| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-062E23.T7 (MSMg01no062_e23.b1) | MSMg01-062E23.TJ (MSMg01no062_e23.g1) |
|---|
| ACC | AG288314 | AG288315 |
|---|
| length | 1,136 | 1,146 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 627 (78 - 704) | 650 (129 - 778) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_e23.b1 PHD_FILE: MSMg01no062_e23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:05:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_e23.g1 PHD_FILE: MSMg01no062_e23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:05:46 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | TTAAGGCATTGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CCTTGTTCAGTTCTGACCTTTATTTTTTAATGGGGTTATTTGATTTTCTG
AAGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATGTTGGATATTAGTCCCCTATC
TGATTTAGGATAGGTAAAGATACTTTCCCAATCTGTTGGTGGTCTTTTTG
TCTTATTGACGGTGTCTTTTGCCTTGCACTAACTTTGAGGTTTCATGAGG
TCCCATTAGTCAATTCTCGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTCTTCTGTT
CAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCGTTTCCCCACTTTCT
CCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTAAGTGAAGTTCCTTGATCCAC
TTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAAGTATGGATCAATTCGCATTCT
TCTACATGATAACCACCAGTTGTGCCAGCACCAATTGTTGAAAATGCTGT
CTTTCTTTCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCGAAGATCAAGTGACCA
TAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTATTCCATTGGTCTAC
TTGTCTGTCTCTATACCAGTATCATGCAGTTTTTATCACAATTGATCTGT
AGTACAGCTTTAGGTCAGGCATGGTGATTCCACCAGAGGTTCTTTTTATC
CTTGAGAAGAGTTTTTGCTATCCTAGGTTTTTTGTTATTCCAAATGAATT
TGCAAATTGCTCCTTCTAATTCGTTGAAGAATTGAGTTGGAATTTTGATG
GGGATTGCCTTGAATCTGTAAATTGCTTTTGGCTAAGAAAGCCATTTTTA
CAATGTTGATTCCTGCCCATCCTTGATCACTGGGAGATCCTTCCATTCTT
TCTGAGGATCTTCCTTTAATTTTCTTTCTTCACAGAACTTGTAGTTTTTT
TATCTATACCCGAATCTTTTCCCTTCCCCTTATGCTTAAAGGTCCCCGCC
CGAAAGATAATCTTTAATAATTTATTTGGTGGACCCATTTTGAAACAAGG
GCGGGGTTTGGTTTTTCCCCTATATTTTCTTTTTTCCTCACCCCCCTGGG
TTTATTTTCTTTTTGGATTAAATACATTAAACAGGG
| CTTCCGTTTNNNNNNTCCAAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTTATAAGAGCAAAAGCAAA
TTGTAGAGTTTTAGAAGACCCTCATTAGAAATCATCCAACCTTAGAATTT
CAAATATGATTGAGAATAAATACTTTGTTGTAAATACAGTGAAAATTACA
CTAGTTAGAATGCTCCCTCAAGATGAAGTTAGTTGGCCATACAATAGTTC
AACTTGAACTATTTTCTATATGTACATGCATTTGAGTGTGTAAATGTGTG
TGTACATGAATGCACATATGTGTTTAATAATATTTCCCTTTGTGAGTATA
AAATATGTTAGTATTCTGAGACAGATCCAAGGACATTTATTATTAGAAAG
AAAGTGATTTGTCAGCCTGATGATGTTCTTTCTTACTAGTTATAGAAATG
AAGTTTTAAAACCACATTTTTCACATACTTTGGGAAATTCAATTTTGTGA
