BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-068I18.T7 (MSMg01no068_i18.b1) | MSMg01-068I18.TJ (MSMg01no068_i18.g1) |
ACC | AG293016 | AG293017 |
length | 1,701 | 716 |
length of high quality (start - end) | --- | 579 (77 - 655) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no068_i18.b1 PHD_FILE: MSMg01no068_i18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:15:01 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no068_i18.g1 PHD_FILE: MSMg01no068_i18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:15:01 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CGGTTCTCTCCCTCCTAGCCTGCTTTTGTTTCTCCTTCGCTCGTTTTCGC
TGGTGGNNTTTGACGTNCGCTTTCTCCACCCCAACCCTTTCCTTCACTCC
TCACCCACCTTTCATAATACTATTCTATCTGTCTCTCGCTTATCACGCAC
ATCAATATCTTATTATCTATATACCAACCCAACGCAATACAACCTCGCTA
TATATTTCACCGCCACACCGAGTAATCACACCCAGCAAAGAGATTGTAGA
GAGGACCAGAGGTGCGCACGTCCTTACTGTATCCCAGCTTATAATGTACA
CTACACCAGTTCTTTTGCACAATGATGTGGTGTGGCCCACTCGCTTAGCA
ATATCTTTCTCTTATGAAACATCAGCTCTCGCTCTCATCGAGGTGGTACT
CGGAGCCGGGATATGTGTCGCGGAGTAAGGATGATGAGAGTTTGAAGCTG
GCATATAGGGATATCGCGTGGTAACTAGAGGCGACAAATGCTTATCAGGA
TATCCAACGTCGAATTTTACGCGCGATGTGGCGTGCACCTGAGATGGCCA
ACTTGTCTAGCGTATTCGTGCGTATGATATGTAGTGTATTGTACACGCGA
ATGTATATTGTTAGACCTGCGCGGTGAGCGGTGCGTTATAGGTAAAACAG
TAGGCGCATATTGTGGCGGTNCACCCTCTCTCGTATTCGCATTTGGTCTC
CACTGTGTTTAGTCTGAAGGCTGATAGTGTAGGTTCGGAGTATCGGAGCG
CGGGCGTATGATGGTTCACGCATATTAAATATAGAGACGAGTAGTATGTG
GGTACTATCGTGCGACGCGACGCGGTCTGAGATTATTTATGGTGAGGAGT
GNCACATACAATAATGCCGCGTGTATCTCAGCACTATGGCGCTACGCGGA
CATCACTATCATCCGCGGATATAGCCTTCCGTTCTTATCCATCACTGTAT
CCGCCCGCGCTCGCTCGCTTCATGAATGCGTAGGCGGACGAGACTCTAGT
TGGGTGTATATTAATTGCCACTGCGCGATCAACGGTGGCGCATGTTCATC
CGAGCGCGATTCGCGCCGTGCATGTTACGGTAGCCGATGAGTTATTCNCG
TGGGGCATTTCAACCCGCCGTGGTGAGTCGCTTTTAAGGCCGCGACTCGT
CGCGCGCGCACCGACGCGTGTTANTGGATCGGACACTAACTAGTATCCTT
AACTTCGTAAAGAACAGCGTGCACTCGCGCCGCGGATAATGTCTTGGCGG
TACACAATAGTGCTGGAGCAGTCAGCANCGCGACTGTTGCGATACTCCGC
ATCCGCGCGCGGTGCGGCGGCGACTCTGTTACAGTCGGTGCGTTGACGCC
ACTCTAATGTGATGACTATCTTCTTTATCACTTATAGCGGNGCGTCTGTA
TTTCTCTGTGCCCGACACGCGTCATACCAATAGTTCGTCATCTTGCTACT
ACTCATATCTCTCGTACTCTACTACCGCNTACTCAGTTTACTCAACATCA
TCTCACGTGATCATGAACTCTCGCGCGCTNATATGATCACTGTNTGCGGG
TCAATCATCCTATCCGACGGCAGACGAACAGATATGTAATATATGCATGT
CGGATATGACCAATAGGAGGCGCCGACTANATTATATATATAATTCANAT
AGCGACCATCATCTCTATCACACCCTAATCTCCGTGTTAAATAACGAACG
T
| CCATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGTACACTCACATAGCACAGTGGA
GTGTGGCAGACAGAGAGGCACACCCTCTCCATCTCAGTCCATGCTCTTAA
GGATCATTAAGAGAGTTTCCATTTGCCCCATACTGTTTTTAATCCACTGT
GATGTCCATTGCCCTTTTTCTCATGGTGATCTAATCAAACCGTTTATACT
AGTTCCGAGTTAAGCTCACATTTGCCAATAAGTAAAAATTATCTAACTAT
GTCTTCAGTCACTTATTTTGTCAATTTTGAATGACTTTTGAACTAGAGAT
AAAAAAAAGTAGCTAACATGGATACTCTAAGTCTCAATGAAACTCTTCTA
TTTGAAAAACCTTCATAATACTTTTTATTTTGTTGTTTTTATATACTAGT
ACAACATTTATTTTCCCTTGGAAAAAATGGTATATATTTATGTGTATGTA
TGTTTTGCCTGTATGTATATCTTTCTACTAAGTATGTGCAGTGCCCACAA
AGCCCAGAAAAGAGTGTTGTATCTCTTCAGATTAGACTAACAGACAGTTG
