCCT  734

seq1  TGGGAATTTAGACTGATATGGTGCATGATGGAAAAAGGAGGTGTTTTGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAATTTAGACTGATATGGTGCATGATGGAAAAAGGAGGTGTTTTGGA  784

seq1  AATAGAAAAATAACAGGACCGGGGAAAGGACATAGATGAACATTACTTGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGAAAAATAACAGGACCGGGGAAAGGACATAGATGAACATTACTTGG  834

seq1  GGTGATTTATGGTTTACATATA-TTTAGGAGAGA-GGGGGGTGAAAT  895
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGTGATTTATGGTTTACATATATTTTAGGAGAGAGGGGGGGTGAAAT  881