CATTGCTCTTGATTGTCATATGCAGAATGGCTGTCATGGGCAGGTGATGA
AAGGCTCTGTTTTAAACAGTGTTTGATATCAGGTCAACAGGAAGTAACAT
TTCACTTTAAATGTAGCCTTTTATGAAAAGACAAAATACACTTATTGGTC
AAATATTTTGTAAAGGTAATTAAGTAAACTTCATTTTTTATTTTGTTATG
ACAGCAAGAGAAATGTGATCATTCATGGTGTCTGTTCATTTCATTGTTTG
ATTGACAAACGGATTGAATGATAATTTGATAGATTGATTGAGTTTTAAAT
TTCCTTTTGTATAACAATTTCCAATCATATCTTTGATGATTCCTGCACTA
CATTATACTATTGAGTTATTTTAAATTATAGCTTTAAACTGAATTTAAGT
TTCAAAGTCTTGATGCCCCAGTGTAAGGGAAATGCCCTGTTGGGCGGTTA
GGTGGGGTATGGAACAATGCCATTTCCAGAAGCAGAAATTGGGAAAAAAA
AAACTTTTGAAATGCAAAAACAATAATATATCCCTCTTAAAAAGAAATAT
CCCCAAAATTAATTGGCTCTTCTTAAAAAAAAGGGTTAACTTTTAAAAAA
TTATTTTTGGGTTTTTAATGGGAACAGGCTCTGGGGGCCTTCACCG
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 7 3 3 6 6 8 6 8 8 8 11 10 10 8 10 8 8 8 15 19 23 16 15 15 12 18 12 18 18 26 39 36 33 33 33 33 33 39 37 41 37 37 36 32 31 31 39 37
37 36 25 29 28 17 24 22 19 19 27 23 23 12 11 12 12 12 12 12 11 12 12 19 25 22 25 23 24 22 28 43 43 39 31 31 29 29 31 36 43 43 43 44 43 39 39 40 37 34
28 28 30 25 23 20 14 14 21 29 37 37 37 37 30 28 19 19 19 31 27 30 19 12 12 12 12 19 17 22 18 34 28 36 36 43 42 33 31 22 22 22 43 43 42 41 41 41 41 41
48 48 54 48 36 36 22 22 38 30 32 23 23 14 21 21 40 36 41 44 44 47 57 57 44 44 39 44 42 37 37 37 44 44 44 42 36 32 28 43 32 32 27 27 43 43 50 43 43 33
33 32 44 44 57 52 52 52 44 38 52 43 43 38 43 43 52 52 59 59 50 44 35 32 24 15 15 15 20 32 20 27 21 30 28 32 33 33 33 43 43 43 43 52 57 57 57 57 57 52
43 43 39 33 33 38 38 57 28 28 11 11 12 24 32 32 35 35 35 43 43 57 57 57 57 57 57 59 43 43 23 20 20 23 27 27 35 44 44 62 62 62 62 62 62 62 44 43 31 31
31 31 43 35 35 26 26 35 43 43 52 62 45 45 43 44 43 52 52 52 52 62 43 43 35 35 39 38 38 19 19 19 39 39 44 44 39 39 43 62 43 62 44 44 39 43 43 62 62 52
52 52 52 62 44 62 62 44 44 31 31 35 43 43 29 29 29 44 39 39 43 62 43 43 35 39 39 43 43 39 39 39 35 35 39 35 44 39 39 39 43 43 43 33 33 34 34 31 44 44
44 39 18 12 12 39 39 62 62 62 62 52 43 43 43 43 52 62 62 62 62 45 52 43 43 39 39 39 31 31 31 43 44 62 62 38 38 16 14 14 20 38 35 35 35 43 59 62 62 62
62 52 43 43 44 43 35 43 43 43 23 23 12 12 12 23 23 31 43 43 62 43 43 39 39 43 35 35 35 43 44 57 57 52 52 57 57 57 45 57 45 57 57 57 57 57 43 43 24 24
20 34 35 52 57 57 57 43 57 57 43 57 39 39 39 39 33 31 35 43 43 43 35 35 35 43 43 52 52 44 44 19 19 13 12 12 10 10 10 25 15 14 14 14 18 23 35 42 37 32
38 43 29 31 38 43 43 57 44 36 28 28 27 38 24 35 35 59 59 59 44 44 32 32 32 37 40 42 36 36 44 32 32 35 35 35 44 44 44 30 30 24 32 20 20 32 34 59 59 59
