BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-296K18.T7 (MSMg01no296_k18.b1) | MSMg01-296K18.TJ (MSMg01no296_k18.g1) |
ACC | AG424218 | AG424219 |
length | 712 | 743 |
length of high quality (start - end) | 283 (430 - 712) | 184 (118 - 301) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no296_k18.b1 PHD_FILE: MSMg01no296_k18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:32:55 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no296_k18.g1 PHD_FILE: MSMg01no296_k18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:32:55 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCATATGTCTCAACAAGTAAAACCATGAACAACCCAACTACTTCTTC
CTCTCTGGTACCCTTTTCTCCTATCTCAAGATACTGGCTCCATTTTTTGG
GATCCCTGCCAGAATGTAAAAGGCTGCTCCCCATATCAATAAATTTTCCC
CATCCAGCTTTTCCCTTCATCCCATTTTGTCCAGCATCTACCCTCACCAT
TCATGACCGTGAATGCTTGCCTAGCTCCTGTTGGGCCTGTGAGTGGGTCT
CACGGCTCCTTTGGTTAGAGTCTTTACTGTGATTTACTGCTTTAGAGTTG
TGCTGTTTTTTTTTTACTCCCGCGCATTATAACCTCTCCACCCTGACTCA
TTTATTGAGACAGAGCCCTGAAGTATAACCTAGGTTGGCCTCGAACTCAG
AATCCTTCTGCTTCAGCCTCCAGAAGCCGGGATTACAGCCATACATGTGT
ATCAGCATGCTCACTGAGACAGCACTATCTCTCACTCACCAGGAACAATT
CACTTTTAGAGGAGTTAAACACCCTTTAAAAAAATGAATCATGGGTCATG
TGTTCTTGCATATATTATCAGTGGAATGCTTTCTATTTCTCTTTGTGACA
ACACCTTTCTCATCTGGTCACTGCCAGGTTAAAGGATGTTTAGATAGGAT
TCAGCTTTAAAT
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXATTACCAACAGCTGCATCTCTGAACAGAGCTACTTCACACTTT
TTTTCTCCCTAAGAACATTGTAACCTCTTGCATGCAGCCACAGTAAGGAG
CAGTATGCTAGGGACCATTTTAAATAAGATAGCAAAGAAAAAGCCCAAAT
ATAGAAAACAGTGGTAAAGCTCTGAGATGGACATTTATTTGCACCGTTAG
GAGTGAAGTAAGGATTCCTTATTGTCCCACAGCTGGTTGCATGCATGTGT
TGGTCAACTCTGGTTAGTCACCAGTCTGTCCTTGTCTGCAAATGCTTTGT
TTTTATCTGCCTCCCCCCGCTATAAACACATGATATCAGGTAGCTGAGTT
CACACCTGCAAACTCCATACAATATAAGTTATTAGATTTACCTGTATGTA
GTCAGTATACATAATACACATGGTATTCAAATGTAAATATATACATATGT
ATACACACACACGCATGTACACATTTATTAAAAAGAGTTTTACCTGAGAA
GTTTAAAGATCAGTATAATTACTATTCAGAAAACTTTATTTTCATCTTCT
CCACAAATTCTATTGGAGTTTGTGGCATTTCTTTTCTACTTTGGTATTCA
CTACATACGGTTGTTGCTAGGTGCACACACCTATGTATGATGACCTATGT
CTCTGCATATTTGAAGACTCTAAAATGTTCACCTATTAGACCC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 11 17 34 34 39 39 39 37 39 37 37 37 37 37 41 37 44 43 43 27 20 24 21 21 19 22 9 9 9 9 10 23 30 41 24 28 18 22 22 31 41 57 57 35
35 31 31 33 33 37 30 22 22 21 11 9 9 11 11 11 11 22 22 30 30 31 41 59 47 47 50 38 42 42 42 43 43 53 53 53 57 57 57 57 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 53 53 59 59 59 59 41 34 31 23 19 11 11 8 8 8 8 6 6 9 11 11 11 11 11 13 13 19 29 29 36 57 57 57 59 53 53 53 53 53 53 59 59 59 59 59 42
42 36 40 40 42 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 68 68
59 68 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 44 41 28 20 20 24 41 43 59 68 68 68 68 68 57 53 50 50 50 50 50 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 41
37 25 25 12 19 13 17 12 12 14 17 21 28 34 30 30 18 15 10 10 9 9 9 10 10 10 10 18 23 32 37 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 50 50 50 50 47 57 57
59 59 59 59 59 59 59 47 47 41 39 34 22 16 12 12 12 21 15 8 8 8 8 9 10 13 10 10 10 16 23 30 34 47 59 59 59 59 59 59 57 57 50 50 50 50 43 43 35 35
