| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-128L05.T7 (MSMg01no128_l05.b1) | MSMg01-128L05.TJ (MSMg01no128_l05.g1) |
| ACC | AG336901 | AG336902 |
| length | 731 | 720 |
length of high quality (start - end) | 365 (44 - 408) | 496 (70 - 565) |
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no128_l05.b1 PHD_FILE: MSMg01no128_l05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:41:53 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no128_l05.g1 PHD_FILE: MSMg01no128_l05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:41:53 2005 |
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | TATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCTCTGTTTATCTCTGTACTCCATTTTAAAATAGGGTTATTTGGTTCTC
TGGAGTCTAACTTCTTCAGTTCTTTGTATACATTGGATATTAGCCCTCTA
TCAGATGTAGGGTTGGTAAAGATCTTTTCCCAATCTGTGGGTTGATGTTT
TGTCCTACTGACAGTGTCCTTTGCCTTACAGAAGCTTTTCAATTTTATGA
GGTCTCATTTAAGGACTGTTGATCTTAGAGCATGAGCCATTGGTGTTCTG
TTCAGGAAACTTTCTCCTATGCCCATGTGTTTGAGGCCCTTTCCTGTTTT
CTCTTCTACTAGATTCAGTGTATCTGGTTTTATGTGGAGGTCCTTGATCC
ACCTGGACTTGAGCAGACAGATTTCCTATGTTTATAGACTGGCTATGGCT
GTCTTACTGAAATCTATCATCAGATTTGATCGCTTTGTACCAGGCTATAA
GAATGTATCATTTTGTGTTCTACCTGTCGACTGTCAGGTTATCCTATATC
ATTTTGCTTAAAACGCCGTCTTTTCTTCCACTATATGGTGTCTAGCCCGT
CTAAGATCATGTTGACATTTATGTGTGGTGGCCTCTTTTTTGGTGTCTCC
TTTTCCCCCTCCCTCCCCCCTTTTTCTCTGCCTTTTTTCCACCCTTTTTG
GTCCCTTCTCCCCTATTTGTTATTTAGCCTC
| ATGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCT
GTCTCAAAAAAAAATAATACCAATAAGATTTTTTTGCTTTAGAGTTGGTT
TGAATTTACCTAAAATTAAGAATGTTGAATATCTTTTAATCTACTTAAAA
ACCATTTTTATTGTAGTTGTAAAAACATCTATACAAAATTCTTTCTCCAT
ATCTAATTATTTTATGTTATTGAAATATGAAACTCCTCCTATGTCCTGCC
CAACATCTAACAGGTTTATAATTGTAATATTTTCTGTTCAAGTATCCTCA
TTCTTTAACCATGTATTGCCACTGTTATCTGGACTATGACTTTTAAAAAT
TTTAACAAACCCTAACATAACCTCCTGAAAACACCATTTTAATGAACCTA
TGTGTAACTCAAGGTCACAGAGACTATCTCTGATATTTTCTTCTCAGCAT
TTTACAGCTTTAGCTCTCACATTGTTCCCTCCGATCAATTTGAGCTCATT
TTTGCATGTGGTATGTGCAGATATTTAAGTTCATAGTTTTTCTTGTTGAA
AAAAAGGCTATTCATTCCTCACTGGATTAACTTGGGGACTCCTTTTTTTG
AAAAGATGTTAAGTATGAATTTCTCTTGTGAATTTCATTCCTTTCCTACT
GAATTTGATGTCTCTCCTTC
|
| quality values | Open.Hide. 6 6 9 9 19 9 22 37 37 20 19 12 10 8 17 9 9 9 21 21 40 48 43 28 28 28 25 23 21 27 11 11 11 12 12 19 27 30 30 33 33 33 33 33 37 47 43 33 33 36
33 33 33 50 42 41 41 21 19 8 8 8 8 8 10 23 22 32 32 37 33 33 33 33 36 38 43 43 37 37 39 37 37 28 23 23 37 42 50 47 48 48 40 36 36 42 42 51 57 68
68 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 54 68 54 48 41 47 36 36 15 18 24 21 21 24 32 38 57 68 68 68 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
57 57 50 50 50 50 50 50 50 52 52 50 50 50 50 47 47 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 54 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 45
45 45 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 45 57 57 57 57 39 43 20 20 18 32 32 43 43 43 42 43 52 57 57 57 57 52 52 37 37 52 43 44 43 35
32 35 32 32 32 32 43 43 52 52 57 57 59 57 57 57 57 43 43 43 29 29 29 32 24 32 32 47 59 44 42 43 43 37 37 42 42 43 57 57 57 54 54 54 57 48 48 48 47 47