57 57 36 36 25 30 30 43 47 57 59 57 42 39 32 32 29 28 33 33 39 43 32 32 32 40 28 28 28 28 40 34 35 39 34 29 23 26 25 15 15 15 30 30 36 36 33 37 28 31
25 19 17 11 10 9 14 20 36 34 34 28 35 28 34 28 35 28 28 28 28 28 24 24 35 37 34 34 32 24 16 18 18 24 16 23 23 26 26 28 28 28 33 33 33 33 33 30 37 30
32 28 16 21 19 19 23 18 18 17 22 21 25 22 26 27 28 30 32 32 28 23 13 18 11 16 16 21 21 29 33 33 37 48 39 30 24 16 13 13 10 13 15 26 32 34 24 24 17 16
16 18 13 30 31 43 39 43 43 30 30 20 24 28 28 21 15 15 15 24 27 25 39 40 41 37 37 33 22 17 24 24 28 24 20 28 28 30 15 16 12 19 16 20 26 20 25 34 28 19
12 11 11 9 11 10 15 9 10 10 13 12 8 8 8 10 10 12 14 17 13 13 19 27 28 22 24 18 16 8 8 8 8 10 10 10 8 9 9 9 10 10 13 13 18 22 19 20 13 21
10 10 12 11 13 19 17 17 14 9 9 9 9 9 9 10 8 8 8 10 8 8 11 13 16 16 11 8 8 6 6 8 7 10 10 10 10 10 10 10 11 12 11 11 13 11 11 13 11 9
9 9 15 15 11 10 10 10 15 15 18 18 15 23 19 17 9 9 9 13 19 8 10 10 10 13 14 13 13 10 8 10 10 8 8 8 9 10 10 18 10 10 9 8 8 8 19 27 23 22
10 8 6 6 6 8 10 12 11 10 8 10 8 8 10 10 13 17 12 9 10 8 8 8 8 8 12 13 13 13 10 9 6 8 6 6 8 8 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 15
10 14 12 14 11 11 11 11 11 10 9 9 9 14 9 7 6 7 6 6 8 11 11 15 10 14 8 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 10 9 9 9 9 10 13 9 9 10 8 8
9 9 9 9 9 14 22 15 10 8 8 8 8 7 13 9 9 9 9 8 10 8 8 8 10 16 13 6 6 6 10 12 15 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 7 8 6 6 6 6 8
8 12 12 10 10 10 8 8 8 8 8 8 15 10 10 9 8 8 8 6 8 6 6 8 6 8 10 10 13 9 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 8 6 6 6 9 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 8 6 6 7 7 11 10 12 11 7 7 9 9 10 10 19 19 20 20 21 21 21 21 23
16 9 9 15 19 24 30 37 37 37 28 26 24 16 16 21 32 33 41 37 50 42 37 22 21 10 10 11 8 12 14 10 9 9 9 9 10 17 18 21 34 41 59 59 59 59 59 57 57 57
53 38 38 38 36 36 36 53 50 31 30 33 33 33 23 19 8 6 6 6 6 8 9 10 15 23 13 13 13 22 22 35 39 21 22 8 8 8 8 14 26 23 23 12 14 24 34 42 57 57
57 68 48 43 42 43 48 48 57 57 36 36 25 44 34 46 32 42 30 30 30 37 42 42 57 57 46 38 32 24 25 28 21 21 21 25 17 27 24 30 35 42 44 41 37 43 44 44 35 35
35 48 42 48 50 50 50 50 37 43 43 57 57 57 43 43 43 43 28 44 43 52 57 52 52 52 52 52 50 44 42 35 35 43 43 37 50 50 68 68 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 43 45 42 39 39 43 43 52 43 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 57 57 57 52 52 59 45 45 45 52 43 52 52 52 43 43 31 31 27
