BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-387G16.T7 (MSMg01no387_g16.b1) | MSMg01-387G16.TJ (MSMg01no387_g16.g1) |
ACC | AG490154 | AG490155 |
length | 734 | 794 |
length of high quality (start - end) | 370 (75 - 444) | 450 (77 - 526) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no387_g16.b1 PHD_FILE: MSMg01no387_g16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:30:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no387_g16.g1 PHD_FILE: MSMg01no387_g16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:30:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCCCTTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCACTGTGTTCAGTCAATTGCTGCACACATCTGCAGGCAGTAA
AATCAGAAATTCAAAATTGTGCTGGGACACAGGTTATGTTGAAATAAGAC
AAGGCCATGAAATAAATAAAAAGAAATCAAGTAAAAATTTCTTTGGGCAT
TGCATATGTATATAGCCTCTTGAATTTGTAATGATTAAATCTCCATCACT
TCTTGCTACAACTTTATGCATGCTGATGGTGTGCATTATTAGAGCATGTT
AGAGACATTCACATTCAGCCACAAAAATTGAACAGGAAGCTCAGCCTTGG
GGCCTTACAATGGCCTCTGATGGAGAATGGGGTATATGGGCTCTCAGAAA
GAGGTAAATGCAAATAAACACAAAGCAGCTTTTACACTTTGACATAGGCA
GAGACAAGATGGTAAGAATACCTTGTTCTTCACACATCCCAACAACGTGT
ACCGCGGCTTTTACTTGTCCTGAAATGTTAAACATTTTACATCTACCCAG
TTACCCTTAAACCACAGAAAAATTTCTTGGAAACCCCCCCCCCCTCCCCT
TTCCAACAAAACACACAACCAACCCCGAGACCCCCCACAAATCGAATCTC
CCCCCTCCCCCGCGGACTCCCCCTCTTCACTAAACTCCCTTCTTCCCCTC
CCCCTAAAACGTCCCACTCCTCCCCCTCCCTCCC
| NCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTAGCCAGAGCAAATAGACATCAA
AAGGAGATCAAAGAAATACAAATTAGAAAGGAAGATGTCAAAATATCACT
ATTTGCAGATGATGCGATAGTGTGTATAAGTGATCCTAAAAATTACATCA
AGGAACTTCTAAACCTGATAAACAGCTCCAGTGCAGTAACATGATAGAAA
ATTAACTCAAACAAATCAGTATCTTTTCCCTACATCAAGGATAAACAGGC
TGAGAAAGAATTTAGGGAAACAACACCCTTCAAAATAGTCACAAATAATA
TAAAATTCCTTGGTCTGACTCTAACTAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGAT
AAGAACTTCAAGTCTCTGATGAAAGAAACTGATGAAGATCTCAGAAGATG
GAAAGATCTCTCATGCTCATGGATTGGCAGGATCAATATAGTAAAAATGG
CTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAAACTCCATCAAAATT
CCCACTCAATTCTTCACAGAGTTAGAAGGAGCAATTTGCCCATTTATCTG
GAGTAACCAAAAACCTTATATAAAAAAACCTATTTTCCTCAATAAAAGAA
ACTCCTGGGGGACCTTGCCGGACTCCTAAATGGGACAAAAAAAAATTGCC
TTTACCTACCCCAACCATATCCCATCCTAACTTATCCTACTCTTACTCTC
CCCAATCCTATCTTTTTCTTTCTAACGGCGTTACCCACCAACTT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 8 6 9 11 15 15 22 30 25 17 15 11 16 11 11 11 19 8 8 8 12 12 24 15 13 9 9 9 17 13 10 10 9 9 12 12 19 19 14 14 14 17 14 10
15 15 15 13 27 27 26 30 15 15 14 19 19 28 28 19 18 10 10 10 12 11 11 11 23 25 35 23 20 18 21 21 18 22 18 20 23 28 25 17 24 23 28 40 36 48 48 57 59 57
57 34 27 19 11 11 23 25 43 30 29 15 14 14 32 32 54 54 54 40 43 28 24 23 32 28 27 17 17 23 23 23 40 43 48 48 48 48 48 48 48 47 47 47 37 37 35 22 22 16
16 16 25 24 21 15 19 19 29 25 28 30 33 33 33 47 47 47 39 48 48 59 59 42 36 36 36 36 36 48 48 48 48 48 48 47 48 40 42 42 41 41 36 32 30 30 44 42 54 54
44 44 26 26 26 34 34 57 57 43 44 44 57 44 44 57 36 36 41 41 41 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 43 43 29 29 29 43 43 37 43
