BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-330O19
Chromosome7 (Build37)
Map Location 125,597,587 - 125,734,670
singlet/doubletdoublet
Overlap geneE030018N11Rik, Coq7, Tmc7
Upstream geneXylt1, LOC669758, Rps15a, Arl6ip1, 2610207I05Rik, LOC100043339, Syt17, LOC100042845
Downstream geneB230311B06Rik, Tmc5, Mir16, 6330503K22Rik, 9030624J02Rik, 2310008H09Rik, Iqck, Gprc5b, Gpr139, LOC100042871, Gp2, Umod, 1700007B13Rik, C730027J19Rik, Acsm2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-330O19.bB6Ng01-330O19.g
ACCGA117437GA117438
length1,0211,068
definitionB6Ng01-330O19.b B6Ng01-330O19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,733,693 - 125,734,670)(125,597,587 - 125,598,649)
sequence
gaattccaataccagtaaaatgaatgaatgagtaatagttattgagcaat
ctctgagagaaagagtctcccctcctccatccattaattcccacaagcct
aatgaacttcttggtgatctgccatgaccacagaccattcctaccatggg
acttacgttctgttgtactggggtaggctgacagccacaataatgccaca
attaccaggaaggcaagctgttaaagaatggtaaatgccacaagagaagg
aggcctagagaagagggtcaagggtcaaggagggtagggaatgcatgcag
gtctgccaggaaaaaggccaggtgtgttatttgtcttattgctgtggtca
aaatgtataacaatgaaggaggaaagagttgcttgggctcatggtttcaa
agggatttcagcccaccacggtagactggcatggtagactgacacggtag
actggcacggtagactggcatggtaggctggcatggtaggctggcatggt
agactagactggcatggtagactagactggcatggtagactggcatggta
gactggcatgtagtggtaggagggagtagctcagtcacgtagtgattgtc
ttagttagggttttactgctgtgagcagacaccatgaccaaggcaactct
tataaaggacaatatttaactggggctatcttacaggtttagaggttcag
tccattatcatgaaggtgggagcatggtagcatccaggcaggcatggtac
aggagaagctgagaggctacatcttcatctgacagctgcttgctacaaga
aagcttgtttccaggcagctaggataaggatttttttttttttttttttg
agaacagggtttctctgtgtagcccctggctgtcctgaaaactcactttg
gtagacgaggctgggctctaaactcagaaatccgcctgcctcttgcctcc
caagtgctggaattaaaggcttatgccatcttgctcgcttaggataagga
tccttaaatgctcatgaccac
gaattctatccctcctaatgcagggtctctgggaactggtatccagttcc
tctggtggtgcctctgccatctccagctcttaagatgagccagccatttc
cttagagcaccaagccctgtggggcagaagcatccacataataacagtct
tcagaagggaattaggggtgggagtgcagtctctggccgtagactacctg
ttatcattgaaaagtgcccggatggcagaaacagctgttgccacccatcg
ggccacacagcttctggtttagttactatcgattctggccattctcactg
atgaaacctgttgcccaagtcccttttaattctatggcatataaaacatg
tccttcacctgttccctgtatcccttcctgggctgtgtttctacccagaa
tgcctgggcagtaagaaagctcaaagctaattaaacggatagtctgaaac
agggtccccagacctcaagctatgctgcatacccatcagaattctctggt
ccccatctttgccagggacaagagttctgtcttgcctgtctaatgatttg
tgaccagaggcgacaagccatttcacctctgtgaacctcggttttccttg
tctgcaaaatgaatattatacactttggtgccagtgctggagagaactct
agccacttaggacaaatccacaaaacatggctcaccaggagtggttccct
tttttcccctcagagcatgtatttagcctggggcctcctgctttatttta
tgcttggaaggtggagtatgtatgtcaaggaggaaggaggaaccacatgg
aggttgaaattccaactgctctcatcagctagcctgcctgcaagtcacca
ctcacctctcccctcactgtgagacccaggatgcatctctctgtgggcct
cagccttctcctcagtgaatggggtcaaaatcagttgcttcatggcagga
agcaccctgccctccctgattgatgcatagagtaactgtatttatcccat
agcacttgtatcaggccctcagaagttcctcagtaatgcaccaactacat
gccttttttttattctca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_125733693_125734670
seq2: B6Ng01-330O19.b_84_1069 (reverse)

seq1  GTGGTCATGAGC-TTTAA-GATCCTTATCCTAAGCCGAGCAAGATGGCAT  48
      |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GTGGTCATGAGCATTTAAGGATCCTTATCCTAAG-CGAGCAAGATGGCAT  49