35 43 43 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 57 57 59 57 59 57 57 57 59 59
68 59 59 59 59 43 47 57 59 59 57 57 57 54 44 44 44 44 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 40 40 28 40 40 54 54 48 54 54 54 48
48 48 59 59 57 44 43 43 37 43 47 47 48 48 48 48 48 48 50 48 47 42 47 47 44 43 39 37 41 44 44 47 47 47 50 50 50 47 47 44 44 41 37 37 41 41 41 41 41 42
59 59 59 48 48 48 48 57 48 59 59 59 48 50 50 50 50 42 39 39 31 31 25 36 43 43 47 47 47 47 59 59 43 43 40 43 43 43 43 48 48 48 46 46 41 41 25 23 18 17
17 21 39 47 41 41 41 50 41 41 46 43 43 43 34 30 27 23 20 28 28 34 32 28 31 35 31 30 34 23 32 34 43 37 37 41 41 39 29 25 24 15 15 23 34 34 37 37 37 37
34 34 28 28 28 23 30 32 18 18 18 17 | Open.Hide.31 35 39 39 41 46 46 46 47 59 41 28 27 12 11 11 12 15 12 18 15 21 21 30 26 43 36 36 43 43 35 35 37 36 36 40 47 47 53 57 43 34 23 15 21 19 25 17 15 15
26 23 48 47 47 54 48 46 41 39 43 36 32 30 42 33 29 27 19 16 19 24 24 32 37 41 43 39 39 29 32 19 19 19 32 32 48 43 59 43 23 23 14 14 14 23 30 37 46 36
43 39 34 19 12 9 9 10 10 16 9 9 9 9 9 10 15 22 22 28 31 32 35 30 37 39 43 47 39 35 35 33 33 24 23 20 31 26 24 15 15 15 18 18 20 24 23 33 28 37
41 30 24 24 33 33 33 46 43 43 43 42 48 42 42 37 47 48 57 44 43 37 37 35 32 24 18 11 11 18 19 18 21 20 27 32 33 24 20 13 13 18 32 44 44 44 33 33 27 32
32 32 15 32 36 43 43 43 38 32 20 20 32 32 16 17 28 28 44 44 52 52 43 43 32 32 28 43 43 52 57 52 52 52 52 57 57 57 52 52 37 46 42 42 37 30 33 43 43 43
43 35 28 28 35 38 32 18 18 18 22 22 43 42 35 35 35 42 42 54 57 48 47 44 43 43 44 46 46 33 37 28 42 30 32 19 12 12 15 32 32 44 43 41 41 28 21 20 15 15
14 15 15 20 19 19 17 17 17 25 27 31 32 23 19 15 24 24 30 30 28 33 36 34 39 30 39 39 43 43 48 32 32 20 15 15 24 19 17 17 13 20 18 12 11 11 6 6 6 6
8 7 17 11 12 12 10 8 8 8 8 8 9 13 13 11 13 11 11 10 12 12 24 25 26 28 28 28 36 37 37 30 30 25 25 23 31 21 24 21 26 25 31 31 47 39 40 40 25 19
8 8 6 6 6 7 12 16 25 24 21 12 11 11 11 11 16 17 29 21 21 12 12 12 23 23 35 30 39 39 30 24 16 18 18 24 31 39 34 34 35 28 28 33 29 31 23 15 13 10
8 8 8 15 12 21 21 41 37 43 32 31 30 27 30 28 28 20 20 20 24 24 24 29 16 17 18 15 15 20 23 28 17 17 17 17 24 31 39 43 43 43 43 37 37 28 29 33 40 40
54 57 57 43 36 31 23 23 31 16 18 10 10 10 13 15 29 26 36 37 37 24 24 19 21 22 25 22 22 20 20 28 28 25 28 22 26 22 23 23 32 32 25 25 22 21 29 15 15 10
11 13 25 23 17 17 17 29 24 28 28 28 28 23 23 23 22 28 18 19 12 12 12 13 11 15 12 14 14 18 26 31 29 19 17 16 21 14 18 23 30 25 17 17 17 21 24 19 19 15
11 12 11 12 12 19 19 23 19 19 15 16 12 9 9 9 9 18 23 27 27 11 11 11 23 23 39 32 32 32 30 28 30 22 22 22 30 30 30 24 24 17 17 17 27 27 28 24 19 19
15 24 14 19 13 15 10 10 11 11 10 12 11 9 8 8 11 23 19 23 21 12 12 11 11 11 13 10 10 10 15 17 23 19 18 18 22 17 20 28 31 32 28 28 17 15 12 15 10 10
10 10 10 11 11 10 10 10 10 10 16 28 29 28 14 12 11 11 11 13 13 14 12 13 10 15 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 12 10 |