| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-313A08.T7 (MSMg01no313_a08.b1) | MSMg01-313A08.TJ (MSMg01no313_a08.g1) |
| ACC | AG435074 | AG435075 |
| length | 1,277 | 1,275 |
length of high quality (start - end) | 740 (91 - 830) | 337 (508 - 844) |
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_a08.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_a08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:14 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_a08.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_a08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:15 2005 |
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | CCGCACTTNNNNNNNNCCACTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXCGCGGAATTCTCAAGTGAGGAATACCCTATTAATGACAAGCACCTGAA
AAAATGTTCAACATCCTTACTCATCAGGGAAACGCACATCAAAACAACCT
TGAGATTCCACCTCACTCCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGT
GACAGCAGATGCTGGCAAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTG
TTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCAGT
TCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTC
CTGGGCATATATCCAGAAGATGTCCCTACCGGTAAGAAGGACACATGCTC
CACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAAC
ACAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATTTAC
ACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCT
AGTCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACCCAAT
CACAAAGGAACTCTCACAATATGCACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCC
AGAAACTTAGGATACCCAAGATATAAGATACAATTTGCTAAACACATTAA
ACTCAAGAGAACGAAGACCAAAGTGTGGACACTTTGCCTCTTCTTAGAAT
AGGAAACAAAACACCCATGAAAGGAGTTACAGAGACAAAATTTGNAAGTG
TGACGAAAGGATGGACCATCTAGTGATTGCCATATCCAGAGATCCATCCC
ATGATCAGCTTCTCAACGCTGACACCATTGCATACACTAGAAAGATTTTG
CTGAAAGGACCCAGATATAGCTGTCTCCTGTAAGACTATGCCGGGGTCTA
GCAAACACAGAAGTGGATGCTCCCAGTCAGCTATTGGAAGGATCACAGGC
CCCCCCAATGAAGGAATTAAAAAAAGGCCCCCAAGGAAATAAAGGGAAAC
GGCACCCCTATGGTGGAACACCAATATGAATTAACCTGTCCCCGGAAGCT
CTTGTCTCTAACGGGGAAGGTTCCAAAAAGGGCTCAAAGGGCCCCCCTTT
AAAAAGAGCCCCTTGGCATTGCAACTTTATTTGCCCCCCAAAGGTAAATG
CCTTGCCCAAACAGGGAAAGGGTTGTTTTAAATAATTCCTCTCTTTTCAA
CCATTACTCTACTACATCTACTATCTC
| CCGCTGTTNNNNNNACAGACGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTAAGGCCCCCTTTTCATCCTC
TTGTCTTGATACGACTCTTTAAATCTCACAGCCCCCTTCCTCTTACTTTG
TAGGAGCCTTTTAGCTGTGCTTCCAAGTCAGTGAGCAGTTTGGTTTGGGT
ACTGTGCCTCTCAACCATCAGCCTCAGAGTCTTCAAGGCAGTCTGAATGC
TAGAAACACAATAGACCTCTTGAGTGGACTCAGAAGAGAAGAAGGAAGTG
AACTGCAAGGGTAGGGCCACTTACCGACTGGCCCTCATCCTCATCTGCAG
GACCATCTGCTGCTGTTGCTGCAGGAACATATCCAAGAAGTCCTGGAAGG
TCTTGTTTTTGACAAGTGGCAATGCAGGGCACATGTGTTTATGGTAACAG
GCAGATGATTTTTGTATGCCACCCATGATGTTGGCCACATTACGAATAAA
AAGGTTGAAATCTGGGTACTTCAAGGAACCTGAAATGGAAATAGTTTTGG
TGTGGCCTTGTAGGATTGGATGGCAATGAGAAAGGAAAAGATCTGCTCTC
AGTTCAGGAAGGAAAGTAGAAAATGTCAGTCAGAAGCAAGGAGAAAAGAA
GAGTGAGATATCAGGTCAAGAAGATGAGACCACCCTGGGAAGGAACTCTC
ACTCGTCAGTCGGGATGAGTAGTCAGAACAAATGAAAAGTGGCTCACCAT
CATCAAGAGGTAGACTGTGATCATTCTCCAGGCAGAATTGAGCAATCCTG
ACCAGAGAAGCTTGGTCCCAGGGTTCATAGCGTTCAACACTGGCAATGGT
CAATTGAAGGAGATTCAGCGAAAGGGTAGGGGCCAGCTGATTTTGGGCTT
GGTTATCTCCCACCATGAAGAACATGTGGAGGTTGTTACCACTTGGTGGT
AAAAACCGGAAACTAGAGAGGACACGGCTGTCTTCATCCTCTCGAACAGT
TTACATATCTTAAAACTTGTTTCCAATCTGAACCTTTTAACCCCCGGCCC
CCCTAAAACCTTTTTCTCCTGCCTTTTTTGGCCCACAAAAAAGTAAAAAC