57 59 59 57 57 57 59 47 32 24 12 12 15 27 32 20 20 20 20 28 28 35 37 32 28 22 22 24 24 30 42 43 59 42 40 35 35 35 39 39 41 43 30 30 25 25 25 21 22 21
24 28 29 25 18 11 11 11 12 16 12 9 9 11 12 12 13 15 15 28 32 30 32 32 30 30 28 30 28 22 18 18 28 26 34 28 24 24 31 32 21 21 13 12 12 15 15 20 26 22
24 22 19 19 17 10 10 10 10 10 11 16 17 14 13 20 17 15 8 8 8 10 10 16 22 30 28 28 23 19 9 9 9 15 19 22 24 12 11 11 13 11 10 8 8 8 10 10 8 10
10 10 20 24 18 18 15 14 8 8 8 8 13 10 8 8 9 8 10 10 12 13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 12 12
12 11 16 12 12 9 9 11 11 11 17 21 11 10 10 10 10 9 16 16 18 16 14 9 9 10 8 15 12 7 7 10 8 14 14 15 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 10 10 11 10
12 12 12 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 12 12 11 10 10 10 10 8 8 10 10 10 10 10 11 16 16 24 28 21 19 9 9 8 8 8 8 10 10 12 11
10 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 10 10 10 10 8 8 12 15 14 10 10 8 8 8 8 8 8 13 14 15 18 12 9 8 8 8 8 13 12 14 9 10 10 8 8
6 6 8 8 11 11 11 11 12 12 12 12 13 13 9 7 8 7 8 8 8 10 8 13 12 12 9 9 10 10 10 | Open.Hide. 6 6 8 13 9 9 9 10 12 13 24 27 29 33 33 33 32 39 34 34 41 32 20 21 11 6 6 7 7 10 6 9 9 11 11 19 17 24 19 22 29 33 28 30 28 36 28 29 33 33
33 33 21 21 9 9 11 11 11 12 17 12 15 13 18 24 24 25 20 20 28 30 35 36 47 47 47 42 42 43 42 42 42 48 36 42 42 36 36 36 36 36 48 47 47 39 46 43 43 48
57 57 50 57 57 57 57 57 50 48 48 33 50 33 33 30 21 18 11 11 11 11 19 23 26 33 33 33 33 43 48 48 50 36 36 36 36 37 37 37 26 20 20 24 28 36 36 42 42 42
48 43 48 48 57 57 57 59 59 59 59 59 54 54 54 54 43 42 35 32 32 36 37 41 46 41 41 48 47 47 47 57 57 57 57 57 68 50 50 50 50 50 57 57 54 57 54 57 57 57
57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 59 57 57 54 54 54 57 57 57 68 57 57 57 68 68 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 52 57 59
59 57 52 52 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 44 44 43 43 37 37 37 34 32 47 48 48 57 57 68 59 59 57 57 48 57 48 48 48 48 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 44 27 19 18 17 17 18 20 28 28 37 20 18 12 12 8 8 14 28 18 23 23 28 34 32 34 25 25 25 36 43 57 43 43 43 43 40 43 43 43 48 48 43 43 43 43
43 43 47 41 39 32 25 18 18 14 14 13 13 13 26 26 35 32 30 30 37 39 41 31 31 35 37 37 39 39 39 39 43 43 43 43 36 43 39 41 41 37 37 28 28 22 31 31 37 40
39 28 28 32 31 33 36 33 33 33 28 28 23 23 23 23 32 37 37 40 28 28 25 37 36 48 48 48 48 43 39 33 28 28 22 24 25 30 30 24 26 20 23 18 25 25 37 34 34 30
37 39 34 34 24 25 22 33 29 29 35 30 23 23 18 22 19 22 18 28 28 36 39 37 41 35 31 28 35 37 37 37 34 30 25 25 25 34 34 37 26 26 14 14 14 26 22 19 8 8
10 17 15 28 35 31 31 32 28 21 15 19 11 13 13 18 18 28 14 12 12 17 17 13 19 15 16 12 11 8 8 15 13 15 12 11 9 9 9 10 11 22 26 28 28 16 19 16 13 13
19 19 24 24 12 8 8 8 8 8 17 20 10 10 10 10 14 12 19 12 14 13 13 14 11 9 10 20 12 14 12 21 20 16 21 28 13 8 8 13 10 9 9 10 14 13 11 10 10 12
9 10 8 8 9 9 10 13 22 10 13 12 13 14 14 19 24 21 28 12 12 9 9 9 9 10 10 17 19 10 9 9 13 12 13 12 12 12 19 22 28 28 17 11 9 9 9 10 10 14
15 13 14 12 10 13 15 9 9 10 9 8 8 8 8 10 6 6 6 6 |