TGGGCTGCTCTATGGATGCCAAGAATTGAACCTGGGTCTTCTGGAATAGC
AGCCAGTGCTCTTAAAGGTTCTGCTGTCCCTTTAGCTCCTAATGCTACAT
TTAATTTTAATTACCN
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 7 10 10 15 8 8 8 12 6 9 8 10 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 6 9 10 10 10 10 11 11 10 6 8
6 9 10 9 11 3 0 0 3 8 6 8 6 6 8 3 0 3 8 8 8 8 13 19 11 8 8 8 8 6 8 13 12 10 8 6 6 6 8 8 10 7 7 8 6 6 6 6 8 6
6 6 6 10 15 12 10 8 8 8 8 6 9 9 10 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 7 10 11 10 9 8 10 8 8 8
8 9 7 8 8 8 8 8 10 12 10 9 7 10 6 6 10 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 6 9 8 11 12 11 10 10 10
10 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 12 10 10 12 12 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 11 12 13 10 10 9 11 6 8 6 6 6 10 16 19 25 17 10 8 8 8 8 6
6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 10 8 11 13 9 9 8 8 7 7 8 6 6 6 7 7 8 10 8 8 8 8 9 8 8 8 9 9 9 10 10 10 10
10 10 10 10 11 11 10 10 10 9 9 9 11 11 11 11 11 11 6 8 6 6 8 8 10 13 21 13 15 15 19 19 15 18 9 10 10 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10
10 11 12 14 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 7 12 11 10 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 7 6 8 8 9 13 10 12 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 7 7 10 6 10 11 8 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6
10 10 10 6 6 6 8 10 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 8 8 9 9 10 10 10 9 8 8 8 8 8 6
6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 6 8 6 6 8 6 8
8 8 8 10 16 10 12 12 10 7 6 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 8 8 8 6 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9 12 16 15 13 11 11 11 11 8 8 8 8 10 10
12 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 10 11 10 10 10 6 8 6 3 0 3 8 8 12 8 8 8 8 6 7 6 6 8 6 7 8 10 10 9 7 6 7 10 8 8 9 8 7 6
6 6 11 6 6 6 10 10 10 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 9 9 8 9 9 9 9 6 6 6 6 6
6 10 10 10 8 8 8 8 8 10 11 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 12 10 7 10 6 6 6 6 9 9 8 8 10 10 8 8 11 11 8 8 6 6 6 8 6 8 8 6 6
10 7 7 6 8 8 8 13 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12 13 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 6 8 6 9 10 9 9 9 9 10 8 8 6 6 6 6 6 8 6
3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 8 8 8 8 8 10 13 12 9 9 9
6 8 6 8 8 8 11 10 9 9 11 10 6 6 6 6 8 8 8 8 10 11 11 11 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 9 8 8 8 8 10 10 8 10 10 10 6 6 6 6
10 6 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 6 6
8 8 9 14 10 10 10 10 8 6 6 6 7 8 8 11 10 10 11 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 10 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8
8 8 6 6 6 8 8 10 10 18 12 10 8 15 8 8 8 8 8 8 11 8 10 12 8 8 8 10 8 8 8 9 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 10 7 6 8 3 0 3 8