GAATTTGGTTTGTAGGGGTTTGGGGCCCCACCAAATCAAAATGGGGCGCC
CTCTAAGGGTGGGGATTATCCTAGGCGCTCCTCTTGGGAAAGGACCTCTC
TTTAATCAAAAATCCTTATTTGTGTGGGTCCATCACCTATATACATTTTC
ACCTCCGCCCATTCTCACACAAGTA
|
| quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 8 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 9 6 6 6 8 6 7 10 8 8 8 8 8 8 10 10 12 8 8 8 12 12 17 24 24 33 26 16 24 16 17 17 29
43 50 50 50 40 47 47 47 42 42 43 42 42 42 35 35 35 35 31 31 33 37 31 30 23 22 10 6 7 6 6 6 6 10 10 10 10 10 10 10 16 26 37 33 33 33 36 36 36 36
53 57 53 53 53 53 53 53 53 53 53 50 50 39 37 30 27 21 13 13 10 10 11 11 18 15 22 21 37 37 37 37 28 28 12 12 12 15 17 24 26 39 59 59 59 59 53 53 50 50
50 50 53 53 53 53 53 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 51 51 51 51 53 53 57 57 48 44 43 43 44 47 57 57 57 57 57
68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 68 57 57 68 57
59 59 57 57 57 57 57 57 59 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 44 44 31 39 39 39 31 29 39 35 44 44 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 45 45 52 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57
57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 35 43 44
43 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 48 47 46 44 43 46 57 57 57 57 57 57 54 47 47 47 47 48 59 59 59 59 59 57 54 54 54 54 48 48 48 48 54 48 48 48 50
48 48 48 43 43 44 44 57 57 57 59 59 59 57 43 43 36 43 43 41 47 59 59 59 39 39 30 32 32 37 41 47 59 59 46 48 46 46 47 41 41 41 41 32 34 39 41 37 37 44
44 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 40 40 40 41 37 37 24 22 22 25 37 29 28 18 17 25 26 26 30 20 20 20 23 19 26 32 39 39 27 27 3 0 3 23 23 37 37
39 37 37 30 30 37 34 37 37 37 39 28 13 14 19 12 12 19 39 37 34 32 28 30 37 32 27 25 24 22 22 21 19 14 15 12 15 23 34 20 20 20 20 19 24 23 25 28 24 24
28 37 37 39 25 19 11 11 11 9 7 7 7 8 9 17 18 18 32 39 34 25 18 18 13 14 16 14 14 14 14 14 14 22 24 14 13 10 8 8 8 12 12 32 22 20 25 27 27 30
30 30 32 20 22 25 22 22 24 32 30 33 33 25 26 21 21 24 15 15 10 9 9 9 9 13 11 11 11 11 11 12 10 10 9 10 12 22 22 28 22 22 15 12 16 9 9 9 12 9
11 11 12 13 17 16 24 13 17 13 11 10 9 9 9 14 9 12 12 21 9 9 9 10 9 9 10 10 16 16 21 15 19 13 18 16 11 13 13 14 16 13 15 10 13 11 11 9 9 12
11 13 16 20 23 14 9 7 7 7 8 8 10 15 15 10 13 8 12 10 9 10 14 24 10 8 8 8 10 12 11 10 12 12 15 21 22 8 8 8 10 12 12 14 14 16 10 8 8 8
8 8 10 15 12 7 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 11 9 9 11 8 8 8 8 10 9 9 9 6 7 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 10 10 10 9 9 9 9
9 10 12 11 12 11 11 12 15 9 9 9 11 11 9 9 9 11 11 12 12 12 11 9 9 9 8 10 6 9 8 10 8 8 8 8 8 12 12 12 15 12 19 12 15 15 15 13 10 10
13 18 20 17 10 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 12 9 12 7 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 11 12 11 6 6 7 6
8 6 8 8 10 10 8 6 6 6 6 7 7 13 19 13 10 10 11 8 8 6 8 6 6 8 8 13 12 10 10 10 8 8 8 8 8 10 15 16 10 10 8 10 8 10 9 8 8 8
8 9 8 9 7 7 7 8 8 8 13 10 8 8 9 9 9 9 11 10 10 13 13 14 21 21 16 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 9 9 3 0 0 0 0 0 0 3 8 7 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 6 6 6 7 9 15 13 8 7 9 3 0 3 15 19 22 8 9 10 26 22 33 28
28 28 28 28 32 32 37 37 37 35 35 35 35 35 36 36 50 50 50 50 42 41 27 21 9 9 11 13 12 13 13 12 12 12 24 25 37 37 37 37 31 31 47 53 53 36 38 50 50 42