seq1  AAGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGC-AGAGGCAGGCGGATTTCTGAG  97
      ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTTTAATTCCAGCACTTGGGAGGCAAGAGGCAGGCGGATTTCTGAG  99

seq1  -TTCGAGGCCAGCCTCGTCTA-CAAAGTGAG-TTTCAGGACAGCCA-GGG  143
       || ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||
seq2  TTTAGAGCCCAGCCTCGTCTACCAAAGTGAGTTTTCAGGACAGCCAGGGG  149

seq1  CTACACAGAGAAACCCTG-TCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAATCCTTATC  191
      |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACAGAGAAACCCTGTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCTTATC  199

seq1  CTAGCTGCCTGGAAACAAGCTTTCTTGTAGCAAGCAGCTGTCAGATGAAG  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCTGCCTGGAAACAAGCTTTCTTGTAGCAAGCAGCTGTCAGATGAAG  249

seq1  ATGTAGCCTCTCAGCTTCTCCTGTACCATGCCTGCCTGGATGCTACCATG  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGCCTCTCAGCTTCTCCTGTACCATGCCTGCCTGGATGCTACCATG  299

seq1  CTCCCACCTTCATGATAATGGACTGAACCTCTAAACCTGTAAGATAGCCC  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCACCTTCATGATAATGGACTGAACCTCTAAACCTGTAAGATAGCCC  349

seq1  CAGTTAAATATTGTCCTTTATAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTGCTC  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTAAATATTGTCCTTTATAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTGCTC  399

seq1  ACAGCAGTAAAACCCTAACTAAGACAATCACTACGTGACTGAGCTACTCC  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAGTAAAACCCTAACTAAGACAATCACTACGTGACTGAGCTACTCC  449

seq1  CTCCTACCACTACATGCCAGTCTACCATGCCAGTCTACCATGCCAGTCTA  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTACCACTACATGCCAGTCTACCATGCCAGTCTACCATGCCAGTCTA  499

seq1  GTCTACCATGCCAGTCTAGTCTACCATGCCAGCCTACCATGCCAGCCTAC  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTACCATGCCAGTCTAGTCTACCATGCCAGCCTACCATGCCAGCCTAC  549

seq1  CATGCCAGTCTACCGTGCCAGTCTACCGTGTCAGTCTACCATGCCAGTCT  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCAGTCTACCGTGCCAGTCTACCGTGTCAGTCTACCATGCCAGTCT  599

seq1  ACCGTGGTGGGCTGAAATCCCTTTGAAACCATGAGCCCAAGCAACTCTTT  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGTGGTGGGCTGAAATCCCTTTGAAACCATGAGCCCAAGCAACTCTTT  649

seq1  CCTCCTTCATTGTTATACATTTTGACCACAGCAATAAGACAAATAACACA  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTTCATTGTTATACATTTTGACCACAGCAATAAGACAAATAACACA  699

seq1  CCTGGCCTTTTTCCTGGCAGACCTGCATGCATTCCCTACCCTCCTTGACC  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCCTTTTTCCTGGCAGACCTGCATGCATTCCCTACCCTCCTTGACC  749

seq1  CTTGACCCTCTTCTCTAGGCCTCCTTCTCTTGTGGCATTTACCATTCTTT  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGACCCTCTTCTCTAGGCCTCCTTCTCTTGTGGCATTTACCATTCTTT  799

seq1  AACAGCTTGCCTTCCTGGTAATTGTGGCATTATTGTGGCTGTCAGCCTAC  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCTTGCCTTCCTGGTAATTGTGGCATTATTGTGGCTGTCAGCCTAC  849

seq1  CCCAGTACAACAGAACGTAAGTCCCATGGTAGGAATGGTCTGTGGTCATG  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTACAACAGAACGTAAGTCCCATGGTAGGAATGGTCTGTGGTCATG  899

seq1  GCAGATCACCAAGAAGTTCATTAGGCTTGTGGGAATTAATGGATGGAGGA  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATCACCAAGAAGTTCATTAGGCTTGTGGGAATTAATGGATGGAGGA  949

seq1  GGGGAGACTCTTTCTCTCAGAGATTGCTCAATAACTA  978
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGACTCTTTCTCTCAGAGATTGCTCAATAACTA  986

seq1: chr7_125597587_125598649
seq2: B6Ng01-330O19.g_69_1136

seq1  GAATTCTATCCCTCCTAATGCAGGGTCTCTGGGAACTGGTATCCAGTTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATCCCTCCTAATGCAGGGTCTCTGGGAACTGGTATCCAGTTCC  50

seq1  TCTGGTGGTGCCTCTGCCATCTCCAGCTCTTAAGATGAGCCAGCCATTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTGGTGCCTCTGCCATCTCCAGCTCTTAAGATGAGCCAGCCATTTC  100