43 57 59 59 50 38 32 32 24 24 28 43 44 59 59 57 57 57 43 43 43 57 59 57 57 57 44 44 35 35 31 33 33 43 42 44 43 43 32 32 27 30 30 44 37 47 47 47 40 43
59 59 68 48 44 46 43 25 32 12 12 12 32 25 34 28 20 16 25 16 16 20 28 28 39 39 48 57 57 57 57 44 43 43 43 44 59 57 57 34 32 32 20 20 32 32 46 46 59 47
43 43 34 34 41 30 34 23 23 23 34 41 27 27 12 18 13 28 28 39 43 41 59 59 43 43 43 44 48 43 43 28 28 28 41 40 42 39 30 41 28 30 21 20 16 9 9 9 19 22
32 43 41 36 36 28 32 32 34 30 24 14 14 18 26 32 22 25 12 12 11 12 18 34 34 33 22 22 17 24 26 21 21 11 11 11 22 24 39 40 25 25 13 11 11 19 19 22 14 12
15 31 27 27 15 15 15 26 30 32 30 25 30 30 37 37 41 41 44 43 36 31 33 34 33 33 33 34 22 24 16 16 16 21 16 16 16 26 30 19 10 10 8 8 8 9 11 11 22 17
20 22 20 27 32 18 18 22 23 27 37 34 34 23 15 15 11 10 9 10 12 10 8 11 10 12 10 13 13 24 16 15 10 10 10 22 21 11 6 6 6 6 6 12 23 12 11 9 9 9
9 9 9 10 14 12 17 23 20 25 16 17 11 9 9 9 23 15 17 9 9 9 6 6 10 15 18 15 22 18 24 22 12 12 15 19 19 19 12 22 10 9 10 8 8 7 8 9 10 9
10 10 10 8 8 8 11 9 8 6 6 6 6 8 8 8 9 6 6 6 6 6 8 10 11 7 7 7 6 6 8 18 15 9 8 10 8 8 9 8 10 10 11 11 11 9 9 12 10 9
8 8 13 17 12 14 11 10 9 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 9 10 8 7 6 6 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 12 9 8 8 8 8 10 13 9 10 8 8 7
9 10 19 8 6 6 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 9 10 13 13 13 7 7 6 13 8 8 8 9 9 | Open.Hide. 0 3 8 8 15 9 9 8 8 7 8 9 9 19 19 37 37 37 32 37 39 39 39 39 37 32 31 37 37 37 59 59 37 36 17 25 24 30 18 19 21 24 24 27 39 53 57 57 47 42
42 43 43 50 53 57 57 57 53 53 44 28 26 26 26 33 33 41 47 47 41 41 41 41 50 50 59 59 57 54 50 48 48 48 53 57 68 68 68 68 68 68 57 57 47 47 47 47 47 47
57 59 68 68 51 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 46 50 50 50 57 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 48 48 48 54 54 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 43 43 35 35 35 39 59 59 59 48 48 48 47 41 41 41 44 44 44 35 35 37 37 37 37 41 41 39 43 39 39 35 39 39 32 28 20 20 32 32 32 28 34 26
31 39 41 39 41 39 41 41 43 43 43 39 39 39 39 37 37 30 30 30 34 29 32 37 32 25 29 41 41 31 31 34 37 35 39 39 41 37 37 31 37 37 37 37 39 43 59 34 32 20
23 23 34 34 47 34 34 18 13 11 11 11 23 20 37 32 29 27 32 37 32 32 23 20 32 23 18 18 19 15 15 23 13 11 11 13 20 30 25 25 13 13 13 22 21 22 26 23 25 22
20 20 18 23 22 21 11 11 11 11 16 26 17 17 9 9 9 9 9 9 12 9 12 9 10 10 11 11 11 19 19 24 19 20 19 19 17 15 12 10 10 10 17 13 11 14 10 10 10 9
8 8 6 6 6 8 9 8 8 8 8 8 8 11 14 16 15 11 11 9 9 9 9 9 10 14 15 8 8 8 8 8 8 16 16 8 6 6 6 8 7 13 13 13 10 15 9 9 9 9
9 9 6 6 6 6 9 9 11 11 10 12 12 10 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 15 19 19 18 15 18 17 13 11 9 12 9 9 9
9 11 10 10 10 10 10 10 10 10 10 12 19 11 11 8 8 6 6 10 6 6 6 8 8 8 8 15 12 10 8 6 8 8 8 15 10 13 6 6 8 10 8 8 8 10 8 10 10 10
10 13 10 11 11 11 11 11 10 9 9 7 8 10 7 9 10 10 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 12 9 8 8 8 8 10 8 8 6 8 6 6 6 6 |