38 38 38 36 36 36 53 33 33 33 33 33 21 19 8 8 8 8 10 12 24 25 24 30 24 26 19 22 19 25 19 14 12 11 11 11 23 23 37 37 37 33 33 33 36 47 53 57 42 42
42 43 43 50 59 57 57 57 57 47 47 53 50 50 43 43 47 47 43 43 43 53 53 57 38 38 36 53 44 33 39 37 37 26 25 12 12 9 9 10 10 18 23 33 37 32 32 18 15 14
21 24 32 28 37 37 43 57 57 53 53 53 53 57 53 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 46 46 46 57 47 54 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 57
57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 59 68 68 57 57 46 46 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 59 57 57 57 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59
59 52 52 52 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 50 50 54 57 57 68 68 68 68 68 59 44 42 33 33 42 42 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 57 57 59 59 59 57 57 57 50 50 53 53 57 57 59 57 48 48 50 50 41 41
36 22 21 8 8 8 8 9 11 19 20 15 29 26 41 59 59 59 59 53 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 43 43 23 23 15 11 11 11 18 17 17 9 9 9 10 10 16 11 11 11 11 17 18 19 25 34 41 46 50 59 59 48 37 39 28 24 15 15 11 15 8 8 8 10 9 11 10 9 10
9 9 9 9 12 15 15 18 15 20 32 41 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 57 50 47 47 47 48 48 59 57 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 57 48 48 48 48 48 48 48 48 57 44 43
37 44 44 57 54 54 54 54 54 68 68 68 68 68 68 57 54 54 54 54 50 53 57 57 43 39 39 35 35 32 37 32 39 39 43 43 43 43 43 48 50 50 46 46 47 47 43 43 37 37
41 41 44 47 41 41 41 37 37 37 37 30 30 39 39 35 35 35 47 37 57 43 43 43 43 43 37 37 28 37 34 37 37 32 32 34 29 29 37 37 37 37 37 35 31 34 28 34 33 43
43 37 28 24 20 32 23 28 28 37 32 43 43 43 43 43 43 48 43 41 41 41 36 37 37 37 35 37 41 43 47 47 59 44 24 18 11 11 10 16 19 11 11 11 25 22 40 40 37 37
35 35 39 39 43 43 43 33 36 25 25 28 28 30 34 40 28 28 28 37 37 42 43 43 34 34 28 26 19 21 28 21 20 20 17 13 15 15 16 22 34 41 41 59 32 32 26 29 32 37
39 17 16 10 10 10 10 10 16 13 19 19 28 24 29 32 32 30 30 25 17 13 14 18 17 19 30 30 23 23 20 30 28 28 22 24 25 37 37 23 19 14 16 18 22 21 23 16 18 15
15 10 10 14 18 23 37 41 31 21 23 11 11 20 18 8 8 8 6 6 17 27 21 19 36 31 35 25 19 14 14 14 14 16 17 18 18 17 24 29 33 33 25 24 19 18 18 24 37 39
31 29 25 19 18 14 10 10 10 15 10 10 9 9 10 10 10 9 8 8 8 8 8 9 9 9 12 11 18 16 21 21 15 15 14 13 11 11 10 8 8 8 8 8 9 9 10 10 8 9
9 10 8 8 9 10 10 9 9 11 7 8 6 6 6 6 9 9 9 11 8 9 9 10 10 8 9 10 8 8 8 10 9 9 11 11 10 12 7 6 6 6 6 6 7 8 8 9 12 12
19 16 11 11 11 11 10 10 10 10 13 15 16 9 12 11 8 8 8 8 8 13 19 23 18 9 10 9 9 10 10 11 8 8 8 11 14 13 11 11 9 8 8 8 8 10 9 11 11 12
13 11 11 11 18 12 10 8 8 13 15 22 17 13 11 10 10 10 10 10 11 21 17 22 23 17 18 14 12 10 10 8 8 8 8 6 6 7 7 7 8 8 8 8 10 13 8 8 8 8
8 8 13 10 13 13 11 11 10 8 6 6 7 6 6 8 19 15 15 15 11 11 11 15 19 14 10 10 9 9 9 13 13 9 8 8 8 8 8 13 11 13 15 13 8 8 7 7 8 10
8 6 6 6 8 8 10 10 10 11 11 12 12 12 10 9 9 9 9 8 8 9 9 6 6 6 6 8 8 13 7 7 7 8 8 8 10 9 6 10 8 10 10 8 8 8 10 8 8 8
8 8 8 9 11 9 9 9 11 11 10 11 10 10 9 8 8 6 6 8 8 11 11 11 11 11 11 11 12 14 10 10 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 9 8 13 12
8 8 8 13 11 8 7 8 8 10 8 9 12 12 14 10 10 8 8 8 8 8 9 9 9 |