43 26 31 31 43 43 62 62 62 39 39 43 43 44 52 62 62 62 62 62 44 44 35 35 39 39 43 43 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 59 47 35 43 41 62 39 43 43
43 62 62 62 62 62 43 39 39 39 35 44 44 68 44 62 43 43 35 44 44 52 52 52 62 43 52 45 43 43 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 38 32 13 13 29 38 62 62
62 62 44 44 35 31 39 39 44 44 52 43 44 31 31 31 44 44 62 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 47 43 35 35 35 44 44 59 57 57 59 59 52 43 47
39 35 35 43 44 57 57 57 57 57 59 52 52 52 52 57 59 59 52 52 52 59 59 68 59 59 52 52 52 59 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 43 43 41 35 37 59
59 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 42 39 35 35 59 59 59 59 59 47 59 59 44 44 36 36 28 36 41 42 59 32 42 28 24 18 13 13 17 30 30 39 40 43 43 47 43 43
59 59 59 32 32 20 32 32 40 30 35 39 59 47 48 48 43 43 43 43 43 43 47 47 46 48 48 44 43 43 43 36 36 39 37 32 32 32 35 39 39 31 26 30 39 39 47 47 41 41
43 43 37 37 28 33 28 33 36 37 48 57 47 39 30 30 42 43 48 50 57 57 57 54 54 54 59 59 48 42 39 37 37 37 39 39 43 44 43 48 46 48 44 57 36 36 25 28 32 37
42 42 46 57 44 48 48 59 57 48 48 48 48 46 44 37 30 24 32 29 36 30 40 40 59 48 57 48 57 57 57 57 57 57 57 44 57 48 48 48 57 57 57 57 48 48 48 48 50 48
48 48 50 50 41 39 37 30 30 30 28 29 34 37 30 30 30 37 37 37 37 40 43 46 41 25 23 10 10 10 23 25 47 47 59 59 40 43 37 34 32 25 25 36 36 40 34 34 34 34
34 34 34 34 43 37 43 39 39 39 37 32 28 37 28 31 23 23 23 34 34 36 25 23 11 9 10 10 19 19 22 22 11 11 10 23 20 31 29 29 30 30 25 31 30 27 25 25 30 28
33 23 33 26 26 25 22 22 17 13 14 28 25 24 24 24 33 26 33 28 28 28 34 27 13 10 10 12 16 24 35 39 39 32 31 22 20 24 21 21 28 27 27 25 13 11 10 10 15 13
13 13 13 19 16 22 21 18 22 22 24 24 24 22 20 20 17 20 19 23 15 15 10 10 10 15 18 32 17 13 6 6 8 8 10 11 11 20 22 22 25 25 18 17 17 15 14 15 17 19
15 11 8 8 9 18 13 17 17 19 22 14 14 14 15 15 24 24 19 13 11 11 10 14 11 10 9 9 16 8 9 12 14 16 13 13 8 10 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8
8 8 7 8 7 7 6 6 6 11 9 15 9 8 8 8 8 8 11 11 11 8 15 10 10 10 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9 11 11 11 16 11 9 8 8 8 8 13 19 17 12
12 12 11 11 12 12 24 10 10 10 10 9 9 10 10 8 13 8 8 6 6 6 8 8 9 9 9 9 11 10 10 10 10 7 6 6 8 8 8 9 9 9 12 10 8 8 8 8 8 8
8 12 8 9 10 8 9 8 10 10 10 13 11 11 11 10 8 6 6 6 6 8 10 10 12 11 15 16 15 26 14 17 10 11 13 10 10 8 8 8 9 9 14 15 17 13 23 11 10 9
9 10 9 11 15 19 15 16 12 9 12 10 13 15 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 12 12 10 10 8 8 8 8 8 8 |
|---|