seq1  CTTAGAGCACCAAGCCCTGTGGGGCAGAAGCATCCACATAATAACAGTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAGCACCAAGCCCTGTGGGGCAGAAGCATCCACATAATAACAGTCT  150

seq1  TCAGAAGGGAATTAGGGGTGGGAGTGCAGTCTCTGGCCGTAGACTACCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAGGGAATTAGGGGTGGGAGTGCAGTCTCTGGCCGTAGACTACCTG  200

seq1  TTATCATTGAAAAGTGCCCGGATGGCAGAAACAGCTGTTGCCACCCATCG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCATTGAAAAGTGCCCGGATGGCAGAAACAGCTGTTGCCACCCATCG  250

seq1  GGCCACACAGCTTCTGGTTTAGTTACTATCGATTCTGGCCATTCTCACTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCACACAGCTTCTGGTTTAGTTACTATCGATTCTGGCCATTCTCACTG  300

seq1  ATGAAACCTGTTGCCCAAGTCCCTTTTAATTCTATGGCATATAAAACATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAACCTGTTGCCCAAGTCCCTTTTAATTCTATGGCATATAAAACATG  350

seq1  TCCTTCACCTGTTCCCTGTATCCCTTCCTGGGCTGTGTTTCTACCCAGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCACCTGTTCCCTGTATCCCTTCCTGGGCTGTGTTTCTACCCAGAA  400

seq1  TGCCTGGGCAGTAAGAAAGCTCAAAGCTAATTAAACGGATAGTCTGAAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGGGCAGTAAGAAAGCTCAAAGCTAATTAAACGGATAGTCTGAAAC  450

seq1  AGGGTCCCCAGACCTCAAGCTATGCTGCATACCCATCAGAATTCTCTGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTCCCCAGACCTCAAGCTATGCTGCATACCCATCAGAATTCTCTGGT  500

seq1  CCCCATCTTTGCCAGGGACAAGAGTTCTGTCTTGCCTGTCTAATGATTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATCTTTGCCAGGGACAAGAGTTCTGTCTTGCCTGTCTAATGATTTG  550

seq1  TGACCAGAGGCGACAAGCCATTTCACCTCTGTGAACCTCGGTTTTCCTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCAGAGGCGACAAGCCATTTCACCTCTGTGAACCTCGGTTTTCCTTG  600

seq1  TCTGCAAAATGAATATTATACACTTTGGTGCCAGTGCTGGAGAGAACTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAAAATGAATATTATACACTTTGGTGCCAGTGCTGGAGAGAACTCT  650

seq1  AGCCACTTAGGACAAATCCACAAAACATGGCTCACCAGGAGTGGTTCCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACTTAGGACAAATCCACAAAACATGGCTCACCAGGAGTGGTTCCCT  700

seq1  TTTTTCCCCTCAGAGCATGTATTTAGCCTGGGGCCTCCTGCTTTATTTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCCCCTCAGAGCATGTATTTAGCCTGGGGCCTCCTGCTTTATTTTA  750

seq1  TGCTTGGAAGGTGGAGTATGTATGTCAAGGAGGAAGGAGGAACCACATGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGGAAGGTGGAGTATGTATGTCAAGGAGGAAGGAGGAACCACATGG  800

seq1  AGGTTGAAATTCCAACTGCTCTCATCAGCTAGCCTGCCTGCAAGTCACCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGAAATTCCAACTGCTCTCATCAGCTAGCCTGCCTGCAAGTCACCA  850

seq1  CTCACCTCTCCCCTCACTGTGAGACCCAGGATGCATCTCTCTGTGGGCCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCTCTCCCCTCACTGTGAGACCCAGGATGCATCTCTCTGTGGGCCT  900

seq1  CAGCCTTCTCCTCAGTGAATGGGGTCAAAATCAG-TGCTTCATGGCAGGA  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CAGCCTTCTCCTCAGTGAATGGGGTCAAAATCAGTTGCTTCATGGCAGGA  950

seq1  AGCACCCTGCCCTCCCTGATTGATGCATAGAGTAACTGTATTTATCCCAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCCTGCCCTCCCTGATTGATGCATAGAGTAACTGTATTTATCCCAT  1000

seq1  AGCAC-TGTATCA-GCCCTCAGGAAGTT-CTCAGTAAATGCAACCACTAC  1046
      ||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| | |||||
seq2  AGCACTTGTATCAGGCCCTCA-GAAGTTCCTCAGT-AATGCACCAACTAC  1048

seq1  ATGCC---TTTTTATTCTCA  1063
      |||||   ||||||||||||
seq2  ATGCCTTTTTTTTATTCTCA  1068