8 8 10 10 8 8 8 8 7 8 6 6 6 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 10 10 11 10 10 10 10 8 10 10 10 8 8 8 6 7 7
8 8 8 14 12 9 10 10 10 8 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 3 0 3 8 8 10 10 9 9 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 13 13 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 13 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6
10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 10 12 8 6 6 6 6 7 3 0 3 7 11 9 9 7 8 8 8 8 10 10 10 10 15 11 13 9 9 9 10 8
8 8 8 8 11 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6
6 6 8 8 7 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 8 8 9 8 8 9 8 8 9 10 10 10 10 11 8 8 8 9 9 3 0 3 6 8 6 6 6 6 10 6
8 8 8 13 11 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 6 6 6 8 6 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 7 7 9 10 10 9 10 10 12 9 9 9 9 9 9 8 10 6 6 6 6 9 11 17 3 0 3 10 8 8 8 6 6 6 7 6 6 8 7 8 6 6 6 8 8 8 8
8 14 14 9 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 8 7 6 6 6 3 0 3 9 10 9 8 8 8 8 8 6 6 6 3 0 3 6 6 6 7 8
8 6 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 10 10 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 12 8 8 8 8 10 9 9 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 6 10 7 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 9 11 16 10 10 3 0 3 10
10 9 9 9 8 6 6 6 6 6 6 8 13 12 12 11 12 12 12 14 12 10 10 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7
7 | Open.Hide. 9 9 8 15 15 8 8 8 8 15 21 39 41 41 47 41 47 50 50 50 50 53 53 53 53 53 53 53 50 50 50 34 33 18 15 18 16 11 10 10 23 23 30 33 50 50 50 50 53 53
50 50 50 53 53 53 53 53 50 50 37 28 19 22 15 15 10 12 12 12 11 23 23 33 33 33 41 41 53 53 57 38 42 42 53 53 50 57 50 53 57 53 53 53 53 47 47 68 68 68
68 68 68 68 68 54 54 54 48 48 51 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 41 44 32 42 35 32 32 43 43 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
48 48 42 42 46 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 43 38 38 38 35 33 38 32 32 35 44 44 50 50 43 32 32 20 20 20 27 32 43 50 50 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 57 68 68 68 57 57 59 59 57 57 48 48 48
48 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 44 37 41 44 44 59 47 44 44 41 37 37 41 41 47 59 59 59 59 59 50 50 50 57 57 57 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 50 50 50 48 48 48 59 59 48 47 47 59 59 41 41 41 37 37 41 41 39 39 39
39 39 37 36 39 36 36 36 41 41 40 40 40 47 43 43 43 43 43 43 43 43 43 48 48 59 59 43 39 39 36 34 34 31 34 34 36 34 37 37 41 41 44 47 59 59 44 37 37 41
36 31 36 36 41 59 39 41 46 41 41 39 39 29 29 32 37 39 34 34 36 34 37 30 28 28 31 32 29 29 29 26 28 22 22 22 24 24 30 31 35 35 32 27 27 19 22 14 26 28
36 33 27 21 21 20 20 20 26 26 24 12 11 11 11 11 11 29 31 28 35 37 37 37 37 35 35 31 34 36 37 27 27 18 18 20 31 28 29 30 25 22 27 25 28 28 24 20 20 28
27 27 24 24 24 34 32 30 22 22 18 18 17 16 3 0 |