BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-110P04.T7 (MSMg01no110_p04.b1) | MSMg01-110P04.TJ (MSMg01no110_p04.g1) |
ACC | AG323744 | AG323745 |
length | 703 | 703 |
length of high quality (start - end) | 583 (45 - 627) | 471 (75 - 545) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no110_p04.b1 PHD_FILE: MSMg01no110_p04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:14:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no110_p04.g1 PHD_FILE: MSMg01no110_p04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:14:42 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (96,954,662 - 96,955,240) | (96,850,645 - 96,851,004) |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCATCCAGCAGGTCATCATACTCCTCCCCACGGACACGCTGGTGTTTC
AGGCCGATGTACAGAGGGTCTCTAAGAAGCTCCTGGAATAGAGAGCATCC
ACTTACCAAACCCATTCCATGCTTCCCACTTTGTTATCTTTTCCTGTAAA
GCAAGAGCCCAGGTTTAGTGGGAAGAACTGGAGGTAGGAGGAGAGAAGAG
CACAGGACTCTGCCTCTGTTTCTCTACCTCTACCTAGGGGTAATCCCTGG
AAGAGTCTGGAGGCCAAGTCCCTGTCTGAGGGTGGATTCCTGTGAAATCC
CATTTTTAGGAATGAACAATGCTTTGATGTAGCTGAGCCTCCATCGGACA
CTCTTTCAAGTCCTGGCTGTAGACTTTGGGTTTCTTTCAGGGTTTCTTAA
TAGTGTCACTATGAACACTTTAGCTTGGATTATTCCTTAATTTGAGAGAT
GACCTGAACATTATAGGATATTTAGCAGCATCTCCAACCTATACCCACAA
GGATCCAGCAACACCTCCACTTGTGGCCATAAAAATGTCCCCAGACATTG
CTACAGGTATTCTTGAAGGTAGAAGTGCTCCAGGTTGAGAACCTCTGATA
CTGACTGTAGGTAGCATCTGCCTTGGTGATAGGAGCCCCATCCACAGATC
TTG
| ATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCCTGTCTGGGTTTGAACTCTAGCT
TCTCCTCCTCTGACTTTTTTTTCTTGTCTATCCTATCTATAAAATAGGTC
TACTTTTAAATAAATTTAATTTAAAGGGTTGTTACAAATACTCAAAATAA
TATAGTTAACCAGAGTTGAAAATAGAAAGCATCAATGAAAAGTAATCATT
CTTTGGGAGAAAAACTGACTTCATTTTAACAAAACAAGAAATGTAATATA
TTATAAAAATAAAGGTTGCTGGTTATCAAGGCTAGAAAGGACACAGAAAT
ACCCTCATTCTTTGATAGTGAGCTATTGCTCAAAAAGCTGACCCCACTTC
AACAGGGGTCTTCTATTTAATGTATTAATTTTCTTTTTTTTTCTTTTTTT
ATTACGTATTTTCTTCAATTACATTTCCAATGCTATCCCAAAAGTCCCCC
CCACTCCCCCCCCCACTCCCCTACCCACCCATTCCCATTTTTTGGTCCTG
GAGTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCCTGACCAATGGGCCCTC
TCTTTCCCGTGATGGTCCATTAAGCCCTCTTCTGACCCATACGCACCTAT
ACTCTCCAGCTCTGCCTCCCCGGCTACTCTATACCGCCTTTCCCCCGATA
CAC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 7 8 22 43 37 29 28 28 23 23 28 21 17 8 8 8 21 21 43 27 24 19 22 22 29 39 39 28 28 28 37 43 57 57 43 43 34 34 42 48 43 57 57 47 47
42 42 50 50 50 50 47 48 50 47 47 48 48 47 47 48 50 53 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 50 50 50 50 48 46 50 50 51 51 57 57 57 57 48 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 59 57 57 52 57 57 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 57 52 52 57 57 68 68 68 68 68 59 62 62 62 52 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 52 62
62 62 68 62 57 57 52 57 52 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 52 57 57 57 52 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 52 57 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 54 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 57 57 52 52 52 57 52 50 48 57 59 59 59 57 59 59 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 57 57 42 32 27 17 17 18 30 30 28 42 42 43 43 44 59 59 57 59 59 57 46 43 46 46 54 57 54 68 57 57 48 48 43 48 48 57 54 54 54 57 57 57 57 57
44 43 43 43 59 47 43 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 50 59 59 47 30 25 18 18 13 21 28 59 59 59 59 59 59 59 59 44 37 37 41 41 41 59 47 59 39 43 43 37
37 39 39 39 39 44 48 48 37 40 30 30 28 43 43 57 37 37 23 23 28 41 34 54 54 54 54 54 44 46 39 42 42 42 39 39 46 46 48 46 46 48 48 46 37 31 22 22 22 31
32 37 37 30 30 32 37 28 30 30 41 33 43 43 48 39 39 36 36 36 37 37 37 30 29 19 21 13 18 18 34 34 37 37 32 28 24 24 28 36 59 48 48 47 47 42 30 30 21 17
20 30 30 28 21 15 13 12 23 23 28 26 26 30 31 40 36 43 47 43 37 33 26 19 15 13 12 13 10 15 10 15 12 12 14 11 15 10 11 16 18 12 12 10 10 10 15 10 10 10
16 16 29 22 17 16 16 22 17 10 10 10 10 10 10 11 11 12 12 22 19 18 15 15 13 12 10 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 13
11 13 13 | Open.Hide. 9 13 11 8 9 9 10 18 14 35 29 32 37 40 37 59 40 40 40 41 33 32 37 32 32 37 37 21 21 8 8 8 13 22 39 43 28 28 24 24 35 42 53 53 53 53 47 47 50 48
48 50 50 53 53 68 53 44 43 30 41 41 41 41 50 59 57 57 50 50 50 50 68 50 68 57 57 57 57 48 57 48 57 46 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 68 68 68 68 59 59 57 57 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52
52 52 52 57 57 57 57 57 54 54 57 59 52 52 52 59 59 59 59 52 52 52 52 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 68 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 54 54 54 54 54 54 57 48 48 48 48 48 48 57 54 54 48 43 43 39 39
40 29 28 28 29 23 21 11 11 11 23 23 32 33 37 33 33 24 28 25 20 19 27 26 26 37 37 37 33 37 32 39 39 37 37 31 31 31 31 37 37 34 23 15 15 19 19 28 20 14
10 10 10 10 10 14 14 23 26 37 28 28 28 28 28 21 15 12 12 8 15 15 19 15 14 23 12 9 10 10 11 12 24 25 19 13 10 10 10 10 12 15 21 14 14 19 16 17 10 10
10 19 19 24 15 9 8 8 8 6 6 8 8 9 10 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 10 10 8 8 8 9 9 10 10 10 9 9 9 9 9 9 9 16 18 18 10 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 13 9 10 10 10 13 12 9 9 9 9 9 8 8
8 8 8 |